More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_2745 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011146  Gbem_2745  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  100 
 
 
163 aa  324  4.0000000000000003e-88  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1496  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  98.16 
 
 
163 aa  318  9.999999999999999e-87  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.440871 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3719  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  84.66 
 
 
163 aa  283  5.999999999999999e-76  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.512898  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1910  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  79.14 
 
 
163 aa  271  2.0000000000000002e-72  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.370159  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2502  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  79.14 
 
 
163 aa  271  2.0000000000000002e-72  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000850238  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1261  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  79.75 
 
 
163 aa  270  4.0000000000000004e-72  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.105007  hitchhiker  0.000000415778 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2557  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  73.01 
 
 
163 aa  251  3e-66  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0881819  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2556  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  70.81 
 
 
165 aa  246  1e-64  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.080772  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1909  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  68.52 
 
 
168 aa  236  8e-62  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1691  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  61.64 
 
 
162 aa  193  7e-49  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1661  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  58.49 
 
 
162 aa  193  8.000000000000001e-49  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.994692 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0409  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  61.01 
 
 
162 aa  192  2e-48  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2167  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  60.38 
 
 
163 aa  190  7e-48  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.998104  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0154  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  61.01 
 
 
163 aa  190  7e-48  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0122247 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0709  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  55.28 
 
 
161 aa  189  2e-47  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0899  acetolactate synthase, small subunit  58.64 
 
 
167 aa  188  2e-47  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2038  acetolactate synthase, small subunit  56.05 
 
 
166 aa  188  2.9999999999999997e-47  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.153751  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0473  acetolactate synthase, small subunit  56.79 
 
 
163 aa  187  4e-47  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.990351  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0282  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  56.6 
 
 
170 aa  185  3e-46  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2271  acetolactate synthase, small subunit  56.79 
 
 
163 aa  184  4e-46  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0219  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  55.97 
 
 
161 aa  184  4e-46  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.680597  normal  0.0364419 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2983  acetolactate synthase, small subunit  56.33 
 
 
166 aa  181  3e-45  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00470165  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3025  acetolactate synthase, small subunit  56.33 
 
 
166 aa  181  3e-45  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.897404  normal  0.20881 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0503  acetolactate synthase, small subunit  54.09 
 
 
170 aa  181  4.0000000000000006e-45  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.723319  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1901  acetolactate synthase, small subunit  55.9 
 
 
166 aa  179  1e-44  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0148095  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3481  acetolactate synthase, small subunit  55.77 
 
 
156 aa  179  1e-44  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.171656  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0707  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  52.2 
 
 
174 aa  179  2e-44  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2980  acetolactate synthase, small subunit  55.35 
 
 
172 aa  178  2.9999999999999997e-44  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0119022  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3022  acetolactate synthase, small subunit  55.35 
 
 
172 aa  178  2.9999999999999997e-44  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0809645  normal  0.107141 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0591  acetolactate synthase, small subunit  51.25 
 
 
166 aa  177  4e-44  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000000221035  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0502  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  55.97 
 
 
163 aa  177  4e-44  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0122567  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1990  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  56.52 
 
 
165 aa  177  5.999999999999999e-44  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1904  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  56.33 
 
 
163 aa  177  7e-44  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4866  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  56.6 
 
 
163 aa  177  7e-44  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.858705  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2157  acetolactate synthase, small subunit  53.09 
 
 
163 aa  176  1e-43  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8058  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  50.94 
 
 
174 aa  176  1e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.654374  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0397  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  54.32 
 
 
163 aa  176  2e-43  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.458686  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1275  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  54.32 
 
 
163 aa  176  2e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1847  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  54.32 
 
 
163 aa  176  2e-43  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.113705  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1420  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  54.32 
 
 
163 aa  176  2e-43  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08880  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  51.57 
 
 
168 aa  176  2e-43  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1046  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  54.32 
 
 
163 aa  176  2e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0172689  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0752  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  54.32 
 
 
163 aa  176  2e-43  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7781  acetolactate synthase, small subunit  51.57 
 
 
207 aa  175  2e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.460716 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1282  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  54.32 
 
 
163 aa  176  2e-43  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1114  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  54.32 
 
 
163 aa  176  2e-43  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2021  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  54.32 
 
 
163 aa  174  3e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5591  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  54.32 
 
 
163 aa  175  3e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.68228 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1952  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  55.97 
 
 
163 aa  175  3e-43  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2369  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  55.97 
 
 
163 aa  174  3e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2774  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  54.32 
 
 
163 aa  175  3e-43  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.805541  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1770  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  55.97 
 
