More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_1947 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_1947  protein of unknown function DUF6 transmembrane  100 
 
 		 298 aa  581  1.0000000000000001e-165  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2268  protein of unknown function DUF6 transmembrane  93.96 
 
 		 302 aa  540  1e-153  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3390  hypothetical protein  66.89 
 
 		 302 aa  401  1e-111  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1132  hypothetical protein  54.06 
 
 		 310 aa  269  4e-71  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2925  hypothetical protein  49.08 
 
 		 308 aa  254  9e-67  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0149695  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2848  protein of unknown function DUF6 transmembrane  45.82 
 
 		 300 aa  237  2e-61  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2952  hypothetical protein  42.46 
 
 		 295 aa  216  4e-55  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0338649  hitchhiker  0.0000000562298 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2169  permease; drug/metabolite exporter family protein  42.46 
 
 		 294 aa  214  9.999999999999999e-55  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.101612  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2992  protein of unknown function DUF6 transmembrane  44.88 
 
 		 302 aa  214  1.9999999999999998e-54  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2249  hypothetical protein  42.81 
 
 		 294 aa  213  3.9999999999999995e-54  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00767545  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2413  hypothetical protein  42.81 
 
 		 294 aa  213  3.9999999999999995e-54  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2208  permease; drug/metabolite exporter family protein  42.46 
 
 		 294 aa  210  2e-53  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000749629  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2431  hypothetical protein  42.46 
 
 		 294 aa  210  2e-53  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.295627 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2227  hypothetical protein  42.2 
 
 		 296 aa  206  4e-52  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.157307  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1520  protein of unknown function DUF6 transmembrane  43.46 
 
 		 295 aa  205  6e-52  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.00453579 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2379  hypothetical protein  42.81 
 
 		 295 aa  204  1e-51  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.557677  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2512  hypothetical protein  42.81 
 
 		 295 aa  201  9.999999999999999e-51  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0135792  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3638  hypothetical protein  40.4 
 
 		 305 aa  196  4.0000000000000005e-49  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.603625  normal  0.524046 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3110  protein of unknown function DUF6 transmembrane  42.91 
 
 		 293 aa  187  1e-46  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.918526  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0564  protein of unknown function DUF6 transmembrane  39.73 
 
 		 305 aa  185  7e-46  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0219  hypothetical protein  37.36 
 
 		 300 aa  179  4e-44  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0152  hypothetical protein  35.74 
 
 		 297 aa  177  1e-43  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_160  hypothetical protein  36.63 
 
 		 297 aa  178  1e-43  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2028  protein of unknown function DUF6 transmembrane  37.82 
 
 		 316 aa  165  6.9999999999999995e-40  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2353  protein of unknown function DUF6 transmembrane  39.58 
 
 		 302 aa  164  2.0000000000000002e-39  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0947  hypothetical protein  34.04 
 
 		 303 aa  158  8e-38  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0647219  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0587  protein of unknown function DUF6 transmembrane  39.92 
 
 		 300 aa  156  4e-37  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.770016  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1388  hypothetical protein  32.36 
 
 		 303 aa  154  1e-36  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00161471  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1123  membrane protein; drug/metabolite exporter family protein  32.36 
 
 		 303 aa  154  2e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1149  hypothetical protein  32.36 
 
 		 303 aa  153  2.9999999999999998e-36  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1130  membrane protein; drug/metabolite exporter family protein  32.36 
 
 		 303 aa  153  2.9999999999999998e-36  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0451138  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1243  hypothetical protein  32.36 
 
 		 303 aa  153  2.9999999999999998e-36  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.142869  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1350  hypothetical protein  32.36 
 
 		 309 aa  153  4e-36  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.287867  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1219  protein of unknown function DUF6 transmembrane  36.02 
 
 		 288 aa  152  5.9999999999999996e-36  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1285  hypothetical protein  32 
 
 		 303 aa  152  7e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.150525  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1311  hypothetical protein  32 
 
 		 303 aa  152  7e-36  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000102965 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4059  hypothetical protein  32 
 
 		 303 aa  151  1e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0153728  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1137  hypothetical protein  32.36 
 
 		 303 aa  150  3e-35  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0899192  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2761  hypothetical protein  38.26 
 
 		 316 aa  149  6e-35  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.112871  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0748  hypothetical protein  38.16 
 
 		 288 aa  148  1.0000000000000001e-34  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2109  hypothetical protein  35.82 
 
 		 295 aa  147  2.0000000000000003e-34  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14500  membrane protein  34.9 
 
 		 286 aa  146  3e-34  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00083685  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3157  protein of unknown function DUF6 transmembrane  35.61 
 
 		 307 aa  145  8.000000000000001e-34  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0896  protein of unknown function DUF6 transmembrane  36.1 
 
 		 295 aa  144  1e-33  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.841785  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0063  hypothetical protein  38.08 
 
 		 285 aa  134  9.999999999999999e-31  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1257  hypothetical protein  44.49 
 
 		 277 aa  125  9e-28  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.858223  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3455  hypothetical protein  34.27 
 
 		 300 aa  123  3e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3817  hypothetical protein  31.6 
 
