More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_2501 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011146  Gbem_2501  aldo/keto reductase  100 
 
 
316 aa  639    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1718  aldo/keto reductase  94.62 
 
 
316 aa  590  1e-167  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000512805 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1437  aldo/keto reductase  75 
 
 
316 aa  486  1e-136  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1727  aldo/keto reductase family oxidoreductase  68.67 
 
 
316 aa  428  1e-119  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.349394 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1641  aldo/keto reductase  45.25 
 
 
315 aa  278  9e-74  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.316031  normal  0.116242 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0152  aldo/keto reductase  42.22 
 
 
315 aa  274  1.0000000000000001e-72  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.145765  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1210  aldo/keto reductase  40.57 
 
 
315 aa  271  1e-71  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.607792  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0774  aldo/keto reductase  46.2 
 
 
315 aa  266  2.9999999999999995e-70  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000724112  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0964  aldo/keto reductase  45.11 
 
 
337 aa  266  5e-70  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000631386  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2266  aldo/keto reductase  39.87 
 
 
317 aa  242  7e-63  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000706888 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0914  aldo/keto reductase  39.75 
 
 
316 aa  235  6e-61  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.288271  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3563  aldo/keto reductase  38.17 
 
 
315 aa  223  4e-57  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000709753  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0465  aldo/keto reductase  29.43 
 
 
340 aa  113  5e-24  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1050  aldo/keto reductase  28.1 
 
 
343 aa  111  1.0000000000000001e-23  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.780587  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1370  aldo/keto reductase family oxidoreductase  27.71 
 
 
350 aa  93.6  4e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.778576  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06340  predicted oxidoreductase of aldo/keto reductase family  29.46 
 
 
341 aa  92.8  6e-18  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.964199  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2291  aldo/keto reductase  26.75 
 
 
337 aa  86.7  5e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000272492  hitchhiker  0.000000557849 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1664  aldo/keto reductase  27.59 
 
 
370 aa  82.4  0.000000000000009  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0234  aldo/keto reductase  29.61 
 
 
328 aa  80.5  0.00000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0871019 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1455  aldo/keto reductase  24.91 
 
 
298 aa  80.5  0.00000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2503  aldo/keto reductase  26.32 
 
 
374 aa  79.3  0.00000000000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4932  aldo/keto reductase  29.89 
 
 
270 aa  77.8  0.0000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0486  aldo/keto reductase  30.5 
 
 
270 aa  77  0.0000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.243692  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4981  aldo/keto reductase  29.12 
 
 
270 aa  77.4  0.0000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.480582  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4804  aldo/keto reductase  29.5 
 
 
270 aa  76.3  0.0000000000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.39186  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2503  aldo/keto reductase  28.49 
 
 
328 aa  76.3  0.0000000000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.652399  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3201  putative oxidoreductase  29.07 
 
 
339 aa  75.5  0.000000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.448174  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3940  aldo/keto reductase  29.07 
 
 
339 aa  75.5  0.000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.336434  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0534  aldo/keto reductase  29.12 
 
 
270 aa  74.7  0.000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.043929 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0695  aldo/keto reductase  24.17 
 
 
396 aa  74.3  0.000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.994792  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1815  aldo/keto reductase family oxidoreductase  28.94 
 
 
311 aa  73.9  0.000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.809952  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0763  aldo/keto reductase  25.2 
 
 
400 aa  73.9  0.000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  hitchhiker  0.00000804851 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3350  aldo/keto reductase  23.45 
 
 
398 aa  73.9  0.000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.343434  normal  0.051891 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0146  aldo/keto reductase  29.78 
 
 
327 aa  73.9  0.000000000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.743062 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5727  hypothetical protein  29.89 
 
 
270 aa  73.6  0.000000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0276  aldo/keto reductase  24.66 
 
 
397 aa  73.2  0.000000000005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.874141  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4981  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  28.96 
 
 
271 aa  73.2  0.000000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2005  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  28.09 
 
 
311 aa  72.8  0.000000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0745  aldo/keto reductase  23.54 
 
 
409 aa  73.2  0.000000000006  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1767  aldo/keto reductase  30.45 
 
 
329 aa  72.8  0.000000000007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.883175  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0539  aldo/keto reductase  33.33 
 
 
271 aa  72.8  0.000000000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1866  aldo/keto reductase  29.95 
 
 
311 aa  72.4  0.000000000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2080  aldo/keto reductase family oxidoreductase  28.7 
 
 
311 aa  72  0.00000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.0058504  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1861  aldo/keto reductase family oxidoreductase  28.51 
 
 
311 aa  72  0.00000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.474884  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1831  aldo/keto reductase family oxidoreductase  28.51 
 
 
311 aa  72.4  0.00000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2003  aldo/keto reductase family oxidoreductase  28.51 
 
 
311 aa  72  0.00000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.53794  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1210  aldo/keto reductase  22.37 
 
 
409 aa  71.6  0.00000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.97605  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2037  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  28.51 
 
 
311 aa  72  0.00000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.1767399999999999e-20 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5332  aldo/keto reductase  30.65 
 
 
291 aa  72  0.00000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.277831  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1762  aldo/keto reductase  30.43 
 
