265 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_2377 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_2377  Methyltransferase type 11  100 
 
 		 190 aa  395  1e-109  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.954171  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1842  Methyltransferase type 11  88.95 
 
 		 190 aa  359  2e-98  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000617793 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4072  Methyltransferase type 11  68.42 
 
 		 192 aa  291  6e-78  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3310  methyltransferase type 11  65.79 
 
 		 192 aa  283  1.0000000000000001e-75  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00554158  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3127  methyltransferase type 11  50 
 
 		 191 aa  187  7e-47  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.182035  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2205  Methyltransferase type 11  45.99 
 
 		 190 aa  176  2e-43  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.450687  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4456  methyltransferase type 12  45.05 
 
 		 180 aa  156  2e-37  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.583593 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0758  Methyltransferase type 11  34.59 
 
 		 189 aa  76.6  0.0000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.00287175  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0193  Methyltransferase type 11  32.12 
 
 		 202 aa  74.7  0.0000000000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.442693  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2707  Methyltransferase type 11  33.14 
 
 		 199 aa  74.7  0.0000000000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2245  Methyltransferase type 11  31.82 
 
 		 197 aa  71.6  0.000000000006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.140081 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2897  Methyltransferase type 11  26.78 
 
 		 189 aa  70.5  0.00000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1832  methyltransferase type 11  31.01 
 
 		 203 aa  69.7  0.00000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1338  Methyltransferase type 11  32.97 
 
 		 244 aa  68.2  0.00000000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.482498  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2392  hypothetical protein  30.77 
 
 		 206 aa  67.4  0.0000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.823369  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1436  Methyltransferase type 11  31.52 
 
 		 231 aa  66.2  0.0000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  decreased coverage  0.00774998  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2515  methyltransferase type 11  33.33 
 
 		 222 aa  65.9  0.0000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.245025  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1330  UbiE/COQ5 methyltransferase  29.55 
 
 		 205 aa  62  0.000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.283996  normal  0.0130791 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0558  Methyltransferase type 11  27.69 
 
 		 188 aa  62.4  0.000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0166016  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1351  methyltransferase type 11  40.2 
 
 		 217 aa  62.4  0.000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.884704  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0017  Methyltransferase type 11  29.87 
 
 		 191 aa  59.3  0.00000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.677573  normal  0.0406571 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3707  Methyltransferase type 11  29.86 
 
 		 184 aa  58.9  0.00000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.52514  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1944  methyltransferase type 11  33.33 
 
 		 202 aa  58.2  0.00000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3468  RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  29.41 
 
 		 420 aa  57.8  0.00000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3469  Methyltransferase type 11  35.65 
 
 		 243 aa  57.8  0.0000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.508961  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2262  Methyltransferase type 11  31.47 
 
 		 272 aa  56.6  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.0068662  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6718  Methyltransferase type 11  31.17 
 
 		 252 aa  56.2  0.0000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2150  methyltransferase type 11  29.3 
 
 		 255 aa  56.2  0.0000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.301161  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1654  methyltransferase type 11  25.16 
 
 		 173 aa  56.2  0.0000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.682174  hitchhiker  0.00196009 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4188  Methyltransferase type 11  28.21 
 
 		 278 aa  55.8  0.0000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1433  methyltransferase type 11  31.01 
 
 		 190 aa  55.8  0.0000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3852  UbiE/COQ5 family methlytransferase  30.71 
 
 		 212 aa  54.7  0.0000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2653  methyltransferase type 11  34.21 
 
 		 210 aa  53.9  0.000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.240915  normal  0.794534 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0825  Methyltransferase type 12  33.62 
 
 		 216 aa  54.3  0.000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2464  Methyltransferase type 11  27.27 
 
 		 187 aa  54.3  0.000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.788915  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2226  hypothetical protein  31.43 
 
 		 251 aa  53.1  0.000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.18592  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4328  Methyltransferase type 11  27.07 
 
 		 188 aa  52.8  0.000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3326  Methyltransferase type 11  27.74 
 
 		 186 aa  52.8  0.000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0604  Methyltransferase type 11  27.59 
 
 		 194 aa  52.8  0.000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4679  Methyltransferase type 11  28.75 
 
 		 251 aa  52.4  0.000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4278  Methyltransferase type 11  26.28 
 
 		 186 aa  52.4  0.000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.867588  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1473  methyltransferase type 12  34.65 
 
 		 270 aa  51.6  0.000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2082  Methyltransferase type 11  32.89 
 
 		 265 aa  51.6  0.000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0250363  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5595  Methyltransferase type 11  34.65 
 
 		 239 aa  51.2  0.000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1561  Methyltransferase type 11  29.5 
 
 		 283 aa  51.2  0.00001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.160915  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4343  Methyltransferase type 11  32.04 
 
 		 415 aa  50.8  0.00001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.414925  normal  0.473204 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2395  Methyltransferase type 11  36.7 
 
 		 208 aa  50.4  0.00001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000965249  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2880  methyltransferase type 11  37.41 
 
 		 246 aa  50.8  0.00001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03350  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  37.14 
 
 		 305 aa  50.4  0.00001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2157  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  30.17 
 
 		 434 aa  50.8  0.00001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.016063  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0457  methyltransferase type 11  29.08 
 
