More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_1507 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_1507  nitrogen regulatory protein P-II  100 
 
 		 112 aa  214  2.9999999999999998e-55  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2709  nitrogen regulatory protein P-II  98.21 
 
 		 112 aa  212  9.999999999999999e-55  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000195324 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0939  nitrogen regulatory protein P-II, putative  91.07 
 
 		 112 aa  197  5e-50  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3366  nitrogen regulatory protein P-II  91.07 
 
 		 112 aa  197  6e-50  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0485  nitrogen regulatory protein P-II  86.61 
 
 		 112 aa  195  2.0000000000000003e-49  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.65619  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0694  nitrogen regulatory protein P-II  88.39 
 
 		 112 aa  194  4.0000000000000005e-49  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.804518  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0472  nitrogen regulatory protein P-II  87.5 
 
 		 112 aa  194  4.0000000000000005e-49  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0782781  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1836  nitrogen regulatory protein P-II  75.89 
 
 		 112 aa  176  1e-43  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0337137  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1481  nitrogen regulatory protein P-II  78.57 
 
 		 112 aa  174  3e-43  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.19711 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1351  nitrogen regulatory protein P-II  75 
 
 		 112 aa  173  7e-43  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000771293  hitchhiker  0.0000000000923382 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3078  nitrogen regulatory protein P-II  75 
 
 		 112 aa  173  8e-43  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.0000004264  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1183  nitrogen regulatory protein P-II  75 
 
 		 112 aa  173  8e-43  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000414961 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1680  nitrogen regulatory protein P-II  76.79 
 
 		 112 aa  172  1.9999999999999998e-42  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000892392  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3243  nitrogen regulatory protein P-II  74.11 
 
 		 112 aa  170  5e-42  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.669306  normal  0.422234 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1879  nitrogen regulatory protein P-II  75 
 
 		 112 aa  169  1e-41  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000257329  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4397  nitrogen regulatory protein P-II  70.54 
 
 		 112 aa  168  2e-41  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.467345 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2085  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  71.43 
 
 		 112 aa  167  3e-41  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4248  nitrogen regulatory protein P-II  71.43 
 
 		 112 aa  168  3e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.415508  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0302  nitrogen regulatory protein P-II  71.43 
 
 		 112 aa  168  3e-41  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0080  nitrogen regulatory protein P-II  67.86 
 
 		 112 aa  167  5e-41  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.416357  normal  0.780104 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0240  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  68.75 
 
 		 112 aa  167  6e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.289663  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4381  nitrogen regulatory protein P-II  70.54 
 
 		 117 aa  167  7e-41  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.647425  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4404  nitrogen regulatory protein P-II  70.54 
 
 		 117 aa  167  7e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.795902  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3314  nitrogen regulatory protein P-II  70.54 
 
 		 112 aa  166  7e-41  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.258343  normal  0.0812118 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3163  nitrogen regulatory protein P-II  67.86 
 
 		 112 aa  166  7e-41  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.105283  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0472  nitrogen regulatory protein P-II  73.21 
 
 		 112 aa  166  9e-41  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2866  nitrogen regulatory protein P-II  69.64 
 
 		 136 aa  166  9e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00138557  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0173  nitrogen regulatory protein P-II  70.54 
 
 		 112 aa  166  1e-40  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000293377  normal  0.353092 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0437  nitrogen regulatory protein P-II  69.64 
 
 		 112 aa  165  2e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0564  nitrogen regulatory protein P-II  68.75 
 
 		 112 aa  165  2e-40  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00000000717962  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0217  nitrogen regulatory protein P-II  70.54 
 
 		 112 aa  165  2e-40  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000368327 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2877  nitrogen regulatory protein P-II  69.64 
 
 		 112 aa  165  2e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.58077  normal  0.596742 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2783  nitrogen regulatory protein P-II  69.64 
 
 		 112 aa  165  2e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.190051  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0198  nitrogen regulatory protein P-II  70.54 
 
 		 112 aa  165  2e-40  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.485304 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4832  nitrogen regulatory protein P-II  73.21 
 
