More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_1577 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_3924  DEAD/H associated domain protein  35.06 
 
 		 1535 aa  638    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1577  DEAD/H associated domain protein  100 
 
 		 1495 aa  3009    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1802  DEAD/H associated domain protein  32.65 
 
 		 1544 aa  652    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0257988  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2329  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  33.27 
 
 		 1516 aa  669    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1724  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  33.42 
 
 		 1553 aa  659    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0413876  normal  0.423713 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1632  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  33.04 
 
 		 1514 aa  652    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0582362  normal  0.286828 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0816  DEAD/H associated domain protein  33.53 
 
 		 1572 aa  647    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1489  DEAD/H associated domain protein  33.98 
 
 		 1584 aa  672    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.369551 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27850  ATP dependent helicase, Lhr family  33.29 
 
 		 1549 aa  649    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.081171 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2613  DEAD/DEAH box helicase domain protein  51.55 
 
 		 1502 aa  1498    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.670287  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1039  DEAD/H associated domain protein  31.08 
 
 		 1618 aa  631  1e-179  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1014  DEAD/H associated domain protein  32.99 
 
 		 1493 aa  627  1e-178  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1406  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  33.23 
 
 		 1539 aa  625  1e-177  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.35203 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1413  DEAD/H associated domain protein  34.01 
 
 		 1606 aa  620  1e-176  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0176402  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1365  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  33.61 
 
 		 1561 aa  621  1e-176  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.338069  hitchhiker  0.000946056 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4684  DEAD/H associated domain protein  32.39 
 
 		 1523 aa  619  1e-175  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.100241 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1545  putative ATP-dependent helicase Lhr  32.11 
 
 		 1538 aa  613  9.999999999999999e-175  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.91893  normal  0.4804 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1865  putative ATP-dependent helicase Lhr  31.97 
 
 		 1538 aa  613  9.999999999999999e-175  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0115691  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13325  ATP-dependent helicase lhr  33.18 
 
 		 1513 aa  615  9.999999999999999e-175  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1240  DEAD/H associated domain protein  33.47 
 
 		 1632 aa  610  1e-173  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0384  DEAD/DEAH box helicase-like  40.39 
 
 		 1531 aa  612  1e-173  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.224382 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01623  predicted ATP-dependent helicase  31.78 
 
 		 1538 aa  608  9.999999999999999e-173  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1987  DEAD/H associated domain protein  31.78 
 
 		 1538 aa  607  9.999999999999999e-173  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19580  ATP dependent helicase, Lhr family  32.78 
 
 		 1601 aa  609  9.999999999999999e-173  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.512724  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1976  putative ATP-dependent helicase Lhr  31.76 
 
 		 1538 aa  607  9.999999999999999e-173  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.987163  hitchhiker  0.00398653 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01613  hypothetical protein  31.78 
 
 		 1538 aa  608  9.999999999999999e-173  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23220  ATP dependent helicase, Lhr family  31.87 
 
 		 1649 aa  603  1.0000000000000001e-171  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.408844  normal  0.0469013 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2365  putative ATP-dependent helicase Lhr  31.59 
 
 		 1538 aa  605  1.0000000000000001e-171  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.812889  normal  0.664089 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1730  putative ATP-dependent helicase Lhr  31.65 
 
 		 1525 aa  602  1e-170  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5792  DEAD/H associated domain protein  40.94 
 
 		 1480 aa  600  1e-170  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.356725  normal  0.0833692 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2211  putative ATP-dependent helicase Lhr  36.56 
 
 		 1620 aa  574  1.0000000000000001e-162  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.961951 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1217  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  38.7 
 
 		 1613 aa  573  1.0000000000000001e-162  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0938904 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1267  DEAD/H associated  39.09 
 
 		 1523 aa  574  1.0000000000000001e-162  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1284  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  39.09 
 
 		 1523 aa  574  1.0000000000000001e-162  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.148383 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4192  DEAD/H associated domain-containing protein  37.81 
 
 		 1534 aa  570  1e-161  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0456896 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1293  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  39.2 
 
 		 1523 aa  573  1e-161  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.193705 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1786  DEAD/H associated domain protein  39.24 
 
 		 1536 aa  567  1e-160  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.509366  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2092  DEAD/DEAH box helicase-like  39.05 
 
 		 1536 aa  567  1e-160  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1865  DEAD/H associated domain protein  39.24 
 
 		 1536 aa  567  1e-160  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.299338  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3527  DEAD/DEAH box helicase-like  38.19 
 
 		 1567 aa  566  1.0000000000000001e-159  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.917212  normal  0.0702055 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4810  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  38.81 
 
 		 1517 aa  563  1e-158  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0712014 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1496  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  39.79 
 
 		 1534 aa  562  1e-158  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.377611  normal  0.775081 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3770  DEAD/DEAH box helicase-like  30.31 
 
 		 1435 aa  559  1e-157  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.515383 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1113  DEAD/H associated domain-containing protein  38.04 
 
 		 1644 aa  556  1e-156  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.79527  normal  0.12197 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1579  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  32.38 
 
 		 1412 aa  547  1e-154  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.690161  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0156  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  39.11 
 
 		 1476 aa  544  1e-153  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0664  DEAD/H associated domain protein  37.61 
 
 		 1509 aa  546  1e-153  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.240887 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2140  DEAD/H associated domain protein  35.59 
 
