More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_2052 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011146  Gbem_2052  dethiobiotin synthase  100 
 
 
239 aa  481  1e-135  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2165  dethiobiotin synthase  96.23 
 
 
239 aa  463  1e-129  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1583  dethiobiotin synthase  64.56 
 
 
240 aa  302  3.0000000000000004e-81  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0552587  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2243  dethiobiotin synthase  62.13 
 
 
243 aa  294  9e-79  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.519579  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1581  dethiobiotin synthase  61.7 
 
 
241 aa  282  4.0000000000000003e-75  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.413996 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2369  dethiobiotin synthase  58.72 
 
 
264 aa  271  1e-71  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0971494  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1176  dethiobiotin synthase  60 
 
 
243 aa  260  1e-68  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.592702  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1327  dethiobiotin synthase  46.36 
 
 
263 aa  179  4e-44  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1836  dethiobiotin synthase  43.29 
 
 
242 aa  173  2.9999999999999996e-42  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.354399  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1459  dethiobiotin synthase  44.81 
 
 
244 aa  157  2e-37  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000175087  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3950  dithiobiotin synthetase  39.06 
 
 
242 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0103  dethiobiotin synthase  42.65 
 
 
241 aa  146  3e-34  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.188104  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1008  dithiobiotin synthetase  40.28 
 
 
242 aa  144  1e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2817  dithiobiotin synthetase  39.19 
 
 
242 aa  142  4e-33  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2160  dethiobiotin synthase  45.65 
 
 
228 aa  142  5e-33  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4252  dithiobiotin synthetase  40.28 
 
 
242 aa  142  6e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4229  dithiobiotin synthetase  38.2 
 
 
242 aa  141  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.411801  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3874  dithiobiotin synthetase  40.36 
 
 
242 aa  140  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0885  dethiobiotin synthase  39.51 
 
 
211 aa  139  3e-32  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4027  dithiobiotin synthetase  40.57 
 
 
242 aa  139  4.999999999999999e-32  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4340  dithiobiotin synthetase  40.57 
 
 
242 aa  139  4.999999999999999e-32  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4188  dithiobiotin synthetase  40.09 
 
 
242 aa  137  1e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3860  dithiobiotin synthetase  40.57 
 
 
242 aa  137  1e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4142  dithiobiotin synthetase  40.57 
 
 
242 aa  137  1e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6892  dethiobiotin synthase  40 
 
 
234 aa  136  3.0000000000000003e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0149  dethiobiotin synthase  44.69 
 
 
248 aa  128  6e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0820  dethiobiotin synthase  37.3 
 
 
186 aa  127  1.0000000000000001e-28  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.22019  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0823  dethiobiotin synthase  34.15 
 
 
228 aa  127  1.0000000000000001e-28  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0599522 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4265  dithiobiotin synthetase  38.43 
 
 
245 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0554323 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0372  dithiobiotin synthetase  42.53 
 
 
239 aa  126  3e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.356167  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2812  dethiobiotin synthase  41.04 
 
 
266 aa  126  4.0000000000000003e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.00660538  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0021  dethiobiotin synthase  33.65 
 
 
244 aa  126  4.0000000000000003e-28  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00210748  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2887  dethiobiotin synthase  40 
 
 
226 aa  125  7e-28  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.5609  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0153  dethiobiotin synthase  39.2 
 
 
238 aa  124  1e-27  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2543  dethiobiotin synthase  36.02 
 
 
243 aa  124  1e-27  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000737689  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1157  dethiobiotin synthase  37.5 
 
 
217 aa  123  2e-27  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.125346  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6277  dithiobiotin synthetase  41.26 
 
 
239 aa  123  3e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1794  dithiobiotin synthetase  32.59 
 
 
228 aa  123  3e-27  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.26269  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0883  dethiobiotin synthase  42.2 
 
 
212 aa  122  4e-27  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.619901  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1833  dethiobiotin synthase  39.29 
 
 
233 aa  121  9.999999999999999e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0899  dethiobiotin synthase  43.68 
 
 
232 aa  120  9.999999999999999e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.579086 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0465  dithiobiotin synthetase  42.61 
 
 
230 aa  120  1.9999999999999998e-26  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  decreased coverage  0.000000224118  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1097  dethiobiotin synthase  35.15 
 
 
190 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.110147  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0445  dithiobiotin synthetase  36.24 
 
 
247 aa  119  3e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1373  dethiobiotin synthase  42.77 
 
 
262 aa  119  6e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1675  dethiobiotin synthetase  42.77 
 
 
251 aa  118  7e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2454  dethiobiotin synthase  37.16 
 
 
224 aa  118  7e-26  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.101684  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0116  dethiobiotin synthase  40.11 
 
 
254 aa  118  7.999999999999999e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.173766  normal  0.959156 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0003  dethiobiotin synthase  34.74 
 
 
186 aa  117  9.999999999999999e-26  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2097  dethiobiotin synthase  41.95 
 
