More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_1175 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_1175  transcriptional regulator, AsnC family  100 
 
 		 157 aa  315  2e-85  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1059  AsnC family transcriptional regulator  56.67 
 
 		 159 aa  179  1e-44  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0704538  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0065  AsnC family transcriptional regulator  54.67 
 
 		 157 aa  164  5.9999999999999996e-40  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3685  AsnC family transcriptional regulator  50.31 
 
 		 174 aa  162  2.0000000000000002e-39  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.930939  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0245  transcriptional regulator  53.64 
 
 		 169 aa  162  2.0000000000000002e-39  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3629  AsnC family transcriptional regulator  51.66 
 
 		 153 aa  161  3e-39  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.217189 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2266  AsnC family transcriptional regulator  51.33 
 
 		 153 aa  160  5.0000000000000005e-39  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.400993  normal  0.321257 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5136  AsnC family transcriptional regulator  50.32 
 
 		 177 aa  160  8.000000000000001e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.944237 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0459  AsnC family transcriptional regulator  50.67 
 
 		 160 aa  157  6e-38  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2899  AsnC family transcriptional regulator  50.66 
 
 		 154 aa  156  1e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5229  AsnC family transcriptional regulator  51.01 
 
 		 152 aa  155  3e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.104749  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3278  AsnC family transcriptional regulator  51.01 
 
 		 152 aa  154  4e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.882377 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3357  AsnC family transcriptional regulator  51.01 
 
 		 152 aa  154  6e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.773724  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4159  AsnC family transcriptional regulator  51.01 
 
 		 152 aa  154  6e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.409138  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4810  AsnC family transcriptional regulator  51.01 
 
 		 152 aa  154  6e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.402994  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0722  AsnC family transcriptional regulator  48 
 
 		 152 aa  153  1e-36  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.777911  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2377  AsnC family transcriptional regulator  48 
 
 		 152 aa  152  2e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.408866 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4559  AsnC family transcriptional regulator  54 
 
 		 156 aa  150  5e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.137777  normal  0.0927691 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2441  AsnC family transcriptional regulator  47.33 
 
 		 152 aa  149  1e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.443821 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1165  AsnC family transcriptional regulator  54.86 
 
 		 147 aa  149  2e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.403646 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5150  transcriptional regulator, AsnC family  52 
 
 		 154 aa  148  3e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0213  AsnC family transcriptional regulator  52 
 
 		 153 aa  148  3e-35  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.757841 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2497  AsnC family transcriptional regulator  52 
 
 		 156 aa  146  1.0000000000000001e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.38008  normal  0.590435 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2309  AsnC family transcriptional regulator  52.67 
 
 		 157 aa  146  1.0000000000000001e-34  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00293447 
 
 
-
 
NC_003296  RS02081  transcription regulator protein  47.33 
 
 		 152 aa  145  2.0000000000000003e-34  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1733  AsnC family transcriptional regulator  49.01 
 
 		 165 aa  144  4.0000000000000006e-34  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.017814  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3311  AsnC family transcriptional regulator  48.05 
 
 		 175 aa  143  1e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.944983  normal  0.0543443 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1530  AsnC family transcriptional regulator  48.67 
 
 		 157 aa  142  1e-33  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.14965  normal  0.648234 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0922  alanine catabolic operon transcriptional regulator, putative  50.67 
 
 		 155 aa  142  2e-33  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.491746  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1736  bkd operon transcriptional regulator  49.03 
 
 		 175 aa  142  2e-33  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.00397839  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2461  AsnC family transcriptional regulator  49.03 
 
 		 202 aa  142  2e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00000130465  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1843  bkd operon transcriptional regulator  49.03 
 
 		 175 aa  142  2e-33  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00082559  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0513  bkd operon transcriptional regulator  49.03 
 
 		 175 aa  142  2e-33  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.000000170709  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0782  bkd operon transcriptional regulator  49.03 
 
 		 229 aa  142  2e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000164018  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2323  AsnC family transcriptional regulator  49.03 
 
 		 202 aa  142  2e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1635  bkd operon transcriptional regulator  49.03 
 
 		 175 aa  142  2e-33  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000232797  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1429  AsnC family transcriptional regulator  46 
 
 		 157 aa  142  2e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2829  AsnC family transcriptional regulator  50 
 
 		 153 aa  142  2e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2221  transcriptional regulator, AsnC family  48.67 
 
 		 154 aa  141  4e-33  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.17044  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0671  bkd operon transcriptional regulator  49.03 
 
 		 229 aa  141  4e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0000013017  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2536  transcriptional regulator, AsnC family  48.37 
 
 		 155 aa  140  6e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.346096  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3830  AsnC family transcriptional regulator  50 
 
 		 158 aa  140  8e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.676178  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2098  transcriptional regulator, AsnC family  48.67 
 
 		 155 aa  139  9.999999999999999e-33  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0374  leucine-responsive regulatory protein  47.33 
 
 		 152 aa  139  9.999999999999999e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0551  transcription regulator AsnC  47.33 
 
 		 152 aa  139  9.999999999999999e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1616  AsnC family transcriptional regulator  48.67 
 
 		 155 aa  139  9.999999999999999e-33  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.636289  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0361  leucine-responsive regulatory protein  47.33 
 
 		 152 aa  139  9.999999999999999e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0019  transcriptional regulator, AsnC family  45.33 
 
 		 156 aa  139  1.9999999999999998e-32  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2230  transcriptional regulator, AsnC family  47.06 
 
 		 155 aa  139  1.9999999999999998e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.685217  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1064  AsnC family transcriptional regulator  46.75 
 
 		 175 aa  139  1.9999999999999998e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7497  AsnC family transcriptional regulator  49.33 
 
