More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_1863 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_1863  phosphate uptake regulator, PhoU  100 
 
 		 227 aa  459  9.999999999999999e-129  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1095  phosphate transport system regulatory protein PhoU  62.56 
 
 		 228 aa  304  9.000000000000001e-82  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.102802  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1514  phosphate uptake regulator, PhoU  66.06 
 
 		 223 aa  300  1e-80  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.875491  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2705  phosphate uptake regulator, PhoU  63.11 
 
 		 229 aa  300  1e-80  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2562  phosphate uptake regulator, PhoU  66.06 
 
 		 223 aa  300  1e-80  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000003122  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2506  phosphate uptake regulator, PhoU  65.16 
 
 		 223 aa  298  5e-80  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1717  phosphate uptake regulator, PhoU  65.61 
 
 		 223 aa  297  7e-80  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1848  phosphate uptake regulator, PhoU  64.71 
 
 		 223 aa  297  1e-79  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3161  phosphate uptake regulator, PhoU  62.44 
 
 		 224 aa  285  5e-76  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.997477  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0622  phosphate uptake regulator, PhoU  60.37 
 
 		 222 aa  274  8e-73  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4118  phosphate uptake regulator, PhoU  52.29 
 
 		 233 aa  223  2e-57  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4144  phosphate uptake regulator, PhoU  52.29 
 
 		 233 aa  220  9.999999999999999e-57  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4002  phosphate uptake regulator, PhoU  52.75 
 
 		 233 aa  219  1.9999999999999999e-56  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.584217  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0422  phosphate uptake regulator, PhoU  50 
 
 		 231 aa  215  4e-55  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.980511 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1533  phosphate transporter PhoU  45.74 
 
 		 235 aa  202  3e-51  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2022  phosphate uptake regulator, PhoU  45.29 
 
 		 237 aa  202  3e-51  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.190943  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1714  phosphate uptake regulator, PhoU  44.84 
 
 		 237 aa  201  9.999999999999999e-51  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0605857  normal  0.609426 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5325  phosphate transporter PhoU  45.33 
 
 		 256 aa  199  3e-50  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0100793 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5233  phosphate uptake regulator, PhoU  45.33 
 
 		 256 aa  199  3e-50  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.229309 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5372  phosphate uptake regulator, PhoU  45.33 
 
 		 256 aa  199  3e-50  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.411001 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5611  phosphate uptake regulator, PhoU  46.08 
 
 		 253 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.401976  normal  0.199229 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5037  hypothetical protein  45.62 
 
 		 253 aa  196  3e-49  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.638399  normal  0.314195 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0149  phosphate uptake regulator, PhoU  44.89 
 
 		 256 aa  196  3e-49  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5483  phosphate transport system protein PhoU  45.16 
 
 		 253 aa  194  1e-48  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0183  phosphate uptake regulator, PhoU  44.04 
 
 		 242 aa  192  3e-48  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70800  phosphate uptake regulatory protein PhoU  44.24 
 
 		 242 aa  191  6e-48  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.611464 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6144  phosphate transporter PhoU  44.24 
 
 		 242 aa  191  7e-48  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48560  phosphate transport system regulatory protein PhoU  44.7 
 
 		 247 aa  190  1e-47  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3751  phosphate uptake regulator, PhoU  45.25 
 
 		 239 aa  191  1e-47  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.444301 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4578  phosphate uptake regulator, PhoU  43.18 
 
 		 226 aa  191  1e-47  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.92814  normal  0.180696 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2549  phosphate uptake regulator, PhoU  45.07 
 
 		 226 aa  189  2.9999999999999997e-47  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0645405 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0130  phosphate uptake regulator, PhoU  43.5 
 
 		 235 aa  189  2.9999999999999997e-47  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21540  phosphate uptake regulator, PhoU  44.66 
 
 		 215 aa  187  9e-47  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0983  phosphate uptake regulator, PhoU  42.86 
 
 		 216 aa  186  2e-46  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.073439 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0435  phosphate uptake regulator, PhoU  44.8 
 