 
163 aa  175  3e-43  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.488316  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1329  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  54.32 
 
 
163 aa  174  4e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.060549 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2120  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  54.32 
 
 
163 aa  174  4e-43  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.596226  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2517  acetolactate synthase, small subunit  50.62 
 
 
170 aa  174  4e-43  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000223689  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2302  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  53.7 
 
 
163 aa  174  4e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.353704  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2180  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  53.7 
 
 
163 aa  174  4e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.177341  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3111  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  55.35 
 
 
163 aa  174  5e-43  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00654911  normal  0.734672 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0694  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  52.76 
 
 
164 aa  174  6e-43  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3230  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  53.7 
 
 
163 aa  174  6e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.88024  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0224  acetolactate synthase, small subunit  51.55 
 
 
164 aa  174  6e-43  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.708645  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1014  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  53.7 
 
 
163 aa  173  7e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.987625  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3436  acetolactate synthase, small subunit  51.85 
 
 
169 aa  174  7e-43  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00183335  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2318  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  55.97 
 
 
163 aa  173  7e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.342254  normal  0.442664 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2287  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  53.7 
 
 
163 aa  173  7e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.766326 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1653  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  53.7 
 
 
163 aa  173  7e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2264  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  53.7 
 
 
163 aa  173  7e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.855191  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2892  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  54.09 
 
 
163 aa  173  9e-43  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.018126 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1409  acetolactate synthase, small subunit  50.62 
 
 
174 aa  173  9e-43  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.678038 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1781  acetolactate synthase, small subunit  55.06 
 
 
164 aa  173  9e-43  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0752076 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2227  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  54.32 
 
 
163 aa  172  9.999999999999999e-43  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.469114 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1904  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  54.32 
 
 
163 aa  172  9.999999999999999e-43  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2257  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  53.46 
 
 
172 aa  173  9.999999999999999e-43  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3553  acetolactate synthase, small subunit  49.69 
 
 
174 aa  173  9.999999999999999e-43  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.177769  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0111  acetolactate synthase, small subunit  50.31 
 
 
165 aa  173  9.999999999999999e-43  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.849988  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1718  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  55.97 
 
 
163 aa  172  9.999999999999999e-43  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0129853  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2076  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  54.32 
 
 
163 aa  172  1.9999999999999998e-42  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4072  acetolactate synthase, small subunit  51.23 
 
 
175 aa  172  1.9999999999999998e-42  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.896436  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0543  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  53.66 
 
 
164 aa  172  1.9999999999999998e-42  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00217032 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0948  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  53.7 
 
 
163 aa  171  2.9999999999999996e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2519  acetolactate synthase small subunit  52.76 
 
 
164 aa  171  2.9999999999999996e-42  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0746  acetolactate synthase, small subunit  51.88 
 
 
161 aa  171  2.9999999999999996e-42  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0893  acetolactate synthase, small subunit  51.88 
 
 
163 aa  171  2.9999999999999996e-42  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.254483  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0912  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  53.7 
 
 
163 aa  172  2.9999999999999996e-42  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1071  acetolactate synthase, small subunit  55.28 
 
 
167 aa  171  3.9999999999999995e-42  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  decreased coverage  0.00570032  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1746  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  55.97 
 
 
163 aa  171  3.9999999999999995e-42  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.482278 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3323  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  55.35 
 
 
163 aa  170  7.999999999999999e-42  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1718  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  48.41 
 
 
159 aa  170  7.999999999999999e-42  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.223819 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0764  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  50 
 
 
167 aa  168  2e-41  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2820  acetolactate synthase small subunit  47.8 
 
 
174 aa  169  2e-41  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_16041  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  50 
 
 
167 aa  168  2e-41  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2104  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  53.46 
 
 
163 aa  168  3e-41  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.111178 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2465  acetolactate synthase, small subunit  53.7 
 
 
170 aa  168  3e-41  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.463882  normal  0.328316 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_13461  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  50 
 
 
174 aa  167  6e-41  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_13311  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  50 
 
 
174 aa  167  6e-41  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.477847  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2400  acetolactate synthase, small subunit  53.8 
 
 
161 aa  167  7e-41  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1876  acetolactate synthase, small subunit  51.57 
 
 
161 aa  166  1e-40  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000339514 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1124  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  49.68 
 
 
171 aa  166  1e-40  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.539849  hitchhiker  0.0000778154 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08540  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  49.38 
 
 
169 aa  165  2e-40  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.097945  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6020  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  50.31 
 
 
168 aa  166  2e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.103742  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>