52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_0988 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_0988  protein of unknown function DUF101  100 
 
 		 143 aa  290  4e-78  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3272  protein of unknown function DUF101  93.01 
 
 		 143 aa  271  2.0000000000000002e-72  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1615  hypothetical protein  53.15 
 
 		 143 aa  126  1.0000000000000001e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.307554  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2728  hypothetical protein  48.95 
 
 		 143 aa  126  1.0000000000000001e-28  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.21951  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1392  hypothetical protein  43.36 
 
 		 143 aa  122  1e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1680  hypothetical protein  44.76 
 
 		 143 aa  119  9.999999999999999e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.594814  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2143  hypothetical protein  46.85 
 
 		 143 aa  114  5e-25  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.706789  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1747  protein of unknown function DUF101  30.3 
 
 		 139 aa  69.3  0.00000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1373  hypothetical protein  34.33 
 
 		 141 aa  66.6  0.00000000009  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1264  protein of unknown function DUF101  30.3 
 
 		 138 aa  65.5  0.0000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1652  hypothetical protein  30.6 
 
 		 135 aa  65.9  0.0000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0121  hypothetical protein  31.82 
 
 		 135 aa  63.5  0.0000000009  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.0000001565  hitchhiker  0.0000415863 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0332  protein of unknown function DUF101  28.03 
 
 		 140 aa  63.5  0.0000000009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2756  protein of unknown function DUF101  32.84 
 
 		 136 aa  63.5  0.000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.905523  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1671  hypothetical protein  28.79 
 
 		 138 aa  63.2  0.000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.532408  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1251  archease family protein  33.58 
 
 		 146 aa  63.2  0.000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0655  protein of unknown function DUF101  30.3 
 
 		 143 aa  63.2  0.000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0242  hypothetical protein  27.27 
 
 		 138 aa  62.4  0.000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1793  hypothetical protein  31.72 
 
 		 135 aa  62.8  0.000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.694231 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0196  hypothetical protein  32.33 
 
 		 143 aa  62.8  0.000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.30479  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0957  archease family protein  27.27 
 
 		 138 aa  60.8  0.000000007  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.395937  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1313  hypothetical protein  31.58 
 
 		 139 aa  60.8  0.000000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.223315  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1546  hypothetical protein  25.76 
 
 		 140 aa  60.5  0.000000008  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1949  protein of unknown function DUF101  30.83 
 
 		 141 aa  58.9  0.00000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.000093626  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46270  hypothetical protein  36.46 
 
 		 137 aa  58.2  0.00000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3180  hypothetical protein  29.55 
 
 		 135 aa  57.8  0.00000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0129  hypothetical protein  25.55 
 
 		 144 aa  55.8  0.0000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.011827  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2152  hypothetical protein  26.52 
 
 		 147 aa  55.1  0.0000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1580  hypothetical protein  25.74 
 
 		 143 aa  55.1  0.0000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.986242  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1729  hypothetical protein  31.88 
 
 		 144 aa  55.1  0.0000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0569  hypothetical protein  32.41 
 
 		 147 aa  54.7  0.0000004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0479  hypothetical protein  32.33 
 
 		 138 aa  53.9  0.0000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.541748  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1685  hypothetical protein  29.17 
 
 		 147 aa  53.1  0.000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.0257186 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1831  hypothetical protein  27.27 
 
 		 150 aa  53.1  0.000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  hitchhiker  0.000057693  normal  0.0919322 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0688  hypothetical protein  28.17 
 
 		 150 aa  53.1  0.000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0414002  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2208  archease family protein  34.03 
 
 		 146 aa  48.9  0.00002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000144175  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0271  hypothetical protein  28.15 
 
 		 165 aa  48.9  0.00002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0128  hypothetical protein  22.73 
 
 		 136 aa  48.5  0.00003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1078  protein of unknown function DUF101  27.27 
 
 		 139 aa  47.8  0.00005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0707  hypothetical protein  25.87 
 
 		 147 aa  47.8  0.00006  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3853  hypothetical protein  27.74 
 
 		 138 aa  47.8  0.00006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2126  hypothetical protein  26.26 
 
 		 110 aa  47.4  0.00006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2022  protein of unknown function DUF101  31.54 
 
 		 148 aa  47  0.0001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.367905 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1267  hypothetical cytosolic protein  25.76 
 
 		 139 aa  46.6  0.0001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_726  hypothetical protein  25.93 
 
 		 138 aa  45.1  0.0003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2360  metal dependent phosphohydrolase  26.32 
 
 		 542 aa  45.1  0.0004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.461963 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2028  protein of unknown function DUF101  32.58 
 
 		 152 aa  43.1  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00595059  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2562  protein of unknown function DUF101  33.33 
 
 		 158 aa  43.1  0.001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0412  protein of unknown function DUF101  27.27 
 
 		 159 aa  43.1  0.001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  decreased coverage  0.00074949  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0741  hypothetical protein  24.44 
 
 		 138 aa  42  0.003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0373  protein of unknown function DUF101  29.79 
 
 		 142 aa  42  0.003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0018  hypothetical protein  28.79 
 
 		 159 aa  40.8  0.006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000044858  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>