More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_1517 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU1068  sodium/solute symporter family protein  80.2 
 
 		 584 aa  926    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.272224  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1070  sodium/solute symporter family protein  80.38 
 
 		 584 aa  955    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00394385  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2352  sodium/solute symporter family protein  80.2 
 
 		 584 aa  956    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0328342  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1397  SSS sodium solute transporter superfamily  76.76 
 
 		 665 aa  923    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.000364072  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1373  SSS sodium solute transporter superfamily  69.1 
 
 		 662 aa  815    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00174329 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1517  SSS sodium solute transporter superfamily  100 
 
 		 664 aa  1323    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.000116414  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0739  Na+/solute symporter  80.89 
 
 		 584 aa  961    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000119238  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3288  Na+/solute symporter  67.28 
 
 		 655 aa  783    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1424  SSS sodium solute transporter superfamily  62.63 
 
 		 659 aa  729    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2699  SSS sodium solute transporter superfamily  95.34 
 
 		 665 aa  1143    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000107835 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1399  SSS sodium solute transporter superfamily  76.17 
 
 		 661 aa  913    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00201971  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2856  SSS sodium solute transporter superfamily  62.63 
 
 		 657 aa  731    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1420  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  81.51 
 
 		 659 aa  976    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000140042  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2840  SSS sodium solute transporter superfamily  69.14 
 
 		 661 aa  818    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1340  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  69.92 
 
 		 655 aa  813    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0827  SSS sodium solute transporter superfamily  48.25 
 
 		 513 aa  508  9.999999999999999e-143  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1672  sodium/solute symporter family protein  45.56 
 
 		 516 aa  490  1e-137  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.206426  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1518  sodium/solute symporter family protein  45.22 
 
 		 516 aa  487  1e-136  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.782594  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1490  sodium/solute symporter family protein; sodium/proline symporter  45.22 
 
 		 516 aa  487  1e-136  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0960795  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1703  sodium/solute symporter family protein  45.22 
 
 		 516 aa  487  1e-136  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1635  sodium/solute symporter family protein  45.22 
 
 		 516 aa  487  1e-136  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3672  sodium/solute symporter family protein  45.22 
 
 		 516 aa  487  1e-136  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0653794  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1777  sodium/solute symporter family protein  45.05 
 
 		 516 aa  485  1e-136  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.165855  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1726  sodium/solute symporter family protein  44.88 
 
 		 516 aa  484  1e-135  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1480  sodium/solute symporter family protein; sodium/proline symporter  45.05 
 
 		 516 aa  485  1e-135  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1718  SSS sodium solute transporter superfamily  47.82 
 
 		 511 aa  485  1e-135  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1330  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  45.86 
 
 		 516 aa  484  1e-135  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.892115  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1523  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  45.05 
 
 		 516 aa  485  1e-135  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.292925  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1760  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  47.24 
 
 		 530 aa  478  1e-133  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.983666  normal  0.122546 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3843  SSS sodium solute transporter superfamily  43.55 
 
 		 541 aa  449  1e-125  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3760  SSS sodium solute transporter superfamily  43.37 
 
 		 541 aa  451  1e-125  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3167  SSS sodium solute transporter superfamily  46.67 
 
 		 536 aa  446  1.0000000000000001e-124  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0572213  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3703  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  43.03 
 
 		 541 aa  447  1.0000000000000001e-124  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3836  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  42.78 
 
 		 539 aa  446  1.0000000000000001e-124  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.808948 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1542  SSS sodium solute transporter superfamily  41.33 
 
 		 577 aa  439  9.999999999999999e-123  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000862893  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1161  SSS sodium solute transporter superfamily  45.71 
 
 		 568 aa  442  9.999999999999999e-123  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.710493  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1021  SSS sodium solute transporter superfamily  41.07 
 
 		 515 aa  436  1e-121  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.359049  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0315  SSS sodium solute transporter superfamily  41.07 
 
 		 519 aa  436  1e-121  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.721086 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2129  SSS sodium solute transporter superfamily protein  45.68 
 
 		 537 aa  432  1e-120  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.896322  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6314  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  46.06 
 
 		 536 aa  432  1e-119  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.267295  normal  0.199401 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5018  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  46.64 
 
 		 557 aa  429  1e-119  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000399279 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2490  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  41.42 
 
 		 515 aa  431  1e-119  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1454  acetate permease  41.12 
 
 		 554 aa  427  1e-118  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.253764  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0635  acetate permease  41.5 
 
 		 559 aa  427  1e-118  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.953483  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0531  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  45.09 
 
 		 508 aa  428  1e-118  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.633147  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5185  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  45.08 
 
 		 508 aa  426  1e-118  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.204616 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0958  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  42.4 
 
 		 570 aa  428  1e-118  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.483778 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0556  acetate permease  47.9 
 
 		 572 aa  429  1e-118  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4508  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  45.98 
 
 		 557 aa  427  1e-118  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1743  acetate permease  39.3 
 
