284 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_2529 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011146  Gbem_2529  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  100 
 
 
210 aa  439  1e-122  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.945859  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1271  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  80.95 
 
 
210 aa  360  9e-99  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1442  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  68.57 
 
 
210 aa  308  5e-83  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3492  azoreductase  48.36 
 
 
212 aa  192  2e-48  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0202  azoreductase  44.13 
 
 
208 aa  184  8e-46  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0196  azoreductase  44.13 
 
 
208 aa  184  8e-46  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0203281  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1642  azoreductase  38.6 
 
 
211 aa  174  6e-43  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  1.15875e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2023  azoreductase  39.44 
 
 
211 aa  174  9e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  2.34094e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2064  azoreductase  38.97 
 
 
211 aa  173  2e-42  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  2.03481e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2351  azoreductase  38.97 
 
 
211 aa  172  4e-42  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  1.7557e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2222  azoreductase  38.97 
 
 
211 aa  171  6e-42  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  1.66234e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3102  azoreductase  38.97 
 
 
211 aa  170  1e-41  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  5.46627e-10  hitchhiker  2.39048e-14 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2085  azoreductase  38.03 
 
 
211 aa  169  3e-41  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  1.56385e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2239  azoreductase  38.03 
 
 
211 aa  169  3e-41  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  2.868e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2269  azoreductase  38.03 
 
 
211 aa  168  4e-41  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  6.07817e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2025  azoreductase  38.03 
 
 
211 aa  168  5e-41  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  1.08402e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2266  azoreductase  38.03 
 
 
211 aa  168  5e-41  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.42446e-33 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0793  flavodoxin family protein  40.95 
 
 
198 aa  148  5e-35  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0777  acyl carrier protein phosphodiesterase  39.52 
 
 
198 aa  142  4e-33  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0988  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  35.71 
 
 
198 aa  137  2e-31  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  1.05649e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0927  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  36.53 
 
 
201 aa  131  8e-30  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5534  azoreductase  36.15 
 
 
208 aa  130  1e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5660  azoreductase  35.68 
 
 
208 aa  130  2e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.883174  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5590  azoreductase  35.68 
 
 
208 aa  130  2e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5505  azoreductase  35.68 
 
 
208 aa  130  2e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0881  Acyl carrier protein phosphodiesterase  46.1 
 
 
161 aa  130  2e-29  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.173079  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5090  azoreductase  35.68 
 
 
208 aa  130  2e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5539  azoreductase  36.15 
 
 
208 aa  130  2e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5262  azoreductase  35.68 
 
 
208 aa  130  2e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000325638  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5204  azoreductase  36.15 
 
 
208 aa  129  3e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5418  azoreductase  36.15 
 
 
208 aa  129  3e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5107  azoreductase  34.27 
 
 
208 aa  126  2e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0384145  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0427  Acyl carrier protein phosphodiesterase  36.67 
 
 
201 aa  125  6e-28  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.319944  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0642  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  33.01 
 
 
213 aa  123  2e-27  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.52382  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1353  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  32.86 
 
 
204 aa  117  2e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.886307  normal  0.112271 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4538  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  32.86 
 
 
199 aa  116  2e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.332795  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4044  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  33.01 
 
 
199 aa  115  5e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.91788 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0519  putative acyl carrier protein phosphodiesterase 1  32.99 
 
 
218 aa  115  7e-25  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0535  flavodoxin family protein  32.99 
 
 
218 aa  114  1e-24  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0871  acyl carrier protein phosphodiesterase 3; NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  36.78 
 
 
213 aa  114  1e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.199319  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1070  hypothetical protein  34.54 
 
 
213 aa  113  2e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3831  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  32.69 
 
 
199 aa  112  3e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.697939 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1432  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  31.79 
 
 
199 aa  111  1e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.243467 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1478  azoreductase  31.31 
 
 
230 aa  110  2e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.237083  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0966  hypothetical protein  33.51 
 
 
220 aa  107  1e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0908  hypothetical protein  33.51 
 
 
220 aa  107  1e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.784167  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19110  Acyl-carrier protein phosphodiesterase  30.54 
 
 
199 aa  107  2e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0334  azoreductase  33.91 
 
 
197 aa  105  5e-22  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.429101  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1298  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  30.92 
 
 
199 aa  104  8e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.352068  normal  0.822829 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1993  azoreductase  30.37 
 
 
208 aa  104  1e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  7.76561e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3430  azoreductase  29.91 
 
 
230 aa  103  2e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  5.41097e-10  hitchhiker  2.34591e-08 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1750  azoreductase  29.91 
 
