More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_0952 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012918  GM21_3309  50S ribosomal protein L15  100 
 
 
146 aa  291  2e-78  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000932499 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0952  50S ribosomal protein L15  100 
 
 
146 aa  291  2e-78  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0376093  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0645  50S ribosomal protein L15  76.03 
 
 
148 aa  238  2e-62  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000111424  hitchhiker  0.000000339891 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1085  50S ribosomal protein L15  74.66 
 
 
146 aa  234  2e-61  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.165048  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2838  50S ribosomal protein L15  78.08 
 
 
148 aa  226  8e-59  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.190663  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1365  ribosomal protein L15  69.86 
 
 
149 aa  211  2.9999999999999995e-54  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0025126  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0720  ribosomal protein L15  69.39 
 
 
147 aa  201  3e-51  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0699  50S ribosomal protein L15  64.14 
 
 
147 aa  198  3e-50  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.82238  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0885  50S ribosomal protein L15  61.9 
 
 
147 aa  184  3e-46  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.487854  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0150  50S ribosomal protein L15  60.96 
 
 
146 aa  183  6e-46  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0036731  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0129  50S ribosomal protein L15  60.27 
 
 
146 aa  182  1.0000000000000001e-45  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.100575  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0129  50S ribosomal protein L15  60.27 
 
 
146 aa  182  1.0000000000000001e-45  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000173867  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0125  50S ribosomal protein L15  60.27 
 
 
146 aa  182  1.0000000000000001e-45  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000308575  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0123  50S ribosomal protein L15  60.27 
 
 
146 aa  182  1.0000000000000001e-45  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00954178  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0123  50S ribosomal protein L15  60.27 
 
 
146 aa  182  1.0000000000000001e-45  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00031572  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0129  50S ribosomal protein L15  60.27 
 
 
146 aa  182  1.0000000000000001e-45  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0450407  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0160  50S ribosomal protein L15  60.27 
 
 
146 aa  182  1.0000000000000001e-45  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000150646  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0141  50S ribosomal protein L15  60.27 
 
 
146 aa  182  1.0000000000000001e-45  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  6.02363e-62 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5176  50S ribosomal protein L15  59.59 
 
 
146 aa  181  3e-45  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000327341  unclonable  1.24723e-25 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0124  50S ribosomal protein L15  58.9 
 
 
146 aa  180  6e-45  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000767925  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2258  50S ribosomal protein L15  57.53 
 
 
146 aa  174  3e-43  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0168117  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2299  50S ribosomal protein L15  57.53 
 
 
146 aa  174  3e-43  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0727  50S ribosomal protein L15  60.27 
 
 
147 aa  172  9.999999999999999e-43  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0174765  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0213  LSU ribosomal protein L15P  58.22 
 
 
146 aa  172  9.999999999999999e-43  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.261833  normal  0.302282 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0130  50S ribosomal protein L15  57.53 
 
 
146 aa  172  9.999999999999999e-43  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.86911  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0441  50S ribosomal protein L15  57.24 
 
 
147 aa  172  1.9999999999999998e-42  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2314  ribosomal protein L15  54.11 
 
 
146 aa  170  5.999999999999999e-42  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0114491  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0972  50S ribosomal protein L15  57.14 
 
 
147 aa  169  1e-41  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0126  50S ribosomal protein L15  56.85 
 
 
146 aa  169  1e-41  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1727  50S ribosomal protein L15  56.46 
 
 
147 aa  168  3e-41  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000774697  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0234  50S ribosomal protein L15  58.22 
 
 
146 aa  167  4e-41  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000856605  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1888  50S ribosomal protein L15  57.53 
 
 
146 aa  165  2e-40  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2692  ribosomal protein L15  57.82 
 
 
147 aa  163  6.9999999999999995e-40  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0077  50S ribosomal protein L15  55.48 
 
 
146 aa  162  1.0000000000000001e-39  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0244  ribosomal protein L15  54.79 
 
 
146 aa  160  7e-39  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0776465  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1375  50S ribosomal protein L15  55.1 
 
 
147 aa  158  2e-38  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0238101  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1311  50S ribosomal protein L15  55.1 
 
 
147 aa  158  2e-38  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000196543  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2922  50S ribosomal protein L15  54.11 
 
 
146 aa  158  2e-38  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000292378  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1119  ribosomal protein L15  55.1 
 
 
148 aa  158  2e-38  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.658156  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0214  50S ribosomal protein L15  53.47 
 
 
144 aa  152  1e-36  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.000818631  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2695  50S ribosomal protein L15  51.39 
 
 
146 aa  151  2e-36  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2380  50S ribosomal protein L15  51.39 
 
 
146 aa  151  2e-36  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0305  50S ribosomal protein L15  52.74 
 
 
146 aa  151  4e-36  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00213706  normal  0.150657 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0777  50S ribosomal protein L15  50.34 
 
 
147 aa  150  5e-36  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000140275  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1812  50S ribosomal protein L15  54.79 
 
 
146 aa  150  7e-36  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1464  50S ribosomal protein L15  51.39 
 
 
144 aa  149  8.999999999999999e-36  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000860578  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0493  50S ribosomal protein L15  51.02 
 
 
153 aa  149  1e-35  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.600314  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0931  ribosomal protein L15  53.1 
 
 
152 aa  149  1e-35  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.00144684  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2441  50S ribosomal protein L15P  51.39 
 
 
146 aa  147  4e-35  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0470  50S ribosomal protein L15  51.02 
 
 
153 aa  147  6e-35  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000419135  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0516  50S ribosomal protein L15  53.79 
 
