More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_1134 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010424  Daud_0863  mannose-1-phosphate guanylyltransferase (GDP)  67.19 
 
 		 813 aa  635    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1134  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/alpha domain III  100 
 
 		 450 aa  930    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0747537  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1779  phosphomannomutase ManB  72.1 
 
 		 450 aa  706    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1792  phosphomannomutase  72.77 
 
 		 450 aa  711    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2589  Phosphomannomutase  70.72 
 
 		 447 aa  673    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3151  Phosphomannomutase  94.67 
 
 		 450 aa  889    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1600  phosphomannomutase  65.56 
 
 		 455 aa  632  1e-180  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0455813  normal  0.713517 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1256  phosphomannomutase  65.2 
 
 		 457 aa  629  1e-179  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000453708  hitchhiker  0.000000000293956 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3037  phosphomannomutase  65.2 
 
 		 457 aa  629  1e-179  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.848364  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3178  phosphomannomutase  65.42 
 
 		 457 aa  628  1e-179  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2662  phosphomannomutase  64.25 
 
 		 456 aa  621  1e-177  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0392975  normal  0.829535 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2337  phosphomannomutase  64.69 
 
 		 456 aa  619  1e-176  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.113042  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2643  phosphomannomutase  64.76 
 
 		 457 aa  618  1e-176  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.320582  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1014  phosphomannomutase  64.25 
 
 		 456 aa  618  1e-176  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2229  phosphomannomutase  64.91 
 
 		 456 aa  619  1e-176  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.117299  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2286  phosphomannomutase  64.69 
 
 		 456 aa  620  1e-176  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000657815 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01932  Phosphomannomutase  64.46 
 
 		 454 aa  614  1e-175  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1609  Phosphomannomutase  64.04 
 
 		 456 aa  615  1e-175  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000012475  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1593  phosphomannomutase  64.25 
 
 		 456 aa  617  1e-175  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.014113  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1317  Phosphomannomutase  63.82 
 
 		 457 aa  617  1e-175  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.214391  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3126  phosphomannomutase  64.72 
 
 		 461 aa  615  1e-175  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00141531  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2982  phosphomannomutase  63.82 
 
 		 456 aa  615  1e-175  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000140295 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2444  phosphomannomutase  64.47 
 
 		 456 aa  615  1e-175  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00188854 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2330  phosphomannomutase  64.69 
 
 		 456 aa  617  1e-175  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0469689 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2255  Phosphomannomutase  67.04 
 
 		 450 aa  617  1e-175  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0395092  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01954  phosphomannomutase  63.82 
 
 		 456 aa  613  9.999999999999999e-175  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0099894  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2340  phosphomannomutase  63.82 
 
 		 456 aa  613  9.999999999999999e-175  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1184  phosphomannomutase  63.6 
 
 		 456 aa  613  9.999999999999999e-175  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01943  hypothetical protein  63.82 
 
 		 456 aa  613  9.999999999999999e-175  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00870446  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0895  Phosphomannomutase  64.96 
 
 		 456 aa  614  9.999999999999999e-175  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.310909  hitchhiker  0.000000688858 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2964  phosphomannomutase  64.79 
 
 		 456 aa  608  1e-173  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000327344 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1118  phosphomannomutase  62.78 
 
 		 454 aa  606  9.999999999999999e-173  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00000519382  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2851  Phosphomannomutase  64.25 
 
 		 457 aa  595  1e-169  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1001  phosphomannomutase  63.53 
 
 		 453 aa  597  1e-169  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.834887  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2172  phosphomannomutase  64.51 
 
 		 460 aa  595  1e-169  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.140706  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3280  Phosphomannomutase  60.89 
 
 		 454 aa  588  1e-167  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0302  phosphomannomutase  60.88 
 
 		 470 aa  587  1e-166  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0458  phosphomannomutase  63.57 
 
 		 450 aa  587  1e-166  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.235202  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2622  phosphomannomutase  59.87 
 
 		 463 aa  577  1.0000000000000001e-163  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0509  Phosphomannomutase  61.49 
 
 		 448 aa  573  1.0000000000000001e-162  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0115906 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0200  phosphomannomutase  61.38 
 
 		 449 aa  572  1.0000000000000001e-162  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1677  phosphomannomutase  58.85 
 
 		 457 aa  570  1e-161  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03174  phosphohexose mutase  61.35 
 
 		 448 aa  569  1e-161  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0229  phosphomannomutase  61.16 
 
 		 449 aa  571  1e-161  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1384  phosphomannomutase  60.5 
 
 		 453 aa  561  1.0000000000000001e-159  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1777  phosphomannomutase  60.59 
 
 		 453 aa  559  1e-158  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.615719  hitchhiker  0.00889462 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00966  phosphomannomutase  57.8 
 
 		 486 aa  560  1e-158  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.17998  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1093  Phosphomannomutase  60.31 
 
 		 448 aa  560  1e-158  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1793  phosphomannomutase  56.07 
 
 		 481 aa  558  1e-158  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00302913  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2109  Phosphomannomutase  61.3 
 
 		 467 aa  557  1e-157  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.221501  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01868  phosphomannomutase  56.99 
 
 		 486 aa  552  1e-156  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.203499  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1738  phosphomannomutase  56.64 
 
 		 462 aa  552  1e-156  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0922588  hitchhiker  0.000796464 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1632  phosphomannomutase  56.64 
 
