More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_2635 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU1805  phosphoglucosamine mutase  81.6 
 
 		 451 aa  758    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.979092  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2635  phosphoglucosamine mutase  100 
 
 		 454 aa  923    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1001  phosphoglucosamine mutase  76.39 
 
 		 460 aa  706    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00128114  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1886  phosphoglucosamine mutase  82.71 
 
 		 451 aa  766    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000764387  hitchhiker  0.00000000296737 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2525  phosphoglucosamine mutase  78 
 
 		 452 aa  724    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.620742  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1599  phosphoglucosamine mutase  97.58 
 
 		 454 aa  907    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2256  phosphoglucosamine mutase  78 
 
 		 453 aa  729    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2730  phosphoglucosamine mutase  83.04 
 
 		 454 aa  779    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2334  phosphoglucosamine mutase  64.6 
 
 		 469 aa  606  9.999999999999999e-173  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.877927  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2368  phosphoglucosamine mutase  62.25 
 
 		 496 aa  580  1e-164  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.529976  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2456  phosphoglucosamine mutase  62.25 
 
 		 496 aa  580  1e-164  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.406799  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1499  phosphoglucosamine mutase  62.94 
 
 		 458 aa  580  1e-164  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3604  phosphoglucosamine mutase  60.31 
 
 		 454 aa  543  1e-153  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.623174  hitchhiker  0.000672034 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1517  phosphoglucosamine mutase  56.28 
 
 		 450 aa  534  1e-150  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.862212  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0059  phosphoglucosamine mutase  56.82 
 
 		 450 aa  524  1e-147  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1783  phosphoglucosamine mutase  56.15 
 
 		 450 aa  521  1e-147  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.363404  normal  0.362539 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1713  phosphoglucosamine mutase  55.61 
 
 		 450 aa  520  1e-146  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1723  phosphoglucosamine mutase  54.85 
 
 		 450 aa  515  1.0000000000000001e-145  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.822287  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0257  phosphoglucosamine mutase  58.14 
 
 		 449 aa  517  1.0000000000000001e-145  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0497563  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0360  phosphoglucosamine mutase  55.41 
 
 		 483 aa  512  1e-144  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.943264  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0545  phosphoglucosamine mutase  55.41 
 
 		 447 aa  490  1e-137  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0512  phosphoglucosamine mutase  55.41 
 
 		 447 aa  486  1e-136  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1863  phosphoglucosamine mutase  55.18 
 
 		 447 aa  485  1e-136  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0294  phosphoglucosamine mutase  54.5 
 
 		 444 aa  485  1e-136  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000894137  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0649  phosphoglucosamine mutase  55.18 
 
 		 447 aa  486  1e-136  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.19519 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2131  phosphoglucosamine mutase  54.16 
 
 		 448 aa  483  1e-135  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.361612  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1100  phosphoglucosamine mutase  54.38 
 
 		 452 aa  482  1e-135  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.445304  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2397  phosphoglucosamine mutase  56.61 
 
 		 447 aa  483  1e-135  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.793208  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2913  phosphoglucosamine mutase  54 
 
 		 449 aa  483  1e-135  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0605  phosphoglucosamine mutase  56.68 
 
 		 451 aa  479  1e-134  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000599128  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0835  phosphoglucosamine mutase  55.03 
 
 		 445 aa  479  1e-134  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0949  phosphoglucosamine mutase  53.33 
 
 		 447 aa  476  1e-133  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0481  phosphoglucosamine mutase  52.82 
 
 		 445 aa  469  1.0000000000000001e-131  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0202  phosphoglucosamine mutase  51.34 
 
 		 459 aa  465  9.999999999999999e-131  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3490  phosphoglucosamine mutase  50.56 
 
 		 450 aa  467  9.999999999999999e-131  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.731606  normal  0.0664049 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2622  phosphoglucosamine mutase  51.24 
 
 		 451 aa  466  9.999999999999999e-131  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.412287  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4113  phosphoglucosamine mutase  52.01 
 
 		 450 aa  465  9.999999999999999e-131  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0304964  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4597  phosphoglucosamine mutase  53.6 
 
 		 448 aa  465  9.999999999999999e-131  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.503943  normal  0.260972 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3195  phosphoglucosamine mutase  50.34 
 
 		 450 aa  465  9.999999999999999e-131  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0158  phosphoglucosamine mutase  51.66 
 
 		 448 aa  461  1e-129  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.135407  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2305  phosphoglucosamine mutase  53.83 
 
 		 447 aa  464  1e-129  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.181279  normal  0.714962 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1205  phosphoglucosamine mutase  52.67 
 
 		 452 aa  462  1e-129  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.713344  normal  0.913107 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0359  phosphoglucosamine mutase  54.19 
 
 		 452 aa  460  9.999999999999999e-129  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4838  phosphoglucosamine mutase  53.61 
 
 		 446 aa  459  9.999999999999999e-129  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.530312  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0817  phosphoglucosamine mutase  53.32 
 
 		 456 aa  461  9.999999999999999e-129  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0832094  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2566  phosphoglucosamine mutase  52.23 
 
 		 466 aa  461  9.999999999999999e-129  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.711802  normal  0.813668 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3914  phosphoglucosamine mutase  53.38 
 
 		 450 aa  460  9.999999999999999e-129  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1114  phosphoglucosamine mutase  51.66 
 
 		 448 aa  458  9.999999999999999e-129  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1817  phosphoglucosamine mutase  51.92 
 
 		 449 aa  461  9.999999999999999e-129  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5306  phosphoglucosamine mutase  53.61 
 
 		 446 aa  459  9.999999999999999e-129  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.462537  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0154  phosphoglucosamine mutase  51.88 
 
