138 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_2271 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011146  Gbem_2271  MOSC domain containing protein  100 
 
 
143 aa  293  5e-79  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1952  MOSC domain containing protein  98.6 
 
 
143 aa  290  5e-78  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0302  MOSC  76.92 
 
 
146 aa  233  9e-61  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3145  MOSC domain-containing protein  77.14 
 
 
144 aa  231  2.0000000000000002e-60  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2418  MOSC domain-containing protein  72.73 
 
 
143 aa  226  1e-58  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1160  MOSC domain containing protein  74.47 
 
 
262 aa  224  4e-58  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.242094  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2094  MOSC  75.18 
 
 
152 aa  223  6e-58  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2930  MOSC domain containing protein  72.03 
 
 
143 aa  222  1e-57  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0913  MOSC domain containing protein  72.66 
 
 
143 aa  221  3e-57  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0303  MOSC domain-containing protein  72.14 
 
 
147 aa  219  9.999999999999999e-57  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.968814  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3570  MOSC domain-containing protein  74.45 
 
 
145 aa  217  3.9999999999999997e-56  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1355  MOSC domain containing protein  69.93 
 
 
143 aa  217  3.9999999999999997e-56  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0782676  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1967  hypothetical protein  68.75 
 
 
153 aa  197  5e-50  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.0000000022743  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1402  MOSC domain containing protein  69.5 
 
 
144 aa  197  6e-50  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2266  MOSC domain-containing protein  69.5 
 
 
145 aa  194  5.000000000000001e-49  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1266  MOSC domain containing protein  65.96 
 
 
154 aa  192  2e-48  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.509209  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2133  MOSC  64.79 
 
 
145 aa  191  3e-48  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0414  MOSC domain-containing protein  56.03 
 
 
144 aa  181  2.0000000000000003e-45  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.761963  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0750  MOSC domain-containing protein  60.28 
 
 
144 aa  181  4.0000000000000006e-45  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0426  MOSC domain containing protein  59.57 
 
 
158 aa  176  8e-44  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0198409  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01830  hypothetical protein  57.24 
 
 
177 aa  175  2e-43  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2403  MOSC domain-containing protein  58.74 
 
 
149 aa  172  9.999999999999999e-43  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0524087  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1394  MOSC domain-containing protein  56.34 
 
 
146 aa  171  3.9999999999999995e-42  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0205  MOSC domain containing protein  56.74 
 
 
147 aa  169  1e-41  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0214556  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0255  MOSC domain containing protein  57.34 
 
 
178 aa  169  2e-41  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10950  hypothetical protein  53.85 
 
 
180 aa  168  3e-41  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00746491  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1438  MOSC domain containing protein  58.99 
 
 
146 aa  165  2e-40  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1892  MOSC domain-containing protein  58.33 
 
 
147 aa  165  2e-40  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00267695  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0491  MOSC domain containing protein  53.9 
 
 
154 aa  163  5.9999999999999996e-40  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0514141  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2044  MOSC domain-containing protein  55 
 
 
142 aa  155  2e-37  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0259  MOSC domain containing protein  51.77 
 
 
162 aa  155  2e-37  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.215992 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1759  MOSC domain-containing protein  54.29 
 
 
142 aa  155  3e-37  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.188575  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1690  MOSC domain containing protein  50.71 
 
 
143 aa  151  2.9999999999999998e-36  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0830  molybdenum cofactor biosynthesis protein MoaC/MOSC-domain-containing protein  52.41 
 
 
308 aa  149  1e-35  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0671  MOSC domain containing protein  55.94 
 
 
144 aa  149  2e-35  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1481  molybdenum cofactor synthesis domain-containing protein  46.1 
 
 
310 aa  144  4.0000000000000006e-34  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.068215  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1545  hypothetical protein  54.01 
 
 
146 aa  144  6e-34  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.695091  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2235  MOSC domain-containing protein  53.96 
 
 
144 aa  144  6e-34  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2367  MOSC domain containing protein  54.01 
 
 
156 aa  142  1e-33  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0410  hypothetical protein  51.77 
 
 
148 aa  142  2e-33  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.966681  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1340  MOSC domain containing protein  52.94 
 
 
146 aa  141  3e-33  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1602  MOSC domain containing protein  44.97 
 
 
154 aa  140  6e-33  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0733  MOSC domain-containing protein  56.62 
 
 
152 aa  139  9e-33  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2768  MOSC domain containing protein  51.77 
 
 
144 aa  137  4.999999999999999e-32  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2836  MOSC domain-containing protein  50.7 
 
 
165 aa  135  2e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.654473  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0326  MOSC domain containing protein  51.15 
 
 
149 aa  132  1.9999999999999998e-30  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1399  MOSC domain-containing protein  40.82 
 
 
152 aa  123  9e-28  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.092789  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0371  MOSC domain-containing protein  44.3 
 
 
144 aa  106  1e-22  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0654  MOSC domain-containing protein  36.88 
 
 
139 aa  102  2e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000905439  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1858  MOSC domain-containing protein  39.86 
 
 
145 aa  100  5e-21  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5597  hypothetical protein  34.52 
 
