111 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_1762 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_1762  flagellin domain protein  100 
 
 		 272 aa  528  1e-149  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2486  flagellin domain protein  95.96 
 
 		 272 aa  509  1e-143  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0087  flagellin domain protein  85.66 
 
 		 272 aa  458  9.999999999999999e-129  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.01522e-16 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0106  flagellin domain protein  85.29 
 
 		 272 aa  452  1.0000000000000001e-126  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.298157  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3830  flagellin domain protein  83.82 
 
 		 272 aa  449  1e-125  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0123845 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3746  flagellin domain protein  83.09 
 
 		 272 aa  443  1e-123  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3371  flagellin domain protein  55.43 
 
 		 275 aa  281  8.000000000000001e-75  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0467531  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3332  flagellin domain-containing protein  55.85 
 
 		 300 aa  278  9e-74  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3370  flagellin domain protein  55.07 
 
 		 275 aa  276  4e-73  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0519137  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2858  flagellin-like  40.07 
 
 		 289 aa  179  4e-44  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.00447179  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2551  putative flagellin protein, C-terminus  42.22 
 
 		 375 aa  147  3e-34  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.345131  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4085  flagellin domain protein  40.8 
 
 		 547 aa  133  1.9999999999999998e-30  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2552  hypothetical protein  39.81 
 
 		 393 aa  133  3.9999999999999996e-30  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0543  flagellin hook IN repeat-containing protein  46.39 
 
 		 693 aa  123  4e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.686559 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6936  hypothetical protein  43.98 
 
 		 620 aa  122  5e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0686  flagellin hook IN repeat-containing protein  44.89 
 
 		 692 aa  121  9.999999999999999e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.153449  normal  0.210468 
 
 
-
 
NC_011760  Mchl_5762  conserved hypothetical protein; putative flagellin C-ter domain  38.14 
 
 		 420 aa  121  9.999999999999999e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7243  hypothetical protein  42.35 
 
 		 578 aa  120  3.9999999999999996e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3020  hypothetical protein  40.41 
 
 		 405 aa  119  3.9999999999999996e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.762369  normal  0.12294 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1246  hypothetical protein  43.01 
 
 		 399 aa  119  4.9999999999999996e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.905349 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1408  hypothetical protein  43.01 
 
 		 399 aa  119  4.9999999999999996e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.596783  normal  0.114857 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5088  hypothetical protein  43.64 
 
 		 630 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.937332 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0522  hypothetical protein  42.17 
 
 		 522 aa  115  6.9999999999999995e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0559459  normal  0.932507 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1247  hypothetical protein  43.01 
 
 		 399 aa  115  6.9999999999999995e-25  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.933518 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3880  flagellin hook IN repeat protein  43.64 
 
 		 1562 aa  115  7.999999999999999e-25  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.411065 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2012  hypothetical protein  40 
 
 		 572 aa  115  8.999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.999486 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1337  hypothetical protein  43.71 
 
 		 537 aa  115  8.999999999999998e-25  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2370  flagellin  43.11 
 
 		 737 aa  115  1.0000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3800  flagellin  41.67 
 
 		 886 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.139024  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5530  putative flagellin protein, C-terminus  40.96 
 
 		 516 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.567075 
 
 
-
 
NC_010517  Mrad2831_6415  hypothetical protein  38.34 
 
 		 405 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2500  hypothetical protein  38.34 
 
 		 405 aa  113  3e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4438  flagellin  40.96 
 
 		 886 aa  113  3e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2995  hypothetical protein  37.82 
 
 		 405 aa  112  5e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1490  flagellin  43.11 
 
 		 753 aa  112  6e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.170223 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5527  putative flagellin protein, C-terminus  41.32 
 
 		 523 aa  112  8.000000000000001e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1670  flagellin  42.51 
 
 		 762 aa  111  1.0000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.940906  normal  0.0365182 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5528  putative flagellin protein, C-terminus  40.36 
 
 		 514 aa  111  1.0000000000000001e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.757214 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2501  hypothetical protein  37.82 
 
 		 405 aa  111  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.98582  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1105  hypothetical protein  40.12 
 
 		 536 aa  110  2.0000000000000002e-23  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0838477  normal  0.21931 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1489  flagellin  43.02 
 
 		 746 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.671791 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0238  conserved hypothetical protein; putative flagellin C-ter domain  42.46 
 
 		 432 aa  110  3e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3814  flagellin  43.11 
 
 		 888 aa  109  4.0000000000000004e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1194  conserved hypothetical protein; putative flagellin C-ter domain  42.93 
 
 		 400 aa  109  4.0000000000000004e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.206866  normal  0.376717 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1193  hypothetical protein  38.29 
 
 		 397 aa  109  6e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.267898  normal  0.475472 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1104  hypothetical protein  41.32 
 
 		 523 aa  108  9.000000000000001e-23  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.926496  normal  0.217444 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1336  hypothetical protein  40.36 
 
 		 528 aa  107  1e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4452  flagellin  39.52 
 
 		 888 aa  103  2e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.438814  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2540  flagellin  39.52 
 
 		 892 aa  103  3e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3292  hypothetical protein  29.56 
 
