142 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_1311 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012918  GM21_2973  peptidase M29 aminopeptidase II  97.55 
 
 		 367 aa  750    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000872397 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1311  peptidase M29 aminopeptidase II  100 
 
 		 367 aa  766    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000144193  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1909  peptidase M29, aminopeptidase II  79.51 
 
 		 368 aa  628  1e-179  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.216085  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1594  peptidase M29, aminopeptidase II  77.05 
 
 		 368 aa  611  9.999999999999999e-175  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000189753  normal  0.134252 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2115  peptidase M29, aminopeptidase II  70.3 
 
 		 367 aa  575  1.0000000000000001e-163  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.517106  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1842  peptidase M29 aminopeptidase II  71.23 
 
 		 366 aa  547  1e-154  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3459  putative aminopeptidase  48.93 
 
 		 371 aa  353  2.9999999999999997e-96  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0624241  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3214  putative aminopeptidase  48.66 
 
 		 371 aa  343  2.9999999999999997e-93  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1544  peptidase M29 aminopeptidase II  48.11 
 
 		 371 aa  342  7e-93  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3636  peptidase M29 aminopeptidase II  47.99 
 
 		 371 aa  338  9.999999999999999e-92  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2842  aminopeptidase  45.97 
 
 		 374 aa  324  2e-87  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.180088  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4795  putative aminopeptidase  46.92 
 
 		 371 aa  322  5e-87  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4820  aminopeptidase, putative  46.92 
 
 		 371 aa  322  7e-87  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4414  aminopeptidase  46.92 
 
 		 371 aa  322  7e-87  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4815  putative aminopeptidase  46.92 
 
 		 371 aa  322  7e-87  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4799  putative aminopeptidase  46.92 
 
 		 371 aa  322  7e-87  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4511  peptidase M29 aminopeptidase II  46.92 
 
 		 371 aa  322  8e-87  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4432  aminopeptidase  46.65 
 
 		 371 aa  320  1.9999999999999998e-86  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4579  aminopeptidase  46.65 
 
 		 371 aa  320  3e-86  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4933  aminopeptidase  46.65 
 
 		 371 aa  320  3e-86  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0443  putative aminopeptidase  46.65 
 
 		 371 aa  318  1e-85  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3346  peptidase M29 aminopeptidase II  46.11 
 
 		 371 aa  316  4e-85  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.736707  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2391  putative aminopeptidase  43.36 
 
 		 370 aa  315  9e-85  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.982861  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1280  aminopeptidase  43.28 
 
 		 369 aa  310  2.9999999999999997e-83  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3002  peptidase M29 aminopeptidase II  43.94 
 
 		 374 aa  304  2.0000000000000002e-81  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0261294 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1168  peptidase M29, aminopeptidase II  38.19 
 
 		 388 aa  268  8e-71  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.712634  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3265  peptidase M29, aminopeptidase II  44.78 
 
 		 304 aa  256  5e-67  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.139393  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_782  aminopeptidase  38.71 
 
 		 369 aa  254  2.0000000000000002e-66  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0911  aminopeptidase protein  38.38 
 
 		 369 aa  252  7e-66  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0175579  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0795  peptidase M29, aminopeptidase II  38.11 
 
 		 389 aa  248  9e-65  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0278  peptidase M29 aminopeptidase II  35.47 
 
 		 367 aa  231  1e-59  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1401  peptidase M29 aminopeptidase II  35.81 
 
 		 367 aa  229  4e-59  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3114  peptidase M29 aminopeptidase II  33.15 
 
 		 367 aa  223  3e-57  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.185719  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06890  aminopeptidase protein  33.15 
 
 		 368 aa  219  3.9999999999999997e-56  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2644  peptidase M29, aminopeptidase II  35.77 
 
 		 366 aa  219  5e-56  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1777  peptidase M29 aminopeptidase II  34.31 
 
 		 380 aa  218  1e-55  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0828  peptidase M29 aminopeptidase II  34.59 
 
 		 365 aa  214  1.9999999999999998e-54  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0855  metalloprotease  33.6 
 
 		 375 aa  213  2.9999999999999995e-54  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0868  metalloprotease  33.51 
 
 		 375 aa  213  3.9999999999999995e-54  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0549814  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2712  peptidase M29 aminopeptidase II  34.42 
 
 		 366 aa  211  2e-53  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2255  peptidase M29 aminopeptidase II  33.98 
 
 		 388 aa  210  4e-53  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0115  peptidase M29 aminopeptidase II  34.08 
 
 		 357 aa  208  1e-52  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0432  peptidase M29 aminopeptidase II  33.98 
 
 		 360 aa  206  7e-52  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2014  peptidase M29 aminopeptidase II  33.8 
 
 		 359 aa  204  1e-51  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2642  peptidase M29 aminopeptidase II  32.07 
 
 		 366 aa  202  6e-51  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0109  peptidase M29 aminopeptidase II  33.89 
 
 		 357 aa  202  7e-51  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00036007  normal  0.110934 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0741  peptidase M29 aminopeptidase II  33.61 
 
 		 363 aa  197  3e-49  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2666  peptidase M29 aminopeptidase II  33.15 
 
 		 373 aa  189  5.999999999999999e-47  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1834  peptidase M29 aminopeptidase II  32.51 
 
 		 366 aa  189  9e-47  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1076  peptidase M29 aminopeptidase II  33.33 
 
