57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_0981 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_0981  protein of unknown function DUF512  100 
 
 		 432 aa  864    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000360347  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3279  protein of unknown function DUF512  95.83 
 
 		 432 aa  812    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1774  hypothetical protein  69.63 
 
 		 430 aa  616  1e-175  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0164491  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2049  hypothetical protein  65.43 
 
 		 433 aa  574  1.0000000000000001e-162  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000101437  hitchhiker  0.0000000146402 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1997  PDZ domain-containing protein  66.2 
 
 		 433 aa  565  1e-160  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0347733  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2966  hypothetical protein  59.81 
 
 		 436 aa  520  1e-146  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0640841  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0990  protein of unknown function DUF512  57.61 
 
 		 444 aa  495  1e-139  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000932101  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1984  hypothetical protein  42.32 
 
 		 438 aa  370  1e-101  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1173  hypothetical protein  47.72 
 
 		 451 aa  360  2e-98  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.734459  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1159  hypothetical protein  45.88 
 
 		 439 aa  355  7.999999999999999e-97  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000801932  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1631  protein of unknown function DUF512  43.43 
 
 		 454 aa  353  2.9999999999999997e-96  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00530205 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2132  protein of unknown function DUF512  41.26 
 
 		 438 aa  345  1e-93  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00526746  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1323  hypothetical protein  45.03 
 
 		 443 aa  337  2.9999999999999997e-91  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.106789 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3382  protein of unknown function DUF512  41.74 
 
 		 442 aa  336  3.9999999999999995e-91  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.322973  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1025  hypothetical protein  40.48 
 
 		 445 aa  331  2e-89  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0603945  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2391  hypothetical protein  39.34 
 
 		 450 aa  327  2.0000000000000001e-88  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000589442  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1326  Fe-S oxidoreductase  40.18 
 
 		 451 aa  326  4.0000000000000003e-88  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1883  FeS-containing oxidoreductase  41.09 
 
 		 451 aa  326  5e-88  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.64586  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2541  FeS-containing oxidoreductase  43.37 
 
 		 448 aa  325  1e-87  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2331  Fe-S oxidoreductase  43.26 
 
 		 465 aa  325  1e-87  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.308629  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2244  FeS-containing oxidoreductase  40.67 
 
 		 453 aa  319  7e-86  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2296  FeS-containing organism-specific oxidoreductase  40.67 
 
 		 453 aa  318  1e-85  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.00042763  normal  0.0619176 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1968  hypothetical protein  43.47 
 
 		 452 aa  317  2e-85  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.161355  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2107  protein of unknown function DUF512  40.18 
 
 		 440 aa  315  7e-85  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00107289  normal  0.222005 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1225  protein of unknown function DUF512  46.21 
 
 		 442 aa  315  9e-85  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.767388  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0632  hypothetical protein  40.19 
 
 		 446 aa  310  2.9999999999999997e-83  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.674286 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0401  protein of unknown function DUF512  40.37 
 
 		 487 aa  305  8.000000000000001e-82  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1466  putative Fe-S oxidoreductase  38.8 
 
 		 449 aa  302  7.000000000000001e-81  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.455289  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0459  FeS-containing organism-specific oxidoreductase  40.19 
 
 		 441 aa  300  3e-80  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.320532  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0359  Fe-S oxidoreductase  39.5 
 
 		 465 aa  300  3e-80  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01681  putative Fe-S oxidoreductase  38.57 
 
 		 449 aa  300  3e-80  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.911896  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0750  protein of unknown function DUF512  39.23 
 
 		 433 aa  299  8e-80  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02221  putative Fe-S oxidoreductase  39.59 
 
 		 465 aa  295  9e-79  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01101  putative Fe-S oxidoreductase  36.17 
 
 		 470 aa  293  3e-78  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.277769  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1727  hypothetical protein  35.91 
 
 		 445 aa  292  8e-78  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.519845  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2009  hypothetical protein  36.09 
 
 		 445 aa  292  9e-78  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01111  putative Fe-S oxidoreductase  38.25 
 
 		 464 aa  290  3e-77  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.980262  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4507  hypothetical protein  38.9 
 
 		 456 aa  286  4e-76  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01141  putative Fe-S oxidoreductase  35.45 
 
 		 459 aa  282  9e-75  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0102  putative Fe-S oxidoreductase  36.56 
 
 		 470 aa  281  2e-74  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.383242  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01131  putative Fe-S oxidoreductase  35.85 
 
 		 459 aa  278  2e-73  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.104938  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2144  hypothetical protein  35.11 
 
 		 501 aa  257  2e-67  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.831905  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3571  hypothetical protein  34.45 
 
 		 523 aa  247  2e-64  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.630428  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3528  hypothetical protein  35.53 
 
 		 515 aa  247  2e-64  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0304  hypothetical protein  37.69 
 
 		 496 aa  244  3e-63  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.874468 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1336  protein of unknown function DUF512  36.07 
 
 		 477 aa  233  6e-60  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.506965 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09690  Fe-S oxidoreductase  35.15 
 
 		 457 aa  228  1e-58  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.268372  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0727  protein of unknown function DUF512  33.49 
 
 		 460 aa  226  7e-58  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.0961895 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1348  protein of unknown function DUF512  38.6 
 
 		 450 aa  214  1.9999999999999998e-54  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2747  protein of unknown function DUF512  46.02 
 
 		 508 aa  213  4.9999999999999996e-54  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.112314  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06880  Fe-S oxidoreductase  32.44 
 
 		 455 aa  209  9e-53  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.364621 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0867  hypothetical protein  21.51 
 
 		 436 aa  48.5  0.0002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0022  hypothetical protein  21.15 
 
 		 436 aa  47  0.0007  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0801  hypothetical protein  20.77 
 
 		 436 aa  45.1  0.002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0798  PDZ/DHR/GLGF domain-containing protein  33.33 
 
 		 365 aa  45.8  0.002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.36429  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1262  hypothetical protein  31.33 
 
 		 455 aa  44.3  0.004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0890  2-alkenal reductase  37.31 
 
 		 480 aa  43.5  0.006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.2841  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>