More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_2272 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011146  Gbem_2272  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  100 
 
 
326 aa  660    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1951  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  97.24 
 
 
326 aa  646    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2818  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  71.78 
 
 
326 aa  476  1e-133  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1436  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  70.55 
 
 
326 aa  468  1.0000000000000001e-131  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2931  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  64.42 
 
 
326 aa  445  1.0000000000000001e-124  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1354  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  64.42 
 
 
326 aa  444  1.0000000000000001e-124  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.935737  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2419  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  63.19 
 
 
326 aa  443  1e-123  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3146  molybdenum cofactor biosynthesis protein A, putative  62.88 
 
 
326 aa  420  1e-116  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0301  radical SAM:molybdenum cofactor synthesis-like  59.51 
 
 
326 aa  417  1e-116  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3571  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  60.74 
 
 
325 aa  413  1e-114  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0337  radical SAM:molybdenum cofactor synthesis-like  62.88 
 
 
326 aa  406  1.0000000000000001e-112  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.910296  hitchhiker  4.2899899999999994e-20 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0304  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  59.51 
 
 
326 aa  400  9.999999999999999e-111  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2095  GTP cyclohydrolase subunit MoaA  55.52 
 
 
326 aa  381  1e-105  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0892  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  55.83 
 
 
326 aa  383  1e-105  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1159  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  58.64 
 
 
330 aa  365  1e-100  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.263056  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1265  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  44.85 
 
 
336 aa  300  2e-80  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.522887  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2768  molybdopterin biosynthesis, protein A  46.67 
 
 
333 aa  300  2e-80  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000149516  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2135  GTP cyclohydrolase subunit MoaA  45.2 
 
 
323 aa  287  2e-76  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1905  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  46.73 
 
 
329 aa  287  2e-76  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.349909  unclonable  0.0000106016 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1860  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  42.94 
 
 
326 aa  285  1.0000000000000001e-75  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.310247  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0373  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  43.12 
 
 
323 aa  272  6e-72  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0327  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  43.52 
 
 
344 aa  271  9e-72  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2195  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  44.25 
 
 
333 aa  270  2e-71  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.823795  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1280  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  44.82 
 
 
332 aa  270  2.9999999999999997e-71  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.412863  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1019  GTP cyclohydrolase subunit MoaA  43.73 
 
 
328 aa  268  1e-70  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.33881  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1400  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  40.87 
 
 
323 aa  267  2e-70  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2859  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  43.69 
 
 
330 aa  264  1e-69  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00116324  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2268  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  42.73 
 
 
325 aa  264  1e-69  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1999  radical SAM:molybdenum cofactor synthesis C-terminal  44.51 
 
 
357 aa  263  2e-69  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.655025  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1590  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  45.58 
 
 
316 aa  264  2e-69  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03880  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  41.84 
 
 
337 aa  264  2e-69  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.329563 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0621  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  47.08 
 
 
327 aa  262  6e-69  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.239747  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2214  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  44.69 
 
 
363 aa  262  6.999999999999999e-69  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.422159  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1930  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  44.65 
 
 
319 aa  261  1e-68  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0187  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  43.12 
 
 
330 aa  261  1e-68  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00819239  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0072  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  45.73 
 
 
340 aa  260  2e-68  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2766  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  45.32 
 
 
331 aa  259  3e-68  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.237766  normal  0.576064 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01630  GTP cyclohydrolase subunit MoaA  42.56 
 
 
333 aa  259  5.0000000000000005e-68  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0336  GTP cyclohydrolase subunit MoaA  43.29 
 
 
327 aa  259  5.0000000000000005e-68  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0158  molybdenum cofactor synthesis-like  43.41 
 
 
331 aa  259  6e-68  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000194349  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_50634  predicted protein  43.47 
 
 
336 aa  257  1e-67  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.612985 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2958  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  42.02 
 
 
325 aa  258  1e-67  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1604  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  40.67 
 
 
328 aa  257  2e-67  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1392  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  41.3 
 
 
317 aa  256  3e-67  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0882  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  42.12 
 
 
323 aa  256  5e-67  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2491  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  41.72 
 
 
353 aa  255  8e-67  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.989174  normal  0.187655 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3688  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  43.29 
 
 
328 aa  255  9e-67  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1202  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  41.28 
 
