55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_1803 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_1803  eight transmembrane protein EpsH  100 
 
 		 281 aa  554  1e-157  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2447  eight transmembrane protein EpsH  95.73 
 
 		 281 aa  492  9.999999999999999e-139  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2443  eight transmembrane protein EpsH  67.3 
 
 		 312 aa  307  1.0000000000000001e-82  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00230441  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2199  eight transmembrane protein EpsH  56.93 
 
 		 277 aa  269  4e-71  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0672  eight transmembrane protein EpsH  51.62 
 
 		 284 aa  246  3e-64  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3054  eight transmembrane protein EpsH  49.11 
 
 		 309 aa  235  7e-61  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0847  hypothetical protein  49.64 
 
 		 281 aa  223  3e-57  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2342  eight transmembrane protein EpsH  39.48 
 
 		 277 aa  199  3e-50  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1503  hypothetical protein  36.03 
 
 		 526 aa  161  1e-38  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2003  hypothetical protein  36.82 
 
 		 285 aa  156  3e-37  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2585  eight transmembrane protein EpsH  33.21 
 
 		 520 aa  147  2.0000000000000003e-34  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2581  EpsI family protein  33.2 
 
 		 516 aa  140  3e-32  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1979  hypothetical protein  34.29 
 
 		 290 aa  134  1.9999999999999998e-30  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2023  hypothetical protein  32.52 
 
 		 295 aa  108  7.000000000000001e-23  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.516883  normal  0.703476 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3384  transmembrane exosortase  31.97 
 
 		 533 aa  105  7e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0246  hypothetical protein  30.86 
 
 		 304 aa  105  9e-22  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2328  hypothetical protein  31.65 
 
 		 522 aa  104  2e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.338173  n/a   
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4271  hypothetical protein  27.92 
 
 		 534 aa  98.2  2e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.331154 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0140  eight transmembrane protein EpsH  30.49 
 
 		 524 aa  97.8  2e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1978  hypothetical protein  30.37 
 
 		 510 aa  97.4  2e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2367  eight transmembrane protein EpsH  31.93 
 
 		 331 aa  96.3  5e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2406  hypothetical protein  30.8 
 
 		 505 aa  96.3  5e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.150586  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3120  hypothetical protein  30.32 
 
 		 523 aa  94.4  2e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.548288  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0720  hypothetical protein  28.79 
 
 		 318 aa  94.4  2e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.736593  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2352  exosortase 2  30.77 
 
 		 310 aa  94  3e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1470  eight transmembrane protein EpsH  26.84 
 
 		 315 aa  92  9e-18  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.537051 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2513  exosortase 1  30.17 
 
 		 514 aa  91.7  1e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.356158  normal  0.155527 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1920  ABC transporter related  33.33 
 
 		 492 aa  91.3  2e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1792  hypothetical protein  30.22 
 
 		 298 aa  89.7  4e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.927446  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2521  hypothetical protein  29.22 
 
 		 529 aa  90.1  4e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.630268  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0290  hypothetical protein  26.89 
 
 		 515 aa  83.2  0.000000000000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3270  exosortase 1  27.46 
 
 		 536 aa  77.8  0.0000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.648481  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1514  eight transmembrane protein EpsH  29.15 
 
 		 530 aa  78.2  0.0000000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0189449  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0666  hypothetical protein  27.5 
 
 		 528 aa  77.4  0.0000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.167239  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1021  hypothetical protein  33.33 
 
 		 213 aa  77  0.0000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02596  eight transmembrane protein EpsH  26.17 
 
 		 476 aa  76.6  0.0000000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.454303  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1173  eight transmembrane protein EpsH  26.35 
 
 		 497 aa  73.2  0.000000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0954  eight transmembrane protein EpsH  30.97 
 
 		 298 aa  69.3  0.00000000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2971  eight transmembrane protein EpsH  28.69 
 
 		 485 aa  68.2  0.0000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3270  hypothetical protein  25.88 
 
 		 542 aa  66.2  0.0000000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.186026  normal  0.0608782 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0581  hypothetical protein  28.97 
 
 		 291 aa  63.2  0.000000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.914687  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0434  eight transmembrane protein EpsH  26.24 
 
 		 496 aa  59.7  0.00000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.021154 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2528  hypothetical protein  35.62 
 
 		 358 aa  59.7  0.00000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.192695 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0284  eight transmembrane protein EpsH  32.5 
 
 		 658 aa  59.7  0.00000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3885  hypothetical protein  29.74 
 
 		 550 aa  58.5  0.0000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.315929  normal  0.0708866 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2394  hypothetical protein  25.13 
 
 		 525 aa  53.1  0.000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2693  eight transmembrane protein EpsH  24.89 
 
 		 297 aa  52.8  0.000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.609355  decreased coverage  0.00255345 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1624  eight transmembrane protein EpsH  26.27 
 
 		 516 aa  50.4  0.00003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.201479  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4958  hypothetical protein  28.41 
 
 		 453 aa  47.8  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0562116  normal  0.187789 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0140  hypothetical protein  25.47 
 
 		 508 aa  46.6  0.0004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0825  RND family efflux transporter subunit MFP  25.5 
 
 		 309 aa  46.6  0.0005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.687604  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2911  hypothetical protein  25.38 
 
 		 306 aa  46.2  0.0006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00326024 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0005  eight transmembrane protein EpsH, putative  27.27 
 
 		 245 aa  43.9  0.003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1390  hypothetical protein  26.11 
 
 		 270 aa  42.7  0.007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.410056  normal  0.360992 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4990  hypothetical protein  21.26 
 
 		 462 aa  42.4  0.009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>