93 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_1177 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_1177  ABC-type uncharacterized transport system periplasmic component-like protein  100 
 
 		 282 aa  566  1e-160  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3118  ABC-type uncharacterized transport system periplasmic component-like protein  91.76 
 
 		 282 aa  475  1e-133  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1965  ABC-type uncharacterized transport system periplasmic component-like protein  46.1 
 
 		 298 aa  258  8e-68  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0577  hypothetical protein  46.62 
 
 		 285 aa  245  6.999999999999999e-64  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1359  hypothetical protein  43.51 
 
 		 297 aa  223  3e-57  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2901  ABC-type uncharacterized transport system periplasmic component-like protein  42.15 
 
 		 289 aa  220  1.9999999999999999e-56  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2388  ABC-type uncharacterized transport system periplasmic component-like protein  44.62 
 
 		 283 aa  216  2.9999999999999998e-55  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0995379  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1831  ABC-type uncharacterized transport system periplasmic component-like protein  43.89 
 
 		 283 aa  213  1.9999999999999998e-54  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00143408 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1444  hypothetical protein  40.45 
 
 		 297 aa  197  1.0000000000000001e-49  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2736  hypothetical protein  41.96 
 
 		 287 aa  194  1e-48  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0882  hypothetical protein  41.7 
 
 		 290 aa  188  8e-47  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.960204  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2427  hypothetical protein  36.52 
 
 		 298 aa  184  1.0000000000000001e-45  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000824724  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1244  hypothetical protein  38.87 
 
 		 336 aa  177  2e-43  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0648578 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0821  ABC transporter substrate binding inner membrane protein  27.9 
 
 		 319 aa  72  0.00000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0105624 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2646  protein of unknown function DUF534  25.74 
 
 		 329 aa  64.7  0.000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002970  ABC transporter substrate-binding protein  25 
 
 		 321 aa  63.2  0.000000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1949  hypothetical protein  27.41 
 
 		 322 aa  62.4  0.000000008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.521982  normal  0.530099 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1750  protein of unknown function DUF534  27.92 
 
 		 322 aa  62  0.00000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0619  hypothetical protein  25 
 
 		 321 aa  61.6  0.00000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0079  ABC-type uncharacterized transport system, periplasmic component  22.33 
 
 		 334 aa  60.8  0.00000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.0035536  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1155  ABC transporter substrate-binding protein  26.53 
 
 		 333 aa  61.2  0.00000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.0000138162  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2037  hypothetical protein  31.33 
 
 		 310 aa  60.8  0.00000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2856  protein of unknown function DUF534  27.45 
 
 		 337 aa  60.5  0.00000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2227  hypothetical protein  27.45 
 
 		 338 aa  60.1  0.00000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00471107  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1817  hypothetical protein  28.19 
 
 		 331 aa  59.7  0.00000005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00011469  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02940  hypothetical protein  25.31 
 
 		 322 aa  59.7  0.00000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3723  protein of unknown function DUF534  24.79 
 
 		 317 aa  59.3  0.00000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2753  hypothetical protein  29.05 
 
 		 260 aa  59.3  0.00000007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.249359  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0867  hypothetical protein  25.66 
 
 		 317 aa  59.3  0.00000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14390  putative ABC-type transport protein, periplasmic c  25.25 
 
 		 325 aa  58.9  0.00000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1277  ABC transporter periplasmic protein  25.25 
 
 		 325 aa  58.9  0.00000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3067  hypothetical protein  24.46 
 
 		 317 aa  58.9  0.0000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4046  protein of unknown function DUF534  24.36 
 
 		 317 aa  58.5  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR2053  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein, putative  25.99 
 
 		 321 aa  55.5  0.0000009  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0747  protein of unknown function DUF534  24.02 
 
 		 319 aa  55.1  0.000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  unclonable  2.99763e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2038  hypothetical protein  26 
 
 		 324 aa  54.7  0.000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0401201 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1746  hypothetical protein  24.22 
 
 		 324 aa  54.3  0.000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.227035 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4311  hypothetical protein  26.4 
 
 		 323 aa  54.7  0.000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0522  putative ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  25.89 
 
 		 323 aa  53.5  0.000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0553  hypothetical protein  27.01 
 
 		 314 aa  53.5  0.000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.5903  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2831  hypothetical protein  25.38 
 
 		 321 aa  53.5  0.000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2842  hypothetical protein  25.38 
 
 		 321 aa  53.5  0.000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.838657  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2218  hypothetical protein  25.38 
 
 		 321 aa  53.5  0.000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.792913  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1211  hypothetical protein  25.38 
 
 		 323 aa  53.1  0.000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0959108 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1949  protein of unknown function DUF534  26.4 
 
 		 323 aa  52.8  0.000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.325569  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4371  hypothetical protein  25.29 
 
