More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_2460 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010814  Glov_2492  penicillin-binding protein 2  62.37 
 
 
640 aa  766  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.86643  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2079  penicillin-binding protein 2  65.21 
 
 
639 aa  857  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1757  penicillin-binding protein 2  93.97 
 
 
647 aa  1236  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.777001 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2858  peptidoglycan glycosyltransferase  71.62 
 
 
636 aa  939  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2460  penicillin-binding protein 2  100 
 
 
645 aa  1326  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2545  peptidoglycan glycosyltransferase  66.33 
 
 
642 aa  832  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0928  peptidoglycan glycosyltransferase  65.46 
 
 
643 aa  882  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0142765  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1046  cell division protein FtsI  45.1 
 
 
619 aa  525  1e-147  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.276341  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0595  peptidoglycan glycosyltransferase  41.24 
 
 
634 aa  490  1e-137  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  7.85776e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2589  peptidoglycan glycosyltransferase  41.95 
 
 
646 aa  465  1e-129  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.916091  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3359  penicillin-binding protein 2  40.38 
 
 
597 aa  447  1e-124  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.20797  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1415  peptidoglycan glycosyltransferase  39.82 
 
 
609 aa  442  1e-122  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.55122  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2494  peptidoglycan glycosyltransferase  38.44 
 
 
645 aa  429  1e-119  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1465  peptidoglycan glycosyltransferase  38.51 
 
 
691 aa  413  1e-114  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.714694  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0113  peptidoglycan glycosyltransferase  37.21 
 
 
636 aa  408  1e-112  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2823  penicillin-binding protein 2  35.22 
 
 
755 aa  405  1e-112  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.774814 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0317  peptidoglycan glycosyltransferase  36.7 
 
 
646 aa  397  1e-109  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4970  peptidoglycan glycosyltransferase  37.25 
 
 
631 aa  399  1e-109  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.474352 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2219  penicillin-binding protein 2  37.07 
 
 
600 aa  398  1e-109  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0263  peptidoglycan glycosyltransferase  36.79 
 
 
630 aa  399  1e-109  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3336  penicillin-binding protein 2  35.97 
 
 
661 aa  393  1e-108  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.101534  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4682  peptidoglycan glycosyltransferase  36.55 
 
 
629 aa  389  1e-107  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3920  peptidoglycan glycosyltransferase  37.94 
 
 
673 aa  392  1e-107  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3798  peptidoglycan glycosyltransferase  36.91 
 
 
630 aa  392  1e-107  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.624413  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0709  penicillin-binding protein 2  36.64 
 
 
640 aa  390  1e-107  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0080  peptidoglycan glycosyltransferase  35.59 
 
 
703 aa  391  1e-107  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.313327 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2326  peptidoglycan glycosyltransferase  38.46 
 
 
648 aa  389  1e-107  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.267693  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0614  penicillin-binding protein 2  36.55 
 
 
629 aa  389  1e-107  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4807  penicillin-binding protein 2  36.55 
 
 
629 aa  390  1e-107  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0974911 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1000  peptidoglycan glycosyltransferase  38.46 
 
 
648 aa  389  1e-107  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0103  penicillin-binding protein 2  37.37 
 
 
611 aa  391  1e-107  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4860  penicillin-binding protein 2  36.55 
 
 
629 aa  390  1e-107  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.493297  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0172  peptidoglycan glycosyltransferase  38.53 
 
 
630 aa  387  1e-106  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.82525  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4825  penicillin-binding protein  37.85 
 
 
631 aa  388  1e-106  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.436079  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2711  Peptidoglycan glycosyltransferase  36.91 
 
 
618 aa  389  1e-106  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.307804  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1603  peptidoglycan glycosyltransferase  37.79 
 
 
648 aa  388  1e-106  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1106  penicillin-binding protein 2  37.15 
 
 
646 aa  383  1e-105  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.906879  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1974  penicillin-binding protein 2  36.22 
 
 
626 aa  383  1e-105  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2545  peptidoglycan glycosyltransferase  34.82 
 
 
658 aa  384  1e-105  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0470  peptidoglycan glycosyltransferase  35.78 
 
 
648 aa  380  1e-104  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4365  peptidoglycan glycosyltransferase  37.33 
 
 
631 aa  380  1e-104  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.710659  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1560  peptidoglycan glycosyltransferase  35.21 
 
 
643 aa  380  1e-104  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0321  peptidoglycan glycosyltransferase  34.04 
 
 
637 aa  380  1e-104  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.277376  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1008  peptidoglycan glycosyltransferase  36.4 
 
 
640 aa  379  1e-104  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1401  penicillin-binding protein 2  35.84 
 
 
574 aa  381  1e-104  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00257822  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0062  substrate-binding transmembrane protein  36.44 
 
 
801 aa  381  1e-104  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.559785  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3903  peptidoglycan glycosyltransferase  36.58 
 
 
630 aa  380  1e-104  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1607  peptidoglycan glycosyltransferase  36.29 
 
 
650 aa  378  1e-103  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.188503  normal  0.818335 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0473  peptidoglycan glycosyltransferase  35.86 
 
 
681 aa  379  1e-103  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1805  penicillin-binding protein 2  37.82 
 
 
610 aa  378  1e-103  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3060  penicillin-binding protein 2  35.63 
 
 
630 aa  376  1e-103  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.569181  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12060  penicillin-binding protein 2  36.81 
 
