More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_1257 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_1257  Polyprenyl synthetase  100 
 
 		 295 aa  600  1.0000000000000001e-171  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00136441  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3026  Polyprenyl synthetase  96.27 
 
 		 295 aa  576  1.0000000000000001e-163  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2176  polyprenyl synthetase  73.74 
 
 		 297 aa  426  1e-118  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000107352  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1765  geranyltranstransferase  72.39 
 
 		 297 aa  416  9.999999999999999e-116  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0316781  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1935  farnesyl-diphosphate synthase  74.07 
 
 		 297 aa  417  9.999999999999999e-116  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2404  polyprenyl synthetase  70.61 
 
 		 297 aa  398  9.999999999999999e-111  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0620494  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2183  Polyprenyl synthetase  69.7 
 
 		 297 aa  397  1e-109  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000465843  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1668  geranyltranstransferase (farnesyldiphosphate synthase)  67.46 
 
 		 296 aa  365  1e-100  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000016201  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1076  polyprenyl synthetase  56.66 
 
 		 294 aa  337  1.9999999999999998e-91  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00179719  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0608  Polyprenyl synthetase  57 
 
 		 307 aa  336  2.9999999999999997e-91  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.887352 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1417  polyprenyl synthetase  56.95 
 
 		 296 aa  332  4e-90  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.430266  normal  0.288086 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0681  polyprenyl synthetase  56.66 
 
 		 299 aa  326  3e-88  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15151  polyprenyl synthetase  57 
 
 		 299 aa  326  3e-88  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.423714  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1081  polyprenyl synthetase  56.16 
 
 		 300 aa  324  8.000000000000001e-88  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.168923  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11761  polyprenyl synthetase  55.82 
 
 		 299 aa  324  1e-87  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11601  polyprenyl synthetase  55.82 
 
 		 300 aa  322  3e-87  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0152  Polyprenyl synthetase  54.92 
 
 		 309 aa  322  5e-87  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00117274  hitchhiker  0.00332618 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11751  polyprenyl synthetase  55.48 
 
 		 300 aa  322  5e-87  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0156  Polyprenyl synthetase  54.92 
 
 		 309 aa  322  5e-87  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11191  polyprenyl synthetase  54.61 
 
 		 300 aa  318  7e-86  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.646183 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1513  farnesyl-diphosphate synthase  54.95 
 
 		 297 aa  318  7.999999999999999e-86  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_17563  predicted protein  55.56 
 
 		 312 aa  317  1e-85  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0164113  normal  0.0513256 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0776  farnesyl-diphosphate synthase  56.46 
 
 		 301 aa  316  4e-85  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.10408 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1049  farnesyl-diphosphate synthase  55.97 
 
 		 294 aa  315  6e-85  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09331  polyprenyl synthetase  55.29 
 
 		 306 aa  313  2.9999999999999996e-84  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.47365 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0972  Polyprenyl synthetase  53.58 
 
 		 320 aa  312  4.999999999999999e-84  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.23311  normal  0.31243 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1697  farnesyl-diphosphate synthase  52.7 
 
 		 297 aa  311  1e-83  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.110898 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4173  farnesyl-diphosphate synthase  51.86 
 
 		 316 aa  302  5.000000000000001e-81  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.16632  normal  0.522672 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2704  farnesyl-diphosphate synthase  51.86 
 
 		 309 aa  301  7.000000000000001e-81  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00000153186  normal  0.671867 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2586  Polyprenyl synthetase  54.24 
 
 		 296 aa  293  2e-78  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0968269  normal  0.362813 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1926  farnesyl-diphosphate synthase  56.31 
 
 		 296 aa  293  2e-78  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0739  geranylgeranyl pyrophosphate synthase  55.29 
 
 		 296 aa  289  3e-77  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.396283  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1538  polyprenyl synthetase  52.22 
 
 		 294 aa  286  2e-76  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000356422  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0831  farnesyl-diphosphate synthase  51.52 
 
 		 295 aa  286  2.9999999999999996e-76  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000171972  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_19000  farnesyltranstransferase  48.31 
 
 		 337 aa  285  5.999999999999999e-76  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.916261  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0833  farnesyl-diphosphate synthase  52.72 
 
 		 299 aa  283  3.0000000000000004e-75  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0162065  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0945  farnesyl-diphosphate synthase  52.65 
 
 		 306 aa  278  7e-74  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3432  farnesyl-diphosphate synthase  50.68 
 
 		 315 aa  278  9e-74  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1025  polyprenyl synthetase  53.08 
 
 		 295 aa  276  4e-73  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0569  polyprenyl synthetase  51.86 
 
 		 301 aa  274  2.0000000000000002e-72  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0210108  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1264  Polyprenyl synthetase  47.78 
 
 		 297 aa  265  5e-70  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1400  Polyprenyl synthetase  51.67 
 
 		 286 aa  265  8e-70  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0250  Polyprenyl synthetase  51.91 
 
 		 297 aa  265  8.999999999999999e-70  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1663  polyprenyl synthetase  48.32 
 
 		 295 aa  259  4e-68  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.746907  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2618  farnesyl-diphosphate synthase  47.64 
 
 		 305 aa  258  6e-68  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3491  Polyprenyl synthetase  52.2 
 
 		 290 aa  258  8e-68  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000932682  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2320  Polyprenyl synthetase  46.76 
 
 		 297 aa  258  9e-68  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0605  polyprenyl synthetase  54.92 
 
 		 295 aa  257  1e-67  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.158094  normal  0.173751 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1456  farnesyl-diphosphate synthase  51.88 
 