 		 208 aa  50.8  0.00001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1238  methyltransferase type 11  33.66 
 
 		 219 aa  50.8  0.00001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1232  methyltransferase type 11  34.62 
 
 		 238 aa  50.4  0.00001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.976917  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01614  S-adenosyl-methionine-sterol-C-methyltransferas (AFU_orthologue; AFUA_4G09190)  29.13 
 
 		 387 aa  50.1  0.00002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.787149  normal  0.132042 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2088  methyltransferase type 11  34.31 
 
 		 258 aa  50.1  0.00002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0330  methyltransferase type 11  28.69 
 
 		 199 aa  50.1  0.00002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0725  Methyltransferase type 11  32.05 
 
 		 313 aa  50.4  0.00002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1891  Methyltransferase type 11  31.93 
 
 		 255 aa  49.7  0.00003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.742505  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2109  methyltransferase type 11  31.61 
 
 		 296 aa  49.7  0.00003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.709004  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0477  Methyltransferase type 11  34.62 
 
 		 235 aa  49.3  0.00004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0885  methyltransferase, putative  33.66 
 
 		 214 aa  48.9  0.00004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.784579  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2136  Cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  31.03 
 
 		 457 aa  49.3  0.00004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000408941 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2811  Methyltransferase type 11  32.46 
 
 		 204 aa  48.9  0.00004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.481855  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2522  Methyltransferase type 11  30.56 
 
 		 280 aa  48.9  0.00004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0795071  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1511  methyltransferase type 11  32.82 
 
 		 208 aa  48.9  0.00005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.298686 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0720  hypothetical protein  29.9 
 
 		 234 aa  48.5  0.00005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.842265 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6463  methyltransferase type 11  30.19 
 
 		 283 aa  48.5  0.00006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0440629 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4221  Methyltransferase type 11  36.45 
 
 		 220 aa  48.1  0.00007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5097  methyltransferase type 11  34.33 
 
 		 260 aa  48.1  0.00007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.715377  normal  0.3355 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4035  ArsR family transcriptional regulator  33.02 
 
 		 312 aa  48.1  0.00007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.140406 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0510  methyltransferase type 11  32.71 
 
 		 276 aa  48.1  0.00008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1552  methyltransferase type 11  33.33 
 
 		 242 aa  48.1  0.00008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.093627 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1145  Methyltransferase type 11  25.93 
 
 		 208 aa  48.1  0.00008  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2840  MCP methyltransferase, CheR-type  35.64 
 
 		 207 aa  47.8  0.00009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.698056  normal  0.8759 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1507  hypothetical protein  33.65 
 
 		 184 aa  47.8  0.00009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5219  Methyltransferase type 11  31.37 
 
 		 259 aa  47.8  0.00009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0306756 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1836  Methyltransferase type 11  30.19 
 
 		 296 aa  47  0.0001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2874  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  30.17 
 
 		 273 aa  47.8  0.0001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.522962 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3543  transcriptional regulator, ArsR family  27.21 
 
 		 335 aa  47.4  0.0001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.304877 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1344  Methyltransferase type 11  30.17 
 
 		 218 aa  47.8  0.0001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1529  ArsR family transcriptional regulator  30.53 
 
 		 337 aa  47.4  0.0001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3515  UbiE/COQ5 methyltransferase  32.08 
 
 		 287 aa  47.8  0.0001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0321  demethylmenaquinone methyltransferase  32.85 
 
 		 216 aa  47.4  0.0001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.728843  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1047  Cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  41.43 
 
 		 403 aa  47.4  0.0001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.350309  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1168  Methyltransferase type 11  30.92 
 
 		 267 aa  47.4  0.0001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4848  Methyltransferase type 11  29.52 
 
 		 241 aa  47.8  0.0001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0077  hypothetical protein  33.33 
 
 		 353 aa  47  0.0002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0005  methyltransferase  28.19 
 
 		 267 aa  47  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.168517  normal  0.967482 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2814  UbiE/COQ5 methyltransferase  31.9 
 
 		 209 aa  46.6  0.0002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.206405 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4002  methyltransferase type 11  27.38 
 
 		 276 aa  47  0.0002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.268063  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1125  Methyltransferase type 11  30.97 
 
 		 270 aa  46.6  0.0002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.321869  normal  0.566486 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0600  methyltransferase type 11  35.14 
 
 		 218 aa  46.6  0.0002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.93996  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0080  Methyltransferase type 11  33.33 
 
 		 353 aa  47  0.0002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0254  Methyltransferase type 11  33.64 
 
 		 273 aa  46.6  0.0002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5873  Methyltransferase type 11  29.2 
 
 		 174 aa  46.6  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.307936  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1867  Methyltransferase type 11  29.63 
 
 		 186 aa  47  0.0002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.00000000037556  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3135  ArsR family transcriptional regulator  36.19 
 
 		 348 aa  46.2  0.0003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2553  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  26.95 
 
 		 229 aa  45.8  0.0003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.416549  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1453  SAM-dependent methyltransferase  24.55 
 
 		 252 aa  46.2  0.0003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.938233  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1136  Methyltransferase type 11  28.26 
 
 		 273 aa  46.2  0.0003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.224282  normal  0.55506 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>