More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_0950 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012918  GM21_3311  30S ribosomal protein S5  100 
 
 
162 aa  322  1e-87  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.04124e-09 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0950  30S ribosomal protein S5  100 
 
 
162 aa  322  1e-87  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00386761  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1083  30S ribosomal protein S5  90.74 
 
 
162 aa  288  2e-77  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.237908  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2840  30S ribosomal protein S5  83.95 
 
 
162 aa  280  6e-75  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.122031  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0643  30S ribosomal protein S5  83.33 
 
 
162 aa  275  2e-73  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  2.75279e-06  hitchhiker  1.14757e-07 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0697  30S ribosomal protein S5  82.1 
 
 
162 aa  268  3e-71  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1363  30S ribosomal protein S5  80.86 
 
 
162 aa  266  9e-71  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00227785  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0718  30S ribosomal protein S5  72.33 
 
 
163 aa  229  9e-60  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.160468  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1928  30S ribosomal protein S5  71.79 
 
 
168 aa  219  2e-56  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.69161 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2035  30S ribosomal protein S5  71.15 
 
 
169 aa  214  4e-55  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.34488  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1950  30S ribosomal protein S5  71.15 
 
 
169 aa  214  4e-55  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1929  30S ribosomal protein S5  70.51 
 
 
169 aa  214  5e-55  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1572  ribosomal protein S5  66.04 
 
 
166 aa  212  1e-54  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0532593  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01340  ribosomal protein S5  70.44 
 
 
166 aa  211  4e-54  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.162816  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2443  30S ribosomal protein S5  68.32 
 
 
166 aa  209  2e-53  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.995236 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0439  30S ribosomal protein S5  67.08 
 
 
166 aa  207  3e-53  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1507  ribosomal protein S5  66.46 
 
 
173 aa  207  3e-53  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.360692  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2240  30S ribosomal protein S5  60.9 
 
 
163 aa  204  4e-52  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.109311  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0232  30S ribosomal protein S5  66.46 
 
 
166 aa  203  1e-51  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0010623  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0725  ribosomal protein S5  62.66 
 
 
165 aa  201  3e-51  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.104359  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2920  30S ribosomal protein S5  65.84 
 
 
166 aa  201  5e-51  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000379873  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0242  ribosomal protein S5  65.41 
 
 
168 aa  200  7e-51  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.529563  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1748  30S ribosomal protein S5  61.54 
 
 
163 aa  199  2e-50  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.749725  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2406  30S ribosomal protein S5  63.23 
 
 
172 aa  197  4e-50  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0326698  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2279  30S ribosomal protein S5  63.23 
 
 
172 aa  197  6e-50  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  1.67346e-08  hitchhiker  0.00339787 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0124  30S ribosomal protein S5  62.73 
 
 
166 aa  197  7e-50  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2212  30S ribosomal protein S5  63.23 
 
 
172 aa  196  8e-50  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  1.5537e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0306  30S ribosomal protein S5  63.23 
 
 
172 aa  196  8e-50  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0963107  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0303  30S ribosomal protein S5  62.11 
 
 
166 aa  196  9e-50  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  1.49284e-05  normal  0.159424 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2047  30S ribosomal protein S5  63.23 
 
 
172 aa  196  9e-50  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0164309  normal  0.432227 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0096  30S ribosomal protein S5  59.24 
 
 
163 aa  196  1e-49  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0990487 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2757  30S ribosomal protein S5  59.49 
 
 
163 aa  196  1e-49  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0511806  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3988  ribosomal protein S5  63.52 
 
 
166 aa  195  2e-49  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0501123  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1834  30S ribosomal protein S5  62.58 
 
 
172 aa  194  3e-49  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.459272  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0128  30S ribosomal protein S5  62.11 
 
 
166 aa  194  4e-49  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0121  30S ribosomal protein S5  62.89 
 
 
166 aa  193  8e-49  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000313294  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2694  ribosomal protein S5  63.92 
 
 
164 aa  193  8e-49  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0775  30S ribosomal protein S5  64.81 
 
 
167 aa  192  1e-48  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  4.09593e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0619  30S ribosomal protein S5  61.39 
 
 
172 aa  192  1e-48  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.797529 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2697  30S ribosomal protein S5  62.66 
 
 
165 aa  192  2e-48  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0198  30S ribosomal protein S5  61.29 
 
 
171 aa  192  2e-48  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.136971  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2382  30S ribosomal protein S5  62.66 
 
 
165 aa  192  2e-48  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09830  SSU ribosomal protein S5P  61.84 
 
 
173 aa  192  2e-48  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0111363  hitchhiker  1.46915e-05 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2316  ribosomal protein S5  60.87 
 
 
167 aa  192  2e-48  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00562795  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1168  30S ribosomal protein S5  62.89 
 
 
180 aa  191  3e-48  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0459782  normal  0.0987019 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0211  SSU ribosomal protein S5P  64.33 
 
 
168 aa  191  4e-48  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.102513  normal  0.321891 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1357  ribosomal protein S5  63.29 
 
 
197 aa  189  2e-47  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4931  ribosomal protein S5  61.15 
 
 
182 aa  188  3e-47  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.023543  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2161  ribosomal protein S5  59.87 
 
 
175 aa  188  3e-47  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0929942  normal  0.978944 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0127  30S ribosomal protein S5  62.26 
 
 
166 aa  187  4e-47  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0304335  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0121  30S ribosomal protein S5  62.26 
 
 
166 aa  187  4e-47  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  8.28927e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0123  30S ribosomal protein S5  62.26 
 
