More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_1263 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011146  Gbem_1263  protein of unknown function UPF0079  100 
 
 
153 aa  306  5e-83  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00204178  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3020  protein of unknown function UPF0079  96.08 
 
 
153 aa  298  2e-80  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2319  hypothetical protein  59.21 
 
 
162 aa  196  1.0000000000000001e-49  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000629849  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1881  hypothetical protein  56.58 
 
 
160 aa  177  4.999999999999999e-44  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000937898  hitchhiker  0.0000223198 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1800  hypothetical protein  54.67 
 
 
161 aa  157  5e-38  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.009423  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2261  hypothetical protein  51.68 
 
 
164 aa  149  1e-35  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000158801  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2888  hypothetical protein  48.05 
 
 
161 aa  145  2.0000000000000003e-34  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000829466  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1005  hypothetical protein  47.97 
 
 
160 aa  139  9.999999999999999e-33  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000601093  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0488  hypothetical protein  48.3 
 
 
153 aa  138  3e-32  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.381265  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2519  protein of unknown function UPF0079  50 
 
 
159 aa  137  3.9999999999999997e-32  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.571842  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1097  protein of unknown function UPF0079  51.7 
 
 
152 aa  137  4.999999999999999e-32  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2530  protein of unknown function UPF0079  45.95 
 
 
176 aa  132  1.9999999999999998e-30  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000117314  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2016  hypothetical protein  47.65 
 
 
158 aa  132  1.9999999999999998e-30  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2452  protein of unknown function UPF0079  48.32 
 
 
183 aa  128  2.0000000000000002e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3739  protein of unknown function UPF0079  53.97 
 
 
159 aa  128  3e-29  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.124017  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2160  hypothetical protein  47.62 
 
 
155 aa  128  3e-29  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000258956 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01950  conserved hypothetical nucleotide-binding protein TIGR00150  42.67 
 
 
158 aa  127  8.000000000000001e-29  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19780  conserved hypothetical nucleotide-binding protein  51.22 
 
 
152 aa  125  1.0000000000000001e-28  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0805781  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0236  hypothetical protein  51.97 
 
 
157 aa  126  1.0000000000000001e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000000721135  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0799  protein of unknown function UPF0079  44.8 
 
 
150 aa  125  2.0000000000000002e-28  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0604779  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0289  conserved hypothetical protein TIGR00150  52.76 
 
 
157 aa  125  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.023351  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0399  protein of unknown function UPF0079  46.1 
 
 
160 aa  124  3e-28  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0207503 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0216  protein of unknown function UPF0079  51.64 
 
 
152 aa  124  4.0000000000000003e-28  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1503  hypothetical protein  52.46 
 
 
188 aa  124  4.0000000000000003e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.170985  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0244  hypothetical protein  46.98 
 
 
157 aa  124  6e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0230  hypothetical protein  51.18 
 
 
157 aa  124  6e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2855  protein of unknown function UPF0079  48.97 
 
 
164 aa  124  6e-28  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.314957 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0258  hypothetical protein  46.98 
 
 
157 aa  124  6e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0284  conserved hypothetical protein TIGR00150  51.18 
 
 
157 aa  124  6e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0243  hypothetical protein  46.36 
 
 
157 aa  123  7e-28  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5035  hypothetical protein  51.97 
 
 
157 aa  123  8.000000000000001e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2364  protein of unknown function UPF0079  51.64 
 
 
183 aa  123  8.000000000000001e-28  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.118731  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0279  hypothetical protein  51.18 
 
 
157 aa  123  9e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0308  conserved hypothetical protein TIGR00150  51.18 
 
 
157 aa  123  9e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0232  P-loop hydrolase  51.18 
 
 
157 aa  122  1e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0399  hypothetical protein  43.14 
 
 
152 aa  123  1e-27  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0100312  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2422  hypothetical protein  42.47 
 
 
154 aa  121  4e-27  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2132  hypothetical protein  42.47 
 
 
154 aa  121  4e-27  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1635  protein of unknown function UPF0079  43.92 
 
 
173 aa  118  3e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1243  protein of unknown function UPF0079  40.38 
 
 
184 aa  118  3e-26  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1776  hypothetical protein  41.29 
 
 
161 aa  117  3.9999999999999996e-26  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00431445  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0713  hypothetical protein  43.05 
 
 
187 aa  117  4.9999999999999996e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.273172  normal  0.667416 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4357  hypothetical protein  41.72 
 
 
189 aa  116  9e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.282412 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2330  hypothetical protein  51.33 
 
 
182 aa  116  9.999999999999999e-26  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0376  hypothetical protein  38.1 
 
 
147 aa  115  1.9999999999999998e-25  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0366  hypothetical protein  40.69 
 
 
169 aa  115  3e-25  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0147  protein of unknown function UPF0079  45.7 
 
 
160 aa  114  5e-25  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0643293  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0444  protein of unknown function UPF0079  43.18 
 
 
157 aa  113  1.0000000000000001e-24  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3245  hypothetical protein  42.11 
 
 
504 aa  112  2.0000000000000002e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.479121  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2169  hypothetical protein  43.36 
 