 		 112 aa  165  2e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0163  nitrogen regulatory protein P-II  71.43 
 
 		 112 aa  165  2e-40  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.814781 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0234  nitrogen regulatory protein P-II  68.75 
 
 		 112 aa  165  2e-40  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.000834653  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0181  nitrogen regulatory protein P-II  71.43 
 
 		 112 aa  165  2e-40  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.153981  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2513  nitrogen regulatory protein P-II  70.54 
 
 		 112 aa  165  2e-40  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.00284343  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2252  nitrogen regulatory protein P-II  69.64 
 
 		 112 aa  165  2e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0233324  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3656  nitrogen regulatory protein P-II  72.32 
 
 		 112 aa  165  2e-40  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2921  nitrogen regulatory protein P-II  69.64 
 
 		 112 aa  165  2e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0772673  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0291  nitrogen regulatory protein P-II  67.86 
 
 		 112 aa  164  2.9999999999999998e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0433  nitrogen regulatory protein P-II  69.64 
 
 		 112 aa  165  2.9999999999999998e-40  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0037358  normal  0.874801 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1074  nitrogen regulatory protein P-II  72.32 
 
 		 112 aa  164  2.9999999999999998e-40  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3119  nitrogen regulatory protein P-II  68.75 
 
 		 112 aa  164  2.9999999999999998e-40  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0525  nitrogen regulatory protein P-II  68.75 
 
 		 112 aa  164  4e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.887906  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0256  nitrogen regulatory protein P-II  68.75 
 
 		 112 aa  164  4e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5499  nitrogen regulatory protein P-II  69.64 
 
 		 112 aa  164  4e-40  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.118454 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4190  nitrogen regulatory protein P-II  68.75 
 
 		 112 aa  164  4e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.959597 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2044  nitrogen regulatory protein P-II  71.43 
 
 		 112 aa  164  5e-40  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0342  nitrogen regulatory P-II transcription regulator protein  68.75 
 
 		 112 aa  164  5e-40  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1116  nitrogen regulatory protein P-II  70.54 
 
 		 112 aa  164  5e-40  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0969  nitrogen regulatory protein P-II  68.75 
 
 		 112 aa  163  5.9999999999999996e-40  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.916041  hitchhiker  0.000334887 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3314  nitrogen regulatory protein P-II  70.54 
 
 		 112 aa  163  6.9999999999999995e-40  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.431384  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2900  nitrogen regulatory protein P-II  70.54 
 
 		 112 aa  163  6.9999999999999995e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0642579  normal  0.0916709 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0233  nitrogen regulatory protein P-II  71.43 
 
 		 112 aa  163  8e-40  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6195  nitrogen regulatory protein P-II  68.75 
 
 		 136 aa  163  9e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1957  nitrogen regulatory protein P-II  69.64 
 
 		 112 aa  163  9e-40  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0468  nitrogen regulatory protein P-II  68.75 
 
 		 112 aa  162  1.0000000000000001e-39  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.409463  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1400  nitrogen regulatory protein P-II  68.75 
 
 		 112 aa  162  1.0000000000000001e-39  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3218  P-II family regulatory protein  68.75 
 
 		 112 aa  162  1.0000000000000001e-39  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.472285  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0651  nitrogen regulatory protein P-II  68.75 
 
 		 112 aa  162  1.0000000000000001e-39  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.888486  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0193  nitrogen regulatory protein P-II  68.75 
 
 		 112 aa  162  1.0000000000000001e-39  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.431486  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0218  nitrogen regulatory protein P-II  70.54 
 
 		 112 aa  162  1.0000000000000001e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.601689  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0407  nitrogen regulatory protein P-II  68.75 
 
 		 112 aa  162  1.0000000000000001e-39  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.32852  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2387  nitrogen regulatory protein P-II  69.64 
 
 		 112 aa  162  1.0000000000000001e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.344208 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0487  nitrogen regulatory protein P-II  68.75 
 
