More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_2050 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU2489  TatD family deoxyribonuclease  71.49 
 
 		 462 aa  692    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2464  TatD-related deoxyribonuclease:radical SAM family protein  71.27 
 
 		 606 aa  703    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2050  hydrolase, TatD family  100 
 
 		 458 aa  934    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2510  TatD family hydrolase  69.08 
 
 		 462 aa  686    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000460878  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2167  hydrolase, TatD family  97.6 
 
 		 458 aa  916    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2238  hydrolase, TatD family  62.28 
 
 		 457 aa  612  9.999999999999999e-175  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1702  TatD family hydrolase  64.55 
 
 		 461 aa  596  1e-169  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00243326  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1695  Mg-dependent DNase  55.36 
 
 		 464 aa  543  1e-153  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1867  TatD family hydrolase  42.73 
 
 		 459 aa  381  1e-104  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0284119  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1239  hydrolase, TatD family  36.72 
 
 		 454 aa  335  1e-90  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0877  Radical SAM domain protein  61.11 
 
 		 210 aa  252  1e-65  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21920  hydrolase, TatD family  44.53 
 
 		 257 aa  248  1e-64  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0038  TatD family deoxyribonuclease  46.06 
 
 		 255 aa  248  2e-64  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0035  TatD related DNase  46.06 
 
 		 255 aa  248  2e-64  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0037  TatD family deoxyribonuclease  46.06 
 
 		 255 aa  248  2e-64  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0044  deoxyribonuclease, TatD family  46.06 
 
 		 255 aa  248  2e-64  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0066  TatD family hydrolase  47.06 
 
 		 257 aa  247  3e-64  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0305827  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0048  deoxyribonuclease, TatD family  45.67 
 
 		 255 aa  246  4.9999999999999997e-64  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0037  TatD family deoxyribonuclease  45.67 
 
 		 255 aa  246  6e-64  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5272  deoxyribonuclease, TatD family  45.67 
 
 		 255 aa  246  8e-64  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0034  TatD family hydrolase  45.28 
 
 		 255 aa  245  9.999999999999999e-64  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0044  deoxyribonuclease, TatD family  45.67 
 
 		 255 aa  245  9.999999999999999e-64  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.413884  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0035  TatD related DNase  45.28 
 
 		 255 aa  244  1.9999999999999999e-63  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.305116  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0468  hydrolase, TatD family  47.15 
 
 		 264 aa  243  3.9999999999999997e-63  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.573991 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0034  TatD family hydrolase  44.09 
 
 		 255 aa  242  1e-62  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0049  TatD-related deoxyribonuclease  46.88 
 
 		 256 aa  241  2e-62  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000233797 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0034  hydrolase, TatD family  44.09 
 
 		 256 aa  240  4e-62  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.301628  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0044  hydrolase, TatD family  42.8 
 
 		 256 aa  239  5e-62  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0032  hydrolase, TatD family  44.09 
 
 		 256 aa  238  1e-61  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3626  TatD family hydrolase  47.22 
 
 		 264 aa  238  2e-61  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000292684  normal  0.319005 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2095  TatD family hydrolase  44.09 
 
 		 255 aa  233  4.0000000000000004e-60  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2114  hydrolase, TatD family  47.29 
 
 		 261 aa  233  4.0000000000000004e-60  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.167709  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0067  TatD family hydrolase  45.28 
 
 		 255 aa  233  5e-60  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000334455  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0107  hydrolase, TatD family  44.88 
 
 		 256 aa  231  2e-59  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000974122  hitchhiker  0.000198831 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0050  TatD family hydrolase  43.8 
 
 		 256 aa  230  5e-59  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000000022674  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2068  hydrolase, TatD family  44.53 
 
 		 257 aa  225  1e-57  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0246  TatD family hydrolase  42.58 
 
 		 258 aa  223  4e-57  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0264  TatD family hydrolase  43.65 
 
 		 256 aa  222  9.999999999999999e-57  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.281145  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0706  TatD family hydrolase  43.19 
 
 		 255 aa  222  9.999999999999999e-57  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0068  hydrolase, TatD family  42.52 
 
 		 253 aa  219  7e-56  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00105138  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1347  TatD-related deoxyribonuclease  42.69 
 
 		 268 aa  219  1e-55  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0168  hydrolase, TatD family  38.98 
 
 		 255 aa  217  2.9999999999999998e-55  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.61634  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2184  hydrolase, TatD family  43.46 
 
 		 263 aa  217  4e-55  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.124679  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0963  TatD family hydrolase  42.46 
 
 		 256 aa  216  9e-55  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1540  TatD-related deoxyribonuclease  47.47 
 
 		 262 aa  214  1.9999999999999998e-54  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.259473  normal  0.131374 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0262  TatD family hydrolase  41.27 
 
 		 256 aa  214  1.9999999999999998e-54  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0578567  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0481  TatD-related deoxyribonuclease  45.88 
 
 		 256 aa  214  2.9999999999999995e-54  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3114  TatD family hydrolase  45.67 
 
 		 268 aa  213  4.9999999999999996e-54  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.677659  normal  0.341817 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0818  TatD family hydrolase  41.86 
 
 		 264 aa  213  7e-54  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1913  putative metallodependent hydrolase  43.24 
 
 		 258 aa  213  7.999999999999999e-54  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000168502  hitchhiker  0.00000614927 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2448  TatD family hydrolase  44.75 
 
 		 259 aa  212  1e-53  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0109125  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0512  TatD family hydrolase  44.31 
 
 		 257 aa  212  1e-53  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.155633  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0525  TatD family hydrolase  44.31 
 