 		 169 aa  139  1.9999999999999998e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000799666  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1640  transcriptional regulator, AsnC family  46.67 
 
 		 154 aa  138  1.9999999999999998e-32  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.113237 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1849  AsnC family transcriptional regulator  48.98 
 
 		 213 aa  138  3e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00276747  hitchhiker  0.0000000161296 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0319  transcription regulator AsnC  47.02 
 
 		 152 aa  138  3e-32  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0671  transcriptional regulator, AsnC family  48.28 
 
 		 145 aa  138  3e-32  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0943569  hitchhiker  0.00922833 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3221  AsnC family transcriptional regulator  49.33 
 
 		 155 aa  137  4.999999999999999e-32  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3971  transcriptional regulator, AsnC family  45.45 
 
 		 175 aa  137  6e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0018  transcriptional regulator, AsnC family  44.67 
 
 		 156 aa  137  6e-32  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.38788  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1446  AsnC family transcriptional regulator  49.66 
 
 		 155 aa  137  7e-32  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4823  AsnC family transcriptional regulator  51.72 
 
 		 149 aa  136  1e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0804417  normal  0.0730617 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3961  AsnC family transcriptional regulator  46.98 
 
 		 161 aa  136  1e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.537786  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4473  AsnC family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 175 aa  136  1e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000700573 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2213  regulatory proteins, AsnC/Lrp  50 
 
 		 153 aa  136  1e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.214008  normal  0.442221 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3332  transcriptional regulator AsnC family  45.75 
 
 		 155 aa  135  2e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3252  AsnC family transcriptional regulator  49.33 
 
 		 153 aa  135  2e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0873  AsnC family transcriptional regulator  49.66 
 
 		 156 aa  135  2e-31  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.286103  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4644  AsnC family transcriptional regulator  44.67 
 
 		 155 aa  134  3.0000000000000003e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.52735  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1369  AsnC family transcriptional regulator  46.94 
 
 		 153 aa  135  3.0000000000000003e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.362978  normal  1 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8143  transcriptional regulator  47.26 
 
 		 153 aa  135  3.0000000000000003e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0298504  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3724  AsnC family transcriptional regulator  44.67 
 
 		 155 aa  134  3.0000000000000003e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.201895  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4400  transcriptional regulator BkdR  46.31 
 
 		 161 aa  134  4e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.739741 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1454  AsnC family transcriptional regulator  46.31 
 
 		 161 aa  134  4e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.283041  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5660  AsnC family transcriptional regulator  44.67 
 
 		 155 aa  134  4e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6217  AsnC family transcriptional regulator  47.33 
 
 		 158 aa  133  8e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.662862  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0505  AsnC family transcriptional regulator  46.67 
 
 		 181 aa  133  8e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.287922  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5614  AsnC family transcriptional regulator  48.37 
 
 		 162 aa  133  9.999999999999999e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.41474  normal  0.0388981 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0321  AsnC family transcriptional regulator  45.1 
 
 		 154 aa  132  9.999999999999999e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.396921  normal  0.759539 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1553  AsnC family transcriptional regulator  48 
 
 		 154 aa  133  9.999999999999999e-31  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0410589  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3945  AsnC family transcriptional regulator  44.67 
 
 		 152 aa  132  1.9999999999999998e-30  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4242  AsnC family transcriptional regulator  46.48 
 
 		 176 aa  132  1.9999999999999998e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3462  AsnC family transcriptional regulator  46.67 
 
 		 162 aa  132  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.112426 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1709  transcriptional regulator, AsnC family  48.7 
 
 		 172 aa  132  1.9999999999999998e-30  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.741571  normal  0.587028 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3168  AsnC family transcriptional regulator  47.06 
 
 		 154 aa  132  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.714414  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3741  AsnC family transcriptional regulator  45.64 
 
 		 161 aa  132  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.641496  normal  0.623498 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4561  AsnC family transcriptional regulator  46 
 
 		 156 aa  132  1.9999999999999998e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00127893  normal  0.163186 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1897  AsnC family transcriptional regulator  46.67 
 
 		 163 aa  132  3e-30  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.129627 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4829  transcriptional regulator, AsnC family  44.83 
 
 		 154 aa  131  3.9999999999999996e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.69587  normal  0.0580849 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4775  transcriptional regulator, AsnC family  44.52 
 
 		 154 aa  131  3.9999999999999996e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.339738  normal  0.145309 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4160  AsnC family transcriptional regulator  45.58 
 
 		 153 aa  130  1.0000000000000001e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3973  AsnC family transcriptional regulator  47.18 
 
 		 154 aa  129  1.0000000000000001e-29  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.918788  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5122  putative transcriptional regulator  46.67 
 
 		 157 aa  129  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58510  AsnC family transcriptional regulator  46.67 
 
 		 157 aa  129  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1480  AsnC family transcriptional regulator  45.03 
 
 		 153 aa  129  1.0000000000000001e-29  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3102  transcription regulator protein  43.23 
 
 		 162 aa  128  2.0000000000000002e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.327288  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4941  AsnC family transcriptional regulator  43.79 
 
 		 154 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.342761  normal  0.28224 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1609  transcriptional regulator, AsnC family  44.83 
 
 		 153 aa  129  2.0000000000000002e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.177256  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1877  AsnC family transcriptional regulator  45.03 
 
 		 157 aa  128  2.0000000000000002e-29  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0216  AsnC family transcriptional regulator  48.08 
 
 		 164 aa  129  2.0000000000000002e-29  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.496692  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0165  transcriptional regulator, AsnC family  47.02 
 
 		 155 aa  129  2.0000000000000002e-29  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  decreased coverage  0.00375326  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2025  AsnC family transcriptional regulator  44.74 
 
 		 157 aa  128  3e-29  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.742298  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>