 
179 aa  78.2  0.00000000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.963565  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0061  MOSC domain-containing protein  31.1 
 
 
201 aa  75.9  0.0000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.489415 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2483  hypothetical protein  33.54 
 
 
179 aa  73.9  0.0000000000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0431097  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1607  MOSC  33.33 
 
 
204 aa  70.1  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.401865  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4111  putative sulferase  37.23 
 
 
174 aa  68.2  0.00000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.641133  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0397  hypothetical protein  35.71 
 
 
145 aa  67.4  0.00000000006  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4234  MOSC domain-containing protein  32.54 
 
 
180 aa  66.2  0.0000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.37433  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3339  MOSC domain-containing protein  34.96 
 
 
200 aa  65.9  0.0000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0430  MOSC domain-containing protein  29.79 
 
 
151 aa  62.8  0.000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.458415 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2179  MOSC domain containing protein  32.12 
 
 
184 aa  62.4  0.000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2298  MOSC domain containing protein  30.71 
 
 
142 aa  62  0.000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0785  MOSC domain containing protein  34.56 
 
 
190 aa  60.8  0.000000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0148555 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4068  hypothetical protein  33.9 
 
 
181 aa  56.6  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0258336  normal  0.178916 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64470  hypothetical protein  42.53 
 
 
98 aa  56.2  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2005  MOSC domain containing protein  28.67 
 
 
180 aa  52.8  0.000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.695737 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1893  MOSC domain-containing protein  28.19 
 
 
218 aa  52.8  0.000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.552866  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1157  hypothetical protein  35.56 
 
 
241 aa  52  0.000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.192207 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7062  MOSC domain containing protein  29.52 
 
 
228 aa  52  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.593642  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3793  MOSC domain containing protein  31.13 
 
 
159 aa  51.6  0.000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00578414 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0779  MOSC domain-containing protein  29.63 
 
 
209 aa  50.1  0.00001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.161048  normal  0.0150919 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7200  MOSC domain-containing protein  29.66 
 
 
167 aa  50.1  0.00001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.313237 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08310  hypothetical protein  28.8 
 
 
214 aa  48.1  0.00004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0821937  normal  0.516945 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3206  MOSC domain containing protein  25.49 
 
 
200 aa  46.6  0.0001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0881785  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2362  MOSC domain-containing protein  26.54 
 
 
217 aa  46.2  0.0001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2405  MOSC domain-containing protein  26.54 
 
 
217 aa  46.2  0.0001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.458158  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4831  hypothetical protein  25.93 
 
 
189 aa  46.6  0.0001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  unclonable  0.000000085919  hitchhiker  0.00670464 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_09307  conserved hypothetical protein  31.67 
 
 
257 aa  45.8  0.0002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.409587  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2516  MOSC  33.33 
 
 
165 aa  45.8  0.0002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.406281  normal  0.326487 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0846  MOSC domain-containing protein  28.95 
 
 
214 aa  45.8  0.0002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.201546  normal  0.0737228 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4394  MOSC domain-containing protein  30.17 
 
 
213 aa  45.8  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11892  hypothetical protein  30.09 
 
 
251 aa  45.8  0.0002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.358209 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0963  MOSC domain-containing protein  26.06 
 
 
221 aa  45.1  0.0003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2674  MOSC domain-containing protein  33.33 
 
 
148 aa  45.4  0.0003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.216386  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06890  hypothetical protein  30.59 
 
 
233 aa  45.4  0.0003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.59857  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2719  MOSC domain-containing protein  33.33 
 
 
148 aa  45.4  0.0003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  decreased coverage  0.005456  normal  0.132425 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3658  MOSC domain containing protein  29.81 
 
 
217 aa  45.4  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.192632 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5926  hypothetical protein  28.68 
 
 
189 aa  45.1  0.0003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0229267  normal  0.231206 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2927  hypothetical protein  34.85 
 
 
165 aa  44.7  0.0004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0113815  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3877  MOSC  27.74 
 
 
224 aa  44.7  0.0004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.913671  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2906  MOSC domain containing protein  29.53 
 
 
167 aa  44.7  0.0004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2705  MOSC domain-containing protein  33.33 
 
 
148 aa  44.7  0.0004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.705945  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9197  hypothetical protein  28.68 
 
 
223 aa  44.7  0.0004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.91426 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5316  MOSC domain containing protein  29.6 
 
 
232 aa  44.7  0.0005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00687382  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2272  hypothetical protein  27.15 
 
 
228 aa  44.3  0.0005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.762242  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2232  hypothetical protein  27.15 
 
 
228 aa  44.3  0.0005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00032832  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2440  hypothetical protein  27.15 
 
 
228 aa  44.3  0.0005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.377712  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0387  MOSC domain containing protein  25.6 
 
 
153 aa  44.7  0.0005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2456  hypothetical protein  27.15 
 
 
228 aa  44.3  0.0005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2189  hypothetical protein  27.15 
 
 
228 aa  44.3  0.0006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.108105  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2534  hypothetical protein  27.15 
 
 
228 aa  44.3  0.0006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.100661  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>