More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_1563 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012918  GM21_2653  glycine cleavage system H protein  100 
 
 		 129 aa  258  2e-68  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000387916 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1563  glycine cleavage system H protein  100 
 
 		 129 aa  258  2e-68  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000855574  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1827  glycine cleavage system H protein  80.8 
 
 		 128 aa  208  2e-53  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000163584  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0985  glycine cleavage system H protein  72.8 
 
 		 132 aa  188  2e-47  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00310181  hitchhiker  0.00751565 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2018  glycine cleavage system H protein  69.6 
 
 		 132 aa  182  1.0000000000000001e-45  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.333643  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1599  glycine cleavage system H protein  66.94 
 
 		 129 aa  177  5.999999999999999e-44  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0335982  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2021  glycine cleavage system H protein  63.71 
 
 		 128 aa  165  2e-40  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.132774  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0849  glycine cleavage system protein H  56 
 
 		 126 aa  150  5.9999999999999996e-36  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000024227  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0832  glycine cleavage system protein H  56 
 
 		 126 aa  150  5.9999999999999996e-36  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00486711  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1698  glycine cleavage system H protein  56.45 
 
 		 126 aa  147  5e-35  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3084  glycine cleavage system protein H  57.02 
 
 		 127 aa  147  6e-35  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0485  glycine cleavage system protein H  56 
 
 		 126 aa  147  6e-35  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2933  glycine cleavage system protein H  55.65 
 
 		 127 aa  147  7e-35  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00141908  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3830  glycine cleavage system H protein  52 
 
 		 126 aa  145  2.0000000000000003e-34  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.741858 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2523  glycine cleavage system protein H  52.42 
 
 		 127 aa  144  4.0000000000000006e-34  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.85836  normal  0.122501 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0721  glycine cleavage system H protein  55.37 
 
 		 126 aa  141  3e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3298  glycine cleavage system H protein  50.81 
 
 		 129 aa  141  3e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.123967  normal  0.480249 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4466  glycine cleavage system H protein  52 
 
 		 126 aa  138  1.9999999999999998e-32  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.332161 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3586  glycine cleavage system protein H  54.17 
 
 		 127 aa  138  3e-32  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.000000166607  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5130  glycine cleavage system protein H  53.33 
 
 		 127 aa  137  7e-32  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000000365083  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5133  glycine cleavage system protein H  53.33 
 
 		 127 aa  137  7e-32  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000135708  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4859  glycine cleavage system protein H  53.33 
 
 		 127 aa  136  1e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000908449  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4700  glycine cleavage system protein H  53.33 
 
 		 127 aa  136  1e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000213752  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4716  glycine cleavage system protein H  53.33 
 
 		 127 aa  136  1e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000000916909  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5097  glycine cleavage system protein H  53.33 
 
 		 127 aa  136  1e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5228  glycine cleavage system protein H  53.33 
 
 		 127 aa  136  1e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.000143615  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2621  glycine cleavage system protein H  48.39 
 
 		 128 aa  135  2e-31  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.233728  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0105  glycine cleavage system protein H  53.33 
 
 		 127 aa  135  2e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.000000835004  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2715  glycine cleavage system protein H  48.39 
 
 		 128 aa  135  2e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4814  glycine cleavage system protein H  52.5 
 
 		 127 aa  134  3.0000000000000003e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00016491  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1244  glycine cleavage system protein H  48.39 
 
 		 128 aa  135  3.0000000000000003e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0187  glycine cleavage system H protein  49.19 
 
 		 126 aa  134  3.0000000000000003e-31  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.717665  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5135  glycine cleavage system protein H  52.5 
 
 		 127 aa  134  4e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00103553  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0676  glycine cleavage system H protein  50.39 
 
 		 127 aa  133  8e-31  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1516  glycine cleavage system H protein  48.78 
 
 		 125 aa  132  1.9999999999999998e-30  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0307602  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23430  glycine cleavage system H protein  49.19 
 
 		 128 aa  130  7.999999999999999e-30  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000556712  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1944  glycine cleavage system H protein  50.81 
 
 		 130 aa  130  9e-30  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000190356 
 
 
-
 
NC_002950  PG0950  glycine cleavage system protein H  51.2 
 
 		 126 aa  129  1.0000000000000001e-29  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.131104 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1693  glycine cleavage system protein H  53.33 
 
 		 127 aa  129  1.0000000000000001e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.418268  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0436  glycine cleavage system H protein  48.8 
 
 		 126 aa  129  2.0000000000000002e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0030  glycine cleavage system protein H  51.85 
 
 		 126 aa  127  4.0000000000000003e-29  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.166486  normal  0.0193025 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1497  glycine cleavage system H protein  45.9 
 
 		 126 aa  127  5.0000000000000004e-29  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01205  glycine cleavage system protein H  46.4 
 
 		 125 aa  125  2.0000000000000002e-28  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0862464  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0897  glycine cleavage system H protein  46.67 
 
 		 135 aa  125  3e-28  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00473644  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4450  glycine cleavage system H protein  44.44 
 
 		 126 aa  124  4.0000000000000003e-28  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1650  glycine cleavage system protein H  49.6 
 
 		 127 aa  124  4.0000000000000003e-28  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0275395  normal  0.35687 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1467  glycine cleavage system protein H  46.72 
 
 		 126 aa  124  5e-28  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0733861 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2869  glycine cleavage system protein H  48.78 
 
 		 129 aa  123  7e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1525  glycine cleavage system H protein  49.59 
 
 		 129 aa  123  9e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.260803 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2284  glycine cleavage system H protein  50.42 
 