 
327 aa  71.6  0.00000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.795834  normal  0.385791 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0236  aldo/keto reductase  24.18 
 
 
376 aa  72.4  0.00000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.062444  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4165  lolS protein  29.19 
 
 
304 aa  71.6  0.00000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4005  lolS protein  28.65 
 
 
304 aa  71.2  0.00000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.149867  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3838  aldo/keto reductase family oxidoreductase  28.65 
 
 
304 aa  71.2  0.00000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3852  aldo/keto reductase family oxidoreductase  28.65 
 
 
304 aa  71.2  0.00000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.95974  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4318  oxidoreductase  28.65 
 
 
304 aa  71.2  0.00000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1623  aldo/keto reductase  24.93 
 
 
399 aa  71.2  0.00000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.34672  normal  0.190024 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2116  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  28.26 
 
 
311 aa  70.9  0.00000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.638189  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0361  aldo/keto reductase  31.21 
 
 
306 aa  71.2  0.00000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4120  lolS protein  28.65 
 
 
304 aa  71.2  0.00000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000109156 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3304  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  27.23 
 
 
311 aa  70.9  0.00000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00236042 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2047  aldo/keto reductase  35.67 
 
 
329 aa  70.9  0.00000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.128714  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3927  aldo/keto reductase  27.57 
 
 
304 aa  70.9  0.00000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.185405  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1733  aldo/keto reductase family oxidoreductase  25.91 
 
 
382 aa  70.1  0.00000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.410484  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1775  aldo/keto reductase  31.67 
 
 
314 aa  70.5  0.00000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000121824  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2410  aldo/keto reductase  31.32 
 
 
331 aa  69.7  0.00000000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0936644  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1826  aldo/keto reductase  30.56 
 
 
329 aa  70.1  0.00000000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1798  aldo/keto reductase  30.17 
 
 
333 aa  70.1  0.00000000005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000356157  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2639  aldo/keto reductase  27.74 
 
 
400 aa  69.7  0.00000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.258498  normal  0.182592 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3100  aldo/keto reductase  28.65 
 
 
319 aa  69.7  0.00000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.124867  normal  0.776601 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3061  aldo/keto reductase  27.35 
 
 
371 aa  69.3  0.00000000008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000337761  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6739  aldo/keto reductase  28.98 
 
 
331 aa  68.9  0.00000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1184  aldo/keto reductase  28.33 
 
 
329 aa  68.9  0.00000000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6241  aldo/keto reductase  30.58 
 
 
327 aa  68.6  0.0000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0885  aldo/keto reductase  28.51 
 
 
341 aa  68.6  0.0000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04990  predicted oxidoreductase of aldo/keto reductase family  25.97 
 
 
364 aa  68.6  0.0000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1049  aldo/keto reductase  29.3 
 
 
323 aa  68.9  0.0000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44630  Aldo/keto reductase family protein  27.03 
 
 
272 aa  68.9  0.0000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0940461  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1923  aldo/keto reductase  26.92 
 
 
312 aa  68.6  0.0000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.226373  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0625  aldo/keto reductase  22.1 
 
 
377 aa  68.9  0.0000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0356812  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2306  aldo/keto reductase  24.51 
 
 
365 aa  68.6  0.0000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1031  lolS protein  28.11 
 
 
304 aa  68.9  0.0000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1743  aldo/keto reductase  28.88 
 
 
334 aa  68.9  0.0000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00138583  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1286  aldo/keto reductase  27.6 
 
 
410 aa  68.2  0.0000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0119891  decreased coverage  0.00591823 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3819  aldo/keto reductase  29.33 
 
 
326 aa  67.8  0.0000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6932  aldo/keto reductase  28.57 
 
 
345 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.933917  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2271  aldo/keto reductase  31.25 
 
 
329 aa  68.6  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0397783  normal  0.307626 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2264  aldo/keto reductase  29.57 
 
 
306 aa  68.2  0.0000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66010  hypothetical protein  31.03 
 
 
270 aa  67.4  0.0000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0637322  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1902  aldo/keto reductase family oxidoreductase  29.57 
 
 
329 aa  67  0.0000000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00458886 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3336  aldo/keto reductase  28.76 
 
 
326 aa  67  0.0000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1522  aldo/keto reductase  28.1 
 
 
285 aa  67  0.0000000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2999  aldo/keto reductase family oxidoreductase  29.57 
 
 
329 aa  67  0.0000000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2573  aldo/keto reductase  28.82 
 
 
337 aa  67  0.0000000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.129048  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3076  aldo/keto reductase  29.57 
 
 
329 aa  67  0.0000000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.545769  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1483  aldo/keto reductase  28.1 
 
 
285 aa  67  0.0000000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000333106  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2855  aldo/keto reductase  34.32 
 
 
327 aa  66.6  0.0000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.113356  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1226  aldo/keto reductase  23.2 
 
 
408 aa  66.6  0.0000000006  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1321  aldo/keto reductase  29.24 
 
 
326 aa  66.2  0.0000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.446153 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0615  aldo/keto reductase  35 
 
 
270 aa  66.6  0.0000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>