More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_1182 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012918  GM21_3093  pyruvate kinase  96.05 
 
 		 481 aa  936    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1182  pyruvate kinase  100 
 
 		 481 aa  972    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2983  pyruvate kinase  61.26 
 
 		 483 aa  553  1e-156  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1613  pyruvate kinase  56.9 
 
 		 480 aa  526  1e-148  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0729902  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4409  pyruvate kinase  57.63 
 
 		 480 aa  518  1.0000000000000001e-145  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000010448  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0122  pyruvate kinase  57.75 
 
 		 480 aa  514  1e-144  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000177516  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3331  pyruvate kinase  57.11 
 
 		 480 aa  504  1e-141  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.616475  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1701  pyruvate kinase  51.7 
 
 		 478 aa  451  1e-125  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0550  pyruvate kinase  47.68 
 
 		 580 aa  439  9.999999999999999e-123  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0357286  normal  0.850223 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1796  pyruvate kinase  48.1 
 
 		 581 aa  439  9.999999999999999e-123  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1692  pyruvate kinase  50.63 
 
 		 479 aa  439  9.999999999999999e-123  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.309469  unclonable  0.00000000134054 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1400  pyruvate kinase  46.9 
 
 		 470 aa  436  1e-121  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.40578 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1428  pyruvate kinase  50.21 
 
 		 478 aa  437  1e-121  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.262848  hitchhiker  0.00576902 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1195  pyruvate kinase., pyruvate, water dikinase  47.47 
 
 		 583 aa  434  1e-120  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000000647409  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3282  pyruvate kinase  47.79 
 
 		 585 aa  433  1e-120  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.829257  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0529  pyruvate kinase  47.58 
 
 		 585 aa  432  1e-120  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4713  pyruvate kinase  47.16 
 
 		 585 aa  429  1e-119  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0392602 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4708  pyruvate kinase  47.37 
 
 		 585 aa  430  1e-119  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4729  pyruvate kinase  47.16 
 
 		 585 aa  430  1e-119  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4492  pyruvate kinase  47.16 
 
 		 585 aa  429  1e-119  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0550646  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4327  pyruvate kinase  47.16 
 
 		 585 aa  429  1e-119  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4339  pyruvate kinase  47.16 
 
 		 585 aa  429  1e-119  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.113971  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4724  pyruvate kinase  47.16 
 
 		 585 aa  430  1e-119  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4428  pyruvate kinase  47.18 
 
 		 585 aa  429  1e-119  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4843  pyruvate kinase  47.16 
 
 		 585 aa  429  1e-119  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2685  pyruvate kinase  49.38 
 
 		 588 aa  428  1e-119  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000142008  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03220  pyruvate kinase  46.97 
 
 		 584 aa  426  1e-118  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000682258  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2602  pyruvate kinase  51.99 
 
 		 471 aa  428  1e-118  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.272565  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1788  pyruvate kinase  46.86 
 
 		 585 aa  422  1e-117  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0815  pyruvate kinase  46.85 
 
 		 583 aa  422  1e-117  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00417655 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1867  pyruvate kinase  47.72 
 
 		 582 aa  422  1e-117  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1754  pyruvate kinase  46.86 
 
 		 585 aa  422  1e-117  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.723076  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1266  pyruvate kinase  46.04 
 
 		 585 aa  424  1e-117  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000010731  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0005  pyruvate kinase  47.29 
 
 		 482 aa  424  1e-117  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0168768  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3378  pyruvate kinase  46.4 
 
 		 479 aa  419  1e-116  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1261  pyruvate kinase  46.65 
 
 		 585 aa  421  1e-116  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0004  pyruvate kinase  48.62 
 
 		 474 aa  420  1e-116  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00236484  normal  0.256492 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4063  pyruvate kinase  46.32 
 
 		 488 aa  420  1e-116  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.910781  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2312  pyruvate kinase  48.01 
 
 		 583 aa  419  1e-116  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1056  pyruvate kinase  49.26 
 
 		 585 aa  417  9.999999999999999e-116  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00524039  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0004  pyruvate kinase  49.05 
 
 		 474 aa  416  9.999999999999999e-116  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.328541  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0381  pyruvate kinase  47.79 
 
 		 578 aa  417  9.999999999999999e-116  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0312  pyruvate kinase  48.74 
 
 		 474 aa  416  9.999999999999999e-116  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.838542  normal  0.668363 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0440  pyruvate kinase  47.58 
 
 		 586 aa  414  1e-114  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4669  pyruvate kinase  45.72 
 
 		 509 aa  415  1e-114  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.725037  normal  0.411009 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2040  pyruvate kinase  46.53 
 
 		 582 aa  412  1e-114  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2352  pyruvate kinase  49.68 
 
 		 472 aa  410  1e-113  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.401076  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24770  pyruvate kinase  46.65 
 
 		 474 aa  410  1e-113  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0778  pyruvate kinase  48 
 
 		 587 aa  411  1e-113  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2404  pyruvate kinase  45.67 
 
 		 474 aa  409  1e-113  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.824082  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0833  pyruvate kinase  47.39 
 
