150 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_2195 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_2195  membrane protein of unknown function  100 
 
 		 111 aa  196  7.999999999999999e-50  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00000942046  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2032  membrane protein of unknown function  87.39 
 
 		 111 aa  149  1e-35  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000008644 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0487  membrane protein of unknown function  51.89 
 
 		 131 aa  111  4.0000000000000004e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.100624 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3507  membrane protein of unknown function  59.81 
 
 		 111 aa  106  1e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3757  membrane protein of unknown function  52.25 
 
 		 117 aa  104  4e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2917  membrane protein of unknown function  50.45 
 
 		 146 aa  102  2e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0179  hypothetical protein  50.45 
 
 		 117 aa  101  3e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1444  membrane protein of unknown function  51.85 
 
 		 113 aa  100  5e-21  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3164  hypothetical protein  47.75 
 
 		 117 aa  99.4  1e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2841  hypothetical protein  47.75 
 
 		 117 aa  99.4  2e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.225789  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0056  YvlD  47.75 
 
 		 117 aa  99.4  2e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3416  hypothetical protein  47.75 
 
 		 117 aa  99.4  2e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1702  hypothetical protein  47.75 
 
 		 117 aa  99.4  2e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3837  hypothetical protein  47.75 
 
 		 117 aa  99.4  2e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.974932  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3918  hypothetical protein  47.75 
 
 		 117 aa  99.4  2e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3135  hypothetical protein  47.75 
 
 		 117 aa  99.4  2e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0809  membrane protein of unknown function  54.13 
 
 		 115 aa  99  2e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0338495  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0181  membrane protein of unknown function  47.75 
 
 		 117 aa  99  2e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.490154  normal  0.0333124 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0995  membrane protein of unknown function  46.3 
 
 		 113 aa  98.6  3e-20  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3376  hypothetical protein  45.95 
 
 		 117 aa  97.1  7e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2834  membrane protein of unknown function  45.95 
 
 		 117 aa  97.1  7e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.533371  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0187  membrane protein of unknown function  45.95 
 
 		 117 aa  97.1  7e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0273  membrane protein of unknown function  45.95 
 
 		 117 aa  97.1  7e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.896434  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0255  membrane protein of unknown function  45.95 
 
 		 117 aa  97.1  7e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0200  membrane protein of unknown function  45.95 
 
 		 117 aa  97.1  7e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1203  membrane protein of unknown function  42.73 
 
 		 112 aa  95.5  2e-19  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1495  hypothetical protein  47.27 
 
 		 114 aa  95.1  3e-19  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.184347  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1110  membrane protein of unknown function  56.52 
 
 		 113 aa  93.6  9e-19  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3391  membrane protein of unknown function  48.6 
 
 		 117 aa  92.8  1e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2963  hypothetical protein  50.47 
 
 		 130 aa  92.4  2e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000675616  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2178  hypothetical protein  50.91 
 
 		 113 aa  90.9  6e-18  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.71562 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0214  membrane protein of unknown function  47.12 
 
 		 116 aa  88.6  2e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0611076  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4241  membrane protein of unknown function  49.53 
 
 		 111 aa  89.4  2e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1471  membrane protein of unknown function  41.12 
 
 		 137 aa  88.6  3e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.260705 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4312  membrane protein of unknown function  46.43 
 
 		 117 aa  87.8  4e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.753835  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5482  membrane protein of unknown function  46.36 
 
 		 111 aa  88.2  4e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.296215 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4088  hypothetical protein  46.79 
 
 		 117 aa  88.2  4e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0925  hypothetical protein  47.71 
 
 		 113 aa  86.3  1e-16  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2723  membrane protein of unknown function  44.34 
 
 		 133 aa  86.3  1e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.67205  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04360  hypothetical protein  46.23 
 
 		 115 aa  85.1  3e-16  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2051  membrane protein of unknown function  44.55 
 
 		 113 aa  84.3  5e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2025  membrane protein of unknown function  44.55 
 
 		 113 aa  84.3  5e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4668  membrane protein of unknown function  41.74 
 
 		 117 aa  83.6  8e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.86551 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2245  membrane protein of unknown function  42.2 
 
 		 114 aa  83.6  9e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000194904  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0859  membrane protein of unknown function  44.9 
 
 		 115 aa  82.4  0.000000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.195504 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2280  membrane protein of unknown function  39.62 
 
 		 117 aa  81.3  0.000000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000000112149  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4653  membrane protein of unknown function  40.8 
 
 		 136 aa  81.3  0.000000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.330782  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1180  membrane protein of unknown function  48.62 
 
 		 138 aa  80.9  0.000000000000006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.746825 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3555  membrane protein of unknown function  44.86 
 
 		 115 aa  80.5  0.000000000000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0169629  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5175  membrane protein of unknown function  39.81 
 
 		 117 aa  80.1  0.000000000000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0092  hypothetical protein  51.92 
 
 		 113 aa  79.7  0.00000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0469  membrane protein of unknown function  40.91 
 