 		 331 aa  52.8  0.000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1974  putative ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  25.55 
 
 		 321 aa  52.8  0.000006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.350596  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2106  hypothetical protein  24.84 
 
 		 323 aa  52.4  0.000008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.363313  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6161  hypothetical protein  25.38 
 
 		 321 aa  52  0.00001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.432237 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0472  hypothetical protein  25.38 
 
 		 321 aa  52  0.00001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.997143 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0687  hypothetical protein  25.38 
 
 		 323 aa  52  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.695936  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2867  hypothetical protein  22.05 
 
 		 316 aa  52  0.00001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2907  putative ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  25.38 
 
 		 323 aa  51.6  0.00001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0505  putative ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  25.38 
 
 		 323 aa  51.6  0.00001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1479  putative ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  25.38 
 
 		 323 aa  51.6  0.00001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0109  putative ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  25.38 
 
 		 323 aa  51.6  0.00001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1270  hypothetical protein  21.67 
 
 		 288 aa  51.2  0.00002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1315  hypothetical protein  26.83 
 
 		 322 aa  51.2  0.00002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.710416  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1473  protein of unknown function DUF534  23.53 
 
 		 335 aa  51.2  0.00002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1712  hypothetical protein  24.87 
 
 		 343 aa  50.4  0.00003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0258  ABC-type uncharacterized transport system, periplasmic component  24.18 
 
 		 347 aa  50.8  0.00003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000000182856  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2840  hypothetical protein  23.08 
 
 		 329 aa  50.1  0.00005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00146979  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1711  hypothetical protein  24.83 
 
 		 370 aa  49.3  0.00006  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0267  ABC-type uncharacterized transport system, periplasmic component  24.72 
 
 		 359 aa  49.3  0.00007  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0239321  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1461  protein of unknown function DUF534  24.32 
 
 		 326 aa  48.9  0.00008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.655823  hitchhiker  0.000000785059 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0440  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein, putative  24.87 
 
 		 323 aa  49.3  0.00008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.173038  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1502  protein of unknown function DUF534  24.32 
 
 		 326 aa  48.5  0.0001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0497356  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1740  putative signal peptide protein  26.02 
 
 		 329 aa  48.5  0.0001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.324025  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1434  ABC transporter, substrate-binding protein  23.81 
 
 		 349 aa  48.5  0.0001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.681297 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3140  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein, putative  24.87 
 
 		 323 aa  48.9  0.0001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.226285  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1598  hypothetical protein  25.45 
 
 		 349 aa  48.5  0.0001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.108913  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1089  hypothetical protein  24.62 
 
 		 324 aa  47.8  0.0002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.623165  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0047  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  21.59 
 
 		 327 aa  48.1  0.0002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03810  ABC-type uncharacterized transport system, periplasmic component  22.69 
 
 		 336 aa  47.8  0.0002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0657  protein of unknown function DUF534  22.76 
 
 		 330 aa  47.4  0.0003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.342868  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0325  hypothetical protein  21.21 
 
 		 337 aa  47.4  0.0003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000000093059  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0134  hypothetical protein  22.68 
 
 		 301 aa  45.8  0.0007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.9202  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1098  hypothetical protein  21.97 
 
 		 313 aa  45.8  0.0008  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1189  hypothetical protein  20.92 
 
 		 334 aa  45.4  0.001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.00418408  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19990  ABC-type uncharacterized transport system, periplasmic component  19.21 
 
 		 325 aa  45.4  0.001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  9.09791e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1116  ABC-type uncharacterized transport system periplasmic component-like protein  28.92 
 
 		 304 aa  44.7  0.002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0249  ribose/xylose/arabinose/galactoside ABC-type transporter permease  21.43 
 
 		 584 aa  44.3  0.002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3415  hypothetical protein  28.51 
 
 		 321 aa  44.3  0.002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.952099  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2365  protein of unknown function DUF534  22.4 
 
 		 331 aa  43.9  0.003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00100062  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4553  protein of unknown function DUF534  20.73 
 
 		 329 aa  43.5  0.004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3141  hypothetical protein  25.61 
 
 		 344 aa  43.5  0.004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.774643 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0511  protein of unknown function DUF534  20.94 
 
 		 329 aa  43.5  0.004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1146  protein of unknown function DUF534  25.22 
 
 		 292 aa  43.1  0.005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1599  hypothetical protein  23.39 
 
 		 341 aa  43.1  0.005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.164938  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3116  protein of unknown function DUF534  21.82 
 
 		 309 aa  43.1  0.005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1661  hypothetical protein  26.92 
 
 		 324 aa  42.7  0.007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.8813 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0251  protein of unknown function DUF534  22.07 
 
 		 320 aa  42.4  0.009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00303449  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2859  protein of unknown function DUF534  25.3 
 
 		 384 aa  42  0.01  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>