More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_1231 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012918  GM21_3046  heavy metal translocating P-type ATPase  94.42 
 
 		 806 aa  1513    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1231  heavy metal translocating P-type ATPase  100 
 
 		 806 aa  1625    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1576  heavy metal translocating P-type ATPase  42.15 
 
 		 807 aa  603  1.0000000000000001e-171  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1177  copper-translocating P-type ATPase  45.01 
 
 		 807 aa  600  1e-170  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1813  heavy metal translocating P-type ATPase  42.75 
 
 		 809 aa  598  1e-169  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1237  heavy metal translocating P-type ATPase  44.4 
 
 		 807 aa  582  1e-164  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1339  heavy metal translocating P-type ATPase  44.28 
 
 		 807 aa  579  1e-164  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.527377  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2081  heavy metal translocating P-type ATPase  39.75 
 
 		 808 aa  567  1e-160  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0785584  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2360  heavy metal translocating P-type ATPase  40.2 
 
 		 818 aa  556  1e-157  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1369  heavy metal translocating P-type ATPase  38.56 
 
 		 814 aa  553  1e-156  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0285  heavy metal translocating P-type ATPase  43.17 
 
 		 793 aa  506  9.999999999999999e-143  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1113  heavy metal translocating P-type ATPase  41.38 
 
 		 794 aa  501  1e-140  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.570312  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3223  heavy metal translocating P-type ATPase  41 
 
 		 814 aa  496  1e-139  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1116  copper-translocating P-type ATPase  35.05 
 
 		 793 aa  490  1e-137  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1689  copper-translocating P-type ATPase  38.26 
 
 		 798 aa  489  1e-137  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1990  heavy metal translocating P-type ATPase  34.23 
 
 		 807 aa  486  1e-136  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1796  cation transporter E1-E2 family ATPase  35.68 
 
 		 795 aa  486  1e-136  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.135451 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2359  cation transporter E1-E2 family ATPase  34.95 
 
 		 799 aa  484  1e-135  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1819  heavy metal translocating P-type ATPase  33.83 
 
 		 806 aa  484  1e-135  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.543484  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1801  copper-translocating P-type ATPase  38.71 
 
 		 797 aa  480  1e-134  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2112  heavy metal translocating P-type ATPase  34.16 
 
 		 803 aa  480  1e-134  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.237749  normal  0.362751 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1848  copper-translocating P-type ATPase  37.07 
 
 		 743 aa  482  1e-134  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.525064  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1994  copper-translocating P-type ATPase  37.75 
 
 		 752 aa  480  1e-134  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2011  heavy metal translocating P-type ATPase  34.24 
 
 		 803 aa  479  1e-134  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000000954051 
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4492  hypothetical protein  35.4 
 
 		 799 aa  478  1e-133  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0576  copper-translocating P-type ATPase:heavy metal translocating P-type ATPase  32.48 
 
 		 817 aa  478  1e-133  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.176053  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2206  heavy metal translocating P-type ATPase  35.4 
 
 		 799 aa  478  1e-133  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.107808  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4326  copper-translocating P-type ATPase  39.33 
 
 		 837 aa  476  1e-133  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000547057  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1964  heavy metal translocating P-type ATPase  34.53 
 
 		 803 aa  479  1e-133  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0125075 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2219  heavy metal translocating P-type ATPase  35.52 
 
 		 799 aa  476  1e-133  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000412933  normal  0.369074 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1420  copper-translocating P-type ATPase  33.67 
 
 		 789 aa  473  1e-132  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3758  heavy metal-transporting ATPase  35.01 
 
 		 805 aa  472  1.0000000000000001e-131  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000825532  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2280  heavy metal translocating P-type ATPase  35.92 
 
 		 818 aa  469  1.0000000000000001e-131  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.252713  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0746  copper-translocating P-type ATPase  35.85 
 
 		 815 aa  470  1.0000000000000001e-131  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.0000116614  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1960  heavy metal translocating P-type ATPase  33.66 
 