 		 352 aa  187  2e-46  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.16768  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1489  peptidase M29, aminopeptidase II  34.16 
 
 		 370 aa  187  4e-46  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.364607  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0257  peptidase M29 aminopeptidase II  32.13 
 
 		 359 aa  185  1.0000000000000001e-45  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.0129156 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3312  leucyl aminopeptidase (aminopeptidase T)-like  31.07 
 
 		 371 aa  140  4.999999999999999e-32  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.390308  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1192  peptidase M29 aminopeptidase II  25.88 
 
 		 399 aa  118  1.9999999999999998e-25  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.318194 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2795  peptidase M29 aminopeptidase II  25.75 
 
 		 399 aa  108  2e-22  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3021  aminopeptidase T  27.2 
 
 		 418 aa  104  2e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0276  peptidase M29 aminopeptidase II  25.47 
 
 		 406 aa  104  3e-21  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1510  peptidase M29 aminopeptidase II  25.12 
 
 		 409 aa  102  1e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.415372  normal  0.272992 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2013  peptidase M29 aminopeptidase II  26.81 
 
 		 410 aa  101  2e-20  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0975831  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7164  peptidase M29, aminopeptidase II  27.68 
 
 		 418 aa  100  5e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0763  peptidase M29 aminopeptidase II  26.46 
 
 		 417 aa  99.4  9e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0308  peptidase M29 aminopeptidase II  27.53 
 
 		 409 aa  97.8  2e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4551  peptidase M29 aminopeptidase II  26.72 
 
 		 417 aa  97.8  3e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.123351  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3504  peptidase M29 aminopeptidase II  26.37 
 
 		 418 aa  97.4  3e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0137  aminopeptidase  27.78 
 
 		 416 aa  97.4  3e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1971  peptidase M29 aminopeptidase II  25.71 
 
 		 410 aa  96.3  8e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.557384  normal  0.0591369 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2337  aminopeptidase  25.25 
 
 		 409 aa  95.9  1e-18  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.00000192416  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1649  peptidase M29 aminopeptidase II  27.58 
 
 		 410 aa  95.1  2e-18  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2758  M29 family peptidase  25.07 
 
 		 403 aa  95.1  2e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0309  peptidase M29 aminopeptidase II  26.96 
 
 		 409 aa  94.4  3e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0376  aminopeptidase AmpS  26.81 
 
 		 409 aa  94.4  3e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4944  aminopeptidase AmpS  26.81 
 
 		 409 aa  94.4  3e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3472  peptidase M29 aminopeptidase II  26.27 
 
 		 419 aa  93.2  6e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.748808 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2586  peptidase M29, aminopeptidase II  27.05 
 
 		 418 aa  93.2  7e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.424521  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0297  aminopeptidase; peptidase_M29  26.88 
 
 		 409 aa  92.4  1e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0301  aminopeptidase; peptidase_M29  26.44 
 
 		 409 aa  92  1e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2184  peptidase M29, aminopeptidase II  26.49 
 
 		 423 aa  92  1e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.774807 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0403  aminopeptidase AmpS  26.63 
 
 		 409 aa  92  1e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0594317  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0361  aminopeptidase AmpS  26.88 
 
 		 409 aa  92.4  1e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0359  aminopeptidase AmpS  26.63 
 
 		 409 aa  91.3  2e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4287  peptidase M29 aminopeptidase II  25.52 
 
 		 417 aa  91.3  2e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.696166 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3780  peptidase M29 aminopeptidase II  26.14 
 
 		 419 aa  91.3  2e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.410643 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1417  aminopeptidase family protein  26.69 
 
 		 413 aa  90.9  3e-17  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0314  aminopeptidase AmpS  26.63 
 
 		 409 aa  90.9  3e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2148  aminopeptidase PepS  27.07 
 
 		 417 aa  89.4  8e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0329  aminopeptidase AmpS  26.39 
 
 		 409 aa  89.4  1e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2984  peptidase M29 aminopeptidase II  24.75 
 
 		 413 aa  88.2  2e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0078  peptidase M29 aminopeptidase II  25.62 
 
 		 413 aa  88.6  2e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3670  peptidase M29 aminopeptidase II  25.74 
 
 		 419 aa  87.4  4e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.875805 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1965  aminopeptidase  23.77 
 
 		 411 aa  87  5e-16  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1618  peptidase M29 aminopeptidase II  25.79 
 
 		 405 aa  87  5e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0907783  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2212  peptidase M29, aminopeptidase II  26.2 
 
 		 401 aa  86.7  6e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5302  peptidase M29 aminopeptidase II  26.92 
 
 		 418 aa  86.7  6e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0490677  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0622  peptidase M29 aminopeptidase II  43.8 
 
 		 415 aa  86.3  8e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.141981 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3109  peptidase M29 aminopeptidase II  31.67 
 
 		 420 aa  85.5  0.000000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.211466  normal  0.0979106 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3777  peptidase M29, aminopeptidase II  24.22 
 
 		 418 aa  84.7  0.000000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2253  aminopeptidase  23.33 
 
 		 411 aa  84  0.000000000000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.06051  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1887  aminopeptidase 2  22.9 
 
 		 409 aa  83.6  0.000000000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.302559  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3460  aminopeptidase 2  24.56 
 
 		 423 aa  83.6  0.000000000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.044996  hitchhiker  8.080459999999999e-21 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1832  peptidase M29 aminopeptidase II  22.87 
 
 		 411 aa  82.4  0.00000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>