More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_1901 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_1901  transcription elongation factor GreA  100 
 
 		 158 aa  318  1.9999999999999998e-86  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00416559  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2307  transcription elongation factor GreA  98.73 
 
 		 158 aa  314  4e-85  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1865  transcription elongation factor GreA  89.87 
 
 		 158 aa  289  9e-78  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000000182493  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2523  transcription elongation factor GreA  85.44 
 
 		 158 aa  280  6.000000000000001e-75  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000000182345  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2078  transcription elongation factor GreA  86.71 
 
 		 158 aa  279  1e-74  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000287405  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1277  transcription elongation factor GreA  84.08 
 
 		 158 aa  275  2e-73  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.000293441  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1775  transcription elongation factor GreA  81.65 
 
 		 159 aa  262  1e-69  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000308338  normal  0.0541245 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1611  transcription elongation factor GreA  68.15 
 
 		 158 aa  228  2e-59  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  5.69568e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0868  transcription elongation factor GreA  58.17 
 
 		 157 aa  181  3e-45  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.639151  normal  0.282498 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2139  transcription elongation factor GreA  55.56 
 
 		 157 aa  174  5e-43  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.194554 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4293  transcription elongation factor GreA  55.48 
 
 		 157 aa  173  9e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.795745 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2312  transcription elongation factor GreA  54.97 
 
 		 152 aa  171  2.9999999999999996e-42  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.693473  hitchhiker  0.00295599 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2677  transcription elongation factor GreA  56.86 
 
 		 160 aa  171  3.9999999999999995e-42  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2549  transcription elongation factor GreA  56.86 
 
 		 160 aa  171  3.9999999999999995e-42  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2073  transcription elongation factor GreA  54.14 
 
 		 168 aa  170  7.999999999999999e-42  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.383099 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1254  transcription elongation factor GreA  53.5 
 
 		 158 aa  170  9e-42  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.378894  normal  0.504509 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1851  transcription elongation factor GreA  54.43 
 
 		 158 aa  169  1e-41  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.888423  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1774  transcription elongation factor GreA  56.13 
 
 		 158 aa  168  3e-41  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.110279  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2715  transcription elongation factor GreA  52.87 
 
 		 158 aa  167  4e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2118  transcription elongation factor GreA  53.59 
 
 		 157 aa  167  5e-41  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3400  transcription elongation factor GreA  56.21 
 
 		 158 aa  167  7e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0549133  normal  0.0891208 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0875  transcription elongation factor GreA  55.48 
 
 		 158 aa  166  8e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.73287  normal  0.0631013 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0673  transcription elongation factor GreA  53.95 
 
 		 152 aa  166  1e-40  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.487901 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2976  transcription elongation factor GreA  52.23 
 
 		 158 aa  166  1e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.174839  normal  0.133661 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1733  transcription elongation factor GreA  55.7 
 
 		 158 aa  165  2e-40  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.669906  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0940  transcription elongation factor GreA  57.42 
 
 		 172 aa  165  2e-40  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2887  transcription elongation factor GreA  53.55 
 
 		 157 aa  165  2e-40  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2612  transcription elongation factor GreA  53.85 
 
 		 158 aa  164  2.9999999999999998e-40  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.657313 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1263  transcription elongation factor GreA  53.55 
 
 		 168 aa  165  2.9999999999999998e-40  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0260201 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4606  transcription elongation factor GreA  53.5 
 
 		 158 aa  165  2.9999999999999998e-40  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.127343  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1129  GreA/GreB family elongation factor  54.55 
 
 		 158 aa  165  2.9999999999999998e-40  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2450  transcription elongation factor GreA  52.87 
 
 		 158 aa  165  2.9999999999999998e-40  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.596907 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1728  transcription elongation factor GreA  53.55 
 
 		 166 aa  164  2.9999999999999998e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2821  transcription elongation factor GreA  55.48 
 
 		 158 aa  164  2.9999999999999998e-40  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2866  transcription elongation factor GreA  56.13 
 
 		 158 aa  164  4e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0891965  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1454  transcription elongation factor GreA  51.61 
 
 		 203 aa  164  4e-40  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.267598  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1515  transcription elongation factor GreA  52.87 
 
 		 174 aa  164  5e-40  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.796858 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1258  transcription elongation factor GreA  56.13 
 
 		 176 aa  164  5e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3127  transcription elongation factor GreA  51.59 
 
 		 158 aa  164  5e-40  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.59991  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1504  transcription elongation factor GreA  51.61 
 
 		 157 aa  164  5.9999999999999996e-40  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.893814  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1980  transcription elongation factor GreA  54.55 
 
 		 158 aa  164  5.9999999999999996e-40  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00819368 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0880  GreA/GreB family elongation factor  53.21 
 
 		 158 aa  163  6.9999999999999995e-40  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6800  transcription elongation factor GreA  52.23 
 
 		 158 aa  163  9e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.817091 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2209  transcription elongation factor GreA  52.9 
 
 		 166 aa  162  1.0000000000000001e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2119  transcription elongation factor GreA  52.9 
 
 		 166 aa  162  1.0000000000000001e-39  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.736032  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1456  transcription elongation factor GreA  52.87 
 
 		 165 aa  162  1.0000000000000001e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2751  transcription elongation factor GreA  52.26 
 
 		 168 aa  163  1.0000000000000001e-39  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4421  transcription elongation factor GreA  54.25 
 
 		 158 aa  162  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3030  transcription elongation factor GreA  53.64 
 