 		 112 aa  162  1.0000000000000001e-39  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.188054  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0132  nitrogen regulatory protein P-II  71.43 
 
 		 112 aa  162  1.0000000000000001e-39  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  unclonable  0.00000000000000199717  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2827  nitrogen regulatory protein P-II  68.75 
 
 		 112 aa  162  1.0000000000000001e-39  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.994537  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2330  nitrogen regulatory protein P-II  72.32 
 
 		 112 aa  162  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.678822  normal  0.202545 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3586  nitrogen regulatory protein P-II  68.75 
 
 		 112 aa  162  2.0000000000000002e-39  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0323305  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7409  nitrogen regulatory protein P-II  72.32 
 
 		 112 aa  161  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.394693  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0183  nitrogen regulatory protein P-II  69.64 
 
 		 112 aa  161  2.0000000000000002e-39  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.320277  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0120  nitrogen regulatory protein P-II  70.54 
 
 		 112 aa  162  2.0000000000000002e-39  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0723912 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0156  nitrogen regulatory protein P-II  67.86 
 
 		 112 aa  161  3e-39  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4461  nitrogen regulatory protein P-II  68.75 
 
 		 112 aa  161  3e-39  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.188449  normal  0.905473 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2559  nitrogen regulatory protein P-II  69.64 
 
 		 112 aa  161  3e-39  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.32282  normal  0.488626 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2651  nitrogen regulatory protein P-II  72.32 
 
 		 112 aa  161  3e-39  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.614169  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5130  nitrogen regulatory protein P-II  72.32 
 
 		 112 aa  161  3e-39  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.179689  normal  0.884639 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2346  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  68.75 
 
 		 112 aa  161  3e-39  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.235899 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2374  nitrogen regulatory protein P-II  72.32 
 
 		 112 aa  161  3e-39  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.261828  normal  0.353669 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6587  nitrogen regulatory protein P-II  72.32 
 
 		 112 aa  161  3e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.490351 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2229  nitrogen regulatory protein P-II  75 
 
 		 112 aa  160  4.0000000000000004e-39  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000520156  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0523  nitrogen regulatory protein P-II  67.86 
 
 		 112 aa  161  4.0000000000000004e-39  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.278087  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0591  nitrogen regulatory protein P-II  67.86 
 
 		 112 aa  160  5.0000000000000005e-39  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.307832  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2043  nitrogen regulatory protein P-II  68.75 
 
 		 112 aa  160  5.0000000000000005e-39  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.242523  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0428  nitrogen regulatory protein P-II  71.43 
 
 		 112 aa  160  5.0000000000000005e-39  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0232  nitrogen regulatory protein P-II  68.75 
 
 		 112 aa  160  5.0000000000000005e-39  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0312248  normal  0.530475 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0429  nitrogen regulatory protein P-II 1  67.86 
 
 		 112 aa  160  5.0000000000000005e-39  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.398049  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2233  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  71.43 
 
 		 112 aa  160  6e-39  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0532084  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2406  nitrogen regulatory protein P-II  65.18 
 
 		 112 aa  160  6e-39  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0641  nitrogen regulatory protein P-II  69.64 
 
 		 112 aa  160  7e-39  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.252116  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0808  nitrogen regulatory protein P-II  69.64 
 
 		 112 aa  160  8.000000000000001e-39  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0899844  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1903  nitrogen regulatory protein P-II  71.43 
 
 		 112 aa  159  8.000000000000001e-39  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.88445  normal  0.529222 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4580  nitrogen regulatory protein P-II  68.75 
 
 		 112 aa  159  8.000000000000001e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.495708  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1005  nitrogen regulatory protein P-II  70.54 
 
 		 112 aa  159  1e-38  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0971  nitrogen regulatory protein P-II  70.54 
 
 		 112 aa  159  1e-38  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.650891  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2088  nitrogen regulatory protein P-II  70.54 
 
 		 112 aa  159  1e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1109  nitrogen regulatory protein P-II  70.54 
 
 		 112 aa  159  1e-38  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0303979  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>