 		 1741 aa  534  1e-150  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.800534 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2240  DEAD/H associated domain protein  37.87 
 
 		 1506 aa  532  1e-149  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.589998 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6550  DEAD/H associated domain protein  33.22 
 
 		 1573 aa  519  1.0000000000000001e-145  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.851379  normal  0.30774 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0406  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  38.49 
 
 		 1475 aa  509  9.999999999999999e-143  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.354786  normal  0.0258746 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0708  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  35.57 
 
 		 1381 aa  504  1e-141  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0405562  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3982  DEAD/H associated domain protein  38.11 
 
 		 1388 aa  494  9.999999999999999e-139  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.347513  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1574  DEAD/H associated domain protein  35.24 
 
 		 1379 aa  478  1e-133  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5281  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  35.98 
 
 		 1497 aa  476  1e-132  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.426487 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21690  putative ATP-dependent DNA helicase  36.14 
 
 		 1448 aa  466  1e-129  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0197  DEAD/H associated domain protein  34.43 
 
 		 1688 aa  466  1e-129  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  unclonable  0.000798352  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1849  putative ATP-dependent DNA helicase  35.68 
 
 		 1448 aa  462  9.999999999999999e-129  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.210225  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4351  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  34.95 
 
 		 1429 aa  457  1e-127  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0930  ATP-dependent helicase  35.4 
 
 		 888 aa  454  1.0000000000000001e-126  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.960036  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5032  DEAD/DEAH box helicase-like  34.83 
 
 		 1431 aa  450  1e-125  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.21227 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1091  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  34.38 
 
 		 1451 aa  451  1e-125  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1153  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  34.95 
 
 		 1510 aa  450  1e-125  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.180513  normal  0.341943 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5453  DEAD/H associated domain protein  34.74 
 
 		 1504 aa  453  1e-125  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.397244  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1102  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  34.8 
 
 		 1426 aa  449  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.484648 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4416  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  34.98 
 
 		 1480 aa  449  1.0000000000000001e-124  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.600521  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1061  DEAD/H associated domain protein  34.57 
 
 		 1434 aa  446  1e-123  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1578  DEAD/H associated domain protein  30.85 
 
 		 1604 aa  430  1e-118  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1541  DEAD/H associated domain protein  30.26 
 
 		 1694 aa  424  1e-117  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.00672173  normal  0.215224 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1087  DEAD/H associated domain protein  32.44 
 
 		 875 aa  418  9.999999999999999e-116  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.414576  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0751  DEAD/H associated domain protein  28.2 
 
 		 1729 aa  416  1e-114  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.14409 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4066  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  40.46 
 
 		 1505 aa  404  1e-111  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3591  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  40.46 
 
 		 1508 aa  405  1e-111  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.485917 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1852  DEAD/DEAH box helicase  40.97 
 
 		 1515 aa  397  1e-108  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.183708 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3338  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  39.83 
 
 		 1518 aa  395  1e-108  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0623  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  28.37 
 
 		 1694 aa  396  1e-108  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1744  putative ATP-dependent helicase lhr  39.57 
 
 		 1599 aa  390  1e-106  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0993  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  39.57 
 
 		 1598 aa  389  1e-106  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1829  ATP-dependent DNA helicase  39.4 
 
 		 1598 aa  387  1e-106  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.850726  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0304  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  39.4 
 
 		 1700 aa  389  1e-106  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1130  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  39.73 
 
 		 1626 aa  390  1e-106  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.00800963  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2113  ATP-dependent helicase  32.03 
 
 		 873 aa  387  1e-106  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.706735 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1332  putative ATP-dependent helicase lhr  39.57 
 
 		 1598 aa  389  1e-106  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.214802  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0375  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  39.57 
 
 		 1598 aa  389  1e-106  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.886751  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0264  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  39.57 
 
 		 1598 aa  389  1e-106  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0533  ATP-dependent helicase  31.25 
 
 		 870 aa  368  1e-100  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0301  Lhr-like helicase  33.69 
 
 		 1577 aa  370  1e-100  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.610985  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0444  ATP-dependent helicase  29.85 
 
 		 874 aa  354  5.9999999999999994e-96  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0392  ATP-dependent helicase  29.8 
 
 		 874 aa  351  5e-95  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.447466 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1527  ATP-dependent helicase  29.69 
 
 		 874 aa  350  1e-94  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.983295  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0463  ATP-dependent helicase  29.4 
 
 		 872 aa  347  1e-93  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0110872  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2870  DEAD/H associated domain protein  29.7 
 
 		 922 aa  333  2e-89  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0779  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  31.89 
 
 		 932 aa  329  2.0000000000000001e-88  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.944003  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1508  ATP-dependent helicase  29.02 
 
 		 872 aa  327  1e-87  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0507962  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3147  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  29.83 
 
 		 900 aa  318  6e-85  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0156392  normal  0.41345 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2116  ATP-dependent helicase  29.49 
 
 		 914 aa  317  9e-85  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.200911  normal  0.796736 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2453  DEAD/H associated domain protein  36.96 
 
 		 1668 aa  314  7.999999999999999e-84  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17730  ATP dependent helicase, Lhr family  30.59 
 
 		 1660 aa  314  7.999999999999999e-84  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.5543  normal  0.230312 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1693  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  31.14 
 
 		 928 aa  311  5e-83  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000881072 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2819  ATP-dependent helicase  28.41 
 
 		 915 aa  311  6.999999999999999e-83  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>