More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_2725 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011146  Gbem_2725  leucyl aminopeptidase  100 
 
 
492 aa  994    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00941459  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1516  leucyl aminopeptidase  81.71 
 
 
491 aa  813    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0890319 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3361  leucyl aminopeptidase  55.14 
 
 
496 aa  538  9.999999999999999e-153  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000650646  hitchhiker  0.00562163 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4252  leucyl aminopeptidase  55.67 
 
 
495 aa  528  1e-148  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0332  leucyl aminopeptidase  55.44 
 
 
496 aa  509  1e-143  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00199325  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0200  aminopeptidase A/I  48.49 
 
 
497 aa  456  1e-127  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000277663  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0289  leucyl aminopeptidase  46.72 
 
 
501 aa  432  1e-120  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.823293  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0222  leucyl aminopeptidase  44.6 
 
 
496 aa  414  1e-114  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0191998  normal  0.929203 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0699  leucyl aminopeptidase  45.77 
 
 
487 aa  407  1.0000000000000001e-112  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0267193  normal  0.882342 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0295  leucyl aminopeptidase  46.06 
 
 
488 aa  404  1e-111  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1016  leucyl aminopeptidase  46.77 
 
 
482 aa  403  1e-111  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0746  leucyl aminopeptidase  45.42 
 
 
518 aa  400  9.999999999999999e-111  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.483343  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3082  leucyl aminopeptidase  43 
 
 
498 aa  396  1e-109  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0737217 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2099  aminopeptidase A/I  43.12 
 
 
497 aa  390  1e-107  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.41187  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0628  leucyl aminopeptidase  43.9 
 
 
496 aa  390  1e-107  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.052928  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0978  Leucyl aminopeptidase  43.09 
 
 
506 aa  392  1e-107  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2115  Leucyl aminopeptidase  47.16 
 
 
492 aa  389  1e-107  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.299036 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1271  cytosol aminopeptidase  43.75 
 
 
496 aa  383  1e-105  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1091  leucyl aminopeptidase  44.2 
 
 
496 aa  382  1e-105  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0580  leucyl aminopeptidase  43.76 
 
 
503 aa  384  1e-105  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.458799  normal  0.873186 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2140  Leucyl aminopeptidase  42.35 
 
 
496 aa  380  1e-104  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.727293  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2102  leucyl aminopeptidase  42.83 
 
 
512 aa  379  1e-104  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2787  leucyl aminopeptidase  44.95 
 
 
499 aa  381  1e-104  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.151843  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2676  leucyl aminopeptidase  45.13 
 
 
511 aa  381  1e-104  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00321125  normal  0.944442 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11650  leucyl aminopeptidase  44.27 
 
 
496 aa  378  1e-103  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2683  leucyl aminopeptidase  43.98 
 
 
510 aa  375  1e-103  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.417849  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4237  leucyl aminopeptidase  44.4 
 
 
497 aa  376  1e-103  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1124  leucyl aminopeptidase  47.4 
 
 
485 aa  377  1e-103  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.67356  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0980  leucyl aminopeptidase  43.98 
 
 
497 aa  374  1e-102  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0989  leucyl aminopeptidase  42.2 
 
 
496 aa  374  1e-102  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.345357  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1748  leucyl aminopeptidase  43.53 
 
 
493 aa  374  1e-102  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0558  PepA aminopeptidase  43.85 
 
 
497 aa  372  1e-102  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.548083  hitchhiker  0.0000733214 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0986  leucyl aminopeptidase  43.78 
 
 
497 aa  371  1e-101  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.481713  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2225  leucyl aminopeptidase  43.61 
 
 
503 aa  370  1e-101  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1018  leucyl aminopeptidase  43.57 
 
 
497 aa  370  1e-101  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3765  Leucyl aminopeptidase  42.68 
 
 
493 aa  370  1e-101  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2807  leucyl aminopeptidase  43.8 
 
 
510 aa  372  1e-101  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.494526  normal  0.367433 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3051  Leucyl aminopeptidase  45.79 
 
 
487 aa  371  1e-101  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.00163591  normal  0.235432 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2201  cytosol aminopeptidase  42.51 
 
 
500 aa  366  1e-100  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.152379  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1282  leucyl aminopeptidase  43 
 
 
495 aa  368  1e-100  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1857  Leucyl aminopeptidase  42.51 
 
 
500 aa  366  1e-100  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0681  leucyl aminopeptidase  42.32 
 
 
499 aa  365  1e-99  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.516579  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2679  leucyl aminopeptidase  45.06 
 
 
502 aa  363  3e-99  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.273234  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3527  leucyl aminopeptidase  42.68 
 
 
512 aa  363  4e-99  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.00117428  normal  0.357164 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01576  leucyl aminopeptidase  39.64 
 
 
513 aa  363  4e-99  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.327034  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0568  leucyl aminopeptidase  42.73 
 
 
514 aa  363  4e-99  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0984  leucyl aminopeptidase  43.57 
 
 
508 aa  362  6e-99  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2918  leucyl aminopeptidase  43.43 
 
 
507 aa  362  6e-99  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0828  leucyl aminopeptidase  43.04 
 
 
503 aa  362  7.0000000000000005e-99  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.871802  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0454  leucyl aminopeptidase  43.69 
 
 
500 aa  362  1e-98  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2083  leucyl aminopeptidase  39.72 
 
 
503 aa  361  2e-98  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000600102  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14470  leucyl aminopeptidase  42.97 
 