 		 257 aa  212  1e-53  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.117566  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1585  putative metallodependent hydrolase  43.63 
 
 		 269 aa  210  5e-53  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000288307  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1693  putative metallodependent hydrolase  43.63 
 
 		 269 aa  209  6e-53  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0223862  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3491  putative metallodependent hydrolase  43.63 
 
 		 269 aa  209  6e-53  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000629456  normal  0.0349317 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0042  TatD family hydrolase  43.97 
 
 		 261 aa  209  1e-52  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.804298  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1776  hydrolase, TatD family  40.39 
 
 		 263 aa  207  3e-52  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1485  hypothetical protein  41.63 
 
 		 257 aa  207  3e-52  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.507354  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1799  hydrolase, TatD family  42.86 
 
 		 257 aa  207  4e-52  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.339563  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1381  TatD-related deoxyribonuclease  42.86 
 
 		 254 aa  206  6e-52  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1584  TatD family hydrolase  45.59 
 
 		 264 aa  206  6e-52  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.873471  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1315  TatD-related deoxyribonuclease  45.31 
 
 		 258 aa  206  8e-52  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.288431  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1289  TatD family hydrolase  44.31 
 
 		 259 aa  206  9e-52  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2545  hydrolase, TatD family  45.91 
 
 		 258 aa  205  1e-51  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0902937  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0774  hydrolase, TatD family  40.55 
 
 		 271 aa  206  1e-51  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2641  hydrolase, TatD family  45.91 
 
 		 258 aa  205  2e-51  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0861989  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1615  putative metallodependent hydrolase  43.63 
 
 		 264 aa  204  3e-51  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.0000000236116  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1630  putative metallodependent hydrolase  41.54 
 
 		 264 aa  203  4e-51  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.000015742  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1984  putative metallodependent hydrolase  43.24 
 
 		 265 aa  203  5e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.0000140367  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1989  hydrolase, TatD family  43.7 
 
 		 260 aa  203  5e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.727306  normal  0.0188315 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1010  hydrolase, TatD family  41.73 
 
 		 258 aa  203  5e-51  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0316  TatD family hydrolase  43.53 
 
 		 257 aa  202  9.999999999999999e-51  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.207917  normal  0.040307 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1301  putative metallodependent hydrolase  42.86 
 
 		 265 aa  202  9.999999999999999e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0214431  hitchhiker  0.0000000000156726 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2167  putative metallodependent hydrolase  42.86 
 
 		 265 aa  202  9.999999999999999e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.337997  hitchhiker  0.000000000251924 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1316  putative metallodependent hydrolase  42.86 
 
 		 265 aa  202  9.999999999999999e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.211046  hitchhiker  0.00000000025238 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1278  putative metallodependent hydrolase  42.86 
 
 		 265 aa  202  9.999999999999999e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.558923  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02901  deoxyribonuclease  42.75 
 
 		 255 aa  201  1.9999999999999998e-50  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1594  putative metallodependent hydrolase  41.31 
 
 		 265 aa  201  1.9999999999999998e-50  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.118654  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0262  hydrolase, TatD family  38.67 
 
 		 251 aa  201  3e-50  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000135646  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1656  hydrolase, TatD family  40.3 
 
 		 269 aa  200  5e-50  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1826  TatD-related deoxyribonuclease  43.75 
 
 		 259 aa  200  5e-50  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1700  TatD-related deoxyribonuclease  41.5 
 
 		 270 aa  199  6e-50  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.294138  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2547  hydrolase, TatD family  42.08 
 
 		 265 aa  199  7e-50  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000234305  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2496  putative metallodependent hydrolase  42.08 
 
 		 265 aa  199  7e-50  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00642491  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2029  TatD-related deoxyribonuclease  38.78 
 
 		 267 aa  199  7e-50  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2224  putative metallodependent hydrolase  42.08 
 
 		 265 aa  199  7e-50  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000510394  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01096  predicted metallodependent hydrolase  42.08 
 
 		 265 aa  199  1.0000000000000001e-49  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0276018  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01104  hypothetical protein  42.08 
 
 		 265 aa  199  1.0000000000000001e-49  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0293758  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2027  putative metallodependent hydrolase  42.08 
 
 		 265 aa  199  1.0000000000000001e-49  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000000195857  hitchhiker  0.00000164226 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0611  TatD family hydrolase  40.62 
 
 		 255 aa  198  1.0000000000000001e-49  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.130062  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0540  hydrolase, TatD family  42.69 
 
 		 267 aa  198  1.0000000000000001e-49  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1479  putative metallodependent hydrolase  42.08 
 
 		 265 aa  199  1.0000000000000001e-49  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00000171284  hitchhiker  0.0000000124971 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1222  putative metallodependent hydrolase  42.08 
 
 		 265 aa  199  1.0000000000000001e-49  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000128858  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1221  putative metallodependent hydrolase  42.08 
 
 		 265 aa  199  1.0000000000000001e-49  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000193485  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2501  putative metallodependent hydrolase  42.08 
 
 		 265 aa  199  1.0000000000000001e-49  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0673622  unclonable  0.0000000127791 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1600  hypothetical protein  41.18 
 
 		 255 aa  198  2.0000000000000003e-49  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0964  TatD family hydrolase  41.47 
 
 		 263 aa  198  2.0000000000000003e-49  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.913879  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0129  TatD family deoxyribonuclease  39.22 
 
 		 256 aa  197  3e-49  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1096  deoxyribonuclease of TatD family protein  40.23 
 
 		 258 aa  197  3e-49  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.664033  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>