More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_2638 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_2638  dihydropteroate synthase  100 
 
 		 278 aa  553  1e-156  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.578756  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1596  dihydropteroate synthase  95.32 
 
 		 278 aa  504  9.999999999999999e-143  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2253  dihydropteroate synthase  61.4 
 
 		 400 aa  342  5e-93  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.379586  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2523  dihydropteroate synthase  60.73 
 
 		 413 aa  330  1e-89  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.974941  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1889  dihydropteroate synthase  61.65 
 
 		 290 aa  329  3e-89  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000220218  hitchhiker  0.00000000634632 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2733  dihydropteroate synthase  65.82 
 
 		 284 aa  318  7.999999999999999e-86  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0148953  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1808  dihydropteroate synthase  61.17 
 
 		 303 aa  303  1.0000000000000001e-81  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.70358  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0998  dihydropteroate synthase  53.43 
 
 		 306 aa  274  1.0000000000000001e-72  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000543452  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2581  dihydropteroate synthase  49.64 
 
 		 393 aa  271  1e-71  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0235  dihydropteroate synthase  51.53 
 
 		 394 aa  263  3e-69  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.683276 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3289  dihydropteroate synthase  47.15 
 
 		 287 aa  259  3e-68  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4007  dihydropteroate synthase  49.81 
 
 		 280 aa  259  3e-68  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0856154 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2404  dihydropteroate synthase  48.29 
 
 		 279 aa  256  2e-67  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2354  dihydropteroate synthase  48.29 
 
 		 279 aa  256  2e-67  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0784  dihydropteroate synthase  48.33 
 
 		 279 aa  254  9e-67  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.362908  unclonable  0.000000150876 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0069  dihydropteroate synthase  47.83 
 
 		 283 aa  253  2.0000000000000002e-66  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0550  dihydropteroate synthase  48.53 
 
 		 286 aa  252  5.000000000000001e-66  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.860771 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0072  dihydropteroate synthase  48.47 
 
 		 285 aa  251  7e-66  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0110  dihydropteroate synthase  48.47 
 
 		 402 aa  248  7e-65  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0070  dihydropteroate synthase  46.93 
 
 		 280 aa  248  1e-64  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0071  dihydropteroate synthase  46.93 
 
 		 280 aa  247  1e-64  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0067  dihydropteroate synthase (DHPS) (dihydropteroate pyrophosphorylase)  46.93 
 
 		 280 aa  247  1e-64  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0067  dihydropteroate synthase (DHPS) (dihydropteroate pyrophosphorylase)  46.93 
 
 		 280 aa  247  1e-64  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0071  dihydropteroate synthase  46.93 
 
 		 280 aa  247  1e-64  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1883  dihydropteroate synthase  52.99 
 
 		 394 aa  247  1e-64  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.436317  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0080  dihydropteroate synthase  46.93 
 
 		 277 aa  247  1e-64  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000343414 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0083  dihydropteroate synthase  47.29 
 
 		 277 aa  247  1e-64  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.944677  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5237  dihydropteroate synthase  46.93 
 
 		 277 aa  247  2e-64  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000121132 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2076  dihydropteroate synthase  47.14 
 
 		 285 aa  246  2e-64  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.495698  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0067  dihydropteroate synthase  45.85 
 
 		 277 aa  246  2e-64  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0067  dihydropteroate synthase  46.93 
 
 		 286 aa  247  2e-64  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0812  dihydropteroate synthase  47.78 
 
 		 270 aa  246  3e-64  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000234542  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0905  dihydropteroate synthase  45.9 
 
 		 278 aa  246  3e-64  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0884892  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2635  dihydropteroate synthase  49.81 
 
 		 277 aa  245  4.9999999999999997e-64  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0079  dihydropteroate synthase  46.57 
 
 		 277 aa  245  6e-64  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.863078  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0675  dihydropteroate synthase  45.88 
 
 		 347 aa  244  9.999999999999999e-64  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0939  dihydropteroate synthase  49.59 
 
 		 397 aa  243  1.9999999999999999e-63  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2459  dihydropteroate synthase  53.47 
 
 		 283 aa  242  3.9999999999999997e-63  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0729  dihydropteroate synthase  45.91 
 
 		 275 aa  241  9e-63  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2568  dihydropteroate synthase  46.01 
 
 		 286 aa  241  1e-62  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.032898  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0883  dihydropteroate synthase  44.4 
 
 		 278 aa  241  1e-62  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0252047  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2861  dihydropteroate synthase  48.91 
 
 		 299 aa  241  1e-62  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.366025  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2371  dihydropteroate synthase  52.65 
 
 		 283 aa  241  1e-62  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0097  dihydropteroate synthase  45.65 
 
 		 412 aa  240  2e-62  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1075  dihydropteroate synthase  46.95 
 
 		 282 aa  240  2e-62  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1971  dihydropteroate synthase  50 
 
 		 289 aa  239  2.9999999999999997e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.305951 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3395  dihydropteroate synthase  46.92 
 
 		 280 aa  239  2.9999999999999997e-62  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000218907  hitchhiker  0.0003141 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0151  dihydropteroate synthase  49.24 
 
 		 407 aa  239  5e-62  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.355211  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1496  dihydropteroate synthase  54.69 
 
 		 283 aa  238  6.999999999999999e-62  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1814  dihydropteroate synthase  54.4 
 
 		 289 aa  238  8e-62  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.690503 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3611  dihydropteroate synthase  48.21 
 
 		 282 aa  237  1e-61  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00230251  normal  0.142126 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0095  dihydropteroate synthase  50 
 
