More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_2382 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_2382  CheA signal transduction histidine kinase  100 
 
 		 679 aa  1366    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1836  CheA signal transduction histidine kinase  95.43 
 
 		 679 aa  1298    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00846455 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4171  CheA signal transduction histidine kinase  54.44 
 
 		 686 aa  728    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0036  CheA signal transduction histidine kinase  36.98 
 
 		 742 aa  414  1e-114  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4206  CheA signal transduction histidine kinase  35.41 
 
 		 741 aa  410  1e-113  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.351121  normal  0.245941 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1482  CheA signal transduction histidine kinases  35.29 
 
 		 734 aa  405  1e-111  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0181827 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0725  CheA signal transduction histidine kinase  35.09 
 
 		 762 aa  378  1e-103  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1056  CheA Signal transduction histidine Kinases (STHK)  33.16 
 
 		 764 aa  367  1e-100  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.355241  normal  0.810589 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3969  signal transduction histidine kinase (cheA)  32.77 
 
 		 768 aa  369  1e-100  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00140745  normal  0.014071 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2405  CheA signal transduction histidine kinase  33.24 
 
 		 740 aa  360  4e-98  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.588075  normal  0.188448 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0331  chemotaxis histidine kinase  36.36 
 
 		 770 aa  356  5.999999999999999e-97  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3649  response regulator receiver:CheW-like protein:ATP-binding region, ATPase-like:Hpt  33.24 
 
 		 763 aa  355  2e-96  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0920169  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0764  CheA signal transduction histidine kinase  34.44 
 
 		 865 aa  353  5e-96  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0790  CheA signal transduction histidine kinase  34.44 
 
 		 865 aa  353  8e-96  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5391  CheA signal transduction histidine kinase  31.73 
 
 		 760 aa  352  1e-95  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.45011  normal  0.581829 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1433  putative chemotaxis sensor/effector fusion protein  31.87 
 
 		 764 aa  350  4e-95  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.654463  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0332  chemotaxis protein CheA  35.95 
 
 		 769 aa  344  2e-93  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2359  CheA signal transduction histidine kinase  32.1 
 
 		 756 aa  345  2e-93  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0310  chemotaxis protein CheA  35.82 
 
 		 769 aa  344  2.9999999999999997e-93  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.560249  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1687  chemotaxis protein CheA  36.13 
 
 		 769 aa  343  4e-93  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16470  putative chemotaxis sensor/effector fusion protein  31.97 
 
 		 769 aa  343  5.999999999999999e-93  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0944854  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1657  chemotaxis protein CheA  36.28 
 
 		 785 aa  342  1e-92  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.153065  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1580  putative response regulator of two-component system  35.78 
 
 		 783 aa  340  4e-92  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1329  CheA signal transduction histidine kinase  32.17 
 
 		 777 aa  340  7e-92  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1834  CheA signal transduction histidine kinases  35.97 
 
 		 878 aa  335  1e-90  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1530  CheA signal transduction histidine kinases  34.45 
 
 		 803 aa  334  3e-90  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1369  chemotaxis protein CheA  33.45 
 
 		 770 aa  331  2e-89  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0205  CheW domain protein  34.57 
 
 		 774 aa  330  4e-89  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00145615  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0831  chemotaxis protein  31.46 
 
 		 752 aa  325  2e-87  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.203342  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1497  sensor histidine kinase/response regulator  38.36 
 
 		 793 aa  325  2e-87  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4942  CheA signal transduction histidine kinase  31.69 
 
 		 766 aa  323  6e-87  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.993861 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1307  response regulator receiver:CheW-like protein:ATP-binding region, ATPase-like:Hpt  36.81 
 
 		 789 aa  322  9.999999999999999e-87  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.105152  hitchhiker  0.00575971 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0238  CheA signal transduction histidine kinases  31.62 
 
 		 764 aa  318  2e-85  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0773  CheA signal transduction histidine kinase  33.57 
 
