More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_2029 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_2029  CheW protein  100 
 
 		 200 aa  395  1e-109  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2190  CheW protein  92.5 
 
 		 199 aa  367  1e-101  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2708  CheW protein  46.7 
 
 		 205 aa  185  4e-46  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1327  CheW protein  46.02 
 
 		 189 aa  155  3e-37  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.893593  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2460  CheW protein  48.19 
 
 		 181 aa  150  1e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.532054  normal  0.0797491 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0991  CheW protein  42.07 
 
 		 183 aa  134  6.0000000000000005e-31  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.894133  normal  0.190355 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0331  CheW protein  36.63 
 
 		 200 aa  126  3e-28  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0240  putative CheW protein  34.95 
 
 		 325 aa  107  1e-22  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.476867  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0496  CheW protein  32.52 
 
 		 344 aa  103  2e-21  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0218818  normal  0.799027 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0468  putative CheW protein  34.34 
 
 		 186 aa  96.7  2e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0754564  normal  0.870958 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3202  CheW protein  31.55 
 
 		 182 aa  89.7  3e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.525075 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0741  CheW protein  34.27 
 
 		 162 aa  89.4  3e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1793  putative CheW protein  32.19 
 
 		 167 aa  83.2  0.000000000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1450  putative CheW protein  31.58 
 
 		 148 aa  81.3  0.00000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1647  purine-binding chemotaxis protein CheW  30 
 
 		 174 aa  80.5  0.00000000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1207  CheW protein  33.58 
 
 		 164 aa  81.3  0.00000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.848506  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02863  chemotaxis protein CheW  31.65 
 
 		 163 aa  79.3  0.00000000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03137  hypothetical protein  31.51 
 
 		 164 aa  79.3  0.00000000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0243  CheW protein  31.97 
 
 		 163 aa  79  0.00000000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002839  positive regulator of CheA protein activity (CheW)  31.51 
 
 		 164 aa  79  0.00000000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.856149  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0575  CheW protein  29.41 
 
 		 183 aa  79  0.00000000000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.426805  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2693  putative CheW protein  32.62 
 
 		 163 aa  79  0.00000000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1391  CheW protein  32.37 
 
 		 164 aa  79  0.00000000000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.896559  normal  0.172651 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2283  chemotaxis protein CheW  31.03 
 
 		 164 aa  78.2  0.00000000000008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1528  chemotaxis protein CheW  31.65 
 
 		 164 aa  77.4  0.0000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.908591  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2676  CheW protein  32.31 
 
 		 212 aa  77.8  0.0000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0640816  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2771  CheW protein  32.82 
 
 		 212 aa  77.4  0.0000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0420843  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3862  putative purine-binding chemotaxis protein  31.94 
 
 		 159 aa  77  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.71104  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3202  purine-binding chemotaxis protein CheW  32.09 
 
 		 164 aa  77  0.0000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3428  CheW-like protein  31.34 
 
 		 159 aa  76.6  0.0000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.661205 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3023  CheW protein  31.65 
 
 		 164 aa  76.6  0.0000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1307  CheW protein  32.09 
 
 		 164 aa  77  0.0000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.897711 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1374  CheW protein  32.09 
 
 		 164 aa  77  0.0000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.158762 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0992  CheW protein  26.97 
 
 		 162 aa  76.6  0.0000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  decreased coverage  0.0071906  normal  0.764949 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45500  putative purine-binding chemotaxis protein  31.94 
 
 		 159 aa  76.6  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1367  CheW protein  32.09 
 
 		 164 aa  77  0.0000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00367325 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1643  CheW protein  32.37 
 
 		 161 aa  75.9  0.0000000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2551  putative CheW protein  32.09 
 
 		 164 aa  76.3  0.0000000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2901  putative CheW protein  32.09 
 
 		 164 aa  75.9  0.0000000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.3057  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1492  chemotaxis protein CheW  34.33 
 
 		 444 aa  75.9  0.0000000000004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1462  CheW protein  32.09 
 
 		 164 aa  75.9  0.0000000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2911  putative CheW protein  32.09 
 
 		 164 aa  75.9  0.0000000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.810949  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3043  putative CheW protein  32.09 
 
 		 164 aa  75.9  0.0000000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.605856 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1347  CheW protein  30.6 
 
 		 159 aa  75.9  0.0000000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.161172  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1386  CheW protein  32.09 
 
 		 163 aa  75.9  0.0000000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2272  purine-binding chemotaxis protein CheW  32.09 
 
 		 164 aa  75.9  0.0000000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.124095  normal  0.11667 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3041  CheW protein  31.65 
 
 		 163 aa  75.5  0.0000000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0219579 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2155  flagellar FliF M-ring protein  30.6 
 
 		 161 aa  75.5  0.0000000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1351  CheW-like protein  31.34 
 
 		 164 aa  75.5  0.0000000000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4332  purine-binding chemotaxis protein CheW  31.34 
 
 		 159 aa  75.1  0.0000000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.300318  normal  0.430196 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1535  putative CheW protein  31.34 
 
