More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_1436 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011146  Gbem_1436  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  100 
 
 
326 aa  656    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2818  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  93.87 
 
 
326 aa  598  1e-170  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2272  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  70.55 
 
 
326 aa  483  1e-135  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1951  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  69.33 
 
 
326 aa  478  1e-134  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1354  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  64.11 
 
 
326 aa  422  1e-117  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.935737  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2931  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  63.19 
 
 
326 aa  419  1e-116  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3571  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  62.88 
 
 
325 aa  416  9.999999999999999e-116  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2419  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  61.04 
 
 
326 aa  416  9.999999999999999e-116  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0301  radical SAM:molybdenum cofactor synthesis-like  61.04 
 
 
326 aa  412  1e-114  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3146  molybdenum cofactor biosynthesis protein A, putative  60.12 
 
 
326 aa  391  1e-108  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0304  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  58.9 
 
 
326 aa  384  1e-106  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0337  radical SAM:molybdenum cofactor synthesis-like  60.12 
 
 
326 aa  381  1e-104  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.910296  hitchhiker  4.2899899999999994e-20 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0892  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  56.75 
 
 
326 aa  379  1e-104  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2095  GTP cyclohydrolase subunit MoaA  55.52 
 
 
326 aa  377  1e-103  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1159  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  57.1 
 
 
330 aa  343  2e-93  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.263056  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2135  GTP cyclohydrolase subunit MoaA  47.37 
 
 
323 aa  286  5e-76  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1905  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  46.77 
 
 
329 aa  280  3e-74  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.349909  unclonable  0.0000106016 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2768  molybdopterin biosynthesis, protein A  46.67 
 
 
333 aa  277  2e-73  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000149516  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0327  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  46.25 
 
 
344 aa  276  3e-73  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1265  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  43.46 
 
 
336 aa  275  1.0000000000000001e-72  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.522887  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1860  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  42.64 
 
 
326 aa  269  5e-71  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.310247  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2958  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  45.4 
 
 
325 aa  268  1e-70  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1400  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  42.07 
 
 
323 aa  267  2e-70  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2268  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  44.34 
 
 
325 aa  266  5e-70  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0373  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  42.86 
 
 
323 aa  265  8e-70  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4597  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  45.48 
 
 
334 aa  262  4.999999999999999e-69  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.770379 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2195  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  43.85 
 
 
333 aa  262  6e-69  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.823795  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1291  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  45.48 
 
 
334 aa  262  8e-69  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4127  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  46.2 
 
 
334 aa  261  1e-68  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3906  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  44.88 
 
 
334 aa  259  3e-68  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.68268 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1930  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  44.98 
 
 
319 aa  260  3e-68  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03880  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  42.14 
 
 
337 aa  259  5.0000000000000005e-68  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.329563 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1999  radical SAM:molybdenum cofactor synthesis C-terminal  45.05 
 
 
357 aa  258  7e-68  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.655025  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01630  GTP cyclohydrolase subunit MoaA  42.9 
 
 
333 aa  257  2e-67  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0072  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  46.82 
 
 
340 aa  255  6e-67  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2859  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  43.87 
 
 
330 aa  255  9e-67  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00116324  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0158  molybdenum cofactor synthesis-like  42.34 
 
 
331 aa  252  7e-66  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000194349  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3388  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  44.11 
 
 
332 aa  250  2e-65  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0336  GTP cyclohydrolase subunit MoaA  43.77 
 
 
327 aa  249  5e-65  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1392  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  40.99 
 
 
317 aa  249  6e-65  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0621  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  43.73 
 
 
327 aa  248  7e-65  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.239747  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1019  GTP cyclohydrolase subunit MoaA  45.7 
 
 
328 aa  247  2e-64  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.33881  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1760  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  39.51 
 
 
323 aa  246  4.9999999999999997e-64  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.7115  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1202  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  40.37 
 
 
335 aa  246  6e-64  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1590  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  44.95 
 
 
316 aa  245  6e-64  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2045  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  38.89 
 
 
323 aa  244  9.999999999999999e-64  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.990495  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2516  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  43.11 
 
 
332 aa  243  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0514833  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3826  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  44.55 
 
 
331 aa  243  3e-63  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.488803  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2294  molybdenum cofactor synthesis-like protein  42.42 
 
 
343 aa  242  6e-63  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.819438  normal  0.288713 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2327  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  42.64 
 
