More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_2318 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011206  Lferr_0494  elongation factor G  44.27 
 
 		 699 aa  635    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  decreased coverage  0.00353597  hitchhiker  0.0000000139334 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0712  translation elongation factor G  46.53 
 
 		 697 aa  647    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0283  translation elongation factor G  47.73 
 
 		 691 aa  668    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000288442  decreased coverage  0.000024327 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1933  elongation factor G  78.4 
 
 		 697 aa  1125    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0407442  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2860  elongation factor G  49.48 
 
 		 692 aa  691    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0281835  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2909  elongation factor G  49.34 
 
 		 686 aa  682    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0188  elongation factor G  44.71 
 
 		 693 aa  635    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.000059659  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2375  elongation factor G  46.81 
 
 		 698 aa  647    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.092172  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1660  translation elongation factor G  48.68 
 
 		 691 aa  688    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00040628  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0102  elongation factor G  47.35 
 
 		 692 aa  668    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000176822  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0107  elongation factor G  47.53 
 
 		 692 aa  672    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.00000143993  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0828  elongation factor G  47.96 
 
 		 679 aa  679    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0128  elongation factor G  47.35 
 
 		 692 aa  666    Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000285485  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1769  elongation factor G  44.74 
 
 		 692 aa  643    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00415674  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0228  elongation factor G  46.08 
 
 		 698 aa  635    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0107  elongation factor G  47.64 
 
 		 692 aa  670    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.0000647757  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0103  elongation factor G  47.64 
 
 		 692 aa  670    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000410071  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2931  elongation factor G  51.31 
 
 		 688 aa  699    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.400395 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0101  elongation factor G  47.64 
 
 		 692 aa  669    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0151971  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0419  elongation factor G  47.58 
 
 		 692 aa  666    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000206577  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0391  elongation factor G  46.5 
 
 		 694 aa  647    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0366  elongation factor G  46.5 
 
 		 694 aa  647    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3331  elongation factor G  46.82 
 
 		 692 aa  655    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.70074e-16 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2649  elongation factor G  47.76 
 
 		 704 aa  638    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0324  elongation factor G  44.27 
 
 		 699 aa  635    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.554345  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1187  translation elongation factor G  46.61 
 
 		 688 aa  650    Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.000000405339  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0138  elongation factor G  47.64 
 
 		 692 aa  669    Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000590247  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002299  translation elongation factor G  46.3 
 
 		 699 aa  638    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000315857  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3663  translation elongation factor G  48.68 
 
 		 690 aa  665    Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.132269 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10040  translation elongation factor 2 (EF-2/EF-G)  47.13 
 
 		 700 aa  639    Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  decreased coverage  0.0000170843  decreased coverage  0.0000000000839395 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2327  elongation factor G  46.73 
 
 		 697 aa  653    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  decreased coverage  0.000000853268  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0698  elongation factor G  45.66 
 
 		 692 aa  650    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000205392  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1969  elongation factor G  59.39 
 
 		 692 aa  863    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.704236  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2714  translation elongation factor G  47.35 
 
 		 691 aa  666    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00080335  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0212  elongation factor G  47.37 
 
 		 692 aa  644    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00232583  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2232  elongation factor G  46.06 
 
 		 704 aa  635    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000000162154  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1937  elongation factor G  48.46 
 
 		 685 aa  640    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0623  elongation factor G  48.45 
 
 		 692 aa  673    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0450617  hitchhiker  1.2333199999999998e-20 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1985  elongation factor G  77.08 
 
 		 697 aa  1138    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.786263  normal  0.270154 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0262  elongation factor G  46.62 
 
 		 692 aa  660    Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000815728  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2741  elongation factor G  50.59 
 
 		 686 aa  699    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.784554  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0107  elongation factor G  47.64 
 
 		 692 aa  670    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.0000000392838  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1794  elongation factor G  48.39 
 
 		 695 aa  684    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1905  elongation factor G  97.72 
 
 		 701 aa  1399    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.129196 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0104  elongation factor G  47.08 
 
 		 689 aa  681    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0864  elongation factor G  49.64 
 
 		 689 aa  689    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000306199  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1142  elongation factor G  49.78 
 
 		 680 aa  682    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.283647  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2463  elongation factor G  49.85 
 
 		 692 aa  689    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.691904  normal  0.0191825 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0222  translation elongation factor G  47.06 
 
 		 689 aa  648    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0488172  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0809  elongation factor G  48.69 
 
