92 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_1372 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_1372  hypothetical protein  100 
 
 		 503 aa  1022    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0697094  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2911  hypothetical protein  88.07 
 
 		 503 aa  902    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000449033 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0735  hypothetical protein  37.69 
 
 		 358 aa  215  9.999999999999999e-55  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2415  hypothetical protein  47 
 
 		 358 aa  186  7e-46  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0547  hypothetical protein  43.78 
 
 		 275 aa  176  9.999999999999999e-43  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1198  hypothetical protein  43.14 
 
 		 242 aa  161  3e-38  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0828  hypothetical protein  43.9 
 
 		 292 aa  154  4e-36  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4672  hypothetical protein  39.91 
 
 		 214 aa  145  1e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.504649  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5138  hypothetical protein  40.59 
 
 		 231 aa  141  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0045  hypothetical protein  36.2 
 
 		 324 aa  139  1e-31  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.113185  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2731  hypothetical protein  40.1 
 
 		 267 aa  137  7.000000000000001e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.829865  normal  0.342321 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2717  hypothetical protein  40.1 
 
 		 267 aa  137  7.000000000000001e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.122181  normal  0.329451 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2687  hypothetical protein  40.1 
 
 		 267 aa  137  7.000000000000001e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0189  hypothetical protein  34.09 
 
 		 242 aa  134  3e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2696  hypothetical protein  31.6 
 
 		 208 aa  125  2e-27  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5524  putative cytoplasmic protein  34.98 
 
 		 196 aa  120  4.9999999999999996e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.564525 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05800  hypothetical protein  33.9 
 
 		 299 aa  120  7.999999999999999e-26  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0113  hypothetical protein  47.83 
 
 		 252 aa  116  1.0000000000000001e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0134  hypothetical protein  36.26 
 
 		 247 aa  115  2.0000000000000002e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1793  hypothetical protein  32.14 
 
 		 226 aa  113  9e-24  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2092  hypothetical protein  36.84 
 
 		 295 aa  110  7.000000000000001e-23  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1282  Ig domain-containing protein  36.9 
 
 		 465 aa  99.4  1e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.592505  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1667  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  32.56 
 
 		 314 aa  99  2e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2747  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  34.81 
 
 		 216 aa  98.2  3e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0268  hypothetical protein  28.69 
 
 		 301 aa  92  2e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0217918  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1413  hypothetical protein  32.83 
 
 		 286 aa  91.7  3e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.430861  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0888  hypothetical protein  32.83 
 
 		 286 aa  91.7  3e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0430779  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0695  hypothetical protein  32.83 
 
 		 286 aa  91.7  3e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.303699  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3678  hypothetical protein  31.47 
 
 		 222 aa  91.3  3e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0369739  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0464  hypothetical protein  32.83 
 
 		 286 aa  91.7  3e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.000209316  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2669  hypothetical protein  31.56 
 
 		 283 aa  90.9  5e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.526313  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3790  hypothetical protein  36.18 
 
 		 168 aa  89.7  1e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.231006 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0406  hypothetical protein  32.61 
 
 		 217 aa  88.6  2e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.99368 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0385  hypothetical protein  32.26 
 
 		 217 aa  89  2e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.195483 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1650  hypothetical protein  32.32 
 
 		 286 aa  88.6  2e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0397  hypothetical protein  32.61 
 
 		 217 aa  88.6  2e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1806  hypothetical protein  32.32 
 
 		 283 aa  89  2e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1629  hypothetical protein  32.32 
 
 		 286 aa  87.8  4e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0613071  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0966  hypothetical protein  31.22 
 
 		 248 aa  85.5  0.000000000000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3257  hypothetical protein  31.73 
 
 		 288 aa  84.7  0.000000000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04119  hypothetical protein  30.8 
 
 		 248 aa  83.2  0.00000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.997583  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0439  hypothetical protein  32.69 
 
 		 189 aa  81.6  0.00000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0382  hypothetical protein  35.81 
 
 		 189 aa  81.3  0.00000000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.687515  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3635  hypothetical protein  37.58 
 
 		 167 aa  80.9  0.00000000000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.514742  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0337  hypothetical protein  31.58 
 
 		 253 aa  80.1  0.00000000000009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2951  hypothetical protein  38.93 
 
 		 170 aa  79.3  0.0000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10314  hypothetical protein  30.21 
 
 		 218 aa  79.3  0.0000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2816  hypothetical protein  38.31 
 