 		 828 aa  472  1.0000000000000001e-131  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2140  copper-translocating P-type ATPase  38.31 
 
 		 803 aa  469  1.0000000000000001e-131  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2078  heavy metal translocating P-type ATPase  37.72 
 
 		 817 aa  472  1.0000000000000001e-131  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.972968 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2131  cation transporter E1-E2 family ATPase  35.58 
 
 		 794 aa  467  9.999999999999999e-131  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0518  copper-translocating P-type ATPase  36.41 
 
 		 796 aa  468  9.999999999999999e-131  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1954  heavy metal translocating P-type ATPase  34.12 
 
 		 799 aa  467  9.999999999999999e-131  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1698  cation transport ATPases  38.59 
 
 		 799 aa  468  9.999999999999999e-131  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.118388  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1730  heavy metal translocating P-type ATPase  38.64 
 
 		 839 aa  463  1e-129  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2215  heavy metal translocating P-type ATPase  35.4 
 
 		 799 aa  464  1e-129  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.948139  normal  0.364632 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2982  heavy metal translocating P-type ATPase  38.93 
 
 		 821 aa  464  1e-129  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000528062  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1846  heavy metal translocating P-type ATPase  33.17 
 
 		 813 aa  463  1e-129  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.418126  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2165  heavy metal translocating P-type ATPase  35.4 
 
 		 799 aa  463  1e-129  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0742745  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2015  heavy metal translocating P-type ATPase  33.5 
 
 		 797 aa  464  1e-129  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.467794  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4235  copper-translocating P-type ATPase  35.9 
 
 		 753 aa  461  9.999999999999999e-129  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.985979  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3829  copper-translocating P-type ATPase  36.58 
 
 		 806 aa  459  9.999999999999999e-129  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0228727  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2219  heavy metal translocating P-type ATPase  34.4 
 
 		 794 aa  459  1e-127  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1472  copper-translocating P-type ATPase  37.24 
 
 		 806 aa  459  1e-127  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000228287  hitchhiker  0.0000337327 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2266  heavy metal translocating P-type ATPase  40.38 
 
 		 790 aa  456  1e-127  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.123408  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2454  heavy metal translocating P-type ATPase  45.36 
 
 		 824 aa  456  1e-127  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.000374704  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0774  copper-translocating P-type ATPase  35.11 
 
 		 797 aa  457  1e-127  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4377  copper-translocating P-type ATPase  36.22 
 
 		 750 aa  458  1e-127  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.172254 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1640  P1 ATPase/HMA domain-containing protein  39.49 
 
 		 817 aa  457  1e-127  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0650256 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1048  cation transporter E1-E2 family ATPase  34.95 
 
 		 790 aa  459  1e-127  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.582758  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2452  copper-translocating P-type ATPase  39.05 
 
 		 797 aa  454  1.0000000000000001e-126  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.7313  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2495  copper-translocating P-type ATPase  35.25 
 
 		 759 aa  454  1.0000000000000001e-126  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.744055  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0934  heavy metal translocating P-type ATPase  33.99 
 
 		 802 aa  454  1.0000000000000001e-126  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.701132  normal  0.512838 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2052  copper-translocating P-type ATPase  35.35 
 
 		 837 aa  456  1.0000000000000001e-126  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.02596e-23 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2579  copper-translocating P-type ATPase  35.37 
 
 		 802 aa  455  1.0000000000000001e-126  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1790  heavy metal translocating P-type ATPase  34.73 
 
 		 815 aa  454  1.0000000000000001e-126  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2413  heavy metal translocating P-type ATPase  39.1 
 
 		 840 aa  455  1.0000000000000001e-126  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.66549  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2994  heavy metal translocating P-type ATPase  36.59 
 
 		 838 aa  456  1.0000000000000001e-126  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2633  copper-translocating P-type ATPase  35.37 
 
 		 802 aa  455  1.0000000000000001e-126  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.881723  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3619  copper-translocating P-type ATPase  35.25 
 
 		 759 aa  454  1.0000000000000001e-126  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3487  heavy metal-transporting ATPase  34.76 
 
