75 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_2523 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_2523  DSBA oxidoreductase  100 
 
 		 300 aa  619  1e-176  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1273  DSBA oxidoreductase  74.41 
 
 		 303 aa  470  1.0000000000000001e-131  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5215  hypothetical protein  38.46 
 
 		 336 aa  139  7e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00274094  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1561  DSBA oxidoreductase  37.91 
 
 		 305 aa  134  1.9999999999999998e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.0000756973  normal  0.805709 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4159  polyketide biosynthesis dithiol-disulfide isomerase-like protein  30.96 
 
 		 328 aa  129  7.000000000000001e-29  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2391  dithiol-disulfide isomerase  35.1 
 
 		 319 aa  120  1.9999999999999998e-26  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.20777  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0770  hypothetical protein  28.72 
 
 		 297 aa  103  3e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1625  hypothetical protein  28.67 
 
 		 297 aa  95.1  1e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0459  hypothetical protein  29 
 
 		 212 aa  89.7  5e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1278  hypothetical protein  24.16 
 
 		 297 aa  85.1  0.000000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1104  hypothetical protein  24.54 
 
 		 297 aa  85.5  0.000000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4092  hypothetical protein  24.54 
 
 		 297 aa  84.7  0.000000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1208  hypothetical protein  24.16 
 
 		 297 aa  84.7  0.000000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1091  cytosolic protein  24.16 
 
 		 297 aa  84.7  0.000000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.726391  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1097  hypothetical protein  24.16 
 
 		 297 aa  84.7  0.000000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1115  hypothetical protein  24.16 
 
 		 297 aa  84.7  0.000000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1354  hypothetical protein  23.79 
 
 		 297 aa  81.6  0.00000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1316  hypothetical protein  23.79 
 
 		 297 aa  81.6  0.00000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.895011  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1249  hypothetical protein  23.79 
 
 		 297 aa  81.6  0.00000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0910  hypothetical protein  23.42 
 
 		 297 aa  78.2  0.0000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0075  hypothetical protein  27.93 
 
 		 206 aa  77.8  0.0000000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2046  hypothetical protein  26.52 
 
 		 207 aa  76.6  0.0000000000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0174425  normal  0.659871 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1413  hypothetical protein  24.54 
 
 		 209 aa  74.7  0.000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0401797  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0530  hypothetical protein  25.11 
 
 		 208 aa  73.9  0.000000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000790995  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1769  putative protein-disulfide isomerase  24.63 
 
 		 207 aa  73.6  0.000000000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0763119  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3102  protein-disulfide isomerase-like protein  27.75 
 
 		 221 aa  73.2  0.000000000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.967383  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1753  hypothetical protein  25.82 
 
 		 207 aa  72  0.00000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.731876  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4660  hypothetical protein  27.49 
 
 		 212 aa  71.6  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.275495  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53160  hypothetical protein  28.57 
 
 		 200 aa  70.1  0.00000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34850  DSBA oxidoreductase  28 
 
 		 199 aa  69.7  0.00000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3657  DSBA oxidoreductase  28.3 
 
 		 210 aa  69.7  0.00000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.381267 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2644  hypothetical protein  25.39 
 
 		 209 aa  69.7  0.00000000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.25227  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1053  hypothetical protein  30.37 
 
 		 215 aa  68.9  0.0000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4089  hypothetical protein  25.47 
 
 		 211 aa  67.4  0.0000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1735  hypothetical protein  26.89 
 
 		 210 aa  66.6  0.0000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.824558  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002936  thioredoxin  23.12 
 
 		 209 aa  65.5  0.000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000472775  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3955  DSBA oxidoreductase  26.29 
 
 		 210 aa  64.7  0.000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0174672 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0725  DSBA oxidoreductase  24.68 
 
 		 221 aa  63.2  0.000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.246686  normal  0.929424 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1350  DSBA oxidoreductase  26.09 
 
 		 210 aa  62.8  0.000000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1694  DSBA oxidoreductase  27.54 
 