 
166 aa  187  4e-47  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  3.20585e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0148  30S ribosomal protein S5  62.26 
 
 
166 aa  187  4e-47  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000129671  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0127  30S ribosomal protein S5  62.26 
 
 
166 aa  187  4e-47  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  3.3601e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0127  30S ribosomal protein S5  62.26 
 
 
166 aa  187  4e-47  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00181316  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5178  30S ribosomal protein S5  62.26 
 
 
166 aa  187  4e-47  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  5.95354e-09  unclonable  1.58877e-25 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0139  30S ribosomal protein S5  62.26 
 
 
166 aa  187  4e-47  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  6.93712e-62 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0158  30S ribosomal protein S5  62.26 
 
 
166 aa  187  4e-47  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  8.26666e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4009  30S ribosomal protein S5  61.64 
 
 
180 aa  187  4e-47  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  8.76107e-05  hitchhiker  7.86108e-05 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0122  30S ribosomal protein S5  61.64 
 
 
166 aa  187  5e-47  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  8.348e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0732  ribosomal protein S5  59.87 
 
 
190 aa  187  6e-47  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3007  30S ribosomal protein S5  59.12 
 
 
179 aa  185  2e-46  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.137174  hitchhiker  0.00889655 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23300  SSU ribosomal protein S5P  60.53 
 
 
179 aa  185  3e-46  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0615843  hitchhiker  6.6757e-06 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2048  30S ribosomal protein S5  55.77 
 
 
163 aa  184  6e-46  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00145313  normal  0.0102029 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0884  30S ribosomal protein S5  59.01 
 
 
167 aa  181  3e-45  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.560186  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0864  SSU ribosomal protein S5P  55.41 
 
 
177 aa  181  5e-45  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0107209  hitchhiker  0.00625642 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4259  ribosomal protein S5  59.33 
 
 
166 aa  181  5e-45  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  1.44419e-06  unclonable  2.59852e-12 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1164  30S ribosomal protein S5  56.33 
 
 
174 aa  180  8e-45  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.00523189  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1243  30S ribosomal protein S5  56.88 
 
 
169 aa  179  1e-44  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00969773  hitchhiker  0.0030984 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0579  30S ribosomal protein S5  61.84 
 
 
210 aa  178  2e-44  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.898965  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0380  30S ribosomal protein S5  54.43 
 
 
173 aa  179  2e-44  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1032  30S ribosomal protein S5  62.25 
 
 
223 aa  178  3e-44  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  hitchhiker  6.81641e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1061  30S ribosomal protein S5  62.25 
 
 
223 aa  178  3e-44  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  hitchhiker  0.000257421  normal  0.422171 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1049  30S ribosomal protein S5  62.25 
 
 
223 aa  178  3e-44  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  hitchhiker  0.00405345  normal  0.132345 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10735  30S ribosomal protein S5  60.9 
 
 
220 aa  177  4e-44  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  9.27793e-05  normal  0.43056 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2629  30S ribosomal protein S5  61.84 
 
 
200 aa  177  6e-44  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.192925  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0715  30S ribosomal protein S5  55.13 
 
 
189 aa  177  6e-44  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.128922  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1728  30S ribosomal protein S5  60.38 
 
 
168 aa  177  7e-44  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  1.23427e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1853  ribosomal protein S5  58.39 
 
 
172 aa  177  7e-44  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  1.52788e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1661  30S ribosomal protein S5  57.62 
 
 
185 aa  177  8e-44  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.115923  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2983  30S ribosomal protein S5  58.39 
 
 
192 aa  176  1e-43  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.394302  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3689  ribosomal protein S5  62.25 
 
 
215 aa  176  1e-43  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  unclonable  5.41133e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3400  ribosomal protein S5  59.35 
 
 
215 aa  176  1e-43  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.608039  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0599  30S ribosomal protein S5  62.18 
 
 
202 aa  175  2e-43  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05805  30S ribosomal protein S5  55.06 
 
 
174 aa  176  2e-43  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1103  Ribosomal protein S5-like protein  61.18 
 
 
210 aa  175  2e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0999583 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6032  30S ribosomal protein S5  63.51 
 
 
202 aa  174  3e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.140148 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1632  ribosomal protein S5  57.86 
 
 
172 aa  175  3e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4781  30S ribosomal protein S5  55.56 
 
 
185 aa  174  3e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.694187  hitchhiker  5.9117e-07 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5030  30S ribosomal protein S5  60.93 
 
 
222 aa  174  4e-43  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  hitchhiker  3.82419e-06  normal  0.598493 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4304  ribosomal protein S5  61.18 
 
 
205 aa  174  6e-43  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1466  30S ribosomal protein S5  55.7 
 
 
169 aa  174  6e-43  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  1.30874e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1371  30S ribosomal protein S5  54.9 
 
 
189 aa  173  8e-43  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.868887  normal  0.133817 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2301  30S ribosomal protein S5  63.27 
 
 
166 aa  173  9e-43  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.186174  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2260  30S ribosomal protein S5  63.27 
 
 
166 aa  173  9e-43  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00378829  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1557  ribosomal protein S5  58.49 
 
 
169 aa  173  9e-43  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000355903  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2671  30S ribosomal protein S5  52.23 
 
 
199 aa  173  9e-43  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.390109  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1929  30S ribosomal protein S5  58.39 
 
 
189 aa  172  1e-42  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1814  30S ribosomal protein S5  63.45 
 
 
166 aa  172  1e-42  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0494  ribosomal protein S5  57.43 
 
 
159 aa  172  1e-42  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.645622  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>