More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_1313 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011146  Gbem_1313  actin-like ATPase  100 
 
 
285 aa  561  1.0000000000000001e-159  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.000000221446  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2971  actin-like ATPase  97.19 
 
 
285 aa  546  1e-154  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000551433 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0161  Actin-like ATPase i  55.12 
 
 
265 aa  276  3e-73  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0515  rod shape-determining protein MreB  28.27 
 
 
343 aa  125  5e-28  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0667798  hitchhiker  0.00000000455643 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1420  rod shape-determining protein MreB  27.73 
 
 
339 aa  124  2e-27  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0088  rod shape-determining protein MreB  29.28 
 
 
340 aa  123  4e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14240  rod shape-determining protein MreB  32.51 
 
 
346 aa  122  9e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000102365  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2445  rod shape-determining protein Mbl  30.12 
 
 
345 aa  120  1.9999999999999998e-26  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0109  rod shape-determining protein Mbl  29.37 
 
 
343 aa  120  3e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00501593  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1489  rod shape-determining protein MreB  28.75 
 
 
347 aa  119  7.999999999999999e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.202566 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1540  rod shape-determining protein MreB  30.53 
 
 
344 aa  119  7.999999999999999e-26  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00158953  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2835  rod shape-determining protein Mbl  28.41 
 
 
345 aa  118  9e-26  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5269  rod shape-determining protein MreB  30.77 
 
 
343 aa  118  9.999999999999999e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.558763  normal  0.287821 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2371  rod shape-determining protein Mbl  29.41 
 
 
345 aa  118  9.999999999999999e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000614585 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2134  rod shape-determining protein MreB  28.01 
 
 
339 aa  117  1.9999999999999998e-25  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000759245  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0900  rod shape-determining protein MreB  31.47 
 
 
340 aa  117  1.9999999999999998e-25  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2155  rod shape-determining protein Mbl  29.22 
 
 
345 aa  117  1.9999999999999998e-25  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1211  rod shape-determining protein MreB  31.21 
 
 
343 aa  117  3e-25  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.984944 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1687  MreB/Mrl family cell shape determining protein  30.67 
 
 
344 aa  117  3e-25  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.869584  normal  0.143925 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0471  rod shape-determining protein MreB  28.09 
 
 
330 aa  115  6e-25  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000843079  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0996  rod shape-determining protein MreB  29.58 
 
 
346 aa  115  6e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0162908  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3356  rod shape-determining protein MreB  27.78 
 
 
346 aa  115  7.999999999999999e-25  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0692396  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0260  rod shape-determining protein MreB  29.02 
 
 
330 aa  115  8.999999999999998e-25  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0636  cell shape determining protein, MreB/Mrl family  30.68 
 
 
347 aa  114  1.0000000000000001e-24  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3645  rod shape-determining protein MreB  27.73 
 
 
353 aa  115  1.0000000000000001e-24  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.168419 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0464  rod shape-determining protein MreB  29.04 
 
 
335 aa  114  1.0000000000000001e-24  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2549  rod shape-determining protein MreB  31.58 
 
 
339 aa  114  2.0000000000000002e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0140838  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3282  rod shape-determining protein Mbl  31.42 
 
 
333 aa  114  2.0000000000000002e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000125947  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2184  rod shape-determining protein MreB  29.93 
 
 
346 aa  114  2.0000000000000002e-24  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7285  rod shape-determining protein MreB  29.91 
 
 
349 aa  114  2.0000000000000002e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2563  rod shape-determining protein MreB  27.27 
 
 
340 aa  114  2.0000000000000002e-24  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.684063  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4032  rod shape-determining protein MreB  26.96 
 
 
366 aa  114  2.0000000000000002e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.467853 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0595  rod shape-determining protein MreB  27.1 
 
 
345 aa  113  3e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2834  rod shape-determining protein MreB  30.6 
 
 
347 aa  113  3e-24  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.000000000000019673  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002383  rod shape-determining protein MreB  30.6 
 
 
347 aa  113  4.0000000000000004e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000533641  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3652  cell shape determining protein, MreB/Mrl family  26.75 
 
 
345 aa  113  4.0000000000000004e-24  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.566148  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1824  cell shape determining protein, MreB/Mrl family  31.7 
 
 
344 aa  113  4.0000000000000004e-24  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03685  rod shape-determining protein MreB  30.6 
 
 
347 aa  113  4.0000000000000004e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0445  cell shape determining protein, MreB/Mrl family  28.23 
 
 
337 aa  113  4.0000000000000004e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.0596021 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2133  rod shape-determining protein Mbl  29.09 
 
 
343 aa  112  5e-24  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4158  rod shape-determining protein Mbl  30.43 
 
 
345 aa  113  5e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.53074  normal  0.031954 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0492  rod shape-determining protein MreB  29.33 
 
 
346 aa  112  7.000000000000001e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.152747  normal  0.695392 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0164  rod shape-determining protein MreB  29.93 
 
 
346 aa  112  7.000000000000001e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3167  rod shape-determining protein MreB  34.15 
 
 
338 aa  112  7.000000000000001e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2089  rod shape-determining protein MreB  30.99 
 
 
347 aa  112  8.000000000000001e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4598  rod shape-determining protein MreB  26.56 
 
 
336 aa  112  8.000000000000001e-24  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2128  rod shape-determining protein MreB  28.03 
 
 
348 aa  112  8.000000000000001e-24  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0242  rod shape-determining protein MreB  31.94 
 
 
329 aa  112  8.000000000000001e-24  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000312684  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2479  rod shape-determining protein MreB  27.56 
 
