176 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_1239 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU0674  hydroxylamine reductase  80.47 
 
 		 548 aa  911    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.09718  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3228  hydroxylamine reductase  66.18 
 
 		 568 aa  745    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.892851 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0837  hydroxylamine reductase  70.36 
 
 		 550 aa  780    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00540032  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2872  hydroxylamine reductase  69.42 
 
 		 553 aa  785    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.000000295577  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2834  hydroxylamine reductase  80.26 
 
 		 547 aa  920    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000787255  hitchhiker  0.00000000000275149 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0585  hydroxylamine reductase  70.44 
 
 		 533 aa  798    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000760383  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1239  hydroxylamine reductase  100 
 
 		 549 aa  1130    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000262121  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2647  hydroxylamine reductase  70.44 
 
 		 533 aa  798    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.654819  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3446  hydroxylamine reductase  56.93 
 
 		 542 aa  640    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000118604 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3702  hydroxylamine reductase  70.44 
 
 		 533 aa  811    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.456407  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1201  hydroxylamine reductase  71.61 
 
 		 531 aa  794    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3576  hydroxylamine reductase  71.06 
 
 		 531 aa  800    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1600  hydroxylamine reductase  56.31 
 
 		 542 aa  637    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0704  hydroxylamine reductase  58.58 
 
 		 537 aa  641    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.308475 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0213  hydroxylamine reductase  69.89 
 
 		 533 aa  798    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.8548  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0988  hydroxylamine reductase  61.45 
 
 		 539 aa  682    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.160693 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3038  hydroxylamine reductase  97.63 
 
 		 549 aa  1071    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0663  hydroxylamine reductase  65.38 
 
 		 541 aa  742    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.430546  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1364  hydroxylamine reductase  82.12 
 
 		 549 aa  955    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.453221  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3125  hydroxylamine reductase  62.89 
 
 		 551 aa  746    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1168  hydroxylamine reductase  63.25 
 
 		 552 aa  747    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1033  hydroxylamine reductase  66.18 
 
 		 568 aa  740    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1609  hydroxylamine reductase  56.12 
 
 		 542 aa  633  1e-180  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.726092  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2641  hydroxylamine reductase  58.76 
 
 		 537 aa  631  1e-179  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.897837  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2941  hydroxylamine reductase  54.77 
 
 		 565 aa  622  1e-177  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0596  hydroxylamine reductase  57.56 
 
 		 535 aa  623  1e-177  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2386  hydroxylamine reductase  52.84 
 
 		 566 aa  581  1e-164  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00790044  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1173  hydroxylamine reductase  53.42 
 
 		 549 aa  575  1.0000000000000001e-163  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000032867  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1750  hybrid cluster protein  53.9 
 
 		 532 aa  573  1.0000000000000001e-162  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.531638  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3188  hydroxylamine reductase  49.91 
 
 		 544 aa  553  1e-156  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0212462 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0977  hydroxylamine reductase  48.46 
 
 		 555 aa  552  1e-156  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.349617 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0816  hydroxylamine reductase  50.54 
 
 		 545 aa  552  1e-156  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4165  hydroxylamine reductase  48.92 
 
 		 549 aa  550  1e-155  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0974  hydroxylamine reductase  51.61 
 
 		 546 aa  545  1e-154  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00100558  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0845  hydroxylamine reductase  50.18 
 
 		 545 aa  548  1e-154  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.633582  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4539  hydroxylamine reductase  50.09 
 
 		 549 aa  544  1e-153  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1355  hydroxylamine reductase  49.28 
 
 		 557 aa  539  9.999999999999999e-153  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1657  hydroxylamine reductase  49.28 
 
 		 556 aa  540  9.999999999999999e-153  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.922648  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2759  hydroxylamine reductase  49.63 
 
 		 549 aa  536  1e-151  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0406  hybrid cluster protein  49.28 
 
 		 554 aa  533  1e-150  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0957  hydroxylamine reductase  48.83 
 
 		 547 aa  535  1e-150  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18290  hydroxylamine reductase  47.57 
 
 		 555 aa  523  1e-147  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000343984  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1798  hydroxylamine reductase  47.54 
 
 		 557 aa  519  1e-146  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1069  hydroxylamine reductase  48.04 
 
 		 554 aa  517  1.0000000000000001e-145  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1165  hydroxylamine reductase  47.05 
 
 		 552 aa  515  1.0000000000000001e-145  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1121  hydroxylamine reductase  48.92 
 
 		 555 aa  512  1e-144  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.800783  normal  0.249924 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1363  hydroxylamine reductase  47.05 
 
 		 554 aa  508  1e-143  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0981  hydroxylamine reductase  47.56 
 
 		 557 aa  511  1e-143  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00091795 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2190  hydroxylamine reductase  48.49 
 
 		 526 aa  508  1e-143  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.317395  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2832  hydroxylamine reductase  46.86 
 
 		 554 aa  508  9.999999999999999e-143  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.310206  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2914  hydroxylamine reductase  46.59 
 
 		 554 aa  506  9.999999999999999e-143  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3609  hydroxylamine reductase  47.39 
 
