227 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_2398 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



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Organism name
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Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_2398  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  100 
 
 		 344 aa  699    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.723604  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1821  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  94.48 
 
 		 344 aa  657    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00597572 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1840  L-lysine 2,3-aminomutase  66.28 
 
 		 344 aa  459  9.999999999999999e-129  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000138489  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1754  L-lysine 2,3-aminomutase  64.91 
 
 		 353 aa  447  1.0000000000000001e-124  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.117521  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2149  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  65.99 
 
 		 347 aa  439  9.999999999999999e-123  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000218503  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2520  hypothetical protein  59.3 
 
 		 347 aa  411  1e-114  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.707016  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2103  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  59.76 
 
 		 341 aa  392  1e-108  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1765  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  61.51 
 
 		 346 aa  392  1e-108  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.930699  n/a   
 
 
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NC_008554  Sfum_4018  radical SAM domain-containing protein  51.47 
 
 		 360 aa  338  7e-92  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.288086 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0215  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  51.94 
 
 		 437 aa  335  1e-90  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0802  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  49.01 
 
 		 437 aa  333  3e-90  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0696  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  47.88 
 
 		 440 aa  332  5e-90  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  unclonable  0.000000000415374  normal  0.0401463 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2886  L-lysine 2,3-aminomutase  49.44 
 
 		 416 aa  331  1e-89  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.623873 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2513  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  53.94 
 
 		 358 aa  331  1e-89  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1079  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  48.88 
 
 		 440 aa  330  3e-89  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1576  hypothetical protein  48.73 
 
 		 438 aa  328  7e-89  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.0162039 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1649  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  49.01 
 
 		 437 aa  326  3e-88  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.641353 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1401  hypothetical protein  48.46 
 
 		 457 aa  326  3e-88  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.536513  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0240  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  48.16 
 
 		 437 aa  325  8.000000000000001e-88  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1886  L-lysine 2,3-aminomutase  48.88 
 
 		 420 aa  325  1e-87  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.185712 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0600  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  48.42 
 
 		 427 aa  324  1e-87  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0133  L-lysine 2,3-aminomutase  47.19 
 
 		 730 aa  324  1e-87  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2548  L-lysine 2,3-aminomutase  50.43 
 
 		 375 aa  323  2e-87  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0274  L-lysine 2,3-aminomutase  48.61 
 
 		 435 aa  322  6e-87  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0189  L-lysine 2,3-aminomutase  47.32 
 
 		 454 aa  322  7e-87  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0207  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  47.59 
 
 		 422 aa  321  9.000000000000001e-87  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1315  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  49.43 
 
 		 413 aa  321  9.999999999999999e-87  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.603808  normal  1 
 
 
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NC_002936  DET0221  GNAT family L-lysine 2,3-aminomutase/acetyltransferase  47.21 
 
 		 708 aa  320  1.9999999999999998e-86  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.893806  n/a   
 
 
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NC_009943  Dole_1893  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  47.01 
 
 		 454 aa  320  1.9999999999999998e-86  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.836798  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0211  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  48.17 
 
 		 437 aa  320  1.9999999999999998e-86  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0711  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  48.86 
 
 		 460 aa  320  1.9999999999999998e-86  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.62516  normal  1 
 
 
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NC_013552  DhcVS_197  L-lysine 2,3-aminomutase/beta-lysine acetyltransferase, GNAT family  46.93 
 
 		 730 aa  320  1.9999999999999998e-86  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1301  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  49.86 
 
 		 415 aa  319  3.9999999999999996e-86  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.156548  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1402  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  49.86 
 
 		 415 aa  319  3.9999999999999996e-86  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.522319  n/a   
 
 
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NC_009616  Tmel_0192  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  47.31 
 
 		 423 aa  319  5e-86  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.863108  n/a   
 
 
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NC_010424  Daud_0171  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  52.86 
 
 		 420 aa  318  7e-86  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1223  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  46.74 
 
 		 433 aa  318  9e-86  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1070  L-lysine 2,3-aminomutase  48.57 
 
 		 416 aa  318  1e-85  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.628059 
 
 
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NC_009637  MmarC7_0106  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  46.88 
 
 		 433 aa  317  2e-85  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.928991  normal  0.154212 
 
 
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NC_009253  Dred_0740  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  49.29 
 
 		 406 aa  316  4e-85  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009135  MmarC5_0666  L-lysine 2,3-aminomutase  48.34 
 
 		 433 aa  315  7e-85  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0598217  n/a   
 
 
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NC_013385  Adeg_1408  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  51.56 
 
 		 427 aa  315  8e-85  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008025  Dgeo_0988  hypothetical protein  48.87 
 
 		 483 aa  314  1.9999999999999998e-84  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.709939  normal  0.113697 
 
 
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NC_009975  MmarC6_1795  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  49.69 
 
 		 433 aa  313  2.9999999999999996e-84  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008942  Mlab_0345  L-lysine 2,3-aminomutase  45.92 
 
 		 453 aa  312  4.999999999999999e-84  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.0000388257  normal  1 
 
 
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NC_010003  Pmob_1080  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  46.02 
 
 		 436 aa  311  1e-83  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013501  Rmar_0136  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  51.52 
 
 		 396 aa  310  2e-83  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.192198  n/a   
 
 
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NC_013552  DhcVS_569  lysine 2,3-aminomutase  47.56 
 
 		 439 aa  309  4e-83  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_012034  Athe_2274  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  46.51 
 
 		 407 aa  308  6.999999999999999e-83  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010001  Cphy_1643  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  46.57 
 
 		 393 aa  307  2.0000000000000002e-82  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013173  Dbac_1776  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  47.26 
 