 
346 aa  111  1.0000000000000001e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.173015  normal  0.21254 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1165  cell shape determining protein, MreB/Mrl family  25.85 
 
 
348 aa  111  1.0000000000000001e-23  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5400  rod shape-determining protein Mbl  29.82 
 
 
333 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000418455  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0100  rod shape-determining protein MreB  30.47 
 
 
347 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5404  rod shape-determining protein Mbl  29.93 
 
 
333 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.00000000385561  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5128  rod shape-determining protein Mbl  29.93 
 
 
333 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000000379199  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4962  rod shape-determining protein Mbl  29.93 
 
 
333 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  1.96321e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4974  rod shape-determining protein Mbl  29.93 
 
 
333 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00000021016  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5369  rod shape-determining protein Mbl  29.93 
 
 
333 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.813722 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5550  rod shape-determining protein Mbl  29.82 
 
 
333 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000581144  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0918  rod shape-determining protein MreB  30.28 
 
 
347 aa  110  2.0000000000000002e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000183454  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5520  rod shape-determining protein Mbl  29.93 
 
 
333 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1465  rod shape-determining protein MreB  25.45 
 
 
345 aa  110  2.0000000000000002e-23  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.28948  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5455  rod shape-determining protein Mbl  29.93 
 
 
333 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000276549  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0573  rod shape-determining protein MreB  28.62 
 
 
335 aa  110  2.0000000000000002e-23  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.788232  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1313  rod shape-determining protein MreB  28.89 
 
 
346 aa  110  2.0000000000000002e-23  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.615742  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2749  cell shape determining protein, MreB/Mrl family  30.6 
 
 
339 aa  110  3e-23  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1248  cell shape determining protein, MreB/Mrl family  27.3 
 
 
345 aa  110  3e-23  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0506008  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2728  rod shape-determining protein MreB  27.91 
 
 
347 aa  110  3e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  unclonable  0.000000992624  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2017  rod shape-determining protein MreB  28.25 
 
 
346 aa  109  4.0000000000000004e-23  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.881411  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3798  rod shape-determining protein Mbl  29.59 
 
 
333 aa  110  4.0000000000000004e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000087539  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4544  rod shape-determining protein MreB  33.8 
 
 
339 aa  109  5e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4586  rod shape-determining protein MreB  33.8 
 
 
339 aa  109  5e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.176997  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4350  rod shape-determining protein MreB  33.8 
 
 
339 aa  109  5e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000471132  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4186  rod shape-determining protein MreB  33.8 
 
 
339 aa  109  5e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.15215  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4197  rod shape-determining protein MreB  33.8 
 
 
339 aa  109  5e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000174477  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4532  rod shape-determining protein MreB  33.8 
 
 
339 aa  109  5e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4684  rod shape-determining protein MreB  33.8 
 
 
339 aa  109  5e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2866  rod shape-determining protein MreB  30.14 
 
 
347 aa  109  5e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000181914  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5932  cell shape determining protein, MreB/Mrl family  30.6 
 
 
344 aa  109  5e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.126603  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17730  rod shape-determining protein Mbl  29.41 
 
 
344 aa  109  6e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1937  rod shape-determining protein MreB  26.38 
 
 
347 aa  109  6e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  unclonable  0.0000000814712  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5352  rod shape-determining protein MreB  27.88 
 
 
344 aa  109  7.000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00418366  normal  0.0848923 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1369  cell shape determining protein MreB/Mrl  26.35 
 
 
352 aa  108  7.000000000000001e-23  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3432  rod shape-determining protein MreB  27.88 
 
 
344 aa  109  7.000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4936  rod shape-determining protein MreB  27.88 
 
 
344 aa  109  7.000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  unclonable  0.0000194239 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2562  rod shape-determining protein MreB  29.9 
 
 
348 aa  109  7.000000000000001e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.497429  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0663  rod shape-determining protein MreB  33.8 
 
 
339 aa  108  8.000000000000001e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.435022  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2192  rod shape-determining protein MreB  29.9 
 
 
347 aa  108  8.000000000000001e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.728891  hitchhiker  0.00000188341 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4571  rod shape-determining protein MreB  33.8 
 
 
339 aa  108  8.000000000000001e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00556747  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2548  rod shape-determining protein MreB  27.82 
 
 
343 aa  108  8.000000000000001e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4298  rod shape-determining protein MreB  33.8 
 
 
339 aa  108  9.000000000000001e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1235  rod shape-determining protein MreB  27.3 
 
 
329 aa  108  9.000000000000001e-23  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2592  rod shape-determining protein MreB  29.32 
 
 
343 aa  108  9.000000000000001e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2222  rod shape-determining protein MreB  26.36 
 
 
346 aa  108  1e-22  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0756  rod shape-determining protein MreB  28.92 
 
 
346 aa  108  1e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.421254  hitchhiker  0.00154989 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0183  rod shape-determining protein MreB  31.09 
 
 
347 aa  108  1e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000000147765  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0169  rod shape-determining protein MreB  31.54 
 
 
347 aa  108  1e-22  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0187  cell shape determining protein, MreB/Mrl family  24.62 
 
 
344 aa  107  2e-22  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00128251  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0766  rod shape-determining protein MreB  31.3 
 
 
342 aa  107  2e-22  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0541555  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0920  rod shape-determining protein MreB  28.57 
 
 
336 aa  107  2e-22  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0375  rod shape-determining protein MreB  27.52 
 
 
336 aa  107  2e-22  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>