 		 129 aa  122  1e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.868083  hitchhiker  0.0000750772 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1654  glycine cleavage system protein H  45.6 
 
 		 126 aa  122  2e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0225  glycine cleavage system protein H  49.6 
 
 		 127 aa  121  3e-27  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0929838 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0697  glycine cleavage system protein H  49.59 
 
 		 127 aa  121  3e-27  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1711  glycine cleavage system H protein  46.09 
 
 		 126 aa  120  4e-27  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.147296  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0231  glycine cleavage system protein H  46.77 
 
 		 126 aa  120  6e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0605  glycine cleavage system H protein  45 
 
 		 132 aa  119  9.999999999999999e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1227  glycine cleavage system H protein  46.83 
 
 		 130 aa  119  1.9999999999999998e-26  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0573  glycine cleavage system protein H  46.46 
 
 		 127 aa  118  1.9999999999999998e-26  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0534  glycine cleavage system H protein  45.67 
 
 		 127 aa  118  3e-26  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0717  glycine cleavage system H protein  46.03 
 
 		 128 aa  117  3.9999999999999996e-26  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1893  glycine cleavage system protein H  46.4 
 
 		 127 aa  117  4.9999999999999996e-26  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.262641 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0363  glycine cleavage system H protein  41.13 
 
 		 133 aa  117  4.9999999999999996e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2673  glycine cleavage system H protein  46.22 
 
 		 124 aa  117  6e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1107  glycine cleavage system H protein  49.09 
 
 		 126 aa  117  6e-26  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2055  glycine cleavage system H protein  46.83 
 
 		 127 aa  117  7e-26  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1982  glycine cleavage system H protein  46.72 
 
 		 130 aa  117  7e-26  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0297807  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0591  glycine cleavage system H protein  46.83 
 
 		 126 aa  117  7.999999999999999e-26  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0600985 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0620  glycine cleavage system protein H  44.88 
 
 		 127 aa  115  9.999999999999999e-26  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2460  glycine cleavage system protein H  47.2 
 
 		 126 aa  116  9.999999999999999e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2004  glycine cleavage system H protein  43.09 
 
 		 127 aa  116  9.999999999999999e-26  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.829681  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3183  glycine cleavage system protein H  47.46 
 
 		 126 aa  115  9.999999999999999e-26  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  unclonable  0.0000000182392  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2036  glycine cleavage system protein H  45.16 
 
 		 129 aa  116  9.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2383  glycine cleavage system H protein  47.93 
 
 		 126 aa  115  9.999999999999999e-26  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1615  glycine cleavage system protein H  45.24 
 
 		 127 aa  115  1.9999999999999998e-25  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.390661 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0787  glycine cleavage system H protein  46.34 
 
 		 128 aa  115  1.9999999999999998e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11856  glycine cleavage system protein H  46.46 
 
 		 134 aa  115  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.795989 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1328  glycine cleavage system H protein  48.7 
 
 		 126 aa  115  1.9999999999999998e-25  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4011  glycine cleavage system H protein  47.62 
 
 		 134 aa  115  3e-25  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.109498  normal  0.181592 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3608  glycine cleavage system H protein  40.32 
 
 		 140 aa  114  3e-25  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.039586  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1612  glycine cleavage system protein H  44 
 
 		 127 aa  115  3e-25  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.645617  normal  0.608002 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1591  glycine cleavage system H protein  44.54 
 
 		 124 aa  114  3.9999999999999997e-25  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2776  glycine cleavage system H protein  52.34 
 
 		 134 aa  114  6e-25  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0264905  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3127  glycine cleavage system H protein  45.53 
 
 		 126 aa  113  6.9999999999999995e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1577  glycine cleavage system H protein  44.72 
 
 		 125 aa  113  7.999999999999999e-25  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.731987  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0447  glycine cleavage system H protein  44.35 
 
 		 126 aa  113  8.999999999999998e-25  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.197212  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6623  glycine cleavage system H protein  42.06 
 
 		 127 aa  113  1.0000000000000001e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.197199 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2348  glycine cleavage system H protein  47.57 
 
 		 134 aa  112  1.0000000000000001e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4038  glycine cleavage system H protein  44.26 
 
 		 128 aa  112  1.0000000000000001e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0664903  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4998  glycine cleavage system protein H  45.9 
 
 		 126 aa  112  1.0000000000000001e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_27674  predicted protein  44.44 
 
 		 134 aa  112  2.0000000000000002e-24  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0154  glycine cleavage system protein H  44.17 
 
 		 131 aa  111  3e-24  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.326161  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0135  glycine cleavage system protein H  43.33 
 
 		 131 aa  111  4.0000000000000004e-24  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1719  glycine cleavage system H protein  45.08 
 
 		 130 aa  110  5e-24  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.891721 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1732  glycine cleavage H-protein  45.6 
 
 		 125 aa  110  7.000000000000001e-24  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4142  glycine cleavage system H protein  47.11 
 
 		 124 aa  110  1.0000000000000001e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3363  glycine cleavage system H protein  46.73 
 
 		 127 aa  109  1.0000000000000001e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.722606 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5357  glycine cleavage system H protein  42.28 
 
 		 126 aa  109  1.0000000000000001e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2761  glycine cleavage system protein H  42.5 
 
 		 130 aa  108  2.0000000000000002e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.982317 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2540  glycine cleavage system H protein  40.32 
 
 		 135 aa  108  2.0000000000000002e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  1.52918e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1812  glycine cleavage system protein H  43.75 
 
 		 131 aa  108  2.0000000000000002e-23  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>