29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_1092 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011146  Gbem_1092  hypothetical protein  100 
 
 
180 aa  365  1e-100  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3170  hypothetical protein  90.16 
 
 
187 aa  326  1.0000000000000001e-88  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2496  hypothetical protein  42.86 
 
 
188 aa  97.8  7e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000377569  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1247  hypothetical protein  52.13 
 
 
188 aa  95.9  3e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1763  hypothetical protein  44.57 
 
 
183 aa  84.3  8e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  1.4783800000000001e-18  normal  0.040844 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0953  hypothetical protein  43.69 
 
 
195 aa  82.4  0.000000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.585982 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3294  hypothetical protein  39.62 
 
 
203 aa  78.2  0.00000000000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0157417  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3620  hypothetical protein  39.56 
 
 
184 aa  74.3  0.0000000000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.794068  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2263  hypothetical protein  39.56 
 
 
213 aa  73.2  0.000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.000000000459083  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1752  hypothetical protein  35.87 
 
 
173 aa  68.9  0.00000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.0000963449  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3095  hypothetical protein  41.86 
 
 
214 aa  67.4  0.0000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0232  hypothetical protein  41.33 
 
 
189 aa  66.6  0.0000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.12225  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1040  hypothetical protein  30.28 
 
 
174 aa  65.9  0.0000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.194155  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0908  hypothetical protein  38.16 
 
 
174 aa  65.5  0.0000000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000542792  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1042  hypothetical protein  36.36 
 
 
288 aa  65.1  0.0000000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0835293  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1180  hypothetical protein  40.7 
 
 
232 aa  64.3  0.0000000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0384  hypothetical protein  35.78 
 
 
202 aa  63.5  0.000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1442  hypothetical protein  38.27 
 
 
265 aa  63.5  0.000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.658193  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1431  hypothetical protein  36.67 
 
 
145 aa  63.2  0.000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000637648  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1038  hypothetical protein  35.53 
 
 
135 aa  62.8  0.000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0131  hypothetical protein  46.97 
 
 
213 aa  63.2  0.000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1260  hypothetical protein  31.86 
 
 
267 aa  62.8  0.000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.541563  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1035  hypothetical protein  30.93 
 
 
177 aa  61.2  0.000000007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.214662  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1496  hypothetical protein  34.21 
 
 
353 aa  59.7  0.00000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0766  hypothetical protein  29.89 
 
 
255 aa  59.7  0.00000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00180926  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1359  hypothetical protein  35.53 
 
 
182 aa  57  0.0000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0526065  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1497  hypothetical protein  33.33 
 
 
170 aa  52.8  0.000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.844823  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0782  hypothetical protein  40 
 
 
177 aa  45.8  0.0003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.674637  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1095  hypothetical protein  29.87 
 
 
171 aa  45.8  0.0004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000152193  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>