 		 210 aa  62.4  0.000000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.274727 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2762  hypothetical protein  30.52 
 
 		 253 aa  62.4  0.000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.675681  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2712  dithiol-disulfide isomerase  24.3 
 
 		 223 aa  61.2  0.00000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1366  DSBA oxidoreductase  23.11 
 
 		 210 aa  61.2  0.00000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.28938  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0606  putative protein-disulfide isomerase  23.18 
 
 		 238 aa  60.5  0.00000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.872062  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1051  hypothetical protein  23.18 
 
 		 242 aa  59.7  0.00000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0212434  normal  0.0155406 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7778  DSBA oxidoreductase  26.7 
 
 		 215 aa  59.7  0.00000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02994  protein-disulfide isomerase  22.47 
 
 		 198 aa  59.7  0.00000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2050  DSBA oxidoreductase  28.37 
 
 		 225 aa  59.7  0.00000006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0778  hypothetical protein  26.41 
 
 		 221 aa  59.3  0.00000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.544779  normal  0.0154482 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3475  DSBA oxidoreductase  27.01 
 
 		 298 aa  58.5  0.0000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.142082  normal  0.0164028 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2620  thioredoxin domain-containing protein  25.45 
 
 		 259 aa  58.5  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.677226  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0795  DSBA oxidoreductase  23.58 
 
 		 221 aa  57.8  0.0000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0142876  normal  0.0910349 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22500  protein-disulfide isomerase  23.08 
 
 		 244 aa  55.8  0.0000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000773657  hitchhiker  0.0000178225 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0545  hypothetical protein  23.18 
 
 		 200 aa  53.9  0.000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3663  hypothetical protein  29.27 
 
 		 256 aa  52.4  0.000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0807483  normal  0.175109 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0058  hypothetical protein  25.98 
 
 		 233 aa  52  0.00001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4446  hypothetical protein  22.51 
 
 		 208 aa  52.4  0.00001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0048258 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1475  DSBA oxidoreductase  26.29 
 
 		 220 aa  52.4  0.00001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1753  hypothetical protein  23.83 
 
 		 245 aa  52  0.00001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.93705  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3568  hypothetical protein  21.29 
 
 		 213 aa  50.4  0.00003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.149179  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3640  protein-disulfide isomerase  23.61 
 
 		 242 aa  49.7  0.00006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1963  DSBA oxidoreductase  20.99 
 
 		 207 aa  48.1  0.0002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00619259  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3237  DSBA oxidoreductase  22.61 
 
 		 223 aa  46.6  0.0005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0294  hypothetical protein  22.4 
 
 		 222 aa  45.8  0.0009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.413 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2566  polyketide biosynthesis dithiol-disulfide isomerase-like protein  38.81 
 
 		 203 aa  45.4  0.001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.901141  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1321  hypothetical protein  22.8 
 
 		 231 aa  45.8  0.001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0445299  normal  0.563378 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03790  predicted dithiol-disulfide isomerase involved in polyketide biosynthesis  24.52 
 
 		 230 aa  45.4  0.001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.288103  normal  0.160551 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1385  hypothetical protein  22.63 
 
 		 231 aa  45.4  0.001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.147376  normal  0.897973 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1375  DSBA oxidoreductase  23.41 
 
 		 215 aa  44.3  0.002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000103023  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2073  DSBA oxidoreductase  28.78 
 
 		 256 aa  43.9  0.003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.232317  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1444  hypothetical protein  23.68 
 
 		 242 aa  43.9  0.003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8729  putative DsbA-like thioredoxin protein  25 
 
 		 221 aa  43.5  0.004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1759  DSBA oxidoreductase  26.87 
 
 		 199 aa  43.5  0.004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3286  DSBA oxidoreductase  37.1 
 
 		 228 aa  43.5  0.005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0691509  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6744  thioredoxin-like fold  23.22 
 
 		 214 aa  43.1  0.006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>