More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_2171 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_2171  protein of unknown function DUF156  100 
 
 		 96 aa  197  3e-50  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2051  protein of unknown function DUF156  97.92 
 
 		 96 aa  196  1.0000000000000001e-49  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  7.44014e-26 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3638  hypothetical protein  79.17 
 
 		 96 aa  162  1.0000000000000001e-39  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1531  hypothetical protein  77.08 
 
 		 96 aa  159  1e-38  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19810  hypothetical protein  42.11 
 
 		 119 aa  77  0.00000000000007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.418046  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3133  protein of unknown function DUF156  43.01 
 
 		 99 aa  76.6  0.0000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.032258  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2278  hypothetical protein  41.49 
 
 		 92 aa  75.5  0.0000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1688  protein of unknown function DUF156  46.15 
 
 		 103 aa  75.1  0.0000000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1700  protein of unknown function DUF156  46.15 
 
 		 103 aa  75.1  0.0000000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0139409  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3871  protein of unknown function DUF156  41.76 
 
 		 125 aa  73.6  0.0000000000009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00362908 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1900  protein of unknown function DUF156  39.78 
 
 		 109 aa  73.6  0.0000000000009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0466  protein of unknown function DUF156  35.48 
 
 		 97 aa  73.2  0.000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.686705  normal  0.135664 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2284  hypothetical protein  45.05 
 
 		 98 aa  72.8  0.000000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1741  protein of unknown function DUF156  57.14 
 
 		 92 aa  72.8  0.000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2597  protein of unknown function DUF156  40.86 
 
 		 109 aa  72.4  0.000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3831  hypothetical protein  39.78 
 
 		 100 aa  72.4  0.000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.715708  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3761  hypothetical protein  39.78 
 
 		 100 aa  72.4  0.000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.894336  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3577  hypothetical protein  39.78 
 
 		 100 aa  72.4  0.000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000813292  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3477  hypothetical protein  39.78 
 
 		 100 aa  72.4  0.000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00168287  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3489  hypothetical protein  39.78 
 
 		 100 aa  72.4  0.000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0105501  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3861  hypothetical protein  39.78 
 
 		 100 aa  72.4  0.000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00835588  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3743  hypothetical protein  39.78 
 
 		 100 aa  72.4  0.000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000430591 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4242  protein of unknown function DUF156  40.86 
 
 		 115 aa  72  0.000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10580  hypothetical protein  39.78 
 
 		 101 aa  71.6  0.000000000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.0042499  normal  0.482533 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10191  hypothetical protein  39.18 
 
 		 96 aa  70.9  0.000000000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0533  hypothetical protein  48.33 
 
 		 100 aa  70.5  0.000000000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0395944  normal  0.0381301 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1470  hypothetical protein  38.71 
 
 		 100 aa  70.5  0.000000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0383615  hitchhiker  0.0000277305 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3498  hypothetical protein  38.71 
 
 		 100 aa  70.5  0.000000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.434736  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0183  hypothetical protein  50.75 
 
 		 103 aa  69.7  0.00000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.49313  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0279  YvgZ  50.75 
 
 		 103 aa  69.7  0.00000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3781  hypothetical protein  38.71 
 
 		 100 aa  69.7  0.00000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00152892  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0175  hypothetical protein  41.76 
 
 		 145 aa  69.7  0.00000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.860909  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1802  protein of unknown function DUF156  47.14 
 
 		 103 aa  69.3  0.00000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3668  hypothetical protein  37.63 
 
 		 97 aa  70.1  0.00000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.531949  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13320  hypothetical protein  35.11 
 
 		 91 aa  68.9  0.00000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00119769  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3257  protein of unknown function DUF156  39.78 
 
 		 101 aa  68.9  0.00000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.664348  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36130  hypothetical protein  40 
 
 		 93 aa  68.9  0.00000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.225482  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4097  hypothetical protein  38.54 
 
 		 115 aa  68.9  0.00000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4499  hypothetical protein  38.71 
 
 		 108 aa  69.3  0.00000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.519747 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0445  hypothetical protein  46.67 
 
 		 103 aa  69.3  0.00000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.467567  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1271  protein of unknown function DUF156  46.77 
 
 		 88 aa  68.6  0.00000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.858801  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2077  protein of unknown function DUF156  52.46 
 
 		 87 aa  68.6  0.00000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.938076  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2124  hypothetical protein  40.54 
 
 		 97 aa  68.2  0.00000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0114083  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2162  hypothetical protein  40.54 
 
 		 97 aa  68.2  0.00000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0148  hypothetical protein  41.76 
 
 		 103 aa  67.8  0.00000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.626316  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0157  hypothetical protein  41.76 
 
 		 103 aa  67.8  0.00000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.603264  normal  0.882667 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2404  hypothetical protein  48.39 
 
 		 101 aa  67.8  0.00000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000296567  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4267  hypothetical protein  38.46 
 
 		 110 aa  67.8  0.00000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5706  hypothetical protein  36.56 
 
 		 97 aa  67.4  0.00000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.840437 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5303  hypothetical protein  36.56 
 