 
208 aa  103  2e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  1.24715e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1728  azoreductase  29.91 
 
 
208 aa  103  2e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  2.41266e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1914  azoreductase  29.91 
 
 
230 aa  103  2e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000230252  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1770  azoreductase  29.91 
 
 
230 aa  102  4e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  2.43182e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3398  (Acyl-carrier-protein) phosphodiesterase  36.53 
 
 
196 aa  102  4e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.27302  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1908  azoreductase  29.91 
 
 
208 aa  102  4e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  3.51554e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1944  azoreductase  29.91 
 
 
230 aa  102  5e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.49606e-30 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1772  azoreductase  29.44 
 
 
230 aa  100  2e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  1.56707e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22490  acyl carrier protein phosphodiesterase  30.39 
 
 
213 aa  99.4  4e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  8.9212e-06  hitchhiker  7.0742e-06 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0307  azoreductase  33.52 
 
 
197 aa  99.4  4e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000628195  hitchhiker  9.50602e-08 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1209  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  31.22 
 
 
232 aa  98.6  5e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.111385  normal  0.974123 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2289  azoreductase  33.69 
 
 
201 aa  98.2  7e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0626375  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1903  acyl carrier protein phosphodiesterase  29.9 
 
 
213 aa  98.2  8e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3584  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  32.63 
 
 
197 aa  95.5  5e-19  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  3.58393e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2589  azoreductase  33.69 
 
 
201 aa  95.1  7e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1242  (Acyl-carrier-protein) phosphodiesterase  33.15 
 
 
206 aa  93.2  2e-18  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0937956 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3478  azoreductase  29.9 
 
 
197 aa  93.2  3e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3529  azoreductase  33.33 
 
 
197 aa  93.2  3e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  6.8989e-05  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0325  azoreductase  35.17 
 
 
198 aa  92.4  5e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  1.73737e-05  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0324  azoreductase  35.17 
 
 
198 aa  91.7  7e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00233774  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1540  (Acyl-carrier-protein) phosphodiesterase  31.58 
 
 
217 aa  91.7  8e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.422429  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0319  azoreductase  35.17 
 
 
198 aa  91.3  1e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  6.41081e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2596  azoreductase  31.87 
 
 
201 aa  90.5  2e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2541  (Acyl-carrier-protein) phosphodiesterase  32.22 
 
 
213 aa  90.1  2e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0403619  normal  0.0844019 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0423  azoreductase  34.48 
 
 
198 aa  90.5  2e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0320  azoreductase  34.48 
 
 
198 aa  90.1  2e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  1.59762e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2372  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  32.98 
 
 
216 aa  90.5  2e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.96964 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1745  azoreductase  29.61 
 
 
201 aa  90.1  2e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.398442  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3615  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  30.9 
 
 
198 aa  89.7  3e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1062  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  31.16 
 
 
207 aa  89.7  3e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00142617  decreased coverage  2.37921e-06 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02502  azoreductase  30.46 
 
 
213 aa  89.7  3e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003549  FMN-dependent NADH-azoreductase  31.4 
 
 
194 aa  89.7  3e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0316  azoreductase  36.55 
 
 
198 aa  89.7  3e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.001628  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1996  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  31.31 
 
 
203 aa  89.7  3e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.122923  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0699  (Acyl-carrier-protein) phosphodiesterase  30.91 
 
 
209 aa  89.4  4e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.252342 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4396  azoreductase  35.86 
 
 
198 aa  89.4  4e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0500  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  30.9 
 
 
198 aa  89  5e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.918757 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2577  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  30.9 
 
 
198 aa  89  5e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0528  (Acyl-carrier-protein) phosphodiesterase  30.9 
 
 
198 aa  89  5e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1603  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  33 
 
 
204 aa  88.6  6e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0527  acyl carrier protein phosphodiesterase  30.22 
 
 
198 aa  88.6  6e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.153343  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3581  acyl carrier protein phosphodiesterase  30.22 
 
 
198 aa  88.6  6e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.876616  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2866  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  30.34 
 
 
198 aa  88.6  6e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.88818  normal  0.601699 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1427  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  30.92 
 
 
204 aa  88.6  6e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.449993 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0650  FMN-dependent NADH-azoreductase  30.22 
 
 
237 aa  88.6  7e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0946  acyl carrier protein phosphodiesterase  30.22 
 
 
237 aa  88.6  7e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2527  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  28.85 
 
 
202 aa  88.6  7e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.330899  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3589  FMN-dependent NADH-azoreductase  30.22 
 
 
237 aa  88.6  7e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1916  FMN-dependent NADH-azoreductase  30.22 
 
 
237 aa  88.6  7e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>