 		 171 aa  78.2  0.0000000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0176  hypothetical protein  31.97 
 
 		 173 aa  77.8  0.0000000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.754868  normal  0.876478 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0607  cell wall binding repeat-containing protein  25.13 
 
 		 454 aa  77.4  0.0000000000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1770  hypothetical protein  32.41 
 
 		 178 aa  77.4  0.0000000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.117901 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1577  hypothetical protein  36.64 
 
 		 197 aa  77  0.0000000000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.855326  normal  0.0747974 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0966  hypothetical protein  34.23 
 
 		 181 aa  75.9  0.000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1856  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  36.64 
 
 		 197 aa  76.6  0.000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.809056 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0043  hypothetical protein  37.6 
 
 		 170 aa  75.5  0.000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.132531  normal  0.0395538 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0041  hypothetical protein  34.34 
 
 		 164 aa  75.5  0.000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000155161 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5035  hypothetical protein  31.76 
 
 		 170 aa  75.1  0.000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.349078 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0287  hypothetical protein  32.69 
 
 		 187 aa  74.7  0.000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0845  hypothetical protein  35.53 
 
 		 164 aa  74.3  0.000000000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2503  hypothetical protein  35.53 
 
 		 164 aa  74.3  0.000000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.984407 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1286  hypothetical protein  33.99 
 
 		 186 aa  73.6  0.000000000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0095  hypothetical protein  32.43 
 
 		 213 aa  72.8  0.00000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.250747  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0281  hypothetical protein  36.88 
 
 		 199 aa  72  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.117733 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3762  hypothetical protein  34.23 
 
 		 173 aa  72.8  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4087  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  30.77 
 
 		 173 aa  72.4  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1662  hypothetical protein  35.88 
 
 		 197 aa  71.6  0.00000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.35409 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3130  hypothetical protein  33.55 
 
 		 164 aa  70.9  0.00000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00016542 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0415  hypothetical protein  36.55 
 
 		 192 aa  70.9  0.00000000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.659798  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0088  hypothetical protein  31.37 
 
 		 189 aa  70.5  0.00000000007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.600446  normal  0.0826635 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0976  GW repeat-containing protein  25 
 
 		 530 aa  69.7  0.0000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.306565  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0049  hypothetical protein  33.11 
 
 		 151 aa  68.2  0.0000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.286188 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0431  hypothetical protein  29.26 
 
 		 230 aa  67.8  0.0000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.329815 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0310  hypothetical protein  30.3 
 
 		 221 aa  67.8  0.0000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.139767 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0061  hypothetical protein  29.53 
 
 		 202 aa  67.4  0.0000000006  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1930  hypothetical protein  33.57 
 
 		 167 aa  65.5  0.000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2007  hypothetical protein  33.57 
 
 		 167 aa  65.5  0.000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.100253  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1236  secreted protein  28.57 
 
 		 240 aa  65.9  0.000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4226  hypothetical protein  31.43 
 
 		 186 aa  65.5  0.000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1019  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  35.88 
 
 		 177 aa  65.5  0.000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0228  hypothetical protein  32.41 
 
 		 225 aa  64.3  0.000000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.202432  normal  0.354498 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2376  hypothetical protein  33.57 
 
 		 174 aa  63.9  0.000000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4106  hypothetical protein  33.33 
 
 		 185 aa  61.6  0.00000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.382148 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3423  hypothetical protein  30.91 
 
 		 204 aa  61.6  0.00000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0334  hypothetical protein  30 
 
 		 179 aa  61.2  0.00000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0085748 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1401  hypothetical protein  34.53 
 
 		 177 aa  60.8  0.00000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.198292 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3057  hypothetical protein  31.75 
 
 		 182 aa  56.2  0.000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3179  hypothetical protein  27.86 
 
 		 220 aa  53.9  0.000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5607  hypothetical protein  25.71 
 
 		 313 aa  53.9  0.000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.133925  decreased coverage  0.000118142 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0935  hypothetical protein  25.53 
 
 		 278 aa  52.8  0.00002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0237848  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1222  S-layer domain protein  29.59 
 
 		 108 aa  48.9  0.0002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2886  hypothetical protein  26.23 
 
 		 248 aa  44.7  0.004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0811534  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4196  hypothetical protein  24.55 
 
 		 269 aa  43.1  0.01  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.606827  normal  0.839395 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>