 		 299 aa  255  6e-67  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.292762  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2894  Polyprenyl synthetase  47.86 
 
 		 292 aa  254  1.0000000000000001e-66  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2437  polyprenyl synthetase  52.41 
 
 		 298 aa  253  2.0000000000000002e-66  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0528  polyprenyl synthetase  55.24 
 
 		 295 aa  253  4.0000000000000004e-66  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07880  geranyltranstransferase  54.3 
 
 		 295 aa  253  4.0000000000000004e-66  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.408699  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0562  polyprenyl synthetase  55.24 
 
 		 295 aa  252  4.0000000000000004e-66  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.109586  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20600  geranyltranstransferase  54.3 
 
 		 295 aa  253  4.0000000000000004e-66  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.715859  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3841  farnesyl-diphosphate synthase  54.39 
 
 		 295 aa  252  6e-66  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.599692  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0699  geranyltranstransferase  53.06 
 
 		 295 aa  251  7e-66  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0580  polyprenyl synthetase  55.99 
 
 		 295 aa  251  1e-65  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1788  geranyltranstransferase  45.42 
 
 		 290 aa  251  1e-65  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.188169  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0573  polyprenyl synthetase  55.44 
 
 		 295 aa  250  2e-65  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2755  farnesyl-diphosphate synthase  49.83 
 
 		 299 aa  250  2e-65  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5006  farnesyl-diphosphate synthase  54.2 
 
 		 295 aa  249  5e-65  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2074  geranyltranstransferase  44.72 
 
 		 290 aa  248  6e-65  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00203562  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3221  farnesyl-diphosphate synthase  51.37 
 
 		 295 aa  246  3e-64  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1916  Polyprenyl synthetase  44.3 
 
 		 294 aa  246  4e-64  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0955  Polyprenyl synthetase  52.05 
 
 		 298 aa  245  6e-64  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3212  geranyltranstransferase  46.82 
 
 		 299 aa  245  6.999999999999999e-64  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000111364 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0267  polyprenyl synthetase  43.5 
 
 		 334 aa  244  9.999999999999999e-64  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.879349  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1902  Polyprenyl synthetase  42.66 
 
 		 294 aa  243  1.9999999999999999e-63  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.267224  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1975  geranyltranstransferase  44.71 
 
 		 306 aa  243  1.9999999999999999e-63  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.668358  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1643  Polyprenyl synthetase  44.71 
 
 		 306 aa  243  1.9999999999999999e-63  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000512207 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2441  Polyprenyl synthetase  51.2 
 
 		 318 aa  244  1.9999999999999999e-63  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3649  polyprenyl synthetase  46.62 
 
 		 294 aa  243  3.9999999999999997e-63  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4487  polyprenyl synthetase  46.62 
 
 		 294 aa  243  3.9999999999999997e-63  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3878  polyprenyl synthetase  46.62 
 
 		 294 aa  243  3.9999999999999997e-63  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.235577 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11560  geranyltranstransferase  52.92 
 
 		 295 aa  241  9e-63  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2037  polyprenyl synthetase  46.98 
 
 		 296 aa  241  1e-62  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6782  Polyprenyl synthetase  45.95 
 
 		 293 aa  241  1e-62  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.750259  hitchhiker  0.0000580202 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4251  geranyltranstransferase  48.12 
 
 		 296 aa  240  2e-62  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0195367  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4308  geranyltranstransferase  48.12 
 
 		 296 aa  240  2e-62  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000458101  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4288  geranyltranstransferase  48.45 
 
 		 296 aa  240  2e-62  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.185381  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1719  polyprenyl synthetase  50.85 
 
 		 299 aa  240  2e-62  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.130705  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2828  farnesyl-diphosphate synthase  46.33 
 
 		 293 aa  239  4e-62  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2616  farnesyl-diphosphate synthase  48.98 
 
 		 294 aa  239  4e-62  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0537917  normal  0.394724 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0946  geranyltranstransferase  48.46 
 
 		 296 aa  238  5.999999999999999e-62  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.228897  hitchhiker  0.0000625392 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2871  polyprenyl synthetase  47.8 
 
 		 297 aa  238  5.999999999999999e-62  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.369696  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3060  farnesyl-diphosphate synthase  47.99 
 
 		 297 aa  238  6.999999999999999e-62  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.016258  hitchhiker  0.00000723246 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2212  farnesyl-diphosphate synthase  45.95 
 
 		 294 aa  238  9e-62  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4030  polyprenyl synthetase  48.12 
 
 		 297 aa  238  1e-61  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0332417  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0416  Polyprenyl synthetase  50.34 
 
 		 297 aa  238  1e-61  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3249  polyprenyl synthetase  45.61 
 
 		 294 aa  238  1e-61  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.923814  normal  0.018819 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4821  polyprenyl synthetase  45.61 
 
 		 294 aa  237  2e-61  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.221306  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3775  polyprenyl synthetase  45.61 
 
 		 294 aa  237  2e-61  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0109984  normal  0.0572479 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0235  polyprenyl synthetase  45.15 
 
 		 297 aa  236  3e-61  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06510  farnesyl-diphosphate synthase  46.96 
 
 		 296 aa  236  3e-61  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000111006  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2439  Polyprenyl synthetase  46.1 
 
 		 290 aa  236  4e-61  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.097508  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2393  geranyltranstransferase  45.95 
 
 		 294 aa  235  6e-61  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0843  geranyltranstransferase  45.95 
 
 		 294 aa  235  6e-61  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2535  geranyltranstransferase  45.95 
 
 		 294 aa  235  6e-61  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1705  geranyltranstransferase  45.95 
 
 		 294 aa  235  7e-61  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>