More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_2348 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_2348  protein tyrosine phosphatase  100 
 
 		 142 aa  293  4e-79  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1874  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  81.88 
 
 		 144 aa  243  6e-64  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0597  protein tyrosine phosphatase  58.82 
 
 		 142 aa  174  2e-43  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2667  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  50 
 
 		 143 aa  153  9e-37  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2878  protein tyrosine phosphatase  50.74 
 
 		 139 aa  151  2.9999999999999998e-36  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1452  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  49.62 
 
 		 157 aa  146  1.0000000000000001e-34  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00327918  normal  0.121343 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1111  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  47.1 
 
 		 146 aa  145  2.0000000000000003e-34  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.660176  normal  0.527551 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2820  protein tyrosine phosphatase  48.23 
 
 		 143 aa  135  1e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2957  protein tyrosine phosphatase  43.7 
 
 		 150 aa  135  1e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.252891  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0526  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  46.72 
 
 		 152 aa  134  4e-31  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0375  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  47.69 
 
 		 140 aa  132  9.999999999999999e-31  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0874  protein tyrosine phosphatase  46.53 
 
 		 143 aa  130  7.999999999999999e-30  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0764045  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0537  arsenate reductase (thioredoxin)  45.93 
 
 		 164 aa  129  1.0000000000000001e-29  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0827  Protein-tyrosine phosphatase low molecular weight  42.03 
 
 		 154 aa  128  3e-29  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1954  protein tyrosine phosphatase  42.86 
 
 		 150 aa  128  3e-29  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.735313  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0845  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  48.53 
 
 		 143 aa  127  6e-29  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.0000114358  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2770  protein tyrosine phosphatase  43.28 
 
 		 143 aa  125  2.0000000000000002e-28  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0218  protein tyrosine phosphatase  46.97 
 
 		 143 aa  125  3e-28  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3147  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  42.86 
 
 		 139 aa  124  3e-28  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.942281  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2571  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  44.03 
 
 		 137 aa  125  3e-28  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3324  arsenate reductase  46.15 
 
 		 139 aa  124  4.0000000000000003e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1772  protein-tyrosine-phosphatase  45.93 
 
 		 148 aa  122  2e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000508591  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0842  protein tyrosine phosphatase  45.74 
 
 		 138 aa  121  3e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.790254  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2033  arsenate reductase (thioredoxin)  46.83 
 
 		 132 aa  120  4e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.00780291  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1414  protein tyrosine phosphatase  47.14 
 
 		 145 aa  120  6e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1583  arsenate reductase  43.48 
 
 		 164 aa  118  1.9999999999999998e-26  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6113  protein tyrosine phosphatase  42.19 
 
 		 138 aa  118  3e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1210  arsenate reductase (thioredoxin)  42.25 
 
 		 144 aa  117  6e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2315  ArsR family transcriptional regulator  46.15 
 
 		 258 aa  115  1.9999999999999998e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.911593  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3054  protein tyrosine phosphatase  40.91 
 
 		 165 aa  115  3e-25  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.570594 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1896  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  44.2 
 
 		 138 aa  114  3.9999999999999997e-25  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0515546  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1929  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  41.79 
 
 		 137 aa  113  1.0000000000000001e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.893973  normal  0.121464 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2953  arsenate reductase  43.41 
 
 		 140 aa  112  2.0000000000000002e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4019  protein tyrosine phosphatase  41.98 
 
 		 151 aa  112  2.0000000000000002e-24  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2881  protein tyrosine phosphatase  42.03 
 
 		 145 aa  110  5e-24  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5345  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  38.24 
 
 		 164 aa  110  6e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.807351  normal  0.94085 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2863  protein tyrosine phosphatase  39.44 
 
 		 151 aa  109  1.0000000000000001e-23  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0521  protein tyrosine phosphatase  40.91 
 
 		 140 aa  109  1.0000000000000001e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2216  protein tyrosine phosphatase  38.85 
 
 		 166 aa  109  1.0000000000000001e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.415752  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0918  protein tyrosine phosphatase  40.71 
 
 		 144 aa  109  1.0000000000000001e-23  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3939  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  39.13 
 
 		 167 aa  108  2.0000000000000002e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.117198 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0062  protein tyrosine phosphatase  38.89 
 
 		 145 aa  108  2.0000000000000002e-23  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1703  protein tyrosine phosphatase  47.37 
 
 		 145 aa  108  2.0000000000000002e-23  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.893409 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3826  protein tyrosine phosphatase  39.13 
 
 		 167 aa  108  2.0000000000000002e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.248837 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1821  protein tyrosine phosphatase  36.76 
 
 		 164 aa  109  2.0000000000000002e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0699312 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3671  protein tyrosine phosphatase  41.04 
 
 		 144 aa  108  2.0000000000000002e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.724528  normal  0.246211 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2919  arsenate reductase  42.66 
 
 		 148 aa  109  2.0000000000000002e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000358516  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1820  protein tyrosine phosphatase  41.18 
 
 		 164 aa  107  4.0000000000000004e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.102898 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0526  ArsR family transcriptional regulator  38.13 
 