 		 691 aa  693    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000920124  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1948  elongation factor G  46.33 
 
 		 697 aa  664    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0832  translation elongation factor G  47.08 
 
 		 695 aa  671    Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0189  translation elongation factor G  48.67 
 
 		 691 aa  665    Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0108  elongation factor G  48.38 
 
 		 692 aa  683    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000924117  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3998  translation elongation factor G  46.98 
 
 		 691 aa  652    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0770762  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01140  translation elongation factor G  48.54 
 
 		 689 aa  676    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  0.0000000000000711404  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2103  elongation factor G  50 
 
 		 688 aa  657    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0294  elongation factor G  46.46 
 
 		 693 aa  650    Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0101  elongation factor G  46.9 
 
 		 692 aa  663    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000583321  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1045  translation elongation factor G  47.17 
 
 		 696 aa  651    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1223  elongation factor G  45.66 
 
 		 697 aa  636    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.0000218328  hitchhiker  0.000228753 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4753  translation elongation factor G  47.84 
 
 		 701 aa  689    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.102638  normal  0.0974046 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1065  elongation factor G  48.97 
 
 		 692 aa  682    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000239049  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0010  translation elongation factor 2 (EF-2/EF-G)  50.72 
 
 		 692 aa  739    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1909  elongation factor G  46.19 
 
 		 697 aa  651    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.105206 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0950  elongation factor G  47.35 
 
 		 691 aa  649    Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.0000219808  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1486  elongation factor G  45.61 
 
 		 695 aa  639    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000303107  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1367  translation elongation factor G  44.8 
 
 		 670 aa  646    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00560984 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1527  translation elongation factor G  47.45 
 
 		 690 aa  663    Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000816454  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0096  elongation factor G  44.56 
 
 		 696 aa  636    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1343  elongation factor G  48.68 
 
 		 692 aa  672    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0141135  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1319  elongation factor G  81.54 
 
 		 694 aa  1196    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0378966  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0191  translation elongation factor 2 (EF-2/EF-G)  47.08 
 
 		 691 aa  661    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.000000112943  hitchhiker  0.00531332 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5198  elongation factor G  47.2 
 
 		 692 aa  666    Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000109677  unclonable  1.5030900000000001e-24 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0119  elongation factor G  47.64 
 
 		 692 aa  671    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.92544e-59 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2972  translation elongation factor G  45.04 
 
 		 673 aa  644    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1152  elongation factor G  47.15 
 
 		 682 aa  676    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.00000572853  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1785  elongation factor G  50.29 
 
 		 687 aa  679    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1931  elongation factor G  45.89 
 
 		 697 aa  658    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0978  translation elongation factor G  47.61 
 
 		 691 aa  655    Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00678136  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2318  elongation factor G  100 
 
 		 701 aa  1447    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.866261  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1762  elongation factor G  44.15 
 
 		 693 aa  637    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.286696  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2729  elongation factor G  48.91 
 
 		 697 aa  679    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.255792  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0930  elongation factor G  47.12 
 
 		 692 aa  658    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0114656  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1229  translation elongation factor G  45.53 
 
 		 673 aa  645    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0505633  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0068  elongation factor G  56.85 
 
 		 691 aa  802    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.480211  normal  0.213325 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0124  translation elongation factor G  45.81 
 
 		 707 aa  659    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2815  elongation factor G  78.89 
 
 		 697 aa  1165    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.146  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2016  elongation factor G  45.89 
 
 		 697 aa  659    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4324  translation elongation factor G  47.7 
 
 		 703 aa  635    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3762  elongation factor G  45.64 
 
 		 698 aa  635    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000464555  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0656  elongation factor G  84.88 
 
 		 694 aa  1232    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0677  elongation factor G  49.27 
 
 		 692 aa  694    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00774195  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2327  translation elongation factor 2 (EF-2/EF-G)  46.72 
 
 		 697 aa  640    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.000709342  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1854  elongation factor G  45.34 
 
 		 704 aa  633  1e-180  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.0000767386  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0579  elongation factor G  47.82 
 
 		 698 aa  632  1e-180  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.179959  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0793  elongation factor G  47.39 
 
 		 701 aa  635  1e-180  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2067  elongation factor G  44.92 
 
 		 704 aa  632  1e-180  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.0000338261  normal  0.439953 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0145  elongation factor G  44.77 
 
 		 698 aa  632  1e-180  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.000000355615  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0210  elongation factor G  45.64 
 
 		 698 aa  633  1e-180  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000406039  unclonable  0.0000140529 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>