 		 449 aa  459  9.999999999999999e-129  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3629  phosphoglucosamine mutase  50.67 
 
 		 450 aa  458  9.999999999999999e-129  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.917297  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2973  phosphoglucosamine mutase  51.22 
 
 		 448 aa  458  1e-127  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1307  phosphoglucosamine mutase  51.12 
 
 		 450 aa  457  1e-127  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.537701  normal  0.197279 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3166  phosphoglucosamine mutase  51.03 
 
 		 465 aa  456  1e-127  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1690  phosphoglucosamine mutase  50.45 
 
 		 451 aa  452  1.0000000000000001e-126  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0081  phosphoglucosamine mutase  52.37 
 
 		 445 aa  453  1.0000000000000001e-126  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.494438  normal  0.513534 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5384  phosphoglucosamine mutase  53.12 
 
 		 446 aa  453  1.0000000000000001e-126  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2324  phosphoglucosamine mutase  52.88 
 
 		 449 aa  454  1.0000000000000001e-126  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.4434  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0960  phosphoglucosamine mutase  53.81 
 
 		 444 aa  454  1.0000000000000001e-126  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.381116  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1634  phosphoglucosamine mutase  50.45 
 
 		 451 aa  452  1.0000000000000001e-126  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.428714  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1163  phosphoglucosamine mutase  51.33 
 
 		 449 aa  454  1.0000000000000001e-126  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4549  phosphoglucosamine mutase  52.68 
 
 		 446 aa  454  1.0000000000000001e-126  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.527136  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3067  phosphoglucosamine mutase  52.08 
 
 		 446 aa  451  1e-125  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.19657  normal  0.240811 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1204  phosphoglucosamine mutase  51.99 
 
 		 449 aa  449  1e-125  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4798  phosphoglucosamine mutase  53.27 
 
 		 450 aa  450  1e-125  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.624556  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1224  phosphoglucosamine mutase  50.9 
 
 		 459 aa  451  1e-125  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4337  phosphoglucosamine mutase  52.07 
 
 		 447 aa  449  1e-125  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.163728  normal  0.0707849 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01560  phosphoglucosamine mutase  51.88 
 
 		 449 aa  450  1e-125  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0157  phosphoglucosamine mutase  50.88 
 
 		 448 aa  446  1.0000000000000001e-124  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0158  phosphoglucosamine mutase  50.88 
 
 		 448 aa  446  1.0000000000000001e-124  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0152  phosphoglucosamine mutase  50.88 
 
 		 448 aa  446  1.0000000000000001e-124  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0150  phosphoglucosamine mutase  50.88 
 
 		 448 aa  446  1.0000000000000001e-124  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.160931  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0157  phosphoglucosamine mutase  50.88 
 
 		 448 aa  446  1.0000000000000001e-124  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0201  phosphoglucosamine mutase  50.88 
 
 		 448 aa  446  1.0000000000000001e-124  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2725  phosphoglucosamine mutase  52.93 
 
 		 447 aa  447  1.0000000000000001e-124  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.949023  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0180  phosphoglucosamine mutase  50.88 
 
 		 448 aa  446  1.0000000000000001e-124  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2840  phosphoglucosamine mutase  50.34 
 
 		 455 aa  442  1e-123  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5135  phosphoglucosamine mutase  50.66 
 
 		 448 aa  443  1e-123  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0151  phosphoglucosamine mutase  50.88 
 
 		 448 aa  444  1e-123  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.205668  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0777  phosphoglucosamine mutase  50.79 
 
 		 449 aa  442  1e-123  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0601478 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1847  phosphoglucosamine mutase  51.45 
 
 		 447 aa  439  9.999999999999999e-123  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.310353  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2709  phosphoglucosamine mutase  50.34 
 
 		 455 aa  441  9.999999999999999e-123  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0150  phosphoglucosamine mutase  50.66 
 
 		 448 aa  441  9.999999999999999e-123  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.250899  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0189  phosphoglucosamine mutase  50.44 
 
 		 448 aa  441  9.999999999999999e-123  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.165004  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1398  phosphoglucosamine mutase  51.68 
 
 		 450 aa  439  9.999999999999999e-123  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.033665 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2100  hypothetical protein  51.85 
 
 		 450 aa  436  1e-121  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.0000873821  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3635  phosphoglucosamine mutase  50.8 
 
 		 451 aa  434  1e-120  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0977166 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3449  phosphoglucosamine mutase  49.89 
 
 		 445 aa  434  1e-120  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2888  phosphoglucosamine mutase  51.01 
 
 		 450 aa  433  1e-120  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1504  phosphoglucosamine mutase  50.44 
 
 		 446 aa  433  1e-120  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1438  phosphoglucosamine mutase  50.44 
 
 		 446 aa  433  1e-120  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.628979  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1333  phosphoglucosamine mutase  51.23 
 
 		 450 aa  432  1e-120  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.951592  hitchhiker  0.00110502 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1973  phosphoglucosamine mutase  50.67 
 
 		 451 aa  434  1e-120  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0100286 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3018  phosphoglucosamine mutase  51.01 
 
 		 450 aa  433  1e-120  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0396425 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4495  phosphoglucosamine mutase  47.31 
 
 		 447 aa  430  1e-119  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.235157  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4185  phosphoglucosamine mutase  47.31 
 
 		 447 aa  431  1e-119  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.599163 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0785  phosphoglucosamine mutase  48.67 
 
 		 453 aa  431  1e-119  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000175981 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5469  phosphoglucosamine mutase  48.55 
 
 		 445 aa  430  1e-119  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.296494  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0716  phosphoglucosamine mutase  48.66 
 
 		 446 aa  428  1e-119  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.149315 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>