 		 276 aa  107  7.000000000000001e-23  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.107472 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1393  protein tyrosine phosphatase  39.16 
 
 		 148 aa  107  7.000000000000001e-23  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0172641  normal  0.707508 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1734  protein tyrosine phosphatase  45.74 
 
 		 127 aa  106  1e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3642  protein tyrosine phosphatase  44.92 
 
 		 149 aa  106  1e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.227119  normal  0.219945 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1022  tyrosine phosphatase  38.93 
 
 		 299 aa  106  1e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1253  transcriptional regulator  40.3 
 
 		 287 aa  106  1e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0585398  normal  0.522722 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3601  protein tyrosine phosphatase  44.44 
 
 		 148 aa  105  1e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.458199 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5346  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  40.44 
 
 		 164 aa  105  2e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.885989  normal  0.524005 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3255  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  38.41 
 
 		 172 aa  105  2e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0381  protein tyrosine phosphatase  41.55 
 
 		 144 aa  105  2e-22  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00670954  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1084  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  38.17 
 
 		 299 aa  105  2e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.592993  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0848  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  39.1 
 
 		 137 aa  105  2e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0909  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  39.1 
 
 		 137 aa  105  2e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.525567  normal  0.101664 
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4210  ArsR family transcriptional regulator  36.88 
 
 		 270 aa  105  3e-22  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.54133  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2792  protein tyrosine phosphatase  43.36 
 
 		 146 aa  104  3e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0091  protein tyrosine phosphatase  38.24 
 
 		 143 aa  105  3e-22  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2516  protein tyrosine phosphatase  38.13 
 
 		 165 aa  104  3e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.69896  hitchhiker  0.0073525 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0250  protein tyrosine phosphatase  44.19 
 
 		 132 aa  105  3e-22  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.371079  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2963  arsenate reductase  41.26 
 
 		 134 aa  104  4e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.341383  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1410  protein tyrosine phosphatase  37.32 
 
 		 270 aa  104  4e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.315605  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1344  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  38.13 
 
 		 165 aa  104  4e-22  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.230877  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5674  protein tyrosine phosphatase  36.3 
 
 		 164 aa  104  4e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2316  ArsR family transcriptional regulator  40 
 
 		 255 aa  104  5e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.137023  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1579  protein tyrosine phosphatase  37.78 
 
 		 159 aa  104  5e-22  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2793  protein tyrosine phosphatase  41.22 
 
 		 144 aa  104  5e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1112  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  43.08 
 
 		 153 aa  104  5e-22  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.988044  normal  0.524433 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6164  protein tyrosine phosphatase  39.71 
 
 		 164 aa  104  5e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.398136 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3207  arsenate reductase  41.26 
 
 		 134 aa  103  6e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.468162  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2971  arsenate reductase  41.26 
 
 		 134 aa  103  8e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000815636  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3196  arsenate reductase  41.26 
 
 		 134 aa  103  8e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.9959  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1780  protein tyrosine phosphatase  39.29 
 
 		 154 aa  103  9e-22  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0180876  normal  1 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0304  arsenate reductase  40.56 
 
 		 134 aa  102  1e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1387  arsenate reductase, putative  39.67 
 
 		 165 aa  103  1e-21  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.782064  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0158  arsenate reductase  40.56 
 
 		 134 aa  102  1e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3579  protein tyrosine phosphatase  38.24 
 
 		 164 aa  102  1e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.747703 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3939  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  40.16 
 
 		 141 aa  103  1e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.164667  normal  0.499641 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3201  arsenate reductase  41.13 
 
 		 134 aa  102  1e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5708  protein tyrosine phosphatase  38.97 
 
 		 164 aa  102  2e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1128  putative arsenate reductase (arsenical PUMP modifier) protein  38.24 
 
 		 164 aa  102  2e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.976104 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4215  protein tyrosine phosphatase  38.24 
 
 		 164 aa  102  2e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2898  arsenate reductase  41.26 
 
 		 134 aa  102  2e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.871154  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3330  ArsR family transcriptional regulator  40.91 
 
 		 257 aa  102  2e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2588  protein tyrosine phosphatase  38.41 
 
 		 167 aa  102  2e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.570758  normal  0.260615 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1787  protein tyrosine phosphatase  40.32 
 
 		 179 aa  102  2e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00981569 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1118  protein tyrosine phosphatase  43.28 
 
 		 144 aa  102  2e-21  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.176181 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1644  protein tyrosine phosphatase  41.79 
 
 		 144 aa  102  2e-21  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.644428 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5707  protein tyrosine phosphatase  35.56 
 
 		 164 aa  102  2e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.598358  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0875  protein tyrosine phosphatase  38.17 
 
 		 189 aa  101  3e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5765  protein tyrosine phosphatase  40.15 
 
 		 164 aa  101  3e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3221  arsenate reductase  40.56 
 
 		 134 aa  101  3e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.305277  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1440  protein tyrosine phosphatase  40.6 
 
 		 147 aa  102  3e-21  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5600  protein tyrosine phosphatase  38.24 
 
 		 164 aa  101  3e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.123028  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>