 		 396 aa  238  1e-61  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2816  dihydropteroate synthase  47.04 
 
 		 275 aa  238  1e-61  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03042  7,8-dihydropteroate synthase  47.62 
 
 		 282 aa  236  2e-61  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000457475  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0530  dihydropteroate synthase  47.62 
 
 		 282 aa  236  2e-61  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0023005  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3662  dihydropteroate synthase  47.62 
 
 		 282 aa  236  2e-61  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000648754  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02993  hypothetical protein  47.62 
 
 		 282 aa  236  2e-61  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000407498  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0523  dihydropteroate synthase  47.62 
 
 		 282 aa  236  2e-61  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00018335  hitchhiker  0.00147266 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3473  dihydropteroate synthase  47.62 
 
 		 282 aa  236  2e-61  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000584102  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3369  dihydropteroate synthase  47.62 
 
 		 282 aa  236  2e-61  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000338476  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1330  dihydropteroate synthase  44.53 
 
 		 274 aa  237  2e-61  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.144104  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4499  dihydropteroate synthase  47.62 
 
 		 282 aa  236  2e-61  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00232473  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0167  dihydropteroate synthase  46.49 
 
 		 278 aa  236  3e-61  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000848147  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2261  dihydropteroate synthase  50.61 
 
 		 258 aa  236  3e-61  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.00525567  hitchhiker  0.00000000957493 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3045  dihydropteroate synthase  50 
 
 		 291 aa  236  4e-61  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3593  dihydropteroate synthase  47.22 
 
 		 282 aa  236  4e-61  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000346067  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2337  dihydropteroate synthase  56.5 
 
 		 280 aa  235  6e-61  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.968107 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0955  dihydropteroate synthase  46.04 
 
 		 279 aa  235  6e-61  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0212772  normal  0.281578 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1674  dihydropteroate synthase  52.51 
 
 		 271 aa  235  6e-61  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.055413 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1925  dihydropteroate synthase  45.28 
 
 		 291 aa  235  7e-61  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  decreased coverage  0.00000353988  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3351  dihydropteroate synthase  46.59 
 
 		 277 aa  235  7e-61  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.0017412  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1572  dihydropteroate synthase  47.67 
 
 		 274 aa  234  9e-61  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0119126  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4718  dihydropteroate synthase  47.06 
 
 		 283 aa  234  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3653  dihydropteroate synthase  48.21 
 
 		 282 aa  234  1.0000000000000001e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0472359  normal  0.97325 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3591  dihydropteroate synthase  48.21 
 
 		 282 aa  234  1.0000000000000001e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0668157  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3554  dihydropteroate synthase  48.21 
 
 		 282 aa  234  1.0000000000000001e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.775184  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3484  dihydropteroate synthase  48.21 
 
 		 282 aa  234  1.0000000000000001e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0132953  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03403  dihydropteroate synthase  44.12 
 
 		 276 aa  233  2.0000000000000002e-60  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1098  dihydropteroate synthase  44.66 
 
 		 269 aa  234  2.0000000000000002e-60  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0139197  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0593  dihydropteroate synthase  43.45 
 
 		 277 aa  233  3e-60  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.271496  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3601  dihydropteroate synthase  45.17 
 
 		 277 aa  233  4.0000000000000004e-60  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000106991  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3567  dihydropteroate synthase  46.33 
 
 		 279 aa  232  4.0000000000000004e-60  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00503342  hitchhiker  0.00000448434 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3485  dihydropteroate synthase  47.83 
 
 		 282 aa  232  4.0000000000000004e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.137354  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3735  dihydropteroate synthase  45.17 
 
 		 277 aa  233  4.0000000000000004e-60  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00714217  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0812  dihydropteroate synthase  46.33 
 
 		 277 aa  232  4.0000000000000004e-60  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.346679  hitchhiker  0.00737464 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1276  dihydropteroate synthase  44.27 
 
 		 269 aa  232  6e-60  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.000186218  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1381  dihydropteroate synthase  43.35 
 
 		 281 aa  231  7.000000000000001e-60  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.131538  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1198  dihydropteroate synthase  45.95 
 
 		 277 aa  231  8.000000000000001e-60  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3614  dihydropteroate synthase  47.06 
 
 		 283 aa  231  8.000000000000001e-60  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3986  dihydropteroate synthase  45.17 
 
 		 277 aa  231  8.000000000000001e-60  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.000000000550562  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0147  dihydropteroate synthase  50 
 
 		 257 aa  231  1e-59  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2775  dihydropteroate synthase  49.28 
 
 		 332 aa  231  1e-59  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0570609  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0513  dihydropteroate synthase  49.81 
 
 		 278 aa  231  1e-59  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.884922 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02040  dihydropteroate synthase/2-amino-4-hydroxy-6- hydroxymethyldihydropteridine pyrophosphokinase  47.49 
 
 		 437 aa  230  2e-59  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.439643  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2150  dihydropteroate synthase  53.97 
 
 		 289 aa  229  3e-59  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.733482  normal  0.221707 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1616  dihydropteroate synthase  50 
 
 		 296 aa  229  3e-59  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.282934  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2833  dihydropteroate synthase  44.53 
 
 		 282 aa  229  3e-59  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0289164  normal  0.0133795 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3451  dihydropteroate synthase  43.24 
 
 		 286 aa  229  4e-59  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0511  dihydropteroate synthase  48.5 
 
 		 345 aa  229  4e-59  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5758  dihydropteroate synthase  49.43 
 
 		 295 aa  229  4e-59  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.425757 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>