 
335 aa  252  8.000000000000001e-66  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03850  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  45.15 
 
 
335 aa  251  2e-65  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2076  GTP cyclohydrolase subunit MoaA  41.77 
 
 
329 aa  250  2e-65  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.000199937  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1853  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  42.04 
 
 
335 aa  250  2e-65  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2327  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  43.03 
 
 
332 aa  248  1e-64  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0620358  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0119  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  42.55 
 
 
327 aa  248  1e-64  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.491091 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1480  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  41.88 
 
 
332 aa  247  2e-64  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.498315  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3826  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  43.77 
 
 
331 aa  244  9.999999999999999e-64  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.488803  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0082  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  42.07 
 
 
328 aa  244  9.999999999999999e-64  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0119  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  42.07 
 
 
328 aa  244  1.9999999999999999e-63  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0460197  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2110  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  42.02 
 
 
356 aa  244  1.9999999999999999e-63  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.163596  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2516  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  42.42 
 
 
332 aa  243  3e-63  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0514833  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30330  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  47.42 
 
 
331 aa  243  3e-63  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3906  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  41.39 
 
 
334 aa  242  5e-63  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.68268 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3388  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  42.3 
 
 
332 aa  242  5e-63  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3318  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  39.82 
 
 
333 aa  241  9e-63  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1760  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  38.58 
 
 
323 aa  241  1e-62  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.7115  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4597  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  40.91 
 
 
334 aa  241  2e-62  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.770379 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4127  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  41.69 
 
 
334 aa  240  2e-62  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0591  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  39.94 
 
 
328 aa  240  2e-62  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1291  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  40.91 
 
 
334 aa  240  2e-62  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44970  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  43.47 
 
 
331 aa  240  2e-62  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2045  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  37.96 
 
 
323 aa  240  2.9999999999999997e-62  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.990495  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1759  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  41.1 
 
 
356 aa  239  5e-62  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.103881  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0143  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  41.69 
 
 
334 aa  237  2e-61  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.391723 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1315  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  37.76 
 
 
341 aa  236  3e-61  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.374397  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2612  GTP cyclohydrolase subunit MoaA  42.12 
 
 
327 aa  234  2.0000000000000002e-60  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.635928 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1239  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  42.68 
 
 
329 aa  233  3e-60  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3073  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  41.87 
 
 
330 aa  233  4.0000000000000004e-60  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.342071  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1242  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  41.9 
 
 
353 aa  233  5e-60  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.00350809  normal  0.534968 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3879  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  39.33 
 
 
327 aa  232  6e-60  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13850  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  42.68 
 
 
329 aa  232  6e-60  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.254776  normal  0.121323 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1477  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  39.88 
 
 
343 aa  231  1e-59  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1230  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  44.76 
 
 
361 aa  230  2e-59  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0359079 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3972  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  39.02 
 
 
327 aa  230  3e-59  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.76185 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3369  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  39.88 
 
 
329 aa  230  3e-59  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.986754 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4636  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  37.16 
 
 
335 aa  230  3e-59  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.886465  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4668  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  39.27 
 
 
326 aa  229  5e-59  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4099  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  41.46 
 
 
328 aa  228  8e-59  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4082  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  39.02 
 
 
327 aa  228  8e-59  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1219  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  39.46 
 
 
343 aa  228  9e-59  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3389  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  40.06 
 
 
345 aa  228  9e-59  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.142655 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2294  molybdenum cofactor synthesis-like protein  39.39 
 
 
343 aa  228  1e-58  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.819438  normal  0.288713 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0369  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  39.17 
 
 
321 aa  227  2e-58  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  unclonable  0.00000000000001817  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1615  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  42.25 
 
 
596 aa  226  3e-58  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3065  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  40.06 
 
 
330 aa  226  3e-58  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.468435 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1410  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  39.4 
 
 
335 aa  227  3e-58  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.438576  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2703  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  39.04 
 
 
345 aa  226  5.0000000000000005e-58  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4724  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  39.02 
 
 
327 aa  226  6e-58  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1769  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  39.82 
 
 
329 aa  226  6e-58  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0518  GTP cyclohydrolase subunit MoaA  41.54 
 
 
365 aa  226  6e-58  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7629  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  41.74 
 
 
342 aa  225  7e-58  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2586  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  41.14 
 
 
340 aa  225  7e-58  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>