 		 260 aa  100  3e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1488  flagellin  41.32 
 
 		 735 aa  99.4  5e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.723636  normal  0.726949 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2886  flagellin domain-containing protein  29.27 
 
 		 273 aa  83.6  0.000000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.919361  normal  0.0484882 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3646  flagellin domain-containing protein  30.69 
 
 		 273 aa  81.6  0.00000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.619307  normal  0.181793 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2887  flagellin domain-containing protein  30.6 
 
 		 272 aa  78.6  0.0000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0771595  normal  0.0510481 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1038  flagellin-like  24.56 
 
 		 282 aa  73.6  0.000000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.10381 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0069  flagellin domain-containing protein  29.24 
 
 		 273 aa  71.2  0.00000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1039  flagellin-like  24.29 
 
 		 281 aa  70.5  0.00000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0579144 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1962  flagellin domain-containing protein  25.72 
 
 		 275 aa  65.1  0.000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.272266  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3254  flagellin domain-containing protein  25.3 
 
 		 277 aa  65.1  0.000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.875793  normal  0.855196 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2884  flagellin domain-containing protein  26.1 
 
 		 279 aa  59.7  0.00000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.134875  normal  0.076703 
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3878  flagellin  28.3 
 
 		 281 aa  58.9  0.00000009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.466019  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4162  flagellin domain-containing protein  28.3 
 
 		 281 aa  58.9  0.00000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  hitchhiker  0.00770352  normal  0.325059 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1257  flagellin domain-containing protein  24.44 
 
 		 274 aa  55.8  0.0000008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.795763  hitchhiker  0.000282514 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0288  flagellin-like  24.83 
 
 		 289 aa  55.5  0.0000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3134  flagellin-like  23.25 
 
 		 281 aa  55.1  0.000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0268  flagellin domain-containing protein  36.05 
 
 		 321 aa  55.1  0.000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0328  flagellin domain protein  23.43 
 
 		 301 aa  55.1  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.281136 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6612  flagellin domain protein  25.26 
 
 		 302 aa  54.7  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0826615 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2974  flagellin-like  23.59 
 
 		 282 aa  54.3  0.000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.255462 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5667  flagellin domain protein  24.11 
 
 		 302 aa  54.3  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0362  flagellin domain protein  24.56 
 
 		 303 aa  54.3  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00825341  normal  0.202796 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0752  flaB  24.03 
 
 		 320 aa  53.9  0.000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0329  flagellin domain protein  22.73 
 
 		 302 aa  53.1  0.000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.27249 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0330  flagellin domain protein  23.76 
 
 		 303 aa  53.1  0.000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.281136 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1375  flagellin  25.84 
 
 		 271 aa  51.6  0.00001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000344656  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0751  flagella associated protein  37.93 
 
 		 320 aa  51.6  0.00001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1138  flagellin  23.32 
 
 		 321 aa  51.6  0.00001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0360  flagellin domain protein  22.38 
 
 		 301 aa  51.6  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00664833  normal  0.0333388 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0361  flagellin domain protein  22.15 
 
 		 302 aa  52  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0478487  normal  0.0540762 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0034  flagellin domain protein  25.09 
 
 		 292 aa  51.2  0.00002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0748  flagella associated protein  32.56 
 
 		 320 aa  50.8  0.00002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0750  flagella associated protein  32.56 
 
 		 320 aa  50.8  0.00002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1040  flagellin-like  25.35 
 
 		 292 aa  50.4  0.00003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0599642 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2690  flagellin domain-containing protein  24.32 
 
 		 328 aa  50.1  0.00004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.768338  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0749  flagella associated protein  31.4 
 
 		 320 aa  50.1  0.00004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3439  flagellin domain protein  23.84 
 
 		 327 aa  49.7  0.00005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0287  flagellin-like  24.57 
 
 		 293 aa  48.5  0.0001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.356859  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4247  flagellin domain protein  23.39 
 
 		 311 aa  47.8  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.157058 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0070  flagellin domain-containing protein  24.6 
 
 		 271 aa  47.4  0.0003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0971133 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0266  flagellin domain-containing protein  37.5 
 
 		 395 aa  47.4  0.0003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0267  flagellin domain-containing protein  33.73 
 
 		 395 aa  47  0.0004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0078  flagellin domain protein  23.77 
 
 		 263 aa  46.6  0.0005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1756  A-type flagellin  24.61 
 
 		 264 aa  45.8  0.0008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0077  flagellin domain protein  22.52 
 
 		 266 aa  45.4  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0068  flagellin domain-containing protein  23.53 
 
 		 271 aa  45.1  0.001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0535962 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0069  flagellin domain-containing protein  23.53 
 
 		 271 aa  45.1  0.001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.104757 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0265  flagellin domain-containing protein  30.12 
 
 		 395 aa  45.1  0.001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1582  flagellin  21.51 
 
 		 287 aa  44.7  0.002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000267264  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0442  flagellin-like  25.68 
 
 		 314 aa  44.3  0.002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1706  flagellin  21.51 
 
 		 287 aa  44.7  0.002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0636682  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>