 		 152 aa  162  2.0000000000000002e-39  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.953757  decreased coverage  0.00490744 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1469  transcription elongation factor GreA  53.55 
 
 		 158 aa  162  2.0000000000000002e-39  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3357  transcription elongation factor GreA  51.9 
 
 		 159 aa  162  2.0000000000000002e-39  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.970031  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1369  transcription elongation factor  50.63 
 
 		 173 aa  162  2.0000000000000002e-39  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0830842  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2389  transcription elongation factor GreA  53.55 
 
 		 158 aa  162  2.0000000000000002e-39  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.643877  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1522  transcription elongation factor GreA  52.9 
 
 		 158 aa  161  3e-39  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3836  transcription elongation factor GreA  52.87 
 
 		 158 aa  162  3e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.722398 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1429  transcription elongation factor GreA  50.63 
 
 		 159 aa  161  3e-39  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2027  transcription elongation factor GreA  54.84 
 
 		 158 aa  161  3e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0978  transcription elongation factor GreA  53.8 
 
 		 158 aa  161  4.0000000000000004e-39  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.389185  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1264  transcription elongation factor GreA  54.84 
 
 		 158 aa  161  4.0000000000000004e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.165873 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0812  transcription elongation factor GreA  54.84 
 
 		 158 aa  161  4.0000000000000004e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1660  transcription elongation factor GreA  49.68 
 
 		 157 aa  161  4.0000000000000004e-39  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.985567  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1293  transcription elongation factor GreA  54.84 
 
 		 158 aa  161  4.0000000000000004e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2876  transcription elongation factor GreA  51.59 
 
 		 158 aa  160  5.0000000000000005e-39  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0984  transcription elongation factor GreA  50.97 
 
 		 157 aa  160  6e-39  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.406423  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1561  transcription elongation factor GreA  53.59 
 
 		 158 aa  160  6e-39  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.970872  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1725  transcription elongation factor GreA  52.26 
 
 		 158 aa  160  6e-39  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2174  transcription elongation factor GreA  54.19 
 
 		 158 aa  160  7e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0700  transcription elongation factor GreA  53.8 
 
 		 159 aa  159  1e-38  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0169393  normal  0.415235 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1218  transcription elongation factor GreA  50.33 
 
 		 160 aa  159  1e-38  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1089  transcription elongation factor GreA  50.33 
 
 		 160 aa  159  1e-38  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.799328 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3017  transcription elongation factor GreA  50.32 
 
 		 157 aa  159  1e-38  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0566  transcription elongation factor GreA  52.29 
 
 		 179 aa  159  2e-38  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0510993  normal  0.103581 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0480  GreA/GreB family elongation factor  52.56 
 
 		 158 aa  159  2e-38  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0337518  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1182  transcription elongation factor GreA  54.19 
 
 		 158 aa  158  2e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.22898 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1478  transcription elongation factor GreA  52.26 
 
 		 158 aa  158  3e-38  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0496142  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0773  transcription elongation factor GreA  52.26 
 
 		 158 aa  158  3e-38  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.568342  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1611  transcription elongation factor GreA  52.26 
 
 		 158 aa  158  3e-38  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.939973  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0850  transcription elongation factor GreA  54.84 
 
 		 158 aa  158  3e-38  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.209846 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1508  transcription elongation factor GreA  52.26 
 
 		 158 aa  158  3e-38  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.150081  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2033  transcription elongation factor GreA  51.61 
 
 		 158 aa  158  3e-38  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.709774  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0567  transcription elongation factor GreA  52.26 
 
 		 158 aa  158  3e-38  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.535804  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0584  transcription elongation factor GreA  52.26 
 
 		 158 aa  158  3e-38  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.125264  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1170  transcription elongation factor GreA  54.19 
 
 		 158 aa  158  3e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1284  transcription elongation factor GreA  52.26 
 
 		 158 aa  158  3e-38  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.177076  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1146  transcription elongation factor GreA  51.61 
 
 		 158 aa  157  4e-38  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2780  transcription elongation factor GreA  52.9 
 
 		 158 aa  157  4e-38  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.115654  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2677  GreA/GreB family elongation factor  51.61 
 
 		 158 aa  157  4e-38  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0910  transcription elongation factor GreA  50.97 
 
 		 157 aa  157  5e-38  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3076  transcription elongation factor GreA  53.55 
 
 		 171 aa  157  5e-38  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1023  transcription elongation factor GreA  49.67 
 
 		 160 aa  157  5e-38  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.299103  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0654  transcription elongation factor GreA  52.26 
 
 		 164 aa  157  6e-38  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.156211  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4930  transcription elongation factor GreA  51.61 
 
 		 158 aa  157  6e-38  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.41417 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4435  transcription elongation factor GreA  53.55 
 
 		 158 aa  157  6e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2213  transcription elongation factor GreA  49.02 
 
 		 158 aa  157  8e-38  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2192  transcription elongation factor GreA  52.9 
 
 		 173 aa  156  9e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0127913  normal  0.0702404 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3355  transcription elongation factor GreA  50.98 
 
 		 158 aa  156  1e-37  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00153993  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1017  transcription elongation factor GreA  56.13 
 
 		 158 aa  156  1e-37  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2221  transcription elongation factor GreA  50.65 
 
 		 164 aa  155  2e-37  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0780  GreA/GreB family elongation factor  53.16 
 
 		 158 aa  155  2e-37  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000129967  hitchhiker  0.000100122 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3084  GreA/GreB family elongation factor  52.6 
 
 		 158 aa  155  2e-37  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>