 		 159 aa  75.1  0.0000000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.107211  normal  0.640168 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3901  CheW protein  31.34 
 
 		 159 aa  75.1  0.0000000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3658  CheW protein  31.34 
 
 		 159 aa  75.1  0.0000000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1988  chemotaxis protein CheW  31.82 
 
 		 159 aa  74.7  0.0000000000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.381098  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1184  CheW protein  29.29 
 
 		 161 aa  74.7  0.0000000000009  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0668983 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2076  CheW protein  29.94 
 
 		 170 aa  74.3  0.000000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0779  CheW protein  34.21 
 
 		 165 aa  73.2  0.000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1966  putative CheW protein  29.1 
 
 		 162 aa  73.2  0.000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2236  CheW protein  25.86 
 
 		 478 aa  72.8  0.000000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1572  CheW protein  29.85 
 
 		 161 aa  72.8  0.000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.650684  normal  0.674901 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2813  CheW protein  33.1 
 
 		 168 aa  72.8  0.000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3769  putative CheW protein  32.85 
 
 		 181 aa  72.8  0.000000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07610  putative CheW protein  31.82 
 
 		 159 aa  72.4  0.000000000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0087055  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2023  CheW protein  31.08 
 
 		 164 aa  72.4  0.000000000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.656036  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3419  putative CheW protein  30.6 
 
 		 163 aa  72  0.000000000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.48741  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1992  CheW domain protein  29.17 
 
 		 169 aa  72  0.000000000005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2796  putative CheW protein  30.3 
 
 		 159 aa  72  0.000000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.153028  normal  0.193406 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1918  CheW protein  30.28 
 
 		 161 aa  72  0.000000000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.33362  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0990  CheW protein  31.03 
 
 		 173 aa  71.2  0.000000000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.519788  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1000  putative CheW protein  30.64 
 
 		 182 aa  70.9  0.00000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3106  biotin synthase  30.56 
 
 		 187 aa  70.9  0.00000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0809  CheW protein  25.87 
 
 		 163 aa  70.5  0.00000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4154  CheW protein  33.33 
 
 		 147 aa  70.1  0.00000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1135  CheW protein  32.06 
 
 		 145 aa  70.5  0.00000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2648  CheW protein  29.93 
 
 		 163 aa  70.1  0.00000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.34231  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0470  putative CheW protein  29.73 
 
 		 165 aa  69.7  0.00000000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.126414  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2888  CheW protein  30.94 
 
 		 167 aa  69.7  0.00000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1639  purine-binding chemotaxis protein  31.94 
 
 		 165 aa  69.7  0.00000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1750  purine-binding chemotaxis protein  31.94 
 
 		 165 aa  69.7  0.00000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0684  purine-binding chemotaxis protein CheW  32.62 
 
 		 164 aa  69.3  0.00000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.260325  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2984  purine-binding chemotaxis protein  33.79 
 
 		 166 aa  69.3  0.00000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.334831  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2824  purine-binding chemotaxis protein  31.25 
 
 		 165 aa  68.6  0.00000000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.176168 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1419  CheW protein  32.81 
 
 		 159 aa  68.6  0.00000000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0639922  normal  0.266915 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0869  CheW protein  31.82 
 
 		 149 aa  68.6  0.00000000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2408  CheW protein  28.78 
 
 		 152 aa  68.6  0.00000000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.492759  normal  0.123205 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1299  purine-binding chemotaxis protein CheW  31.47 
 
 		 164 aa  68.2  0.00000000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.125322  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1513  purine-binding chemotaxis protein  34.48 
 
 		 165 aa  68.2  0.00000000008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.095587  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1600  CheW protein  29.25 
 
 		 171 aa  68.2  0.00000000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.443722  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01858  purine-binding chemotaxis protein  35.07 
 
 		 167 aa  67.8  0.00000000009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.017881  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1753  CheW protein  35.07 
 
 		 167 aa  67.8  0.00000000009  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00384276  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01847  hypothetical protein  35.07 
 
 		 167 aa  67.8  0.00000000009  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0297243  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2120  purine-binding chemotaxis protein  35.07 
 
 		 167 aa  67.8  0.00000000009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000459496  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1983  purine-binding chemotaxis protein  35.07 
 
 		 167 aa  67.8  0.00000000009  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.174065  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1297  purine-binding chemotaxis protein  35.07 
 
 		 167 aa  67.8  0.00000000009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.734506  hitchhiker  0.0000988763 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2626  purine-binding chemotaxis protein  35.07 
 
 		 167 aa  67.8  0.00000000009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.476506  hitchhiker  0.000000000506085 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3142  putative CheW protein  30.5 
 
 		 160 aa  67.8  0.00000000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1745  purine-binding chemotaxis protein  35.07 
 
 		 167 aa  67.8  0.00000000009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1301  purine-binding chemotaxis protein CheW  31.47 
 
 		 164 aa  67.8  0.0000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.278999  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2136  purine-binding chemotaxis protein  37.3 
 
 		 167 aa  67.8  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  8.6841e-22 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1201  purine-binding chemotaxis protein  37.3 
 
 		 167 aa  67.8  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.958746  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>