More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_2651 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011146  Gbem_2651  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  100 
 
 
257 aa  502  1e-141  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1583  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  95.72 
 
 
257 aa  484  1e-136  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.889628 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2042  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  75 
 
 
260 aa  392  1e-108  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000269177  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1425  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  69.53 
 
 
260 aa  354  5.999999999999999e-97  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1227  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  64.98 
 
 
261 aa  327  1.0000000000000001e-88  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.0136152 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1698  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  59.38 
 
 
266 aa  313  1.9999999999999998e-84  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000567119  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2273  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  61.57 
 
 
269 aa  298  4e-80  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1877  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  54.47 
 
 
261 aa  281  1e-74  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000288014  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0434  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  54.09 
 
 
266 aa  275  4e-73  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0921151  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04460  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  53.7 
 
 
266 aa  274  8e-73  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0206  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  52.92 
 
 
271 aa  267  1e-70  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0572  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  52.34 
 
 
283 aa  265  5e-70  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0106138  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004428  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  51.36 
 
 
273 aa  263  2e-69  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00970  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  51.36 
 
 
273 aa  263  3e-69  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0440  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  51.76 
 
 
261 aa  260  1e-68  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.541789  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1733  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  51.76 
 
 
261 aa  259  3e-68  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1334  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  49.02 
 
 
268 aa  257  1e-67  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2948  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  52.33 
 
 
263 aa  256  3e-67  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.622382  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2862  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  48.63 
 
 
268 aa  255  4e-67  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.107443  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2944  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  48.63 
 
 
268 aa  255  4e-67  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00576066  normal  0.798295 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3040  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  48.63 
 
 
268 aa  256  4e-67  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.600526 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3071  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  49.82 
 
 
298 aa  255  6e-67  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000126836 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3126  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  47.84 
 
 
269 aa  254  1.0000000000000001e-66  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.178661  normal  0.438843 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1231  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  47.84 
 
 
269 aa  254  1.0000000000000001e-66  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.270014  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1880  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  48.99 
 
 
271 aa  254  1.0000000000000001e-66  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0668134  normal  0.877518 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1264  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  47.45 
 
 
269 aa  253  2.0000000000000002e-66  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.327178  normal  0.379558 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1639  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  50.38 
 
 
281 aa  252  3e-66  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1903  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  53.73 
 
 
271 aa  253  3e-66  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1187  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  47.45 
 
 
269 aa  252  4.0000000000000004e-66  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0797242  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1145  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  49.22 
 
 
268 aa  250  2e-65  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.286559  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2928  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  49.39 
 
 
256 aa  249  2e-65  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2782  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  48.99 
 
 
256 aa  249  2e-65  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2573  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  50 
 
 
267 aa  250  2e-65  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.604509  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4214  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  50.78 
 
 
266 aa  249  4e-65  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0866  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  47.45 
 
 
268 aa  249  4e-65  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.13181 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3622  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  50.2 
 
 
290 aa  248  5e-65  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2548  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  49.81 
 
 
272 aa  246  2e-64  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.535661  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5374  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  49.22 
 
 
271 aa  246  3e-64  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.4033 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1415  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  52.82 
 
 
248 aa  246  3e-64  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.269297  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03707  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  51.63 
 
 
267 aa  245  4e-64  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2746  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  50 
 
 
265 aa  245  4e-64  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3239  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  45.88 
 
 
290 aa  245  6e-64  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.132712  normal  0.305063 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0983  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  45.88 
 
 
290 aa  245  6e-64  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000100522  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1035  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  45.88 
 
 
290 aa  245  6e-64  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.849889  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3822  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  46.4 
 
 
290 aa  244  8e-64  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00839067  normal  0.429606 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2039  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  50.78 
 
 
261 aa  244  9e-64  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0323  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  49.22 
 
 
269 aa  244  9.999999999999999e-64  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.337894  normal  0.658901 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3015  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  47.12 
 
 
287 aa  244  9.999999999999999e-64  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1413  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  49.62 
 
 
284 aa  244  9.999999999999999e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0172478  normal  0.657625 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5195  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  49.2 
 
