More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_2483 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_2483  PfkB domain protein  100 
 
 		 302 aa  602  1.0000000000000001e-171  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1736  PfkB domain protein  88.74 
 
 		 304 aa  538  9.999999999999999e-153  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2817  PfkB domain protein  38.54 
 
 		 295 aa  163  3e-39  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.575722  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0692  carbohydrate kinase  35.96 
 
 		 304 aa  147  2.0000000000000003e-34  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.19709  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2334  PfkB domain protein  32.08 
 
 		 314 aa  134  1.9999999999999998e-30  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0161012  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2812  PfkB  36.03 
 
 		 321 aa  134  3e-30  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1649  ribokinase-like domain-containing protein  33.44 
 
 		 308 aa  128  1.0000000000000001e-28  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0416676  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2838  putative sugar kinase  29.39 
 
 		 299 aa  127  3e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1648  PfkB  28.9 
 
 		 297 aa  122  9.999999999999999e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.46421  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0389  PfkB  30.24 
 
 		 323 aa  120  3e-26  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.211683  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3654  PfkB  28.29 
 
 		 300 aa  119  3.9999999999999996e-26  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.349862 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3386  ribokinase-like domain-containing protein  33 
 
 		 298 aa  119  7.999999999999999e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.139536 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1805  PfkB  27.63 
 
 		 318 aa  116  3.9999999999999997e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.512756  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4268  PfkB family kinase  34.64 
 
 		 298 aa  115  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4302  PfkB domain protein  27.3 
 
 		 297 aa  113  4.0000000000000004e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03768  predicted sugar kinase  34.31 
 
 		 298 aa  113  4.0000000000000004e-24  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4103  PfkB domain protein  34.31 
 
 		 298 aa  113  4.0000000000000004e-24  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4406  PfkB family kinase  34.31 
 
 		 298 aa  113  4.0000000000000004e-24  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03717  hypothetical protein  34.31 
 
 		 298 aa  113  4.0000000000000004e-24  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.953641  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4169  ribokinase-like domain-containing protein  31.44 
 
 		 320 aa  111  1.0000000000000001e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5330  kinase, PfkB family  34.31 
 
 		 298 aa  111  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.574224 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4257  kinase, PfkB family  33.66 
 
 		 298 aa  110  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4235  kinase, PfkB family  33.66 
 
 		 298 aa  110  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.907464  normal  0.927219 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4348  kinase, PfkB family  33.66 
 
 		 298 aa  110  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.603923  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4302  kinase PfkB family  33.66 
 
 		 298 aa  110  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4413  PfkB family kinase  33.66 
 
 		 298 aa  110  3e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0354  ribokinase  31.85 
 
 		 308 aa  109  7.000000000000001e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0970  carbohydrate kinase  32.89 
 
 		 314 aa  108  2e-22  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0149  PfkB  30.86 
 
 		 407 aa  107  2e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.029935  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5895  sugar kinase, putative  33.56 
 
 		 304 aa  105  1e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.760771  normal  0.0122717 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3407  ribokinase  29.43 
 
 		 424 aa  101  1e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1117  ribokinase-like domain-containing protein  30.26 
 
 		 305 aa  102  1e-20  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.145837 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1119  ribokinase-like domain-containing protein  27.24 
 
 		 322 aa  101  2e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2370  putative sugar kinase  32.27 
 
 		 316 aa  101  2e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.976267  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1030  ribokinase-like domain-containing protein  32.27 
 
 		 316 aa  100  2e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.791095 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3688  PfkB domain protein  30.41 
 
 		 317 aa  100  4e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1366  ribokinase-like domain-containing protein  27.88 
 
 		 320 aa  99.8  5e-20  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2283  ribokinase  29.9 
 
 		 310 aa  98.6  1e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.269259 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0344  ribokinase  30.62 
 
 		 308 aa  98.6  1e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4140  ribokinase-like domain-containing protein  31.56 
 
 		 298 aa  97.4  2e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.682006  normal  0.581205 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4103  PfkB family kinase  31.56 
 
 		 298 aa  97.4  2e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1789  ribokinase  30.67 
 
 		 297 aa  97.4  3e-19  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000225274  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1728  PfkB  28.48 
 
 		 645 aa  96.7  4e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.371371  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0082  myo-inositol catabolism protein IolC  26.67 
 
 		 338 aa  96.7  4e-19  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0275  PfkB domain-containing protein  32.15 
 
 		 312 aa  97.1  4e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05691  carbohydrate kinase  25.91 
 
 		 338 aa  96.7  4e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0990225  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4087  PfkB domain protein  28.16 
 
 		 330 aa  96.7  5e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4349  kinase, PfkB family  31.56 
 
 		 298 aa  96.3  5e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1094  ribokinase-like domain-containing protein  32.68 
 
