More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_1271 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_1271  trigger factor  100 
 
 		 435 aa  874    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.254971  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3012  trigger factor  95.17 
 
 		 435 aa  837    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1914  trigger factor  61.52 
 
 		 433 aa  543  1e-153  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00300614  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1874  trigger factor  56.45 
 
 		 433 aa  497  1e-139  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00213864  hitchhiker  0.00627328 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1793  trigger factor  55.45 
 
 		 431 aa  475  1e-133  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.25642  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1184  trigger factor  42.26 
 
 		 437 aa  367  1e-100  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0453455  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1929  trigger factor  42.07 
 
 		 440 aa  356  5e-97  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000216068  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1690  trigger factor  42.36 
 
 		 439 aa  328  1.0000000000000001e-88  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000675856  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14950  trigger factor  39.45 
 
 		 429 aa  271  2e-71  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000821588  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0864  trigger factor  37.96 
 
 		 428 aa  271  2e-71  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4318  trigger factor  38.55 
 
 		 425 aa  262  1e-68  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.694533  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3436  trigger factor  34.58 
 
 		 429 aa  259  4e-68  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3354  trigger factor  35.43 
 
 		 429 aa  259  4e-68  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3500  trigger factor  34.58 
 
 		 429 aa  260  4e-68  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1101  trigger factor  36.96 
 
 		 446 aa  258  1e-67  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.355325 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3643  trigger factor  34.17 
 
 		 442 aa  256  6e-67  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000676288  normal  0.562655 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0572  trigger factor  33.64 
 
 		 435 aa  255  8e-67  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.19365 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4609  trigger factor  37.83 
 
 		 425 aa  254  2.0000000000000002e-66  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000116057  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2588  trigger factor  37.5 
 
 		 428 aa  254  2.0000000000000002e-66  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000707375  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4564  trigger factor  37.83 
 
 		 425 aa  254  3e-66  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.769811  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3187  trigger factor  36.78 
 
 		 427 aa  254  3e-66  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4370  trigger factor  37.83 
 
 		 425 aa  253  4.0000000000000004e-66  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00100486  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4206  trigger factor  37.83 
 
 		 425 aa  253  4.0000000000000004e-66  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0389445  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4217  trigger factor  37.83 
 
 		 425 aa  253  4.0000000000000004e-66  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000155995  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4560  trigger factor  37.83 
 
 		 425 aa  253  4.0000000000000004e-66  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4705  trigger factor  37.83 
 
 		 425 aa  253  4.0000000000000004e-66  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0400876  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0643  trigger factor  38.07 
 
 		 425 aa  253  5.000000000000001e-66  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.143322  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4591  trigger factor  38.07 
 
 		 425 aa  253  5.000000000000001e-66  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0423813  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1386  trigger factor  41.9 
 
 		 428 aa  253  6e-66  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00824823  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1513  trigger factor  34.18 
 
 		 433 aa  252  1e-65  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000677902  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0652  trigger factor  34.75 
 
 		 436 aa  251  1e-65  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000093301  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1648  trigger factor  41.9 
 
 		 428 aa  251  2e-65  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.56288  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3422  trigger factor  34.58 
 
 		 430 aa  250  3e-65  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.375201  normal  0.212187 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2692  trigger factor  34.42 
 
 		 443 aa  249  5e-65  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000538517  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1846  trigger factor  35.17 
 
 		 435 aa  246  4e-64  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.00000327269  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1239  trigger factor  33.41 
 
 		 433 aa  246  4.9999999999999997e-64  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.00475597  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2563  trigger factor  35.97 
 
 		 435 aa  245  9e-64  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000372878  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1176  trigger factor  34.94 
 
 		 436 aa  243  3.9999999999999997e-63  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1657  trigger factor  34.33 
 
 		 438 aa  243  5e-63  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.186849  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3093  trigger factor  33.8 
 
 		 434 aa  242  7e-63  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000353037  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3055  trigger factor  33.8 
 
 		 434 aa  242  7e-63  Yersinia pestis Angola  Bacteria  unclonable  0.000000000166473  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3235  trigger factor  33.8 
 
 		 434 aa  242  7e-63  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.00052643  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1094  trigger factor  33.57 
 
 		 434 aa  240  4e-62  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.00000123079  hitchhiker  0.00000434188 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3235  trigger factor  33.87 
 
 		 512 aa  240  4e-62  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.112931  normal  0.882786 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0938  trigger factor  31.63 
 
 		 436 aa  239  5e-62  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.401032  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1767  trigger factor  34.87 
 
 		 433 aa  239  5.999999999999999e-62  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.013878  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1733  trigger factor  34.87 
 
 		 433 aa  239  5.999999999999999e-62  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0000517183  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1841  trigger factor  32.71 
 
 		 434 aa  238  1e-61  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00619817  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2509  trigger factor  33.8 
 
 		 434 aa  238  1e-61  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000731467  normal  0.870147 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1522  trigger factor  36.95 
 
 		 431 aa  237  2e-61  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  decreased coverage  0.00548401  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0527  trigger factor  34.65 
 
 		 446 aa  237  3e-61  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000228546  normal  0.800279 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2047  trigger factor  31.96 
 