 		 113 aa  79.7  0.00000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4042  membrane protein of unknown function  44.35 
 
 		 139 aa  78.6  0.00000000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.700012  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3547  membrane protein of unknown function  50 
 
 		 146 aa  78.2  0.00000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0137  membrane protein of unknown function  39.45 
 
 		 115 aa  77  0.00000000000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0712  membrane protein of unknown function  42.7 
 
 		 115 aa  76.6  0.0000000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2518  hypothetical protein  51.38 
 
 		 115 aa  75.9  0.0000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.505715 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2165  membrane protein of unknown function  46 
 
 		 115 aa  75.5  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.44463  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2118  membrane protein of unknown function  46 
 
 		 115 aa  75.5  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1532  membrane protein of unknown function  42.59 
 
 		 136 aa  74.7  0.0000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.679157 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1137  membrane protein of unknown function  38.74 
 
 		 134 aa  74.3  0.0000000000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.278732  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0362  membrane protein of unknown function  43.69 
 
 		 122 aa  73.6  0.0000000000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.825053 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1341  membrane protein of unknown function  48.65 
 
 		 146 aa  73.2  0.000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1666  membrane protein of unknown function  42.39 
 
 		 116 aa  72.8  0.000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.124642 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3080  hypothetical protein  51.35 
 
 		 114 aa  70.1  0.00000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0378  membrane protein of unknown function  47.12 
 
 		 115 aa  69.7  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35940  predicted membrane protein  39.67 
 
 		 130 aa  69.7  0.00000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.334945  normal  0.45133 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0255  hypothetical protein  50.55 
 
 		 119 aa  68.9  0.00000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1873  hypothetical protein  39.62 
 
 		 129 aa  68.9  0.00000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3918  membrane protein of unknown function  43.62 
 
 		 117 aa  69.3  0.00000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.239558  hitchhiker  0.00320816 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0393  membrane protein of unknown function  44.44 
 
 		 134 aa  69.3  0.00000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.785636  normal  0.196357 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25510  predicted membrane protein  37.72 
 
 		 130 aa  68.6  0.00000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.355716  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0192  membrane protein of unknown function  48.04 
 
 		 115 aa  68.2  0.00000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00196121 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0171  membrane hypothetical protein  48.62 
 
 		 115 aa  68.6  0.00000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.186847  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2284  membrane protein  37.23 
 
 		 117 aa  67.8  0.00000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.555314 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2907  membrane protein of unknown function  35.9 
 
 		 122 aa  67.8  0.00000000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0596  hypothetical protein  35.78 
 
 		 118 aa  67.4  0.00000000006  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0520  membrane protein of unknown function  36.84 
 
 		 115 aa  67.4  0.00000000007  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4030  membrane protein of unknown function  38.06 
 
 		 141 aa  67  0.00000000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3382  membrane protein of unknown function  43.12 
 
 		 122 aa  66.6  0.0000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4032  membrane protein of unknown function  43.12 
 
 		 144 aa  66.2  0.0000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0562  hypothetical protein  31.19 
 
 		 114 aa  65.1  0.0000000003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3225  membrane protein of unknown function  39.37 
 
 		 137 aa  65.1  0.0000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4413  membrane protein of unknown function  39.25 
 
 		 115 aa  63.9  0.0000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.936738 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2517  membrane protein of unknown function  35.11 
 
 		 117 aa  63.9  0.0000000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0110304 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1700  membrane protein of unknown function  47.62 
 
 		 114 aa  63.5  0.0000000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2469  membrane protein of unknown function  44.44 
 
 		 132 aa  63.5  0.0000000009  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.978118  normal  0.0141689 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4675  membrane protein of unknown function  42.2 
 
 		 124 aa  63.2  0.000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2988  membrane protein of unknown function  42.5 
 
 		 119 aa  63.5  0.000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.547777  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2711  membrane protein of unknown function  37.04 
 
 		 145 aa  63.2  0.000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.233324  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1135  membrane protein of unknown function  52.63 
 
 		 66 aa  62.4  0.000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.0708618 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0977  membrane protein of unknown function  40.57 
 
 		 119 aa  61.6  0.000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.443655  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4717  membrane protein of unknown function  35.83 
 
 		 129 aa  61.2  0.000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.559466  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3407  membrane protein of unknown function  47.06 
 
 		 126 aa  61.2  0.000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1075  membrane protein of unknown function  41.24 
 
 		 136 aa  60.5  0.000000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3172  membrane protein of unknown function  38.83 
 
 		 120 aa  59.7  0.00000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0185  membrane protein of unknown function  47.27 
 
 		 115 aa  60.1  0.00000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4337  membrane protein of unknown function  35 
 
 		 129 aa  60.1  0.00000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  hitchhiker  0.00733225  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4423  membrane protein of unknown function  35 
 
 		 129 aa  60.1  0.00000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.512548 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3396  membrane protein of unknown function  44.57 
 
 		 126 aa  58.9  0.00000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.573144  hitchhiker  0.0024636 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>