 		 296 aa  96.7  5e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.495819  normal  0.168418 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4160  ribokinase  30.52 
 
 		 310 aa  95.9  7e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.233177 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05321  carbohydrate kinase  25.23 
 
 		 333 aa  95.9  7e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0559209  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1838  carbohydrate kinase  25.68 
 
 		 335 aa  95.9  8e-19  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4407  PfkB domain protein  27.85 
 
 		 330 aa  95.9  8e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04580  Ribokinase  28.01 
 
 		 306 aa  95.9  8e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05631  carbohydrate kinase  25.6 
 
 		 335 aa  95.9  8e-19  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.577343 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4464  aminoimidazole riboside kinase  30.13 
 
 		 319 aa  95.1  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.680577  normal  1 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_4029  carbohydrate kinase, PfkB  32.12 
 
 		 299 aa  95.1  1e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4209  ribokinase  29.49 
 
 		 308 aa  94.7  2e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.847437  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0008  ribokinase  29.49 
 
 		 308 aa  94  2e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000914124  normal  0.985734 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0008  ribokinase  29.49 
 
 		 308 aa  94  2e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0252287  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3350  hypothetical protein  31.68 
 
 		 315 aa  94.7  2e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.373497 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0558  PfkB domain protein  28.42 
 
 		 295 aa  94  3e-18  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2413  PfkB domain protein  28.7 
 
 		 642 aa  94  3e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1214  ribokinase-like domain-containing protein  30.77 
 
 		 329 aa  94  3e-18  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0041  ribokinase-like domain-containing protein  29.14 
 
 		 304 aa  94  3e-18  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4283  aminoimidazole riboside kinase  29.8 
 
 		 319 aa  92.8  7e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4655  ribokinase  32.68 
 
 		 319 aa  92.4  8e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.128299  normal  0.557505 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0220  ribokinase  31.49 
 
 		 305 aa  92  9e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.328501  normal  0.180212 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1228  ribokinase-like domain-containing protein  31.5 
 
 		 337 aa  91.7  1e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2720  PfkB domain protein  31.54 
 
 		 313 aa  92  1e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06142  ribokinase  30.35 
 
 		 305 aa  91.7  2e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2306  PfkB family kinase  28.38 
 
 		 319 aa  90.9  2e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1124  ribokinase  27.18 
 
 		 403 aa  90.9  2e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0982  PfkB domain protein  27.3 
 
 		 644 aa  90.9  2e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0007  ribokinase  29.49 
 
 		 306 aa  91.3  2e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.328015  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2407  ribokinase-like domain-containing protein  28.38 
 
 		 319 aa  91.3  2e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05621  carbohydrate kinase  24.84 
 
 		 333 aa  90.9  2e-17  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1960  ribokinase  31.83 
 
 		 302 aa  90.5  3e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0122509  normal  0.0586965 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4395  aminoimidazole riboside kinase  29.8 
 
 		 319 aa  90.9  3e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0902  PfkB domain protein  29.74 
 
 		 309 aa  90.5  3e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3378  ribokinase-like domain-containing protein  27.67 
 
 		 330 aa  90.1  4e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.463525  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5091  PfkB  28.3 
 
 		 309 aa  90.1  4e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.170499  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0576  putative ribokinase  30.52 
 
 		 312 aa  90.1  4e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.588326 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1135  PfkB domain protein  27.79 
 
 		 644 aa  90.1  4e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.488845 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0569  PfkB domain protein  30.27 
 
 		 295 aa  89.7  5e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0316  pfkB family carbohydrate kinase  25.63 
 
 		 330 aa  89.7  5e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.930013  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1940  PfkB  25 
 
 		 294 aa  89.7  5e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.123547  normal  0.0238447 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4397  aminoimidazole riboside kinase  29.8 
 
 		 319 aa  89.7  6e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000338  ribokinase  30.87 
 
 		 305 aa  89.4  6e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2588  PfkB domain-containing protein  34.05 
 
 		 311 aa  89.4  8e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.02383  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3562  ribokinase-like domain-containing protein  26.11 
 
 		 655 aa  89  1e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.249096 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0506  carbohydrate kinase-like  25 
 
 		 334 aa  88.6  1e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0253  ribokinase  27.83 
 
 		 304 aa  88.2  1e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18220  Fructokinase  26.67 
 
 		 320 aa  88.6  1e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.749798  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0259  ribokinase  27.83 
 
 		 304 aa  88.2  1e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0169  carbohydrate kinase  26.03 
 
 		 330 aa  87.8  2e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19960  PfkB domain protein  28.04 
 
 		 323 aa  87.4  2e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0162  carbohydrate kinase  26.03 
 
 		 330 aa  87.8  2e-16  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.98466  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4122  PfkB  27.19 
 
 		 320 aa  87.4  2e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1402  ribokinase  31.67 
 
 		 318 aa  88.2  2e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0972031 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>