 
332 aa  242  7e-63  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0620358  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2491  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  41.94 
 
 
353 aa  242  7e-63  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.989174  normal  0.187655 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0187  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  41.59 
 
 
330 aa  242  7e-63  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00819239  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03850  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  45.45 
 
 
335 aa  241  9e-63  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1280  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  41.95 
 
 
332 aa  241  1e-62  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.412863  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44970  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  44.07 
 
 
331 aa  241  1e-62  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2766  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  42.55 
 
 
331 aa  239  2.9999999999999997e-62  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.237766  normal  0.576064 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1604  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  39.58 
 
 
328 aa  239  4e-62  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1315  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  38.82 
 
 
341 aa  238  1e-61  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.374397  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1480  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  40 
 
 
332 aa  237  2e-61  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.498315  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13850  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  44.98 
 
 
329 aa  235  6e-61  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.254776  normal  0.121323 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1239  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  44.98 
 
 
329 aa  235  9e-61  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19300  GTP cyclohydrolase subunit MoaA  42.86 
 
 
333 aa  234  1.0000000000000001e-60  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00282794  normal  0.0296768 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3318  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  40.24 
 
 
333 aa  235  1.0000000000000001e-60  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30330  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  44.98 
 
 
331 aa  234  1.0000000000000001e-60  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0257  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  40.74 
 
 
315 aa  234  2.0000000000000002e-60  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.862128  normal  0.0494726 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1477  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  42.31 
 
 
343 aa  233  4.0000000000000004e-60  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2076  GTP cyclohydrolase subunit MoaA  40.12 
 
 
329 aa  232  5e-60  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.000199937  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2214  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  42.86 
 
 
363 aa  232  7.000000000000001e-60  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.422159  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4724  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  39.63 
 
 
327 aa  230  2e-59  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3884  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  40.12 
 
 
327 aa  230  2e-59  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0143  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  40.79 
 
 
334 aa  231  2e-59  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.391723 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0119  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  40.06 
 
 
327 aa  231  2e-59  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.491091 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2612  GTP cyclohydrolase subunit MoaA  41.95 
 
 
327 aa  230  3e-59  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.635928 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2254  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  42.81 
 
 
344 aa  229  6e-59  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.483047  normal  0.0526989 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_50634  predicted protein  43.54 
 
 
336 aa  229  6e-59  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.612985 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3073  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  41.64 
 
 
330 aa  228  7e-59  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.342071  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2266  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  40.55 
 
 
329 aa  227  2e-58  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00162832  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0240  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  41.09 
 
 
330 aa  227  2e-58  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3972  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  39.33 
 
 
327 aa  227  2e-58  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.76185 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4636  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  38.49 
 
 
335 aa  226  3e-58  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.886465  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3369  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  42.6 
 
 
329 aa  226  3e-58  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.986754 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3879  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  39.33 
 
 
327 aa  226  4e-58  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3688  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  40.3 
 
 
328 aa  226  4e-58  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4082  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  39.33 
 
 
327 aa  226  5.0000000000000005e-58  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1615  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  43.16 
 
 
596 aa  226  6e-58  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1219  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  42.31 
 
 
343 aa  226  6e-58  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3480  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  42.95 
 
 
344 aa  226  6e-58  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.460525 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1853  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  42.22 
 
 
335 aa  225  8e-58  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2110  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  41.29 
 
 
356 aa  225  9e-58  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.163596  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2072  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  43.59 
 
 
329 aa  224  1e-57  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1230  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  44.95 
 
 
361 aa  224  2e-57  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0359079 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0882  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  39.54 
 
 
323 aa  224  2e-57  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2231  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  41.99 
 
 
345 aa  223  2e-57  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.813022  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1759  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  41.83 
 
 
356 aa  223  3e-57  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.103881  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34160  GTP cyclohydrolase subunit MoaA  40.12 
 
 
339 aa  223  3e-57  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.142269  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1878  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  43.17 
 
 
355 aa  223  4e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  hitchhiker  0.0061453  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0560  GTP cyclohydrolase subunit MoaA  40 
 
 
329 aa  222  6e-57  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.763521 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0082  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  40.3 
 
 
328 aa  222  8e-57  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3389  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  41.53 
 
 
345 aa  222  8e-57  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.142655 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1648  GTP cyclohydrolase subunit MoaA  38.85 
 
 
362 aa  222  8e-57  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.918642  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>