 		 805 aa  450  1e-125  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000442964  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0631  heavy metal translocating P-type ATPase  39.84 
 
 		 800 aa  451  1e-125  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000735513 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0711  ATPase, E1-E2 type:copper-translocating P-type ATPase:heavy metal translocating P-type ATPase  35.4 
 
 		 812 aa  451  1e-125  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.139476  normal  0.239991 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3741  heavy metal-transporting ATPase  34.76 
 
 		 805 aa  451  1e-125  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000497644 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3639  heavy metal translocating P-type ATPase  36.69 
 
 		 786 aa  451  1e-125  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2772  copper-translocating P-type ATPase:heavy metal translocating P-type ATPase  38.09 
 
 		 798 aa  451  1e-125  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0164  heavy metal translocating P-type ATPase  36.46 
 
 		 846 aa  449  1e-125  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.914587 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4090  heavy metal translocating P-type ATPase  39.7 
 
 		 813 aa  452  1e-125  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.670864 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4416  copper-translocating P-type ATPase  36.44 
 
 		 759 aa  451  1e-125  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3783  copper-translocating P-type ATPase  35.78 
 
 		 811 aa  449  1e-125  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0413939  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3779  heavy metal-transporting ATPase  34.76 
 
 		 805 aa  449  1e-125  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000381926  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0534  copper-translocating P-type ATPase  34.92 
 
 		 889 aa  451  1e-125  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.541541  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1450  heavy metal translocating P-type ATPase  33.96 
 
 		 792 aa  446  1.0000000000000001e-124  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0366901  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0385  copper-transporter ATPase CopA  34.91 
 
 		 744 aa  449  1.0000000000000001e-124  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3575  heavy metal-transporting ATPase  34.64 
 
 		 805 aa  448  1.0000000000000001e-124  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0131319  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3475  heavy metal-transporting ATPase  34.64 
 
 		 805 aa  448  1.0000000000000001e-124  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000616421  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1876  heavy metal translocating P-type ATPase  39.38 
 
 		 748 aa  448  1.0000000000000001e-124  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.972303  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0056  copper-transporting P-type ATPase  39.46 
 
 		 804 aa  447  1.0000000000000001e-124  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1275  heavy metal translocating P-type ATPase  36.03 
 
 		 839 aa  447  1.0000000000000001e-124  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3859  heavy metal-transporting ATPase  34.64 
 
 		 805 aa  448  1.0000000000000001e-124  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000448263  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4578  heavy metal translocating P-type ATPase  39.51 
 
 		 799 aa  447  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.530867  decreased coverage  0.00687508 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1259  heavy metal translocating P-type ATPase  38.34 
 
 		 834 aa  449  1.0000000000000001e-124  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.499676  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3496  heavy metal translocating P-type ATPase  34.88 
 
 		 806 aa  449  1.0000000000000001e-124  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.170842  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0518  copper-translocating P-type ATPase  34.92 
 
 		 889 aa  446  1.0000000000000001e-124  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44440  putative cation-transporting P-type ATPase  35.42 
 
 		 811 aa  448  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.838322  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0586  heavy metal translocating P-type ATPase  39.56 
 
 		 799 aa  445  1e-123  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.943128 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2276  heavy metal translocating P-type ATPase  37.5 
 
 		 801 aa  444  1e-123  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0267  copper-translocating P-type ATPase  33.38 
 
 		 797 aa  445  1e-123  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.594062  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1835  heavy metal translocating P-type ATPase  39.68 
 
 		 804 aa  444  1e-123  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1879  heavy metal translocating P-type ATPase  38.15 
 
 		 836 aa  443  1e-123  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.753132  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0625  heavy metal translocating P-type ATPase  39.42 
 
 		 799 aa  443  1e-123  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0643992  normal  0.943938 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2170  copper-translocating P-type ATPase  36.69 
 
 		 831 aa  446  1e-123  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1307  copper-translocating P-type ATPase  35.17 
 
 		 758 aa  443  1e-123  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>