 
646 aa  378  1e-103  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0239  penicillin-binding protein 2  37.01 
 
 
681 aa  373  1e-102  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.289832  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2509  penicillin-binding protein  36.07 
 
 
629 aa  372  1e-102  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.741152  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0286  penicillin-binding protein 2  37.42 
 
 
655 aa  373  1e-102  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.54247  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0699  peptidoglycan glycosyltransferase  34.9 
 
 
618 aa  373  1e-102  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00364586  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2482  peptidoglycan glycosyltransferase  35.14 
 
 
628 aa  374  1e-102  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.266047 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08390  Peptidoglycan glycosyltransferase  37.21 
 
 
640 aa  375  1e-102  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.630549  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2313  peptidoglycan glycosyltransferase  36.05 
 
 
629 aa  370  1e-101  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.124317  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1370  peptidoglycan glycosyltransferase  38.04 
 
 
808 aa  371  1e-101  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0776138  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2187  peptidoglycan glycosyltransferase  37.54 
 
 
595 aa  371  1e-101  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2022  peptidoglycan glycosyltransferase  35.89 
 
 
667 aa  371  1e-101  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.238074  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0993  peptidoglycan glycosyltransferase  33.62 
 
 
602 aa  371  1e-101  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.223837  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2014  peptidoglycan glycosyltransferase  36.7 
 
 
624 aa  372  1e-101  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.327783  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3741  penicillin-binding protein 2  35.89 
 
 
631 aa  370  1e-101  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2024  peptidoglycan glycosyltransferase  36.55 
 
 
635 aa  370  1e-101  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0252806  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3648  peptidoglycan glycosyltransferase  37.14 
 
 
649 aa  372  1e-101  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.0783266 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0800  peptidoglycan glycosyltransferase  35.59 
 
 
678 aa  369  1e-101  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0101369  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2588  peptidoglycan glycosyltransferase  34.56 
 
 
610 aa  369  1e-100  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0301777  normal  0.34105 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1326  penicillin-binding protein 2  34.65 
 
 
617 aa  367  1e-100  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1092  penicillin-binding protein 2  33.78 
 
 
618 aa  367  1e-100  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000952492  hitchhiker  1.09983e-07 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0167  putative penicillin-binding protein  35.62 
 
 
803 aa  367  1e-100  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.900799  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3275  peptidoglycan glycosyltransferase  33.78 
 
 
618 aa  367  1e-100  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  2.07443e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3687  penicillin-binding protein 2  35.08 
 
 
801 aa  366  1e-100  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.955324  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0176  peptidoglycan glycosyltransferase  34.9 
 
 
683 aa  368  1e-100  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1271  penicillin-binding protein 2  35.61 
 
 
627 aa  369  1e-100  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0178  putative penicillin-binding protein  35.62 
 
 
809 aa  367  1e-100  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0363  penicillin-binding protein 2  35.62 
 
 
803 aa  367  1e-100  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3341  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase / peptidoglycan glycosyltransferase  35.5 
 
 
619 aa  366  1e-100  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.198786  normal  0.0253146 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3453  peptidoglycan glycosyltransferase  33.78 
 
 
618 aa  367  1e-100  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00243084  hitchhiker  0.00384932 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3317  peptidoglycan glycosyltransferase  33.78 
 
 
618 aa  367  1e-100  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  1.42864e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0049  penicillin-binding protein 2  35.23 
 
 
800 aa  368  1e-100  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0161  penicillin-binding protein 2  34.85 
 
 
640 aa  366  1e-100  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.806413  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3364  penicillin-binding protein 2  34.92 
 
 
801 aa  366  1e-100  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2165  penicillin-binding protein 2  35.56 
 
 
655 aa  365  1e-99  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.574544 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1357  penicillin-binding protein 2  36.81 
 
 
684 aa  364  2e-99  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.723027  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1454  penicillin-binding protein 2  36.81 
 
 
684 aa  365  2e-99  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14210  Peptidoglycan glycosyltransferase  33.92 
 
 
671 aa  364  3e-99  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  1.18475e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0501  penicillin-binding protein 2  35.05 
 
 
679 aa  363  4e-99  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0109803 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2291  penicillin-binding protein 2  35.62 
 
 
802 aa  363  4e-99  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.396249  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2788  penicillin-binding protein 2  35.62 
 
 
802 aa  363  4e-99  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1170  penicillin-binding protein 2  34.89 
 
 
633 aa  363  4e-99  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.117814  normal  0.171214 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3110  penicillin-binding protein 2  35.5 
 
 
775 aa  363  4e-99  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2371  penicillin-binding protein 2  35.62 
 
 
802 aa  363  4e-99  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.4187  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0159  penicillin-binding protein 2  35.62 
 
 
802 aa  363  4e-99  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.799571  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0995  peptidoglycan glycosyltransferase  33.28 
 
 
618 aa  363  4e-99  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  9.00115e-07  normal  0.206093 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1329  penicillin-binding protein 2  34.13 
 
 
617 aa  363  5e-99  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0225  peptidoglycan glycosyltransferase  36.43 
 
 
691 aa  363  5e-99  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.466269  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1056  peptidoglycan glycosyltransferase  33.28 
 
 
618 aa  363  5e-99  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0906078  hitchhiker  0.0072323 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0991  peptidoglycan glycosyltransferase  33.28 
 
 
618 aa  363  5e-99  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  5.94498e-05  normal  0.0491088 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>