 		 296 aa  122  9e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000393324  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1136  protein of unknown function DUF6 transmembrane  35.57 
 
 		 286 aa  119  4.9999999999999996e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.762369  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2519  hypothetical protein  38.54 
 
 		 318 aa  118  9.999999999999999e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.561835 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0751  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.15 
 
 		 284 aa  114  2.0000000000000002e-24  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0968  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.21 
 
 		 314 aa  114  3e-24  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1151  protein of unknown function DUF6 transmembrane  36.94 
 
 		 305 aa  114  3e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00557636 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4832  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.38 
 
 		 304 aa  111  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.484087 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7770  protein of unknown function DUF6 transmembrane  36.84 
 
 		 317 aa  110  3e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1038  hypothetical protein  32.39 
 
 		 273 aa  110  3e-23  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000348344  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0997  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.84 
 
 		 315 aa  110  4.0000000000000004e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.848361  normal  0.602087 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1716  protein of unknown function DUF6 transmembrane  34.23 
 
 		 307 aa  109  7.000000000000001e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00280057  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2018  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.03 
 
 		 300 aa  108  9.000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.618176 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0089  hypothetical protein  37.93 
 
 		 285 aa  107  3e-22  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.893408  normal  0.178289 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1137  hypothetical protein  34.25 
 
 		 285 aa  106  6e-22  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.893174  hitchhiker  0.00000000116999 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1991  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.03 
 
 		 300 aa  105  1e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0097  hypothetical protein  35.76 
 
 		 286 aa  97.8  2e-19  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3886  hypothetical protein  30.9 
 
 		 299 aa  96.3  5e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.765611  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2511  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.77 
 
 		 290 aa  94.7  1e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000710736  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2973  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.51 
 
 		 325 aa  90.5  3e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_2001  hypothetical protein  28.62 
 
 		 283 aa  90.5  3e-17  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1219  hypothetical protein  34.62 
 
 		 306 aa  90.9  3e-17  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.465362  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0721  hypothetical protein  35.5 
 
 		 306 aa  88.6  1e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.117715 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1270  protein of unknown function DUF6 transmembrane  34.93 
 
 		 284 aa  87.4  3e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2413  hypothetical protein  30.04 
 
 		 281 aa  86.3  5e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.163379 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0861  hypothetical protein  23.64 
 
 		 294 aa  83.2  0.000000000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0312  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.71 
 
 		 301 aa  81.3  0.00000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0737  hypothetical protein  29.33 
 
 		 281 aa  81.6  0.00000000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0689  hypothetical protein  29.33 
 
 		 281 aa  81.6  0.00000000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.164127  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00855  predicted permease  25.69 
 
 		 309 aa  77.8  0.0000000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2973  hypothetical protein  27.67 
 
 		 325 aa  77.4  0.0000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.140721 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0791  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.77 
 
 		 296 aa  76.6  0.0000000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0667  hypothetical protein  37.11 
 
 		 319 aa  75.5  0.000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.522504 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0281  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.62 
 
 		 297 aa  73.6  0.000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0010  protein of unknown function DUF6 transmembrane  34.04 
 
 		 312 aa  73.2  0.000000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000000000000132585 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0301  hypothetical protein  26.24 
 
 		 308 aa  70.9  0.00000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000637282  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1818  hypothetical protein  29.17 
 
 		 283 aa  70.9  0.00000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.264733  normal  0.803156 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1024  ribosomal protein S6  29.86 
 
 		 293 aa  70.5  0.00000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0009  hypothetical protein  30.88 
 
 		 304 aa  69.7  0.00000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1044  hypothetical protein  30.4 
 
 		 308 aa  68.6  0.0000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1215  hypothetical protein  26.01 
 
 		 299 aa  68.6  0.0000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5090  hypothetical protein  29.07 
 
 		 307 aa  68.2  0.0000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.194809  normal  0.0140686 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2339  hypothetical protein  26.76 
 
 		 337 aa  67.8  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0842181  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2918  hypothetical protein  28.99 
 
 		 315 aa  67.8  0.0000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.103188  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2581  hypothetical protein  26.98 
 
 		 295 aa  67.8  0.0000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0869086  normal  0.0298393 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1022  transport protein; drug/metabolite exporter  26.32 
 
 		 300 aa  67.4  0.0000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.506824  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1008  hypothetical protein  31.28 
 
 		 312 aa  67  0.0000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.508617 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1204  permease, drug/metabolite transporter superfamily  26.1 
 
 		 302 aa  67  0.0000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.717476 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_46762  predicted protein  25.97 
 
 		 461 aa  67  0.0000000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.013384  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1281  permease, drug/metabolite transporter superfamily  26.1 
 
 		 300 aa  66.2  0.0000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.232405  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0442  hypothetical protein  26.01 
 
 		 302 aa  66.2  0.0000000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1224  EamA family protein  25.74 
 
 		 289 aa  65.9  0.0000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2448  hypothetical protein  25.36 
 
 		 311 aa  65.5  0.000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1025  transport protein; drug/metabolite exporter  25.67 
 
 		 300 aa  65.1  0.000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00291899  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>