 
268 aa  243  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5049  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  49.2 
 
 
268 aa  243  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2727  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  52.02 
 
 
262 aa  243  3e-63  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0904003  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3843  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  52.12 
 
 
280 aa  243  3e-63  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.944466  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2131  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  51.01 
 
 
265 aa  242  5e-63  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5142  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  49.22 
 
 
268 aa  241  7e-63  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0470002  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2262  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  50.98 
 
 
276 aa  240  1e-62  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4841  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  47.31 
 
 
270 aa  240  1e-62  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3095  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  47.74 
 
 
291 aa  241  1e-62  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3397  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  46.59 
 
 
289 aa  240  1e-62  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0216761  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1528  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  50.39 
 
 
281 aa  240  2e-62  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1477  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  50.39 
 
 
281 aa  240  2e-62  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0180455  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5283  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  48.4 
 
 
270 aa  239  2.9999999999999997e-62  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2504  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  49.02 
 
 
291 aa  239  4e-62  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.686642  normal  0.496408 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3196  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  46.76 
 
 
287 aa  239  4e-62  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.270272  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12220  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  50.19 
 
 
281 aa  238  5e-62  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00000110554  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0592  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  53.2 
 
 
280 aa  238  5e-62  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000801291  unclonable  2.22313e-18 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2433  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  48.84 
 
 
262 aa  239  5e-62  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3875  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  47.92 
 
 
288 aa  238  6.999999999999999e-62  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.102914  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0906  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  46.59 
 
 
289 aa  237  1e-61  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.705572  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0902  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  50.19 
 
 
275 aa  236  2e-61  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0233  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  48.26 
 
 
270 aa  236  2e-61  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0641  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  50.39 
 
 
274 aa  236  2e-61  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.462482  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48180  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  49.22 
 
 
265 aa  236  2e-61  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1765  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  47.74 
 
 
285 aa  236  4e-61  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4164  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  47.55 
 
 
287 aa  234  9e-61  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.123051 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4842  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  46.62 
 
 
286 aa  234  9e-61  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3746  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  49.4 
 
 
269 aa  234  1.0000000000000001e-60  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0511253  hitchhiker  0.00206835 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3171  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  49.44 
 
 
287 aa  234  1.0000000000000001e-60  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.105737  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0992  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  49.58 
 
 
271 aa  231  7.000000000000001e-60  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2186  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  49.61 
 
 
272 aa  231  7.000000000000001e-60  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1844  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  49.61 
 
 
272 aa  231  7.000000000000001e-60  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2219  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  45.99 
 
 
301 aa  231  1e-59  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.321148  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0505  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  50 
 
 
287 aa  230  1e-59  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0238281 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02676  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  46.07 
 
 
291 aa  230  2e-59  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00174418  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0863  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  46.07 
 
 
291 aa  230  2e-59  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00349665  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0887  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  46.07 
 
 
291 aa  230  2e-59  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3034  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  46.07 
 
 
291 aa  230  2e-59  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0527385  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3148  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  46.07 
 
 
291 aa  230  2e-59  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000698602  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0301  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  47.27 
 
 
263 aa  230  2e-59  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000153612  normal  0.153918 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02637  hypothetical protein  46.07 
 
 
291 aa  230  2e-59  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00123723  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2975  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  46.07 
 
 
291 aa  230  2e-59  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00678242  normal  0.0109979 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2974  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  46.07 
 
 
291 aa  230  2e-59  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.115465  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4094  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  46.07 
 
 
291 aa  230  2e-59  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00562509  normal  0.0603079 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3215  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  45.88 
 
 
291 aa  228  5e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.023751 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3329  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  45.88 
 
 
291 aa  228  5e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00985131 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2150  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  46.99 
 
 
300 aa  229  5e-59  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3149  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  45.88 
 
 
291 aa  228  5e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.69155  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0499  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  49.18 
 
 
285 aa  228  1e-58  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.686032  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2802  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  47.13 
 
 
270 aa  228  1e-58  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.780836 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0990  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  44.44 
 
 
301 aa  226  2e-58  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.910285  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>