 		 770 aa  317  5e-85  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.198559  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4420  CheA signal transduction histidine kinase  33.39 
 
 		 598 aa  317  6e-85  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0721  CheA signal transduction histidine kinase  35.45 
 
 		 544 aa  316  9e-85  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.159017  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2466  CheA signal transduction histidine kinase  37.5 
 
 		 772 aa  316  9.999999999999999e-85  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.378158  normal  0.0397197 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4026  CheA signal transduction histidine kinase  33.01 
 
 		 604 aa  315  1.9999999999999998e-84  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000112235 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0877  CheA signal transduction histidine kinases  32.88 
 
 		 601 aa  315  1.9999999999999998e-84  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00846405  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0622  CheA signal transduction histidine kinase  35.3 
 
 		 543 aa  315  1.9999999999999998e-84  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0357  CheA signal transduction histidine kinase  33.48 
 
 		 695 aa  314  2.9999999999999996e-84  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2773  CheA signal transduction histidine kinase  33.52 
 
 		 705 aa  313  9e-84  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  decreased coverage  0.00107192  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3199  chemotaxis protein CheA  37.19 
 
 		 561 aa  312  1e-83  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3266  CheA signal transduction histidine kinase  32.78 
 
 		 607 aa  311  2.9999999999999997e-83  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000540814 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0998  CheA signal transduction histidine kinase  38.04 
 
 		 783 aa  311  4e-83  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.154879  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0657  CheA signal transduction histidine kinase  31.16 
 
 		 758 aa  310  4e-83  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0137797  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3975  CheA signal transduction histidine kinase  35.37 
 
 		 804 aa  310  5e-83  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.4439  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2710  CheA signal transduction histidine kinase  40.35 
 
 		 777 aa  310  6.999999999999999e-83  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3895  response regulator receiver:CheW-like protein:ATP-binding region, ATPase-like:Hpt  31.75 
 
 		 1866 aa  307  4.0000000000000004e-82  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1668  CheA signal transduction histidine kinase  39.26 
 
 		 660 aa  307  4.0000000000000004e-82  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3136  CheA signal transduction histidine kinase  34.8 
 
 		 649 aa  307  5.0000000000000004e-82  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.382319  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3772  CheA signal transduction histidine kinase  32.18 
 
 		 2539 aa  306  8.000000000000001e-82  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4126  CheA signal transduction histidine kinase  35.98 
 
 		 755 aa  305  2.0000000000000002e-81  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.153494  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1156  CheA signal transduction histidine kinases  40.99 
 
 		 1089 aa  305  2.0000000000000002e-81  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.254693  normal  0.262443 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0989  CheA signal transduction histidine kinases  34.76 
 
 		 764 aa  304  3.0000000000000004e-81  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.166384  normal  0.27333 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1873  CheA signal transduction histidine kinases  35.18 
 
 		 839 aa  305  3.0000000000000004e-81  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.7666  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0505  chemotaxis sensor histidine kinase, putative  33.39 
 
 		 832 aa  304  4.0000000000000003e-81  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.391708  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3683  CheA signal transduction histidine kinase  37.16 
 
 		 769 aa  304  4.0000000000000003e-81  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.461303  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0492  response regulator receiver:CheW-like protein:ATP-binding region, ATPase-like:Hpt  31.67 
 
 		 1992 aa  303  6.000000000000001e-81  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2027  CheA signal transduction histidine kinase  37.55 
 
 		 777 aa  303  6.000000000000001e-81  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.162071  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2538  chemotaxis histidine kinase/response regulator  34.18 
 
 		 864 aa  303  8.000000000000001e-81  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4230  CheA signal transduction histidine kinase  36.2 
 
 		 765 aa  303  9e-81  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1383  CheA signal transduction histidine kinase  40.45 
 
 		 1031 aa  302  1e-80  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2683  chemotaxis histidine kinase/response regulator  34.18 
 
 		 864 aa  303  1e-80  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0636  CheA signal transduction histidine kinase  34.7 
 