 		 97 aa  67.4  0.00000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.198456  normal  0.383245 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2632  hypothetical protein  49.23 
 
 		 95 aa  67.4  0.00000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.00527658  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1293  protein of unknown function DUF156  39.74 
 
 		 86 aa  67.4  0.00000000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0819  hypothetical protein  37.63 
 
 		 89 aa  67  0.00000000008  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  decreased coverage  0.0000000405513  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4465  hypothetical protein  39.78 
 
 		 109 aa  67  0.00000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4548  hypothetical protein  39.78 
 
 		 109 aa  67  0.00000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0673  hypothetical protein  48.28 
 
 		 152 aa  67  0.00000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.121389  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3443  protein of unknown function DUF156  37.36 
 
 		 119 aa  67  0.00000000009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0992847  hitchhiker  0.00675708 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4549  protein of unknown function DUF156  36.26 
 
 		 98 aa  66.6  0.0000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3671  protein of unknown function DUF156  38.71 
 
 		 93 aa  66.2  0.0000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1454  hypothetical protein  52.54 
 
 		 109 aa  66.6  0.0000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1112  protein of unknown function DUF156  44.59 
 
 		 98 aa  66.6  0.0000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.192751  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1472  hypothetical protein  52.54 
 
 		 109 aa  66.6  0.0000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0138  hypothetical protein  39.56 
 
 		 103 aa  66.6  0.0000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0713014 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5191  protein of unknown function DUF156  50 
 
 		 93 aa  66.6  0.0000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0909997  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0484  hypothetical protein  40.66 
 
 		 104 aa  66.6  0.0000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.082192 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2851  hypothetical protein  50 
 
 		 109 aa  66.2  0.0000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.978833 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1694  hypothetical protein  39.19 
 
 		 97 aa  65.5  0.0000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.607073  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4045  hypothetical protein  36.84 
 
 		 93 aa  65.9  0.0000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0914  hypothetical protein  50 
 
 		 109 aa  65.9  0.0000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5881  hypothetical protein  35.48 
 
 		 98 aa  65.5  0.0000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.811301 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0784  protein of unknown function DUF156  36.96 
 
 		 98 aa  65.1  0.0000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.63261  normal  0.0129071 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3648  protein of unknown function DUF156  54.9 
 
 		 121 aa  65.1  0.0000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3583  protein of unknown function DUF156  53.85 
 
 		 121 aa  64.7  0.0000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2658  protein of unknown function DUF156  49.21 
 
 		 99 aa  64.7  0.0000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00269509  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4021  protein of unknown function DUF156  38.46 
 
 		 93 aa  64.7  0.0000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.359633 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4587  hypothetical protein  46.67 
 
 		 93 aa  64.7  0.0000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3092  hypothetical protein  46.03 
 
 		 91 aa  64.3  0.0000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.642683  normal  0.388953 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2026  hypothetical protein  42.42 
 
 		 88 aa  64.3  0.0000000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0017  hypothetical protein  35.16 
 
 		 93 aa  64.3  0.0000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3585  protein of unknown function DUF156  34.41 
 
 		 92 aa  64.3  0.0000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000231569  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3652  protein of unknown function DUF156  52.94 
 
 		 121 aa  63.9  0.0000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3495  hypothetical protein  40 
 
 		 121 aa  64.3  0.0000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3870  hypothetical protein  50.79 
 
 		 91 aa  63.9  0.0000000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.863177 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3876  hypothetical protein  46.88 
 
 		 103 aa  63.9  0.0000000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000226345  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2499  protein of unknown function DUF156  44.93 
 
 		 141 aa  63.9  0.0000000007  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.716085 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1650  hypothetical protein  40.26 
 
 		 93 aa  63.9  0.0000000007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0910  hypothetical protein  41.67 
 
 		 91 aa  63.5  0.0000000008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1674  hypothetical protein  47.62 
 
 		 97 aa  63.9  0.0000000008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.184479  hitchhiker  0.000845863 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0461  hypothetical protein  37.18 
 
 		 91 aa  63.9  0.0000000008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000042131  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1857  protein of unknown function DUF156  49.21 
 
 		 91 aa  63.5  0.0000000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.151072  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1481  hypothetical protein  49.21 
 
 		 91 aa  63.2  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.494418  normal  1 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4381  hypothetical protein  47.62 
 
 		 91 aa  63.2  0.000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3435  hypothetical protein  49.21 
 
 		 91 aa  62.8  0.000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5648  protein of unknown function DUF156  37.23 
 
 		 93 aa  63.2  0.000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0952  hypothetical protein  48.28 
 
 		 95 aa  62.8  0.000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9134  hypothetical protein  46.55 
 
 		 93 aa  62.8  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.733777 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1475  hypothetical protein  43.08 
 
 		 88 aa  62.4  0.000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000574434  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36760  hypothetical protein  34.38 
 
 		 93 aa  62.4  0.000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.176148 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1739  protein of unknown function DUF156  42.62 
 
 		 103 aa  62.8  0.000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0478748  hitchhiker  0.00498764 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0207  hypothetical protein  46.03 
 
 		 91 aa  62.8  0.000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>