 		 411 aa  306  3e-82  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0350095  n/a   
 
 
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NC_011772  BCG9842_B3042  L-lysine 2,3-aminomutase  46.57 
 
 		 473 aa  306  5.0000000000000004e-82  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.137592  normal  1 
 
 
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NC_003909  BCE_2334  L-lysine 2,3-aminomutase  46.57 
 
 		 473 aa  305  7e-82  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011773  BCAH820_2325  L-lysine 2,3-aminomutase  46.57 
 
 		 473 aa  305  8.000000000000001e-82  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
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NC_005945  BAS2145  L-lysine 2,3-aminomutase  46.57 
 
 		 473 aa  305  8.000000000000001e-82  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_005957  BT9727_2083  lysine 2,3-aminomutase  46.57 
 
 		 473 aa  305  8.000000000000001e-82  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_006274  BCZK2079  lysine 2,3-aminomutase  46.57 
 
 		 473 aa  305  8.000000000000001e-82  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.492987  n/a   
 
 
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NC_007530  GBAA_2300  L-lysine 2,3-aminomutase  46.57 
 
 		 473 aa  305  8.000000000000001e-82  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011658  BCAH187_A2408  L-lysine 2,3-aminomutase  46.57 
 
 		 473 aa  305  8.000000000000001e-82  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.481514  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0628  radical SAM domain-containing protein  46.7 
 
 		 439 aa  305  1.0000000000000001e-81  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00861881  n/a   
 
 
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NC_011725  BCB4264_A2281  L-lysine 2,3-aminomutase  46.57 
 
 		 473 aa  305  1.0000000000000001e-81  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1916  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  46.74 
 
 		 403 aa  304  1.0000000000000001e-81  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0601  L-lysine 2,3-aminomutase  46.7 
 
 		 439 aa  304  1.0000000000000001e-81  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2118  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  46.59 
 
 		 472 aa  303  3.0000000000000004e-81  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.284772  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0670  L-lysine 2,3-aminomutase  48.01 
 
 		 414 aa  302  5.000000000000001e-81  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.420719 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1688  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  46.31 
 
 		 472 aa  301  1e-80  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.157129  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3041  L-lysine 2,3-aminomutase  46.49 
 
 		 527 aa  300  2e-80  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0099  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  47.99 
 
 		 365 aa  295  6e-79  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.521426  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3939  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  47.59 
 
 		 419 aa  295  7e-79  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0153502  normal  0.0100362 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0457  L-lysine 2,3-aminomutase  48.12 
 
 		 415 aa  295  9e-79  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0632034  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2148  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  45.82 
 
 		 422 aa  294  2e-78  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011830  Dhaf_1337  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  47.68 
 
 		 413 aa  293  4e-78  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0608146  n/a   
 
 
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NC_010424  Daud_1068  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  47.81 
 
 		 419 aa  291  1e-77  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000489798  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0599  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  45.22 
 
 		 432 aa  288  1e-76  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1121  lysine 2,3-aminomutase  45.82 
 
 		 422 aa  285  1.0000000000000001e-75  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2931  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  44.16 
 
 		 408 aa  283  3.0000000000000004e-75  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000971208  normal  0.769663 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1768  L-lysine 2,3-aminomutase  40.17 
 
 		 412 aa  278  9e-74  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.303353 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1302  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  42.7 
 
 		 402 aa  272  6e-72  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.188876  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3908  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  44.55 
 
 		 362 aa  272  7e-72  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.935392 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1316  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  41.26 
 
 		 385 aa  268  7e-71  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.246389  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4126  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  46.01 
 
 		 350 aa  268  8e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.100876  normal  0.401423 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2547  L-lysine 2,3-aminomutase  42.13 
 
 		 402 aa  267  2e-70  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1403  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  42.13 
 
 		 402 aa  267  2e-70  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0453  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  49.66 
 
 		 363 aa  261  1e-68  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.284633 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3223  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  47.16 
 
 		 356 aa  261  1e-68  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_011369  Rleg2_3797  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  45.2 
 
 		 350 aa  260  3e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0445503  normal  0.635435 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1886  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  46.35 
 
 		 356 aa  259  4e-68  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4485  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  43.44 
 
 		 381 aa  259  7e-68  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0796  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  39.66 
 
 		 374 aa  257  2e-67  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0377  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  45.2 
 
 		 356 aa  257  2e-67  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.284595 
 
 
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NC_009636  Smed_3476  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  43.64 
 
 		 350 aa  256  4e-67  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_010505  Mrad2831_2740  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  45.37 
 
 		 347 aa  253  3e-66  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.525407 
 
 
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NC_010172  Mext_3003  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  45.11 
 
 		 353 aa  253  4.0000000000000004e-66  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.108543  normal  1 
 
 
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NC_011988  Avi_6024  L-lysine 2,3-aminomutase  42.24 
 
 		 349 aa  251  2e-65  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007643  Rru_A0224  L-lysine 2,3-aminomutase  47.15 
 
 		 324 aa  249  6e-65  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.620911  n/a   
 
 
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NC_011757  Mchl_3228  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  44.24 
 
 		 353 aa  248  7e-65  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.486913 
 
 
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NC_010725  Mpop_3192  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  45.48 
 
 		 353 aa  246  4.9999999999999997e-64  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_010338  Caul_0763  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  47.97 
 
 		 347 aa  245  9.999999999999999e-64  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.475279  normal  0.239148 
 
 
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NC_011004  Rpal_2794  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  43.08 
 
 		 363 aa  239  2.9999999999999997e-62  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.102124  n/a   
 
 
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NC_007778  RPB_2954  hypothetical protein  42.24 
 
 		 363 aa  236  3e-61  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.583634  normal  1 
 
 
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