 
145 aa  147  6e-35  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.061752  unclonable  0.0000000000147617 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0346  50S ribosomal protein L15  53.79 
 
 
145 aa  147  6e-35  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_435  ribosomal protein L15  50.34 
 
 
153 aa  146  8e-35  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0090931  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1574  ribosomal protein L15  56.85 
 
 
172 aa  144  4.0000000000000006e-34  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0317141  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0309  50S ribosomal protein L15  49.32 
 
 
146 aa  144  5e-34  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  unclonable  2.36933e-28 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01350  ribosomal protein L15  53.74 
 
 
147 aa  142  1e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.053024  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0734  ribosomal protein L15  49.34 
 
 
153 aa  142  1e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09810  LSU ribosomal protein L15P  54.11 
 
 
149 aa  142  1e-33  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0846946  hitchhiker  0.0000267286 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1659  50S ribosomal protein L15  50.67 
 
 
155 aa  142  1e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0131033  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0298  50S ribosomal protein L15P  53.1 
 
 
144 aa  141  3e-33  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.0000000000286334  hitchhiker  0.00000213592 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1008  50S ribosomal protein L15  53.1 
 
 
144 aa  141  4e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00101008  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1165  ribosomal protein L15  51.35 
 
 
148 aa  140  5e-33  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0536923  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0613  50S ribosomal protein L15P  48.95 
 
 
154 aa  139  9.999999999999999e-33  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0537361  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0424  50S ribosomal protein L15P  51.03 
 
 
144 aa  138  1.9999999999999998e-32  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.41995  normal  0.220664 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2460  50S ribosomal protein L15  50.34 
 
 
169 aa  138  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.907941  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2182  50S ribosomal protein L15  50.34 
 
 
169 aa  138  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.34852 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4933  ribosomal protein L15  53.06 
 
 
150 aa  139  1.9999999999999998e-32  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0104537  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0866  50S ribosomal protein L15P  54.48 
 
 
157 aa  139  1.9999999999999998e-32  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00380263  hitchhiker  0.00669218 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1927  50S ribosomal protein L15  50.33 
 
 
162 aa  138  3e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0978  50S ribosomal protein L15  52.41 
 
 
144 aa  138  3e-32  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00708309  hitchhiker  0.00387669 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3648  50S ribosomal protein L15  52.38 
 
 
146 aa  138  3e-32  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000516585  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0678  50S ribosomal protein L15  48.63 
 
 
145 aa  137  3.9999999999999997e-32  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2145  50S ribosomal protein L15  48.99 
 
 
169 aa  137  3.9999999999999997e-32  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0620  ribosomal protein L15  51.72 
 
 
144 aa  137  6e-32  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.527453  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1005  50S ribosomal protein L15  49.33 
 
 
156 aa  137  6e-32  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.10484  normal  0.0101477 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1245  50S ribosomal protein L15  51.03 
 
 
144 aa  137  6e-32  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0277502  hitchhiker  0.00267047 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0440  50S ribosomal protein L15P  48.28 
 
 
144 aa  137  7e-32  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.124289  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2382  50S ribosomal protein L15  52.74 
 
 
147 aa  136  7.999999999999999e-32  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.0000043437  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0786  ribosomal protein L15  50.69 
 
 
143 aa  135  1e-31  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.00496718  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001723  LSU ribosomal protein L15p (L27Ae)  49.66 
 
 
144 aa  135  2e-31  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000210638  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2199  50S ribosomal protein L15  48.68 
 
 
167 aa  135  2e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0650553  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0308  50S ribosomal protein L15  49.32 
 
 
184 aa  135  2e-31  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0135677  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0503  50S ribosomal protein L15  49.66 
 
 
144 aa  134  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000448251  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0473  50S ribosomal protein L15  49.66 
 
 
144 aa  134  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.874189  hitchhiker  0.00000311349 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0268  50S ribosomal protein L15  50.34 
 
 
144 aa  134  3.0000000000000003e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.366477  normal  0.0148786 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4730  50S ribosomal protein L15  49.66 
 
 
144 aa  134  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.000304581  normal  0.615753 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0506  50S ribosomal protein L15  49.66 
 
 
144 aa  134  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0331231  normal  0.0198269 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1505  ribosomal protein L15  47.22 
 
 
149 aa  134  3.0000000000000003e-31  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.628014  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0786  50S ribosomal protein L15  48.97 
 
 
150 aa  134  5e-31  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0000129799  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0334  50S ribosomal protein L15  47.02 
 
 
162 aa  134  6.0000000000000005e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.379704  normal 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl141  50S ribosomal protein L15  47.26 
 
 
145 aa  133  7.000000000000001e-31  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0346  50S ribosomal protein L15  49.66 
 
 
144 aa  133  7.000000000000001e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.187663  normal  0.0708986 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3466  50S ribosomal protein L15  49.66 
 
 
144 aa  133  7.000000000000001e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0152588  normal  0.0772589 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2740  50S ribosomal protein L15  49.66 
 
 
144 aa  133  7.000000000000001e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0509969  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0367  50S ribosomal protein L15  49.66 
 
 
144 aa  133  7.000000000000001e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.293833  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2820  50S ribosomal protein L15  50.34 
 
 
144 aa  133  8e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.355582  normal  0.252798 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0232  50S ribosomal protein L15  46.9 
 
 
159 aa  133  8e-31  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.211551 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3895  50S ribosomal protein L15  48.97 
 
 
144 aa  133  9e-31  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000614268  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0302  50S ribosomal protein L15  48.97 
 
 
144 aa  133  9e-31  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000713012  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1746  50S ribosomal protein L15  49.65 
 
 
148 aa  133  9e-31  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.718432  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>