 		 462 aa  552  1e-156  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1525  phosphomannomutase  56.64 
 
 		 462 aa  552  1e-156  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0489  Phosphomannomutase  56.25 
 
 		 493 aa  545  1e-154  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0414  Phosphomannomutase  57.08 
 
 		 473 aa  531  1e-149  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0274  phosphomannomutase  53.48 
 
 		 487 aa  514  1e-144  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000825  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0835  phosphomannomutase  54.63 
 
 		 458 aa  506  9.999999999999999e-143  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.584316  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0831  phosphomannomutase  53.59 
 
 		 451 aa  505  9.999999999999999e-143  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.975214  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2492  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/subunit  54.63 
 
 		 458 aa  506  9.999999999999999e-143  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.211242  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1900  phosphomannomutase/phosphoglucomutase  51.54 
 
 		 456 aa  489  1e-137  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.662048  hitchhiker  0.0000555961 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0120  phosphomannomutase  49.89 
 
 		 497 aa  479  1e-134  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0111  phosphomannomutase  48.92 
 
 		 493 aa  464  1e-129  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01918  hypothetical protein  67.73 
 
 		 282 aa  404  1e-111  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4694  phosphomannomutase  44.27 
 
 		 446 aa  399  9.999999999999999e-111  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0585  Phosphomannomutase  43.82 
 
 		 447 aa  390  1e-107  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.681403  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1218  phosphomannomutase  42.49 
 
 		 448 aa  375  1e-102  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0459323  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4124  phosphomannomutase  42.02 
 
 		 448 aa  370  1e-101  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3174  Phosphomannomutase  42.79 
 
 		 456 aa  364  1e-99  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1134  phosphomannomutase  42.57 
 
 		 472 aa  350  3e-95  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.579862  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0756  Phosphomannomutase  43.72 
 
 		 451 aa  340  2.9999999999999998e-92  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.106468  normal  0.0777802 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2432  Fis family transcriptional regulator  42.15 
 
 		 444 aa  338  9.999999999999999e-92  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1768  Phosphomannomutase  40 
 
 		 451 aa  325  1e-87  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0465  phosphomannomutase  42.57 
 
 		 454 aa  325  1e-87  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.441417  normal  0.856635 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1387  Phosphomannomutase  42.02 
 
 		 450 aa  325  1e-87  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.598505 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31020  phosphomannomutase/phosphoglucomutase  43.17 
 
 		 451 aa  319  5e-86  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0815121  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3760  Phosphomannomutase  40.09 
 
 		 453 aa  317  2e-85  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.343268  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0751  phosphomannomutase/phosphoglucomutase  41.8 
 
 		 452 aa  317  2e-85  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.648752  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1432  Phosphomannomutase  38.6 
 
 		 453 aa  317  2e-85  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5858  phosphomannomutase/phosphoglucomutase  42.21 
 
 		 453 aa  314  1.9999999999999998e-84  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0925623 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3841  Phosphomannomutase  40.67 
 
 		 497 aa  314  1.9999999999999998e-84  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.062306 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4298  Phosphomannomutase  39.69 
 
 		 454 aa  313  4.999999999999999e-84  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2510  phosphomannomutase/phosphoglucomutase  40.49 
 
 		 455 aa  311  2e-83  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4063  Phosphomannomutase  41.37 
 
 		 456 aa  310  2.9999999999999997e-83  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0919518  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6327  phosphomannomutase/phosphoglucomutase  41.78 
 
 		 450 aa  308  1.0000000000000001e-82  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.428689  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0898  phosphomannomutase  39.95 
 
 		 461 aa  300  2e-80  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.478971  normal  0.0385997 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08560  phosphomannomutase  40.47 
 
 		 487 aa  300  4e-80  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.749123 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7604  Phosphomannomutase  40.79 
 
 		 449 aa  299  5e-80  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.908268 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6010  Phosphomannomutase  41.52 
 
 		 454 aa  300  5e-80  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.30884  normal  0.056179 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2542  Phosphomannomutase  38.66 
 
 		 488 aa  298  1e-79  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1425  phosphomannomutase  39.96 
 
 		 469 aa  292  1e-77  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.896243  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1856  Phosphomannomutase  38.56 
 
 		 502 aa  292  1e-77  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.114337  decreased coverage  0.00605536 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13286  phosphomannomutase/phosphoglucomutase  39.6 
 
 		 465 aa  290  5.0000000000000004e-77  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.489635 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09120  phosphomannomutase  38.93 
 
 		 529 aa  288  2e-76  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.187509 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1737  phosphomannomutase/phosphoglucomutase  38.63 
 
 		 464 aa  285  8e-76  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.847298  normal  0.689022 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0961  phosphomannomutase  39.95 
 
 		 461 aa  285  1.0000000000000001e-75  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.386078 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0671  phosphomannomutase  38.61 
 
 		 475 aa  284  2.0000000000000002e-75  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.828766  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1187  Phosphomannomutase  38.78 
 
 		 456 aa  284  3.0000000000000004e-75  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.485619  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4168  Phosphomannomutase  39.39 
 
 		 471 aa  279  6e-74  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.400371  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1345  phosphomannomutase/phosphoglucomutase  39.19 
 
 		 465 aa  277  3e-73  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.701993 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>