 
495 aa  361  2e-98  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2219  leucyl aminopeptidase  45.21 
 
 
502 aa  360  3e-98  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.515886 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0740  leucyl aminopeptidase  37.82 
 
 
501 aa  360  3e-98  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03635  leucyl aminopeptidase  38.93 
 
 
502 aa  359  5e-98  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0961  leucyl aminopeptidase  42.95 
 
 
500 aa  359  6e-98  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3557  leucyl aminopeptidase  39.36 
 
 
502 aa  359  6e-98  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0823  leucyl aminopeptidase  43.87 
 
 
503 aa  358  9.999999999999999e-98  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.971724  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0038  leucyl aminopeptidase  38.76 
 
 
504 aa  357  1.9999999999999998e-97  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0672  leucyl aminopeptidase  44.07 
 
 
503 aa  357  1.9999999999999998e-97  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.131904  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2519  leucyl aminopeptidase  44.05 
 
 
522 aa  358  1.9999999999999998e-97  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.164338  normal  0.0174769 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1015  leucyl aminopeptidase  44.07 
 
 
503 aa  357  1.9999999999999998e-97  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.490931  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1653  leucyl aminopeptidase  44.07 
 
 
503 aa  357  1.9999999999999998e-97  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.197906  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1022  leucyl aminopeptidase  44.07 
 
 
503 aa  357  1.9999999999999998e-97  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2339  leucyl aminopeptidase  44.07 
 
 
503 aa  357  1.9999999999999998e-97  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1855  leucyl aminopeptidase  42.83 
 
 
503 aa  357  1.9999999999999998e-97  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2947  leucyl aminopeptidase  44.07 
 
 
503 aa  357  1.9999999999999998e-97  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.76246  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2466  leucyl aminopeptidase  42.83 
 
 
503 aa  357  1.9999999999999998e-97  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3720  leucyl aminopeptidase  39.56 
 
 
502 aa  357  2.9999999999999997e-97  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1176  leucyl aminopeptidase  43.87 
 
 
503 aa  357  2.9999999999999997e-97  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.624268  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002428  cytosol aminopeptidase PepA  38.74 
 
 
502 aa  357  3.9999999999999996e-97  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00175472  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3638  leucyl aminopeptidase  43.36 
 
 
508 aa  356  3.9999999999999996e-97  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5797  leucyl aminopeptidase  42.2 
 
 
503 aa  356  5.999999999999999e-97  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.172158 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2383  leucyl aminopeptidase  42.2 
 
 
503 aa  356  5.999999999999999e-97  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2515  leucyl aminopeptidase  42.2 
 
 
503 aa  355  7.999999999999999e-97  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.880203  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04126  leucyl aminopeptidase  39.52 
 
 
503 aa  354  2e-96  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0158539  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3737  Leucyl aminopeptidase  39.52 
 
 
503 aa  354  2e-96  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.662158  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4516  leucyl aminopeptidase  39.52 
 
 
503 aa  354  2e-96  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000167051  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4740  leucyl aminopeptidase  39.52 
 
 
503 aa  354  2e-96  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00000218455  normal  0.712457 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3752  leucyl aminopeptidase  39.52 
 
 
503 aa  354  2e-96  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00102834  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4832  leucyl aminopeptidase  39.52 
 
 
503 aa  354  2e-96  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000259407  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0795  leucyl aminopeptidase  37.4 
 
 
502 aa  354  2e-96  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5781  leucyl aminopeptidase  39.52 
 
 
503 aa  354  2e-96  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0325394  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04090  hypothetical protein  39.52 
 
 
503 aa  354  2e-96  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0200795  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3648  leucyl aminopeptidase  39.09 
 
 
503 aa  353  2.9999999999999997e-96  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.433879  normal  0.196646 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4733  leucyl aminopeptidase  39.48 
 
 
503 aa  353  4e-96  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.138793  normal  0.355526 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4826  leucyl aminopeptidase  39.48 
 
 
503 aa  353  4e-96  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.956713  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4863  leucyl aminopeptidase  39.48 
 
 
503 aa  353  4e-96  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0321011  normal  0.585074 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4763  leucyl aminopeptidase  39.48 
 
 
503 aa  353  4e-96  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000189037  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4882  leucyl aminopeptidase  39.48 
 
 
503 aa  353  4e-96  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.417344  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4821  leucyl aminopeptidase  39.09 
 
 
503 aa  352  7e-96  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000301619  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2471  leucyl aminopeptidase  42.2 
 
 
503 aa  352  8e-96  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1178  leucyl aminopeptidase  37.6 
 
 
502 aa  352  8.999999999999999e-96  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0516  leucyl aminopeptidase  40.37 
 
 
495 aa  352  1e-95  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.204663  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2827  leucyl aminopeptidase  37.2 
 
 
502 aa  351  1e-95  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.246514  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1368  leucyl aminopeptidase  36.98 
 
 
502 aa  350  2e-95  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0910  leucyl aminopeptidase  37.6 
 
 
502 aa  350  2e-95  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000452493  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3262  leucyl aminopeptidase  36.98 
 
 
502 aa  350  2e-95  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0507418  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0939  leucyl aminopeptidase  38.03 
 
 
502 aa  351  2e-95  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.245826  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1257  leucyl aminopeptidase  36.98 
 
 
502 aa  350  2e-95  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0396745  hitchhiker  0.0000114036 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>