 
243 aa  117  9.999999999999999e-26  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1133  dithiobiotin synthetase  36.07 
 
 
226 aa  116  1.9999999999999998e-25  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3643  dethiobiotin synthase  36.19 
 
 
236 aa  115  5e-25  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2536  dethiobiotin synthase  37.36 
 
 
226 aa  115  5e-25  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000213384  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1568  dethiobiotin synthase  41.4 
 
 
231 aa  115  6.9999999999999995e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.248853  normal  0.275033 
 
 
-
 
NC_002950  PG2053  dithiobiotin synthetase  36.22 
 
 
217 aa  113  3e-24  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0534973 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4330  dithiobiotin synthetase  34.44 
 
 
228 aa  113  3e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.112465  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0410  dithiobiotin synthetase  44.25 
 
 
240 aa  112  5e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0572  dithiobiotin synthetase  44.25 
 
 
240 aa  112  5e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0389  dithiobiotin synthetase  44.25 
 
 
240 aa  112  5e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0526  dethiobiotin synthase  37.99 
 
 
248 aa  110  1.0000000000000001e-23  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1842  dithiobiotin synthetase  33.97 
 
 
244 aa  109  3e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.709275  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2384  dethiobiotin synthase  40.91 
 
 
238 aa  108  6e-23  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.393597  normal  0.141052 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0422  dethiobiotin synthase  39.08 
 
 
234 aa  107  1e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000789598 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0246  dethiobiotin synthetase  39.08 
 
 
234 aa  107  1e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.187676  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2855  dethiobiotin synthase  37.99 
 
 
249 aa  106  3e-22  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2293  dethiobiotin synthase  35.78 
 
 
220 aa  106  4e-22  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2900  dithiobiotin synthetase  37.14 
 
 
221 aa  105  4e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.380379  normal  0.231577 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0323  dethiobiotin synthase  44.5 
 
 
227 aa  106  4e-22  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.0117307 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2982  dithiobiotin synthetase  41.26 
 
 
239 aa  105  5e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0144  dethiobiotin synthase  36.71 
 
 
474 aa  105  8e-22  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.211479  normal  0.0379424 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2835  dethiobiotin synthase  35.2 
 
 
225 aa  105  9e-22  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0398  dethiobiotin synthase  34.25 
 
 
213 aa  104  9e-22  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003868  dethiobiotin synthetase  34.51 
 
 
228 aa  104  1e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0874118  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2946  dethiobiotin synthase  34.08 
 
 
239 aa  103  2e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00040484  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1047  dethiobiotin synthase  40.56 
 
 
216 aa  103  2e-21  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.113648  normal  0.557843 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1373  dithiobiotin synthetase  38.01 
 
 
235 aa  103  2e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.409918  normal  0.0708007 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0292  dethiobiotin synthase  37.39 
 
 
237 aa  103  3e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0765643  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0613  dethiobiotin synthase  38.57 
 
 
245 aa  102  4e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.661073  normal  0.951436 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3699  dethiobiotin synthase  36.36 
 
 
240 aa  102  4e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0969414  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2319  dithiobiotin synthetase  43.68 
 
 
239 aa  102  4e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0506133  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2933  dithiobiotin synthetase  43.68 
 
 
239 aa  102  4e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0892  dithiobiotin synthetase  36 
 
 
228 aa  102  5e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.000165002  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2066  dithiobiotin synthetase  33.94 
 
 
231 aa  102  5e-21  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1474  dithiobiotin synthetase  38.19 
 
 
202 aa  102  5e-21  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.718832 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0304  dethiobiotin synthase  34.46 
 
 
225 aa  102  5e-21  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0861  dithiobiotin synthetase  36 
 
 
230 aa  102  5e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00211774  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2948  dithiobiotin synthetase  43.1 
 
 
239 aa  102  5e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2678  dithiobiotin synthetase  30.45 
 
 
234 aa  102  6e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3426  dithiobiotin synthetase  30.45 
 
 
234 aa  102  6e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0249  dithiobiotin synthetase  31.37 
 
 
225 aa  102  6e-21  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1804  dethiobiotin synthase  35.8 
 
 
221 aa  101  8e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.511205  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2845  dithiobiotin synthetase  43.1 
 
 
239 aa  102  8e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0071  dethiobiotin synthase  37.12 
 
 
223 aa  101  9e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.255458  normal  0.0373724 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1437  dithiobiotin synthetase  37.43 
 
 
235 aa  101  9e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.895386  normal  0.581627 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1163  dethiobiotin synthase  34.18 
 
 
255 aa  101  1e-20  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2753  dithiobiotin synthetase  33.49 
 
 
234 aa  101  1e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.11733  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1910  dethiobiotin synthase  35.92 
 
 
204 aa  101  1e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01810  dithiobiotin synthetase  36.08 
 
 
227 aa  101  1e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1428  dithiobiotin synthetase  32.11 
 
 
240 aa  100  2e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0924  dithiobiotin synthetase  35.43 
 
 
228 aa  100  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.000798071  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>