 		 448 aa  236  4e-61  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.109899  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3356  trigger factor  33.79 
 
 		 435 aa  237  4e-61  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.185732  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4984  trigger factor  32.88 
 
 		 448 aa  236  5.0000000000000005e-61  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.555193 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1167  trigger factor  34.34 
 
 		 449 aa  236  5.0000000000000005e-61  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  0.0000000000324107  unclonable  1.0795e-27 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1549  trigger factor  34.56 
 
 		 463 aa  235  1.0000000000000001e-60  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1223  trigger factor  34.03 
 
 		 434 aa  235  1.0000000000000001e-60  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000148222  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01416  trigger factor  33.03 
 
 		 435 aa  234  2.0000000000000002e-60  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2682  trigger factor  32.63 
 
 		 434 aa  234  2.0000000000000002e-60  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000000115435  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2739  trigger factor  35.02 
 
 		 428 aa  234  3e-60  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.18941  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0903  trigger factor  33.33 
 
 		 432 aa  233  4.0000000000000004e-60  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000144682  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3069  trigger factor  33.33 
 
 		 434 aa  233  4.0000000000000004e-60  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0128477  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2049  trigger factor  31.93 
 
 		 436 aa  233  4.0000000000000004e-60  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.431317  normal  0.217945 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1607  trigger factor  32.87 
 
 		 444 aa  233  5e-60  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000000266404  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2662  trigger factor  33.1 
 
 		 434 aa  233  6e-60  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000000102256  normal  0.690021 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0472  trigger factor  33.1 
 
 		 432 aa  233  7.000000000000001e-60  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.00000000000231464  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0376  trigger factor  34.65 
 
 		 428 aa  232  8.000000000000001e-60  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.119844  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00387  trigger factor  33.1 
 
 		 432 aa  232  9e-60  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000419065  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3173  trigger factor  33.1 
 
 		 432 aa  232  9e-60  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  0.00000000000000698649  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0479  trigger factor  33.1 
 
 		 432 aa  232  9e-60  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.00000000713029  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0513  trigger factor  33.1 
 
 		 432 aa  232  9e-60  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  2.68965e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3196  trigger factor  33.1 
 
 		 432 aa  232  9e-60  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000193083  hitchhiker  0.000427763 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00391  hypothetical protein  33.1 
 
 		 432 aa  232  9e-60  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000262738  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0522  trigger factor  33.1 
 
 		 432 aa  232  9e-60  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.0000000233962  normal  0.478364 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1603  trigger factor  32.87 
 
 		 434 aa  232  1e-59  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000000736756  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1626  trigger factor  32.87 
 
 		 434 aa  232  1e-59  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000959254  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2751  trigger factor  32.87 
 
 		 434 aa  232  1e-59  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000000172139  normal  0.125648 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1592  trigger factor  32.87 
 
 		 434 aa  232  1e-59  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000000981502  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3137  trigger factor  32.12 
 
 		 436 aa  231  2e-59  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.00000644844  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2496  trigger factor  32.87 
 
 		 434 aa  231  2e-59  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000377099  normal  0.020755 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2564  trigger factor  32.87 
 
 		 434 aa  231  2e-59  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000061517  normal  0.0625081 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4378  trigger factor  35.19 
 
 		 426 aa  231  2e-59  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000799754  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3114  trigger factor  33.1 
 
 		 434 aa  230  4e-59  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00000617295  decreased coverage  0.000000421874 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0359  trigger factor  32.87 
 
 		 432 aa  230  5e-59  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  0.0000000000000325154  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004045  cell division trigger factor  31.87 
 
 		 435 aa  229  6e-59  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000395206  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3727  trigger factor  32.4 
 
 		 436 aa  229  7e-59  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.267155  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1793  trigger factor  32.63 
 
 		 434 aa  229  8e-59  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0550  trigger factor  32.63 
 
 		 432 aa  228  2e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.000374305  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0105  trigger factor  34.18 
 
 		 427 aa  228  2e-58  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.00110725  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0496  trigger factor  32.63 
 
 		 432 aa  228  2e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.000142859  hitchhiker  0.000578508 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2562  trigger factor  32.13 
 
 		 452 aa  228  2e-58  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.435247 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2496  trigger factor  32.17 
 
 		 434 aa  228  2e-58  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000000460382  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0550  trigger factor  34.64 
 
 		 427 aa  228  2e-58  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000250017  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1489  trigger factor  32.63 
 
 		 434 aa  228  2e-58  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.0000000061134  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0506  trigger factor  32.63 
 
 		 432 aa  227  3e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  unclonable  0.00000626608  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0489  trigger factor  32.63 
 
 		 432 aa  227  3e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.000095414  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0487  trigger factor  32.63 
 
 		 432 aa  227  3e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.000000000182354  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0307  trigger factor  32.56 
 
 		 445 aa  227  3e-58  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000121023  normal  0.638239 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1047  trigger factor  32.79 
 
 		 434 aa  226  9e-58  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000149025  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3786  trigger factor  31.59 
 
 		 435 aa  225  1e-57  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.363592  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>