More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_1613 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_1613  glycosyl transferase family 2  100 
 
 		 343 aa  720    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2950  glycosyl transferase family protein  26.45 
 
 		 376 aa  98.2  2e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.268496 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1422  glycosyl transferase, group 2 family protein  25.27 
 
 		 341 aa  92  1e-17  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2888  glycosyl transferase family protein  39.84 
 
 		 247 aa  91.7  2e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.468847  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4705  glycosyl transferase family 2  25.12 
 
 		 311 aa  90.9  3e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.274846 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1962  glycosyl transferase, group 2 family protein  27.35 
 
 		 312 aa  90.1  5e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1721  glycosyl transferase family protein  24.71 
 
 		 261 aa  89.4  8e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.205644  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1684  glycosyl transferase family protein  26.01 
 
 		 285 aa  87.4  3e-16  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0952  glycosyl transferase family 2  28.46 
 
 		 276 aa  87.4  3e-16  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.768268 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2524  glycosyl transferase family 2  30.74 
 
 		 337 aa  85.1  0.000000000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0357419 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0556  glycosyl transferase family protein  32.04 
 
 		 349 aa  85.5  0.000000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.532544  normal  0.84686 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1697  glycosyl transferase family protein  26.35 
 
 		 336 aa  85.1  0.000000000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.591253  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2767  glycosyl transferase family protein  23.72 
 
 		 303 aa  84  0.000000000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.280211  normal  0.34813 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0769  glycosyl transferase family protein  27.52 
 
 		 297 aa  83.2  0.000000000000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2372  glycosyl transferase family 2  26.28 
 
 		 379 aa  82  0.00000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3694  glycosyl transferase, group 2 family protein  35.85 
 
 		 266 aa  82  0.00000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1917  glycosyl transferase family protein  26.2 
 
 		 317 aa  81.3  0.00000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.795527 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1579  glycosyl transferase family protein  25.39 
 
 		 280 aa  81.3  0.00000000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0249485  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1651  glycosyl transferase, group 2 family protein  35.85 
 
 		 266 aa  81.6  0.00000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.590239  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3070  glycosyl transferase family protein  27.35 
 
 		 317 aa  80.9  0.00000000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.976972  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4597  glycosyl transferase family 2  27.12 
 
 		 307 aa  80.5  0.00000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1683  glycosyl transferase, group 2 family protein  34.91 
 
 		 266 aa  80.1  0.00000000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2164  glycosyl transferase family 2  33.96 
 
 		 330 aa  80.1  0.00000000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0430  glycosyl transferase, group 2 family protein  24.55 
 
 		 337 aa  80.1  0.00000000000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.407234  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1497  glycosyl transferase, group 2 family protein  34.91 
 
 		 266 aa  80.1  0.00000000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.366034  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1615  group 2 family glycosyl transferase  34.91 
 
 		 266 aa  80.1  0.00000000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.653601  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1469  glycosyl transferase, group 2 family protein  34.91 
 
 		 266 aa  80.1  0.00000000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000134346  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7037  glycosyl transferase family 2  30.92 
 
 		 727 aa  79.3  0.00000000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3380  glycosyl transferase, group 2 family protein  27.97 
 
 		 853 aa  79.3  0.0000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  8.74419e-17 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1508  glycosyl transferase family protein  25.98 
 
 		 350 aa  79  0.0000000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0142825  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1948  glycosyl transferase, group 2 family protein  27.12 
 
 		 853 aa  79  0.0000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0961  glycosyl transferase family protein  28.7 
 
 		 302 aa  79  0.0000000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.121689  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0779  glycosyl transferase family protein  34.75 
 
 		 311 aa  79  0.0000000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0140186 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0622  glycosyl transferase, group 2 family protein  26.32 
 
 		 341 aa  78.2  0.0000000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2026  glycosyl transferase, group 2 family protein  25.96 
 
 		 853 aa  78.2  0.0000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.739679  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0374  glycosyl transferase, group 2 family protein  24.55 
 
 		 316 aa  78.6  0.0000000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.00522517  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3031  glycosyl transferase family protein  32.71 
 
 		 249 aa  77.8  0.0000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.170793 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3338  glycosyl transferase family protein  37.38 
 
 		 1250 aa  78.2  0.0000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1156  beta-1,3-galactosyltransferase  30.82 
 
 		 181 aa  78.2  0.0000000000002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.000973066  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22790  glycosyl transferase family 2  36.36 
 
 		 250 aa  78.6  0.0000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0333  glycosyl transferase family protein  27.27 
 
 		 277 aa  77.4  0.0000000000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0642645  decreased coverage  0.00000584386 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3250  glycosyl transferase family protein  30.45 
 
 		 302 aa  77.8  0.0000000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.253985  normal  0.48335 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0133  glycosyl transferase family 2  30.22 
 
 		 581 aa  77.8  0.0000000000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000274352  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3066  glycosyl transferase family protein  25.99 
 
 		 402 aa  77.4  0.0000000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2949  glycosyl transferase family 2  31.5 
 
 		 329 aa  77.8  0.0000000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.384487  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0132  glycosyl transferase family protein  29.15 
 
 		 597 aa  77.8  0.0000000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4968  glycosyl transferase family protein  34.91 
 
 		 338 aa  77.8  0.0000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0894  glycosyl transferase family 2  32.6 
 
 		 235 aa  77  0.0000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2229  glycosyl transferase family protein  26.36 
 