 		 235 aa  185  5e-46  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2649  phosphate uptake regulator, PhoU  44.7 
 
 		 241 aa  184  9e-46  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.436885  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2163  phosphate uptake regulator, PhoU  43.5 
 
 		 234 aa  184  1.0000000000000001e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.125702  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2181  phosphate uptake regulator PhoU  43.5 
 
 		 234 aa  183  2.0000000000000003e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0784096 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0025  phosphate uptake regulator, PhoU  43.61 
 
 		 233 aa  181  6e-45  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.115861 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0602  phosphate uptake regulator, PhoU  41.7 
 
 		 243 aa  180  1e-44  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.226674  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2854  phosphate uptake regulator, PhoU  43.24 
 
 		 234 aa  180  1e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1991  phosphate uptake regulator, PhoU  42.2 
 
 		 217 aa  180  2e-44  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1270  phosphate uptake regulator, PhoU  42.79 
 
 		 234 aa  178  4.999999999999999e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0482464  normal  0.12165 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0012  phosphate uptake regulator, PhoU  42.21 
 
 		 220 aa  178  7e-44  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000224503  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3625  phosphate uptake regulator, PhoU  41.28 
 
 		 240 aa  177  9e-44  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1658  phosphate uptake regulator, PhoU  41.52 
 
 		 235 aa  177  1e-43  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.764338 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0886  phosphate uptake regulator, PhoU  41.89 
 
 		 234 aa  176  3e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.257388  normal  0.0383148 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1276  phosphate uptake regulator, PhoU  40.18 
 
 		 235 aa  175  5e-43  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.382015 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2889  phosphate uptake regulator, PhoU  41.78 
 
 		 218 aa  175  6e-43  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.114573 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2904  phosphate uptake regulator, PhoU  41.78 
 
 		 218 aa  175  6e-43  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.18358  normal  0.0218976 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2448  phosphate transport system protein PhoU  41.74 
 
 		 242 aa  174  7e-43  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.71201  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0571  phosphate uptake regulator, PhoU  40.37 
 
 		 217 aa  174  9.999999999999999e-43  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000468215  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1275  phosphate uptake regulator, PhoU  41.44 
 
 		 234 aa  173  1.9999999999999998e-42  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0115  phosphate uptake regulator, PhoU  44.71 
 
 		 234 aa  173  1.9999999999999998e-42  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2769  phosphate transport system regulatory protein PhoU  41.44 
 
 		 234 aa  173  1.9999999999999998e-42  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.338608  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0823  phosphate uptake regulator, PhoU  41.44 
 
 		 234 aa  173  1.9999999999999998e-42  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1304  phosphate uptake regulator, PhoU  41.44 
 
 		 234 aa  173  1.9999999999999998e-42  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.537167  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2016  phosphate uptake regulator, PhoU  41.44 
 
 		 234 aa  172  2.9999999999999996e-42  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.83984  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0784  phosphate transport system regulatory protein PhoU  40.99 
 
 		 234 aa  172  2.9999999999999996e-42  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.701508  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1622  phosphate transport system regulatory protein PhoU  40.99 
 
 		 234 aa  172  2.9999999999999996e-42  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0578  phosphate transport system regulatory protein PhoU  40.99 
 
 		 234 aa  172  2.9999999999999996e-42  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.141913  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0579  phosphate uptake regulator, PhoU  40.99 
 
 		 233 aa  172  2.9999999999999996e-42  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1519  phosphate transport system regulatory protein PhoU  40.99 
 
 		 234 aa  172  2.9999999999999996e-42  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0573  phosphate transport system regulatory protein PhoU  40.99 
 
 		 234 aa  172  2.9999999999999996e-42  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.219505  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1489  phosphate transport system regulatory protein PhoU  40.99 
 
 		 234 aa  172  2.9999999999999996e-42  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1295  phosphate transport system regulatory protein PhoU  40.99 
 