 		 479 aa  407  1.0000000000000001e-112  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.117468  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3162  pyruvate kinase  46.62 
 
 		 477 aa  407  1.0000000000000001e-112  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0597738  normal  0.419031 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1179  pyruvate kinase  45.97 
 
 		 476 aa  402  1e-111  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3211  pyruvate kinase  45.91 
 
 		 471 aa  403  1e-111  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.981437  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3160  pyruvate kinase  45.65 
 
 		 482 aa  404  1e-111  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0251321 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0351  pyruvate kinase  46.95 
 
 		 467 aa  404  1e-111  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0288145  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0342  pyruvate kinase  46.74 
 
 		 467 aa  403  1e-111  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2116  pyruvate kinase  45.24 
 
 		 474 aa  404  1e-111  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0677  pyruvate kinase  44.75 
 
 		 590 aa  405  1e-111  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2211  pyruvate kinase  46.95 
 
 		 471 aa  402  9.999999999999999e-111  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0824427 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4428  pyruvate kinase  48.01 
 
 		 471 aa  400  9.999999999999999e-111  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.132665  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3524  pyruvate kinase  47.77 
 
 		 592 aa  400  9.999999999999999e-111  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0098  pyruvate kinase  47.98 
 
 		 594 aa  399  9.999999999999999e-111  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1766  pyruvate kinase  45.05 
 
 		 472 aa  400  9.999999999999999e-111  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.179073 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2582  pyruvate kinase  47.77 
 
 		 592 aa  400  9.999999999999999e-111  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3070  pyruvate kinase  44.86 
 
 		 472 aa  400  9.999999999999999e-111  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000899763  hitchhiker  0.00558917 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4383  pyruvate kinase  48.12 
 
 		 491 aa  399  9.999999999999999e-111  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.116424 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2862  pyruvate kinase  46.62 
 
 		 476 aa  401  9.999999999999999e-111  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0222457  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3058  pyruvate kinase  45.91 
 
 		 472 aa  397  1e-109  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.947696  normal  0.788477 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2208  pyruvate kinase  47.79 
 
 		 590 aa  396  1e-109  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0888  pyruvate kinase  46.06 
 
 		 597 aa  397  1e-109  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.918446  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1115  pyruvate kinase  48.65 
 
 		 490 aa  398  1e-109  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  0.000000141137  hitchhiker  0.0000000000000541512 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3042  pyruvate kinase  45.91 
 
 		 472 aa  397  1e-109  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.139243  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3101  pyruvate kinase  45.91 
 
 		 472 aa  397  1e-109  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.509766  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2940  pyruvate kinase  44.49 
 
 		 477 aa  395  1e-109  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.324729  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09491  pyruvate kinase  45.84 
 
 		 596 aa  397  1e-109  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_09951  pyruvate kinase  47.12 
 
 		 596 aa  395  1e-109  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09471  pyruvate kinase  45.84 
 
 		 596 aa  398  1e-109  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2535  pyruvate kinase  42.49 
 
 		 471 aa  394  1e-108  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0129939  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2569  pyruvate kinase  43.88 
 
 		 580 aa  393  1e-108  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0396442  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1063  pyruvate kinase  46.27 
 
 		 483 aa  394  1e-108  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3385  pyruvate kinase  44.59 
 
 		 482 aa  392  1e-108  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.468525  normal  0.558043 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3020  pyruvate kinase  45.49 
 
 		 487 aa  393  1e-108  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.111812  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2824  pyruvate kinase  45.07 
 
 		 472 aa  395  1e-108  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2490  pyruvate kinase  44.82 
 
 		 476 aa  395  1e-108  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3440  pyruvate kinase  47.56 
 
 		 601 aa  389  1e-107  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.386221 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11020  pyruvate kinase  44.61 
 
 		 495 aa  390  1e-107  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.887694  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1694  pyruvate kinase  47.58 
 
 		 589 aa  390  1e-107  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4234  pyruvate kinase  48.33 
 
 		 489 aa  389  1e-107  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4190  pyruvate kinase  43.99 
 
 		 476 aa  392  1e-107  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.85429 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4390  pyruvate kinase  48.33 
 
 		 489 aa  390  1e-107  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.474716  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2900  pyruvate kinase  45.45 
 
 		 474 aa  391  1e-107  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000957395  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3804  pyruvate kinase  44.33 
 
 		 476 aa  389  1e-107  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00347272 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4367  pyruvate kinase  48.33 
 
 		 489 aa  389  1e-107  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.569542  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3905  pyruvate kinase  48.31 
 
 		 600 aa  386  1e-106  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.252836 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5687  pyruvate kinase  44.63 
 
 		 474 aa  385  1e-106  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0177756  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3591  pyruvate kinase  44.86 
 
 		 472 aa  388  1e-106  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.802913  normal  0.0255261 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0913  pyruvate kinase  45.99 
 
 		 477 aa  388  1e-106  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00173367  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1461  pyruvate kinase  44.44 
 
 		 474 aa  385  1e-106  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.566125  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2354  pyruvate kinase  43.13 
 
 		 476 aa  388  1e-106  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>