 
167 aa  111  4.0000000000000004e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.884354  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0617  protein of unknown function UPF0079  41.54 
 
 
150 aa  109  1.0000000000000001e-23  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.202797  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0375  hypothetical protein  38.36 
 
 
163 aa  109  2.0000000000000002e-23  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000128461  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_339  hypothetical protein  36.99 
 
 
163 aa  108  2.0000000000000002e-23  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00581672  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4289  protein of unknown function UPF0079  39.86 
 
 
505 aa  108  3e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0623599  normal  0.680884 
 
 
-
 
NC_002936  DET0396  hypothetical protein  38.36 
 
 
163 aa  108  3e-23  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0965  protein of unknown function UPF0079  38.51 
 
 
156 aa  108  3e-23  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1869  hypothetical protein  41.06 
 
 
158 aa  108  3e-23  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000565626  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4975  hypothetical protein  38.1 
 
 
171 aa  105  2e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0346  hypothetical protein  43.44 
 
 
143 aa  105  3e-22  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.101542  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0100  protein of unknown function UPF0079  39.69 
 
 
151 aa  103  1e-21  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0009157  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1469  hypothetical protein  47.75 
 
 
143 aa  102  2e-21  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0774  hypothetical protein  42.62 
 
 
164 aa  101  3e-21  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.0000567369  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11800  conserved hypothetical nucleotide-binding protein  42.52 
 
 
163 aa  102  3e-21  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0483  protein of unknown function UPF0079  40.91 
 
 
149 aa  100  7e-21  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.790809  normal  0.0607901 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2842  hypothetical protein  42.28 
 
 
158 aa  100  8e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.523389 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0090  protein of unknown function UPF0079  39.06 
 
 
145 aa  100  9e-21  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.184225  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3050  hypothetical protein  40.14 
 
 
153 aa  99.8  1e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.664938  normal  0.025275 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3962  protein of unknown function UPF0079  39.16 
 
 
503 aa  99.8  1e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0122  protein of unknown function UPF0079  40 
 
 
158 aa  99  2e-20  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.000147481  hitchhiker  0.00840651 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0487  hypothetical protein  45.69 
 
 
148 aa  99.4  2e-20  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2671  RNA binding S1  40.77 
 
 
157 aa  98.2  3e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.543969  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0408  hypothetical protein  39.1 
 
 
157 aa  97.4  6e-20  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3029  hypothetical protein  37.93 
 
 
153 aa  97.4  7e-20  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.63375  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4849  hypothetical protein  40.91 
 
 
150 aa  95.9  2e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.366742  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1522  hypothetical protein  42.76 
 
 
161 aa  95.9  2e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.229097  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1531  ATPase or kinase  36.55 
 
 
149 aa  95.9  2e-19  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6124  protein of unknown function UPF0079  44.44 
 
 
161 aa  95.1  3e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0433891  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1390  protein of unknown function UPF0079  39.16 
 
 
167 aa  95.1  3e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.004631  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0046  protein of unknown function UPF0079  38 
 
 
174 aa  94.7  4e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0562  hypothetical protein  36.91 
 
 
157 aa  94.7  4e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000200674  normal  0.209641 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0134  protein of unknown function UPF0079  40 
 
 
146 aa  94.7  4e-19  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00098  hypothetical protein  38.52 
 
 
154 aa  94.4  5e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0793  hypothetical protein  35.95 
 
 
152 aa  94  7e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.949281  hitchhiker  0.00232347 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1664  ATPase or kinase  37.91 
 
 
152 aa  93.6  9e-19  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2955  hypothetical protein  40.41 
 
 
161 aa  92.8  1e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.263755  normal  0.0249448 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2666  hypothetical protein  38.58 
 
 
143 aa  93.2  1e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0641125  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2636  hypothetical protein  41.26 
 
 
153 aa  92.8  2e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00016395  hitchhiker  0.000000000107728 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0174  hypothetical protein  42.07 
 
 
169 aa  92  2e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  hitchhiker  0.00309519  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2754  hypothetical protein  38.69 
 
 
188 aa  91.7  3e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000152007  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0118  hypothetical protein  40.44 
 
 
152 aa  91.3  4e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.927124 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002255  ATPase YjeE  38.52 
 
 
154 aa  91.7  4e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000336436  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0611  hypothetical protein  38.78 
 
 
153 aa  90.9  5e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.400731 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0095  hypothetical protein  38.3 
 
 
146 aa  90.9  6e-18  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.442138  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0369  protein of unknown function UPF0079  40.14 
 
 
161 aa  90.9  6e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0568  hypothetical protein  38.17 
 
 
143 aa  90.5  7e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2531  hypothetical protein  40.31 
 
 
162 aa  90.5  7e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0051  hypothetical protein  47.66 
 
 
502 aa  89.7  1e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1784  protein of unknown function UPF0079  40.46 
 
 
176 aa  90.1  1e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0485483  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0182  protein of unknown function UPF0079  34.13 
 
 
148 aa  90.1  1e-17  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0313363  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0427  putative ATPase  37.32 
 
 
156 aa  89.4  2e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000000368421  hitchhiker  0.000000532779 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>