 		 544 aa  302  1e-80  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.83539e-26 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5517  CheA signal transduction histidine kinases  37.16 
 
 		 769 aa  302  1e-80  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0873322  normal  0.1808 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3091  CheA signal transduction histidine kinases  34.93 
 
 		 538 aa  302  1e-80  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.832082  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0296  chemotaxis protein CheA, putative  32.17 
 
 		 610 aa  302  2e-80  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1492  CheA signal transduction histidine kinase  36.2 
 
 		 762 aa  301  2e-80  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0312687  normal  0.934055 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0221  putative chemotaxis sensor histidine kinase  34.18 
 
 		 864 aa  302  2e-80  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1599  putative chemotaxis sensor histidine kinase  34.18 
 
 		 864 aa  302  2e-80  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0258  putative chemotaxis sensor histidine kinase  34.18 
 
 		 864 aa  302  2e-80  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.334424  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1402  putative chemotaxis sensor histidine kinase  34.18 
 
 		 864 aa  302  2e-80  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0244  CheA signal transduction histidine kinase  40.22 
 
 		 681 aa  301  3e-80  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0417  CheA signal transduction histidine kinase  35.1 
 
 		 896 aa  300  4e-80  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0485913  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0964  chemotaxis histidine kinase  36.95 
 
 		 1079 aa  301  4e-80  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0407  CheA signal transduction histidine kinase  35.1 
 
 		 896 aa  300  4e-80  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3733  CheA signal transduction histidine kinase  33.67 
 
 		 769 aa  300  7e-80  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.577352  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2192  CheA signal transduction histidine kinase  37.53 
 
 		 801 aa  300  7e-80  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4572  CheA signal transduction histidine kinases  33.67 
 
 		 769 aa  300  7e-80  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3791  CheA signal transduction histidine kinases  33.67 
 
 		 769 aa  300  7e-80  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.267283 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1577  CheA signal transduction histidine kinase  40.6 
 
 		 954 aa  300  8e-80  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.199949  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2304  CheA signal transduction histidine kinase  33.67 
 
 		 769 aa  299  1e-79  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.400657 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2678  CheA signal transduction histidine kinase  38.53 
 
 		 705 aa  299  1e-79  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.295272  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2367  CheA signal transduction histidine kinase  33.29 
 
 		 688 aa  299  1e-79  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.990508  decreased coverage  0.0000928264 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2694  CheA signal transduction histidine kinase  34.93 
 
 		 558 aa  297  4e-79  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1097  CheA signal transduction histidine kinase  35.79 
 
 		 767 aa  297  4e-79  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0638  CheA signal transduction histidine kinase  36.21 
 
 		 753 aa  296  7e-79  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0647  CheA signal transduction histidine kinase  36.21 
 
 		 756 aa  296  1e-78  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0774  CheA signal transduction histidine kinase  41.58 
 
 		 1030 aa  295  2e-78  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.142014 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2814  CheA signal transduction histidine kinase  39.61 
 
 		 606 aa  293  5e-78  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2690  CheA signal transduction histidine kinase  37.9 
 
 		 697 aa  293  6e-78  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0874  putative CheA signal transduction histidine kinases  39.22 
 
 		 677 aa  293  8e-78  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3200  CheA signal transduction histidine kinase  37.35 
 
 		 781 aa  292  1e-77  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.3357 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0126  CheA signal transduction histidine kinase  35.64 
 
 		 1758 aa  291  2e-77  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0600  CheA signal transduction histidine kinase  32.81 
 
 		 706 aa  291  2e-77  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0228  CheA signal transduction histidine kinase  39.24 
 
 		 671 aa  291  2e-77  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0226  CheA signal transduction histidine kinase  39.95 
 
 		 671 aa  291  3e-77  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.985632  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0494  CheA signal transduction histidine kinases  35.13 
 
 		 798 aa  291  4e-77  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3629  putative CheA signal transduction histidine kinases  36.95 
 
 		 2336 aa  290  5.0000000000000004e-77  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>