 		 274 aa  77.4  0.0000000000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0938  glycosyl transferase family protein  28.95 
 
 		 317 aa  76.6  0.0000000000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0960  glycosyl transferase family 2  29.31 
 
 		 338 aa  76.6  0.0000000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0106239  normal  0.233193 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3495  glycosyl transferase family 2  28.57 
 
 		 276 aa  76.6  0.0000000000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2262  glycosyl transferase, group 2  35.11 
 
 		 386 aa  76.6  0.0000000000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2382  glycosyl transferase family protein  31.9 
 
 		 319 aa  76.6  0.0000000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0024  glycosyl transferase family 2  24.51 
 
 		 358 aa  76.3  0.0000000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2369  glycosyl transferase family 2  27.75 
 
 		 335 aa  76.3  0.0000000000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.783266 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3408  glycosyl transferase family 2  26.02 
 
 		 323 aa  75.9  0.0000000000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5782  glycosyl transferase family 2  26.42 
 
 		 317 aa  75.5  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1368  glycosyl transferase family protein  25 
 
 		 324 aa  75.5  0.000000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.537191  normal  0.711331 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1565  glycosyl transferase family 2  33.05 
 
 		 970 aa  75.9  0.000000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000603283  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3698  glycosyl transferase family protein  33.64 
 
 		 256 aa  75.9  0.000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0703  glycosyl transferase family 2  30.15 
 
 		 348 aa  74.7  0.000000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  6.39468e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3321  glycosyl transferase, group 2 family protein  27.08 
 
 		 851 aa  75.1  0.000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3284  glycosyl transferase, group 2 family protein  27.08 
 
 		 851 aa  75.1  0.000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0268448  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3236  glycosyl transferase, group 2 family protein  27.08 
 
 		 851 aa  75.1  0.000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4073  glycosyl transferase family protein  32.07 
 
 		 334 aa  75.1  0.000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.162964  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2592  glycosyltransferase domain-containing protein  29.95 
 
 		 308 aa  75.1  0.000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3582  group 2 family glycosyl transferase  27.08 
 
 		 851 aa  75.1  0.000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1570  glycosyl transferase family protein  26.5 
 
 		 252 aa  75.1  0.000000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3238  glycosyl transferase family protein  32.48 
 
 		 703 aa  74.7  0.000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3536  glycosyl transferase, group 2 family protein  27.08 
 
 		 851 aa  74.7  0.000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000936493 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1649  glycosyl transferase family 2  29.89 
 
 		 327 aa  74.7  0.000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0348  glycosyl transferase family 2  31.54 
 
 		 473 aa  74.3  0.000000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.504921 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2676  glycosyl transferase family protein  23.18 
 
 		 294 aa  73.9  0.000000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0148  glycosyl transferase family protein  27.19 
 
 		 350 aa  74.3  0.000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.341853  normal  0.155279 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2881  glycosyl transferase family protein  27.94 
 
 		 271 aa  74.3  0.000000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1378  glycosyl transferase family protein  29.91 
 
 		 249 aa  74.3  0.000000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.687728  hitchhiker  0.00000635475 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0710  glycosyl transferase family 2  24.1 
 
 		 348 aa  73.9  0.000000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0849  glycosyl transferase family protein  27.78 
 
 		 321 aa  73.9  0.000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0730658 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0739  glycosyl transferase family 2  24.1 
 
 		 348 aa  73.6  0.000000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.646928  normal  0.825745 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2391  glycosyl transferase family 2  32.38 
 
 		 244 aa  73.9  0.000000000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1087  glycosyl transferase family 2  33.05 
 
 		 209 aa  73.6  0.000000000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.674225 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5207  glycosyl transferase family 2  29.66 
 
 		 254 aa  73.6  0.000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1727  glycosyl transferase family 2  27.97 
 
 		 689 aa  73.6  0.000000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.158076 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1154  glycosyl transferase family 2  29.66 
 
 		 217 aa  73.6  0.000000000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6302  glycosyl transferase family 2  29.5 
 
 		 312 aa  73.6  0.000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.532443 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3252  glycosyl transferase family 2  28.15 
 
 		 300 aa  73.2  0.000000000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0232  glycosyl transferase family 2  27 
 
 		 276 aa  73.2  0.000000000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1796  glycosyltransferase  34.29 
 
 		 249 aa  73.2  0.000000000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3947  glycosyl transferase family protein  27.72 
 
 		 326 aa  72.8  0.000000000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1391  glycosyl transferase family 2  30.77 
 
 		 209 aa  73.2  0.000000000007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.961124  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3837  glycosyl transferase family 2  25.4 
 
 		 276 aa  73.2  0.000000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.567699 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1918  glycosyl transferase family 2  31.48 
 
 		 290 aa  72.8  0.000000000008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.238052  hitchhiker  0.00463208 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30120  Glycosyl transferase, family 2 protein  28.65 
 
 		 328 aa  72.8  0.000000000009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3797  glycosyl transferase family 2  35.09 
 
 		 329 aa  72  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.5387  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11553  sugar transferase  28.83 
 
 		 357 aa  72  0.00000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0769  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  31.2 
 
 		 329 aa  72  0.00000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0632  glycosyl transferase family 2  21.24 
 
 		 313 aa  72.4  0.00000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.138746  normal  0.982719 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3748  glycosyl transferase family 2  35.09 
 
 		 329 aa  72  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3218  glycosyl transferase family protein  32.17 
 
 		 246 aa  72  0.00000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>