 		 552 aa  507  9.999999999999999e-143  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.918432  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3011  hydroxylamine reductase  46.59 
 
 		 554 aa  507  9.999999999999999e-143  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0036  hydroxylamine reductase  46.28 
 
 		 542 aa  508  9.999999999999999e-143  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1174  hydroxylamine reductase  47.85 
 
 		 554 aa  508  9.999999999999999e-143  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0529148  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0754  hydroxylamine reductase  46.84 
 
 		 552 aa  506  9.999999999999999e-143  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1293  hydroxylamine reductase  47.41 
 
 		 554 aa  506  9.999999999999999e-143  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.86267  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1260  hydroxylamine reductase  47.23 
 
 		 552 aa  508  9.999999999999999e-143  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.181543  hitchhiker  0.000316349 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0895  hydroxylamine reductase  46.94 
 
 		 554 aa  502  1e-141  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.62617 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3097  hydroxylamine reductase  47.04 
 
 		 554 aa  501  1e-141  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0213297  normal  0.133055 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_28240  hydroxylamine reductase  49.19 
 
 		 525 aa  502  1e-141  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.230727 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4621  hydroxylamine reductase  48.56 
 
 		 559 aa  504  1e-141  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0716541 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1829  hydroxylamine reductase  47.65 
 
 		 545 aa  504  1e-141  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1163  hydroxylamine reductase  45.04 
 
 		 543 aa  503  1e-141  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0742  hydroxylamine reductase  48.92 
 
 		 531 aa  498  1e-140  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.483638  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2909  hydroxylamine reductase  46.11 
 
 		 547 aa  500  1e-140  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1120  hydroxylamine reductase  45.72 
 
 		 568 aa  501  1e-140  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.170872  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2587  hydroxylamine reductase  46.03 
 
 		 547 aa  500  1e-140  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000431874  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4090  hydroxylamine reductase  48.43 
 
 		 555 aa  501  1e-140  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1216  hydroxylamine reductase  46.68 
 
 		 554 aa  499  1e-140  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.453579  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1260  hydroxylamine reductase  46.87 
 
 		 554 aa  501  1e-140  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1055  hydroxylamine reductase  46.61 
 
 		 554 aa  499  1e-140  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4555  hydroxylamine reductase  48.43 
 
 		 555 aa  501  1e-140  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00753041 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6194  hydroxylamine reductase  47.21 
 
 		 553 aa  497  1e-139  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.994183  normal  0.0395415 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0164  hydroxylamine reductase  45.39 
 
 		 546 aa  496  1e-139  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.930451  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0141  hybrid cluster protein  47.58 
 
 		 553 aa  496  1e-139  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.409118 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0137  hydroxylamine reductase  58.52 
 
 		 427 aa  494  9.999999999999999e-139  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000271526  normal  0.86078 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1424  hydroxylamine reductase  48.29 
 
 		 522 aa  493  9.999999999999999e-139  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.013462  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0970  hydroxylamine reductase  46.62 
 
 		 591 aa  493  9.999999999999999e-139  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.164641  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1053  hydroxylamine reductase  44.46 
 
 		 539 aa  491  1e-137  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1390  hydroxylamine reductase  44.8 
 
 		 550 aa  486  1e-136  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1054  hydroxylamine reductase  45.14 
 
 		 550 aa  485  1e-136  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003799  hydroxylamine reductase  45.8 
 
 		 553 aa  487  1e-136  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00878  hydroxylamine reductase  44.98 
 
 		 550 aa  482  1e-135  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2769  hybrid cluster protein  44.98 
 
 		 550 aa  482  1e-135  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00884  hypothetical protein  44.98 
 
 		 550 aa  482  1e-135  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0937  hydroxylamine reductase  45.14 
 
 		 550 aa  485  1e-135  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.697919  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1004  hydroxylamine reductase  45.14 
 
 		 550 aa  485  1e-135  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.97662  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1034  hydroxylamine reductase  44.98 
 
 		 550 aa  482  1e-135  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2458  hydroxylamine reductase  45.16 
 
 		 550 aa  482  1e-135  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0972  hydroxylamine reductase  45.14 
 
 		 550 aa  485  1e-135  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0149  hydroxylamine reductase  43.32 
 
 		 542 aa  483  1e-135  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00268758  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3948  hybrid cluster protein  43.86 
 
 		 551 aa  483  1e-135  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0977  hydroxylamine reductase  44.98 
 
 		 550 aa  482  1e-135  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0946  hydroxylamine reductase  44.98 
 
 		 550 aa  482  1e-135  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.869117  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1035  hydroxylamine reductase  45.14 
 
 		 550 aa  485  1e-135  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1905  hydroxylamine reductase  55.82 
 
 		 427 aa  484  1e-135  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00412747  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2723  hydroxylamine reductase  44.98 
 
 		 550 aa  482  1e-135  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.18873  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0902  hydroxylamine reductase  44.98 
 
 		 550 aa  483  1e-135  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.800969 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2371  hydroxylamine reductase  44.93 
 
 		 550 aa  479  1e-134  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>