 		 234 aa  172  2.9999999999999996e-42  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.617631  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1440  phosphate transport system protein PhoU  42.04 
 
 		 237 aa  171  6.999999999999999e-42  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1157  phosphate uptake regulator, PhoU  42.04 
 
 		 237 aa  171  6.999999999999999e-42  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.724725  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2810  phosphate uptake regulator, PhoU  40.72 
 
 		 234 aa  171  1e-41  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1193  phosphate uptake regulator, PhoU  40.99 
 
 		 234 aa  169  2e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.132592  normal  0.461227 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3314  phosphate uptake regulator, PhoU  42.86 
 
 		 233 aa  170  2e-41  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00113393  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1181  phosphate uptake regulator, PhoU  40.99 
 
 		 234 aa  169  2e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.449533  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0953  phosphate uptake regulator, PhoU  40.18 
 
 		 240 aa  169  3e-41  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.627486  normal  0.0660647 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4447  phosphate uptake regulator, PhoU  40.99 
 
 		 234 aa  169  4e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1504  transcriptional regulator PhoU  39.63 
 
 		 236 aa  169  4e-41  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.682781  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0700  phosphate uptake regulator, PhoU  39.91 
 
 		 219 aa  169  4e-41  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.977876 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4413  phosphate uptake regulator, PhoU  38.01 
 
 		 236 aa  168  6e-41  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.210966  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3566  phosphate uptake regulator, PhoU  42.61 
 
 		 229 aa  168  6e-41  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3165  transcriptional regulator PhoU  39.63 
 
 		 236 aa  168  6e-41  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1289  phosphate uptake regulator, PhoU  40.54 
 
 		 233 aa  167  9e-41  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.498595  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2405  phosphate uptake regulator, PhoU  38.71 
 
 		 239 aa  167  9e-41  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.086285 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2950  phosphate uptake regulator, PhoU  40.54 
 
 		 239 aa  167  1e-40  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2581  transcriptional regulator PhoU  38.64 
 
 		 236 aa  167  1e-40  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2742  transcriptional regulator PhoU  39.55 
 
 		 236 aa  167  1e-40  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.498773  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0142  phosphate transport system regulatory protein PhoU  44.66 
 
 		 221 aa  166  2e-40  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2395  phosphate transporter PhoU  42.4 
 
 		 237 aa  167  2e-40  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2315  phosphate uptake regulator, PhoU  38.74 
 
 		 233 aa  166  2e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.23954  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3264  phosphate uptake regulator, PhoU  39.11 
 
 		 239 aa  167  2e-40  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2630  phosphate uptake regulator, PhoU  40.09 
 
 		 233 aa  166  2e-40  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.608204  normal  0.109033 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4914  phosphate uptake regulator, PhoU  39.64 
 
 		 233 aa  166  4e-40  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.24576 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2256  phosphate uptake regulator, PhoU  39.19 
 
 		 233 aa  165  4e-40  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0952502  normal  0.407318 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1360  transcriptional regulator PhoU  39.17 
 
 		 231 aa  166  4e-40  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.465651  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1411  transcriptional regulator PhoU  38.71 
 
 		 236 aa  165  5e-40  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.816456  normal  0.0228624 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2105  phosphate uptake regulator, PhoU  38.81 
 
 		 221 aa  165  5.9999999999999996e-40  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_150  phosphate transport system regulatory protein  44.17 
 
 		 221 aa  164  8e-40  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1929  phosphate uptake regulator, PhoU  41.18 
 
 		 226 aa  164  8e-40  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0982293  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1238  phosphate uptake regulator, PhoU  39.32 
 
 		 219 aa  164  1.0000000000000001e-39  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.17919  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1726  transcriptional regulator PhoU  38.18 
 
 		 236 aa  164  1.0000000000000001e-39  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0092  phosphate uptake regulator, PhoU  40.54 
 
 		 246 aa  164  1.0000000000000001e-39  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1536  transcriptional regulator PhoU  38.25 
 
 		 236 aa  163  2.0000000000000002e-39  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.726746  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>