 		 554 aa  420  1e-116  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2431  acetate permease  48.34 
 
 		 577 aa  420  1e-116  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.157146  normal  0.21776 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0535  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  46.63 
 
 		 575 aa  420  1e-116  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2623  acetate permease  42.14 
 
 		 563 aa  420  1e-116  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0970  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  42.07 
 
 		 516 aa  416  9.999999999999999e-116  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1293  acetate permease  40.17 
 
 		 554 aa  416  9.999999999999999e-116  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3782  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  45.06 
 
 		 563 aa  418  9.999999999999999e-116  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.804193  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1335  acetate permease  38.85 
 
 		 554 aa  418  9.999999999999999e-116  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.384462  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3976  acetate permease  39.14 
 
 		 554 aa  418  9.999999999999999e-116  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.900001  normal  0.864966 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1980  Na+/solute symporter  44.73 
 
 		 576 aa  413  1e-114  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0347  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  45.39 
 
 		 534 aa  413  1e-114  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1850  SSS sodium solute transporter superfamily  41.57 
 
 		 513 aa  415  1e-114  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4127  SSS sodium solute transporter superfamily  43.28 
 
 		 561 aa  411  1e-113  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3756  acetate permease  40 
 
 		 552 aa  409  1e-113  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.574544  normal  0.130195 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0449  SSS sodium solute transporter superfamily  45.08 
 
 		 576 aa  412  1e-113  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.254616  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5957  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  47.52 
 
 		 577 aa  409  1e-113  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0071  SSS sodium solute transporter superfamily  45.91 
 
 		 528 aa  412  1e-113  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1577  SSS sodium solute transporter superfamily  47.76 
 
 		 546 aa  412  1e-113  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0392611  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0465  SSS sodium solute transporter superfamily  45.08 
 
 		 576 aa  412  1e-113  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1624  sodium:solute symporter family protein  45.68 
 
 		 552 aa  406  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.484288  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0887  SSS sodium solute transporter superfamily  38.9 
 
 		 553 aa  407  1.0000000000000001e-112  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4211  acetate permease  46.61 
 
 		 571 aa  407  1.0000000000000001e-112  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.31095  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2501  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  44.99 
 
 		 607 aa  403  1e-111  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000632414 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1608  acetate permease  39.8 
 
 		 552 aa  403  1e-111  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.409391 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3142  acetate permease  47.06 
 
 		 576 aa  404  1e-111  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4960  Na+/solute symporter  44.22 
 
 		 544 aa  403  1e-111  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.319543  normal  0.144233 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4622  acetate permease  38.8 
 
 		 549 aa  403  1e-111  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5596  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  42.28 
 
 		 560 aa  405  1e-111  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1538  SSS sodium solute transporter superfamily protein  42.9 
 
 		 551 aa  405  1e-111  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.535704  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3960  acetate permease  38.8 
 
 		 549 aa  403  1e-111  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.221467 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4311  acetate permease  38.8 
 
 		 549 aa  403  1e-111  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3879  acetate permease  48.34 
 
 		 576 aa  404  1e-111  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.262245  normal  0.214662 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03939  acetate permease  38.64 
 
 		 549 aa  401  9.999999999999999e-111  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.68156  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3925  cation/acetate symporter ActP  38.64 
 
 		 549 aa  401  9.999999999999999e-111  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03899  hypothetical protein  38.64 
 
 		 549 aa  401  9.999999999999999e-111  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.790578  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5572  acetate permease  38.64 
 
 		 549 aa  402  9.999999999999999e-111  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3923  acetate permease  38.85 
 
 		 551 aa  400  9.999999999999999e-111  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.281224  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4586  acetate permease  38.64 
 
 		 549 aa  401  9.999999999999999e-111  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.781469  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0694  SSS sodium solute transporter superfamily  44.92 
 
 		 543 aa  402  9.999999999999999e-111  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3837  acetate permease  38.85 
 
 		 551 aa  400  9.999999999999999e-111  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0353587  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22350  acetate permease  45.67 
 
 		 551 aa  399  9.999999999999999e-111  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000000316225 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4529  acetate permease  38.64 
 
 		 549 aa  402  9.999999999999999e-111  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5873  acetate permease  45.19 
 
 		 553 aa  401  9.999999999999999e-111  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1891  acetate permease  39.29 
 
 		 551 aa  399  1e-109  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.45053  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2866  acetate permease  39.83 
 
 		 666 aa  396  1e-109  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0150163 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5783  acetate permease  45.61 
 
 		 553 aa  396  1e-109  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.061822 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0004  acetate permease  40.3 
 
 		 548 aa  397  1e-109  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.415194  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2954  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  40.78 
 
 		 563 aa  399  1e-109  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0772192 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4619  acetate permease  38.95 
 
 		 549 aa  397  1e-109  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4617  acetate permease  38.95 
 
 		 549 aa  396  1e-109  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.825598  normal  0.309264 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1379  acetate permease  44.88 
 
 		 574 aa  398  1e-109  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.644113  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>